สายพันธุ์ต่างๆ ของ SARS-CoV-2

การกลายพันธุ์ในเชิงบวก เชิงลบ และแบบเป็นกลาง ในระหว่างวิวัฒนาการของไวรัสโคโรนา เช่น SARS-CoV-2

สายพันธุ์ของไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ 2 ที่ก่อให้เกิดโรคทางเดินหายใจเฉียบพลันรุนแรง ( SARS-CoV-2 ) คือไวรัสที่แม้จะคล้ายกับสายพันธุ์ดั้งเดิม แต่มีการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่มีนัยสำคัญมากพอที่จะทำให้นักไวรัสวิทยาเรียกพวกมันแยกกัน SARS-CoV-2 เป็นไวรัสที่ก่อให้เกิดโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 (COVID-19) บางสายพันธุ์ได้รับการระบุว่ามีความสำคัญเป็นพิเศษ เนื่องจากมีศักยภาพในการแพร่กระจายที่เพิ่มขึ้น^{[ 1 ]}ความรุนแรงที่เพิ่มขึ้น หรือประสิทธิภาพของวัคซีนที่ลดลง^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}สายพันธุ์เหล่านี้มีส่วนทำให้ SARS-CoV-2 ยังคงแพร่กระจายต่อไป

ณ วันที่ 25 มิถุนายน2568 ตัวแปรที่น่าสนใจตามที่องค์การอนามัยโลก กำหนด คือ JN.1 และตัวแปรที่อยู่ภายใต้การเฝ้าระวังคือ KP.3, KP.3.1.1, JN.1.18, LP.8.1, NB.1.8.1, XEC และ XFG ^{[ 4 ]}

ภาพรวม

ยังไม่สามารถระบุที่มาของ SARS-CoV-2 ได้^{[ 5 ]}อย่างไรก็ตาม การเกิดขึ้นของ SARS-CoV-2 อาจเป็นผลมาจากเหตุการณ์การรวมตัวกันใหม่ระหว่าง ไวรัสโคโรนาที่คล้ายกับ SARS ใน ค้างคาวและ ไวรัสโคโรนา ในตัว นิ่ม ผ่านการแพร่กระจายข้ามสายพันธุ์^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}จีโนมไวรัส SARS-CoV-2 ที่เก่าแก่ที่สุดที่มีอยู่ถูกรวบรวมจากผู้ป่วยในเดือนธันวาคม 2019 และนักวิจัยชาวจีนได้เปรียบเทียบจีโนมในช่วงแรกเหล่านี้กับสายพันธุ์ไวรัสโคโรนาในค้างคาวและตัวนิ่มเพื่อประเมินชนิดของไวรัสโคโรนาในมนุษย์ที่เป็นบรรพบุรุษ โดยจีโนมที่เป็นบรรพบุรุษที่ระบุได้นั้นถูกตั้งชื่อว่า "S" และจีโนมที่ได้มาซึ่งเด่นกว่านั้นถูกตั้งชื่อว่า "L" เพื่อสะท้อนถึงการเปลี่ยนแปลงของกรดอะมิโนที่กลายพันธุ์ ในขณะเดียวกัน นักวิจัยชาวตะวันตกได้ทำการวิเคราะห์ที่คล้ายกัน แต่ตั้งชื่อจีโนมที่เป็นบรรพบุรุษว่า "A" และจีโนมที่ได้มาว่า "B" ไวรัสชนิด B กลายพันธุ์เป็นชนิดอื่นๆ รวมถึง B.1 ซึ่งเป็นบรรพบุรุษของสายพันธุ์หลักทั่วโลกที่น่าเป็นห่วง ซึ่งองค์การอนามัยโลกได้กำหนดชื่อไว้ในปี 2021 ว่าเป็นสายพันธุ์อัลฟาเบต้าแกมมาเดลต้าและโอ ไมครอน^[⁸^]^[⁹^]^[¹⁰^]

