กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 9 นาที

เอ็มเอ็มพี3

สโตรเมไลซิน-1 หรือที่รู้จักกันในชื่อ เมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเนส-3 (MMP-3) เป็น เอนไซม์ ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน MMP3 ยีน MMP3 เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่ม ยีน MMP ซึ่งอยู่บนโครโมโซม...

เอ็มเอ็มพี3

เอ็มเอ็มพี3
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบีการค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่นMMP3 , CHDS6, MMP-3, SL-1, STMY, STMY1, STR1, เมทริกซ์เมทัลโลเปปติเดส 3
รหัสภายนอกOMIM : 185250 ; MGI : 97010 ; HomoloGene : 20545 ; GeneCards : MMP3 ; OMA : MMP3 - orthologs
หมายเลข EC3.4.24.17
ออร์โธล็อก
สายพันธุ์มนุษย์หนู
เอนเทรซ
วงดนตรี
ยูนิโปรท
RefSeq (mRNA)

NM_002422

NM_010809

RefSeq (โปรตีน)

NP_002413

NP_034939

สถานที่ตั้ง (UCSC)Chr 11: 102.84 – 102.84 Mbบทที่ 9: 7.45 – 7.46 เมกะไบต์
การค้นหาใน PubMed[ 3 ][ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ดู/แก้ไขเมาส์
สตรอมิไลซิน 1
ตัวระบุ
หมายเลข EC3.4.24.17
หมายเลข CAS79955-99-0
ฐานข้อมูล
อินท์เอ็นซ์มุมมองของ IntEnz
เบรนด้าเบรนด้าเข้าร่วม
เอ็กซ์แพซี่มุมมองของ NiceZyme
เคกก์รายการ KEGG
เมตาไซค์วิถีการเผาผลาญ
ไพรแอมประวัติโดยย่อ
โครงสร้างPDBRCSB PDB PDBe PDBsum
ค้นหา
พีเอ็มซีบทความ
พับเมดบทความ
เอ็นซีบีไอโปรตีน

สโตรเมไลซิน-1หรือที่รู้จักกันในชื่อเมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเนส-3 (MMP-3) เป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนMMP3 ยีน MMP3 เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่ม ยีน MMPซึ่งอยู่บนโครโมโซม 11q22.3 [ 5 ] MMP-3 มีน้ำหนักโมเลกุลโดยประมาณ 54 kDa [ 6 ]

การทำงาน

โปรตีนในกลุ่มเมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเนส ( MMP ) มีส่วนเกี่ยวข้องในการสลาย โปรตีน เมทริกซ์นอกเซลล์และในระหว่างการปรับโครงสร้างเนื้อเยื่อในกระบวนการทางสรีรวิทยาปกติ เช่น การพัฒนาของตัวอ่อนและการสืบพันธุ์ ตลอดจนในกระบวนการของโรค เช่น โรคข้ออักเสบและการแพร่กระจายของเนื้องอก MMP ส่วนใหญ่จะถูกหลั่งออกมาในรูปของโปรโปรตีนที่ไม่ทำงาน ซึ่งจะถูกกระตุ้นเมื่อถูกตัดโดยโปรตีเนสนอกเซลล์[ 7 ]

เอนไซม์ MMP-3 ย่อยสลายคอลลาเจนชนิด II, III, IV, IX และ X, โปรตีโอไกลแคน , ไฟโบรเนกติน , ลามินินและ อีลาสติน [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] นอกจากนี้ MMP-3 ยังสามารถกระตุ้น MMP อื่นๆ เช่นMMP-1 , MMP-7และMMP-9ทำให้ MMP-3 มีบทบาทสำคัญในการปรับโครงสร้างเนื้อเยื่อเกี่ยวพัน[ 11 ]เชื่อกันว่าเอนไซม์นี้ยังมีส่วนเกี่ยวข้องกับการซ่อมแซมบาดแผล การดำเนินไปของหลอดเลือดแดงแข็ง และการเริ่มต้นของเนื้องอก

นอกจากบทบาทดั้งเดิมของ MMP3 ในพื้นที่นอกเซลล์แล้ว MMP3 ยังสามารถเข้าไปในนิวเคลียสของเซลล์และควบคุมการถอดรหัสได้อีกด้วย[ 12 ]

การควบคุมยีน

MMP3 เองสามารถเข้าไปในนิวเคลียสของเซลล์และควบคุมยีนเป้าหมาย เช่น ยีน CTGF/CCN2 ได้[ 12 ]

การแสดงออกของ MMP3 ส่วนใหญ่ถูกควบคุมในระดับการถอดรหัส โดยที่โปรโมเตอร์ของยีนจะตอบสนองต่อสิ่งเร้าต่างๆ รวมถึงปัจจัยการเจริญเติบโตไซโตไคน์สารกระตุ้นเนื้องอก และผลิตภัณฑ์ ของยีน ก่อมะเร็ง[ 13 ]โพลีมอร์ฟิซึมในโปรโมเตอร์ของยีน MMP3 ได้รับการรายงานครั้งแรกในปี 1995 [ 14 ]โพลีมอร์ฟิซึมนี้เกิดจากการเปลี่ยนแปลงจำนวนอะดีโนซีนที่ตำแหน่ง -1171 เมื่อเทียบกับตำแหน่งเริ่มต้นการถอดรหัส ส่งผลให้แอลลีล หนึ่ง มีอะดีโนซีนห้าตัว (5A) และอีกแอลลีลหนึ่งมีอะดีโนซีนหกตัว (6A) การวิเคราะห์การทำงานของโปรโมเตอร์ในหลอดทดลองแสดงให้เห็นว่าแอลลีล 5A มีกิจกรรมของโปรโมเตอร์มากกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับแอลลีล 6A [ 11 ]มีการแสดงให้เห็นในการศึกษาต่างๆ ว่าบุคคลที่มียีนแอลลีล 5A มีความเสี่ยงต่อโรคต่างๆ ที่เกิดจากการแสดงออกของ MMP ที่เพิ่มขึ้น เช่นกล้ามเนื้อหัวใจตายเฉียบพลันและหลอดเลือดแดงใหญ่ในช่องท้องโป่งพอง[ 15 ] [ 16 ]

ในทางกลับกัน พบว่าอัลลีล 6A เกี่ยวข้องกับโรคที่มีลักษณะการแสดงออกของ MMP-3 ไม่เพียงพอเนื่องจากกิจกรรมของโปรโมเตอร์ของอัลลีล 6A ต่ำกว่า เช่นโรคหลอดเลือดหัวใจตีบเรื้อรัง[ 11 ] [ 17 ] [ 18 ]ตัวแปร -1171 5A/6A ยังเกี่ยวข้องกับความผิดปกติแต่กำเนิด เช่นปากแหว่งเพดานแหว่งโดยผู้ที่มีปากแหว่งเพดานแหว่งมีจีโนไทป์ 6A/6A มากกว่ากลุ่มควบคุมอย่างมีนัยสำคัญ[ 19 ]เมื่อเร็วๆ นี้ พบว่ายีน MMP3 ถูกควบคุมลดลงในผู้ที่มีปากแหว่งเพดานแหว่งเมื่อเทียบกับกลุ่มควบคุม[ 20 ]ซึ่งเป็นการยืนยันถึงลักษณะของปากแหว่งเพดานแหว่งว่าเป็นภาวะที่เกิดจากการปรับโครงสร้างเนื้อเยื่อตัวอ่อนที่ไม่เพียงพอหรือบกพร่อง