ในช่วงเริ่มต้นของการระบาด จำนวนผู้ติดเชื้อที่ค่อนข้างต่ำ (เมื่อเทียบกับช่วงหลังของการระบาด) ส่งผลให้มีโอกาสน้อยลงสำหรับการกลายพันธุ์ของจีโนมไวรัส และด้วยเหตุนี้จึงมีโอกาสน้อยลงสำหรับการเกิดสายพันธุ์ที่แตกต่างกัน^{[ 11 ]}เนื่องจากการเกิดสายพันธุ์นั้นหายาก การสังเกตการกลายพันธุ์ของโปรตีน S ในบริเวณโดเมนที่จับกับตัวรับ (RBD) ที่ทำปฏิกิริยากับ ACE2 จึงไม่บ่อยนัก^{[ 12 ]}

เมื่อเวลาผ่านไป วิวัฒนาการของจีโนมของ SARS-CoV-2 (โดยการกลายพันธุ์แบบสุ่ม) นำไปสู่ตัวอย่างไวรัสกลายพันธุ์ (เช่น สายพันธุ์ทางพันธุกรรม) ซึ่งพบว่าแพร่กระจายได้ง่ายกว่า และได้รับการคัดเลือกตามธรรมชาติ ที่น่าสังเกตคือ ทั้งสายพันธุ์อัลฟาและเดลต้าพบว่าแพร่กระจายได้ง่ายกว่าสายพันธุ์ไวรัสที่ระบุไว้ก่อนหน้านี้^{[ 13 ]}

สายพันธุ์ SARS-CoV-2 บางสายพันธุ์ถือว่าน่าเป็นห่วง เนื่องจากยังคงรักษา (หรือแม้แต่เพิ่ม) ความสามารถในการจำลองตัวเองได้แม้ว่าภูมิคุ้มกันของประชากรจะเพิ่มขึ้น^{[ 14 ]}ไม่ว่าจะโดยการฟื้นตัวจากการติดเชื้อหรือผ่านการฉีดวัคซีน สายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงบางสายพันธุ์แสดงให้เห็นการกลายพันธุ์ใน RBD ของโปรตีน S ^{[ 15 ]}

คำจำกัดความ

คำว่า " ตัวแปรที่น่าเป็นห่วง " ( VOC ) สำหรับSARS-CoV-2ซึ่งเป็นสาเหตุของCOVID-19เป็นหมวดหมู่ที่ใช้สำหรับตัวแปรของไวรัสที่การกลายพันธุ์ใน โดเมนการจับตัวรับ โปรตีนหนาม (RBD) ทำให้ความสามารถในการจับตัวเพิ่มขึ้นอย่างมาก (เช่น N501Y) ในคอมเพล็กซ์ RBD-hACE2 (ข้อมูลทางพันธุกรรม) ในขณะเดียวกันก็เชื่อมโยงกับการแพร่กระจายอย่างรวดเร็วในประชากรมนุษย์ (ข้อมูลทางระบาดวิทยา) ^{[ 16 ]}

ก่อนที่จะถูกจัดสรรให้กับหมวดหมู่นี้ ตัวแปรที่เกิดขึ้นใหม่อาจถูกระบุว่าเป็นตัวแปรที่น่าสนใจ ( VOI ) ^{[ 17 ]}หรือในบางประเทศเป็นตัวแปรที่อยู่ระหว่างการตรวจสอบ ( VUI ) ^{[ 18 ]}ในระหว่างหรือหลังจากการประเมินอย่างเต็มรูปแบบว่าเป็นตัวแปรที่น่าเป็นห่วง ตัวแปรนี้มักจะถูกกำหนดให้กับสายพันธุ์ในระบบการตั้งชื่อPango ^{[ 19 ]}และให้กับกลุ่มในระบบNextstrain ^{[ 20 ]}และGISAID ^{[ 21 ]}