โครงสร้าง

โครงสร้างทั่วไปของเมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเอส

สมาชิกส่วนใหญ่ของตระกูล MMP ถูกจัดระเบียบออกเป็นสามโดเมนพื้นฐานที่โดดเด่นและคงสภาพไว้อย่างดี โดยพิจารณาจากโครงสร้าง ได้แก่โปรเปปไทด์ ที่ปลายอะมิโน โดเมนเร่งปฏิกิริยา และ โดเมนคล้าย เฮโมเพ็กซินที่ปลายคาร์บอกซิล โปรเปปไทด์ประกอบด้วยกรดอะมิโนประมาณ 80-90 ตัว ซึ่งมีหมู่ซิสเทอีนที่ทำปฏิกิริยากับอะตอมสังกะสีเร่งปฏิกิริยาผ่านหมู่ไทออลของโซ่ข้าง โปรเปปไทด์มีลำดับที่คงสภาพไว้สูง (. . .PRCGXPD. . .) การกำจัดโปรเปปไทด์โดยการย่อยสลายโปรตีนจะทำให้เกิด การกระตุ้น ไซโมเจนเนื่องจากสมาชิกทั้งหมดของตระกูล MMP ถูกผลิตขึ้นในรูปแบบแฝง

โดเมนเร่งปฏิกิริยาประกอบด้วยไอออนสังกะสี 2 ไอออนและไอออนแคลเซียมอย่างน้อย 1 ไอออนที่ประสานกับกรดอะมิโนต่างๆ ไอออนสังกะสีหนึ่งในสองไอออนนั้นอยู่ในบริเวณออกฤทธิ์และมีส่วนร่วมในกระบวนการเร่งปฏิกิริยาของ MMPs ไอออนสังกะสีตัวที่สอง (หรือที่เรียกว่าสังกะสีโครงสร้าง) และไอออนแคลเซียมอยู่ในโดเมนเร่งปฏิกิริยาห่างจากไอออนสังกะสีเร่งปฏิกิริยาประมาณ 12 อังสตรอม ไอออนสังกะสีเร่งปฏิกิริยามีความสำคัญต่อกิจกรรมการย่อยโปรตีนของ MMPs กรดอะมิโนฮิสติดีน 3 ตัวที่ประสานกับไอออนสังกะสีเร่งปฏิกิริยานั้นได้รับการอนุรักษ์ไว้ใน MMPs ทุกชนิด ยังไม่เป็นที่ทราบแน่ชัดเกี่ยวกับบทบาทของไอออนสังกะสีตัวที่สองและไอออนแคลเซียมภายในโดเมนเร่งปฏิกิริยา แต่พบว่า MMPs มีความสัมพันธ์สูงกับไอออนสังกะสีโครงสร้างและไอออนแคลเซียม

TIMP-1 (สีน้ำเงิน) ที่จับคู่กับ MMP-3 (สีแดง) สังเกต Cys1 (สีเขียว) ของ TIMP-1 ที่จับกับสังกะสีเร่งปฏิกิริยา (สีม่วง) นอกจากนี้ยังแสดงไอออนแคลเซียม (สีเหลือง) ด้วย อ้างอิงจากการแสดงผลด้วย PyMOL ของPDB 1UEAเพื่อความง่าย จึงไม่ได้แสดงโมโนเมอร์ของ MMP-3 อีกตัวที่จับคู่กับ TIMP-1 ที่เกี่ยวข้อง

โดเมนเร่งปฏิกิริยาของ MMP-3 สามารถถูกยับยั้งได้ด้วยสารยับยั้งเมทัลโลโปรตีเอสในเนื้อเยื่อ (TIMPs)ชิ้นส่วนปลายด้าน n ของ TIMP จะจับกับร่องของตำแหน่งออกฤทธิ์ในลักษณะเดียวกับที่สารตั้งต้นเปปไทด์จะจับ หมู่ Cys1 ของ TIMP จะจับกับสังกะสีเร่งปฏิกิริยาและสร้างพันธะไฮโดรเจนกับออกซิเจนคาร์บอกซิเลตตัวใดตัวหนึ่งของหมู่กลูตาเมตเร่งปฏิกิริยา (Glu202 ดูกลไกด้านล่าง) ปฏิสัมพันธ์เหล่านี้บังคับให้โมเลกุลน้ำที่จับกับสังกะสีซึ่งจำเป็นต่อการทำงานของเอนไซม์ออกจากเอนไซม์ การสูญเสียโมเลกุลน้ำและการปิดกั้นตำแหน่งออกฤทธิ์โดย TIMP ทำให้เอนไซม์ไม่สามารถทำงานได้[ 21 ]