ในอดีต องค์การอนามัยโลกได้จัดทำรายการอัปเดตเกี่ยวกับสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง (VOC) เป็นประจำ ซึ่งเป็นสายพันธุ์ที่มีอัตราการแพร่เชื้อ ความรุนแรง หรือความต้านทานต่อมาตรการบรรเทา เช่น วัคซีนเพิ่มขึ้น การส่งสายพันธุ์จากประเทศสมาชิกจะถูกส่งไปยังGISAID จากนั้น จึงดำเนินการตรวจสอบสายพันธุ์ในภาคสนาม^{[ 22 ]}คำจำกัดความที่ปรับปรุงใหม่ ซึ่งเผยแพร่เมื่อวันที่ 4 ตุลาคม 2023 ได้เพิ่มสายพันธุ์ที่น่าสนใจ (VOI) และสายพันธุ์ที่อยู่ภายใต้การเฝ้าระวัง ( VUM ) ลงในคำจำกัดความการทำงานขององค์การอนามัยโลกสำหรับสายพันธุ์ SARS-CoV-2 คำจำกัดความที่ปรับปรุงใหม่ของ VUM รวมถึงการมีข้อได้เปรียบในการเติบโตทางระบาดวิทยาที่น่าสงสัยหรือการแพร่เชื้อในชุมชนในอย่างน้อยสองประเทศในช่วง 2–4 สัปดาห์ ในขณะที่คำจำกัดความของ VOI กำหนดให้ต้องมีการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่ทราบซึ่งเกี่ยวข้องกับความเสี่ยงทางระบาดวิทยาที่มากขึ้น และข้อได้เปรียบในการเติบโตที่ทราบในอย่างน้อยสองภูมิภาคขององค์การอนามัยโลก และการแพร่ระบาดที่เพิ่มขึ้น หรือหลักฐานทางระบาดวิทยาอื่น ๆ ที่ "บ่งชี้ถึงความเสี่ยงที่เกิดขึ้นใหม่ต่อสุขภาพของประชาชนทั่วโลก" VOC ตามคำจำกัดความในเดือนตุลาคม 2023 จะต้องตรงตามคำจำกัดความของ VOIs และตรงตามเกณฑ์อื่นๆ ที่กำหนดความเสี่ยงต่อสุขภาพทั่วโลก ชื่อตัวอักษรกรีกสำหรับตัวแปรต่างๆ ถูกจำกัดไว้เฉพาะ VOC ตั้งแต่เดือนมีนาคม 2023 ^{[ 23 ]}^{[ 24 ]}

องค์กรอื่นๆ เช่นCDCในสหรัฐอเมริกามักจะกำหนดตัวแปรที่น่าเป็นห่วงแตกต่างกันเล็กน้อย ตัวอย่างเช่น CDC ลดระดับความรุนแรงของตัวแปร Delta เมื่อวันที่ 14 เมษายน 2022 ^{[ 25 ]}ในขณะที่ WHO ทำเช่นนั้นเมื่อวันที่ 7 มิถุนายน 2022

ข้อมูล ณ วันที่ 15 มีนาคม2566 [ ²⁶^]องค์การอนามัยโลก (WHO) นิยาม VOI ว่าเป็นสายพันธุ์ "ที่มีการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่คาดการณ์หรือทราบว่ามีผลต่อลักษณะของไวรัส เช่น การแพร่กระจาย ความรุนแรง การหลบเลี่ยงแอนติบอดี ความไวต่อการรักษา และการตรวจจับได้" และมีการหมุนเวียนมากกว่าสายพันธุ์อื่น ๆ ในภูมิภาคของ WHO มากกว่าหนึ่งภูมิภาคในระดับที่สามารถบ่งชี้ถึงความเสี่ยงต่อสุขภาพของประชาชนทั่วโลกได้^[^{27 ] นอกจาก}นี้ การอัปเดตยังระบุว่า "VOI จะถูกอ้างถึงโดยใช้ระบบการตั้งชื่อทางวิทยาศาสตร์ที่เป็นที่ยอมรับ เช่น ระบบที่ใช้โดย Nextstrain และ Pango" ^{[ 27 ]}

เกณฑ์ความโดดเด่น

โดยทั่วไปไวรัสจะเกิดการกลายพันธุ์เมื่อเวลาผ่านไป ทำให้เกิดสายพันธุ์ใหม่ เมื่อสายพันธุ์ใหม่ปรากฏขึ้นและเติบโตในประชากร ก็สามารถเรียกได้ว่าเป็น "สายพันธุ์ที่เกิดขึ้นใหม่" ในกรณีของ SARS-CoV-2 สายพันธุ์ใหม่มักจะแตกต่างกันเพียงไม่กี่นิวคลีโอไทด์^{[ 14 ]}

ผลที่อาจเกิดขึ้นจากตัวแปรที่เกิดขึ้นใหม่มีดังต่อไปนี้: ^{[ 28 ]}^{[ 29 ]}

การแพร่กระจายที่เพิ่มขึ้น
อัตราการเจ็บป่วยที่เพิ่มขึ้น
อัตราการเสียชีวิตที่เพิ่มขึ้น
ความสามารถในการหลีกเลี่ยงการตรวจจับโดยการทดสอบวินิจฉัยโรค
ความไวต่อ ยา ต้านไวรัส ลดลง (หากและเมื่อมียาเหล่านั้นวางจำหน่าย)
ความไวต่อแอนติบอดีที่ทำให้เป็นกลางลดลง ไม่ว่าจะเป็นแอนติบอดีที่ใช้ในการรักษา (เช่น พลาสมาของผู้ป่วยที่หายดี หรือแอนติบอดีโมโนโคลนอล) หรือแอนติบอดีที่ได้จากการทดลองในห้องปฏิบัติการ
ความสามารถในการหลีกเลี่ยงภูมิคุ้มกันตามธรรมชาติ (เช่น การทำให้เกิดการติดเชื้อซ้ำ)
ความสามารถในการแพร่เชื้อไปยังบุคคลที่ได้รับการฉีดวัคซีนแล้ว
มีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นต่อภาวะบางอย่าง เช่น กลุ่มอาการอักเสบหลายระบบ หรือภาวะลองโควิด
มีความโน้มเอียงเพิ่มขึ้นต่อกลุ่มประชากรหรือกลุ่มทางคลินิกบางกลุ่ม เช่น เด็ก หรือผู้ที่มีระบบภูมิคุ้มกันบกพร่อง

ตัวแปรที่ดูเหมือนจะตรงตามเกณฑ์เหล่านี้อย่างน้อยหนึ่งข้อ อาจถูกจัดเป็น"ตัวแปรที่อยู่ระหว่างการตรวจสอบ"หรือ"ตัวแปรที่น่าสนใจ"จนกว่าจะมีการตรวจสอบและยืนยันคุณสมบัติเหล่านี้ คุณลักษณะหลักของตัวแปรที่น่าสนใจคือ ต้องมีหลักฐานที่แสดงให้เห็นว่าเป็นสาเหตุของการเพิ่มขึ้นของสัดส่วนผู้ป่วยหรือกลุ่มการระบาดที่ไม่ซ้ำกัน อย่างไรก็ตาม ตัวแปรนั้นจะต้องมีการแพร่กระจายหรือการขยายตัวในระดับประเทศอย่างจำกัด มิฉะนั้นการจัดประเภทจะถูกยกระดับเป็น " ตัวแปรที่น่าเป็นห่วง " ^{[ 30 ]}^{[ 31 ]}หากมีหลักฐานที่ชัดเจนว่าประสิทธิภาพของมาตรการป้องกันหรือการแทรกแซงสำหรับตัวแปรใดตัวแปรหนึ่งลดลงอย่างมาก ตัวแปรนั้นจะถูกเรียกว่า "ตัวแปรที่มีผลกระทบรุนแรง" ^{[ 25 ]}