โดเมนคล้ายเฮโมเพ็กซินของ MMP มีการอนุรักษ์สูงและแสดงความคล้ายคลึงกันของลำดับกับโปรตีนพลาสมา เฮโมเพ็กซิน โดเมนคล้ายเฮโมเพ็กซินได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีบทบาทเชิงหน้าที่ในการจับกับสารตั้งต้นและ/หรือในการโต้ตอบกับตัวยับยั้งเนื้อเยื่อของเมทัลโลโปรตีเนส (TIMPs) ซึ่งเป็นกลุ่มของโปรตีนยับยั้ง MMP ที่เฉพาะเจาะจง[ 22 ]

กลไก

กลไกของ MMP-3 เป็นรูปแบบที่แตกต่างจากรูปแบบทั่วไปที่พบในเมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเนสทั้งหมด ในบริเวณออกฤทธิ์ โมเลกุลของน้ำจะประสานกับกรดกลูตามิก (Glu202) และไอออนสังกะสีตัวใดตัวหนึ่งที่มีอยู่ในโดเมนเร่งปฏิกิริยา ก่อนอื่น โมเลกุลของน้ำที่ประสานกันจะทำการโจมตีแบบนิวคลีโอฟิลิกที่คาร์บอนที่ ถูกตัด ของสารตั้งต้นเปปไทด์ในขณะที่กรดกลูตามิกจะดึงโปรตอนจากโมเลกุลของน้ำไปพร้อมกัน จากนั้นโปรตอนที่ดึงมาจะถูกกำจัดออกจากกรดกลูตามิกโดยไนโตรเจนของอะไมด์ที่ถูกตัด ซึ่งจะก่อให้เกิดสารตัวกลางเจมไดโอเลตแบบทรงสี่หน้าซึ่งประสานกับอะตอมสังกะสี[ 23 ]เพื่อให้ผลิตภัณฑ์อะไมด์ถูกปล่อยออกจากบริเวณออกฤทธิ์ อะไมด์ที่ถูกตัดจะต้องดึงโปรตอนตัวที่สองจากโมเลกุลของน้ำที่ประสานกัน[ 24 ]อีกทางเลือกหนึ่ง มีการแสดงให้เห็นสำหรับเทอร์โมไลซิน (เมทัลโลโปรตีเนสอีกชนิดหนึ่ง) ว่าผลิตภัณฑ์อะไมด์สามารถถูกปล่อยออกมาในรูป ที่เป็นกลาง (R-NH 2 ) ได้ [ 25 ] [ 26 ]ผลิตภัณฑ์คาร์บอกซิเลตจะถูกปล่อยออกมาหลังจากโมเลกุลน้ำเข้าโจมตีไอออนสังกะสีและแทนที่ผลิตภัณฑ์คาร์บอกซิเลต[ 27 ]การปล่อยผลิตภัณฑ์คาร์บอกซิเลตถือเป็นขั้นตอนที่จำกัดอัตราในปฏิกิริยา[ 26 ]

นอกจากโมเลกุลน้ำที่เกี่ยวข้องโดยตรงในกลไกแล้ว ยังมีการเสนอว่าโมเลกุลน้ำตัวที่สองเป็นส่วนหนึ่งของตำแหน่งออกฤทธิ์ของ MMP-3 โมเลกุลน้ำเสริมนี้เชื่อว่าจะช่วยทำให้ตัวกลาง gem-diolate และสถานะการเปลี่ยนผ่านมีเสถียรภาพมากขึ้นโดยการลดพลังงานกระตุ้นสำหรับการก่อตัวของพวกมัน[ 23 ] [ 28 ]สิ่งนี้แสดงให้เห็นในแผนภาพกลไกและพิกัดปฏิกิริยาด้านล่าง

กลไกการเร่งปฏิกิริยาของ MMP-3 โดยมีโมเลกุลน้ำเป็นตัวช่วย ประจุที่แสดงเป็นประจุอย่างเป็นทางการ

ความเกี่ยวข้องกับโรค

MMP-3 มีส่วนเกี่ยวข้องในการทำให้ผลกระทบของการบาดเจ็บที่สมอง (TBI) รุนแรงขึ้นผ่านการรบกวนของอุปสรรคเลือด-สมอง (BBB) ​​การศึกษาต่างๆ แสดงให้เห็นว่าหลังจากสมองได้รับบาดเจ็บและ เริ่ม มีการอักเสบการผลิต MMP ในสมองจะเพิ่มขึ้น[ 29 ] [ 30 ]ในการศึกษาที่ดำเนินการโดยใช้หนู MMP-3 ชนิดป่า (WT) และชนิดน็อกเอาต์ (KO)พบว่า MMP-3 เพิ่มการซึมผ่านของ BBB หลังจากการบาดเจ็บ[ 31 ]พบว่าหนู WT มี ระดับ คลอดีน -5 และออคลูดิน ต่ำ กว่าหนู KO หลังจาก TBI คลอดีนและออคลูดินเป็นโปรตีนที่จำเป็นสำหรับการสร้างจุดเชื่อมต่อที่แน่นระหว่างเซลล์ของอุปสรรคเลือด-สมอง[ 32 ] [ 33 ]เนื้อเยื่อจากสมองของหนู WT และ KO ที่ไม่ได้รับบาดเจ็บยังได้รับการรักษาด้วย MMP-3 ที่ออกฤทธิ์ด้วย เนื้อเยื่อทั้ง WT และ KO แสดงให้เห็นการลดลงของคลอดีน-5, อ็อกคลูดิน และลามินิน -α1 ( โปรตีน ในเยื่อฐาน ) ซึ่งบ่งชี้ว่า MMP-3 ทำลายโปรตีนไทต์จังก์ชันและเยื่อฐานโดยตรง

MMP-3 ยังก่อให้เกิดความเสียหายต่อสิ่งกีดขวางเลือด- ไขสันหลัง (BSCB) ซึ่งเป็นสิ่งที่เทียบเท่ากับสิ่งกีดขวางเลือด-สมอง[ 34 ]หลังจากได้รับบาดเจ็บที่ไขสันหลัง (SCI) ในการศึกษาที่คล้ายกันซึ่งดำเนินการโดยใช้หนู MMP-3 WT และ KO พบว่า MMP-3 เพิ่มการซึมผ่านของ BSCB โดยหนู WT แสดงการซึมผ่านของ BSCB ที่มากกว่าหนู KO หลังจากได้รับบาดเจ็บที่ไขสันหลัง การศึกษาเดียวกันนี้ยังพบว่าการซึมผ่านของ BSCB ลดลงเมื่อเนื้อเยื่อไขสันหลังได้รับการรักษาด้วยสารยับยั้ง MMP-3 ผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่าการมีอยู่ของ MMP-3 ทำหน้าที่เพิ่มการซึมผ่านของ BSCB หลังจาก SCI [ 35 ]การศึกษาแสดงให้เห็นว่า MMP-3 ก่อให้เกิดความเสียหายนี้โดยการย่อยสลายคลอดีน-5, อ็อกคลูดิน และZO-1 (โปรตีนไทต์จังก์ชันอีกชนิดหนึ่ง) คล้ายกับวิธีที่ MMP-3 ทำลาย BBB

การเพิ่มขึ้นของความสามารถในการซึมผ่านของสิ่งกีดขวางเลือด-สมองและสิ่งกีดขวางเลือด-ไขสันหลังทำให้เซลล์ เม็ดเลือดขาวชนิดนิวโทรฟิล สามารถแทรกซึมเข้าไปในสมองและไขสันหลังบริเวณที่มีการอักเสบ ได้มากขึ้น [ 31 ]เซลล์เม็ดเลือดขาวชนิดนิวโทรฟิลมี MMP-9 [ 36 ]ซึ่งแสดงให้เห็นว่าสามารถย่อยสลายออคลูดินได้เช่นกัน[ 37 ] ซึ่งนำไปสู่การรบกวนของ BBB และ BSCB มากขึ้น[ 38 ]

อ่านเพิ่มเติม

  • Matrisian LM (เม.ย. 1990). "เมทัลโลโปรตีเนสและสารยับยั้งในการปรับโครงสร้างเมทริกซ์". แนวโน้มในพันธุศาสตร์6 (4): 121– 5. doi : 10.1016/0168-9525(90)90126-Q . PMID  2132731 .
  • Massova I, Kotra LP, Fridman R, Mobashery S (ก.ย. 1998). "เมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเนส: โครงสร้าง วิวัฒนาการ และความหลากหลาย". FASEB Journal . 12 (25n26): 1075– 95. CiteSeerX  10.1.1.31.3959 . doi : 10.1142/S0217984998001256 . PMID  9737711 .
  • Nagase H, Woessner JF (กรกฎาคม 1999). "เมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเนส"วารสารเคมีชีวภาพ274 (31): 21491– 4. doi : 10.1074/jbc.274.31.21491 . PMID  10419448 .
  • Lijnen HR (ม.ค. 2545). "เมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเนสและกิจกรรมไฟบรินไลติกของเซลล์". ชีวเคมี. Biokhimiia . 67 (1): 92– 8. doi : 10.1023/A:1013908332232 . PMID  11841344. S2CID  2905786 .
  • ฐาน ข้อมูลออนไลน์ MEROPSสำหรับเอนไซม์เปปติเดสและสารยับยั้ง: M10.005
  • Stromelysin+1 ใน หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=MMP3&oldid=1355745671 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เอ็มเอ็มพี3

สโตรเมไลซิน-1 หรือที่รู้จักกันในชื่อ เมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเนส-3 (MMP-3) เป็น เอนไซม์ ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน MMP3 ยีน MMP3 เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่ม ยีน MMP ซึ่งอยู่บนโครโมโซม...

การทำงาน

โปรตีนในกลุ่มเมทริกซ์เมทัลโลโปรตีเนส ( MMP ) มีส่วนเกี่ยวข้องในการสลาย โปรตีน เมทริกซ์นอกเซลล์ และในระหว่างการปรับโครงสร้างเนื้อเยื่อในกระบวนการทางสรีรวิทยาปกติ เช่น การพัฒนาของตัวอ่อนและการสืบพันธุ์ ตลอดจนในกระบวนการของโรค เช่น โรคข้ออักเสบและ...

การควบคุมยีน

MMP3 เองสามารถเข้าไปในนิวเคลียสของเซลล์และควบคุมยีนเป้าหมาย เช่น ยีน CTGF/CCN2 ได้ [ 12 ]

โครงสร้าง

สมาชิกส่วนใหญ่ของตระกูล MMP ถูกจัดระเบียบออกเป็นสามโดเมนพื้นฐานที่โดดเด่นและคงสภาพไว้อย่างดี โดยพิจารณาจากโครงสร้าง ได้แก่ โปรเปปไทด์ ที่ปลายอะมิโน โดเมนเร่งปฏิกิริยา และ โดเมนคล้าย เฮโมเพ็กซิน ที่ปลายคาร์บอกซิล โปรเปปไทด์ประกอบด้วยกรดอะมิโนประมาณ 80-90 ตัว...