การตั้งชื่อ

ชื่อเรียกที่สอดคล้องกับ SARS-CoV-2 ^{[ 32 ]}
สายพันธุ์ PANGO ^{[ 19 ]}	หมายเหตุถึงสายตระกูล PANGO ^{[ 33 ]}	กลุ่มสายพันธุ์ถัดไป^{[ 34 ]} 2021 ^{[ 20 ]}	กลุ่มสายพันธุ์GISAID	รูปแบบที่น่าสนใจ
A.1–A.6		19บี	เอส	ประกอบด้วย "ลำดับอ้างอิง" WIV04/2019 ^{[ 35 ]}
B.3–B.7 , B.9 , B.10 , B.13–B.16		19A	แอล
B.3–B.7 , B.9 , B.10 , B.13–B.16			โอ^[ก]
บี.2			วี
บี.1	B.1.5–B.1.72	20เอ	จี	สายพันธุ์ B.1 ในระบบการตั้งชื่อสายพันธุ์ PANGO; รวมถึงDelta/ B.1.617 ^{[ 36 ]}^{[ 37 ]}
	B.1.9 , B.1.13 , B.1.22 , B.1.26 , B.1.37	20เอ	จีเอช
	B.1.3–B.1.66	20 องศาเซลเซียส		รวมถึงEpsilon/ B.1.427/ B.1.429/ CAL.20CและEta/ B.1.525 ^{[ 25 ]}^{[ 38 ]}
		20 กรัม		แพร่หลายในสหรัฐอเมริกาโดยทั่วไป กุมภาพันธ์ 2021 ^{[ 38 ]}
		20 ชั่วโมง		รวมถึงBeta/ B.1.351 หรือที่รู้จักกันในชื่อ 20H/501Y.V2 หรือ 501.V2 lineage

	B.1.1	20บี	จีอาร์	รวมถึงB.1.1.207 ^{[ 39 ]}และLambda (สายเลือด C.37) ^{[ 40 ]}
		20D
		20 จูล		รวมถึงแกมมา/ P.1และซีตา/ P.2 ^{[ 41 ]}^{[ 42 ]}
		20 องศาฟาเรนไฮต์
		20I		รวมถึงAlpha/ B.1.1.7 หรือที่รู้จักกันในชื่อ VOC-202012/01, VOC-20DEC-01 หรือ 20I/501Y.V1
บี.1.177	20E (EU1) ^{[ 20 ]}	GV ^{[ a ]}	มาจาก 20A ^{[ 20 ]}

สายพันธุ์ของ SARS-CoV-2 ถูกจัดกลุ่มตามสายพันธุ์และการกลายพันธุ์ของส่วนประกอบ^{[ 14 ]}หลายองค์กร รวมถึงรัฐบาลและสำนักข่าว อ้างถึงสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงโดยใช้ชื่อประเทศที่พบเป็นครั้งแรก^{[ 43 ]}^{[ 44 ]}^{[ 45 ]}หลังจากหารือกันเป็นเวลาหลายเดือนองค์การอนามัยโลกได้ประกาศ ชื่อ ตัวอักษรกรีกสำหรับสายพันธุ์ที่สำคัญเมื่อวันที่ 31 พฤษภาคม 2021 ^{[ 46 ]}เพื่อให้สามารถอ้างถึงได้ง่าย เข้าใจง่าย และไม่สร้างความอับอาย^{[ 47 ]}^{[ 48 ]}การตัดสินใจนี้อาจเกิดขึ้นบางส่วนเนื่องจากการวิพากษ์วิจารณ์จากรัฐบาลเกี่ยวกับการใช้ชื่อประเทศในการอ้างถึงสายพันธุ์ของไวรัส องค์การอนามัยโลกกล่าวถึงความเป็นไปได้ที่การกล่าวถึงชื่อประเทศจะก่อให้เกิดความอับอาย^{[ 49 ]}หลังจากใช้ตัวอักษรทั้งหมดตั้งแต่ Alpha ถึง Mu (ดูด้านล่าง) ในเดือนพฤศจิกายน 2021 องค์การอนามัยโลกได้ข้ามตัวอักษรกรีกสองตัวถัดไป คือ Nu และ Xi และใช้ Omicron แทน ทำให้เกิดการคาดการณ์ว่าการข้าม Xi ไปนั้นเพื่อหลีกเลี่ยงการทำให้ผู้นำจีน Xi Jinpingขุ่นเคือง^{[ 50 ]}องค์การอนามัยโลกให้คำอธิบายว่า Nu นั้นสับสนกับคำว่า "ใหม่" ได้ง่ายเกินไป และเพื่อหลีกเลี่ยง "การทำให้ขุ่นเคือง" เนื่องจาก " Xi เป็นนามสกุลทั่วไป " (นามสกุลจีนจริงๆ แล้วเป็นชื่อแรก) ^{[ 50 ]}^{ในกรณีที่องค์การอนามัยโลกใช้ตัวอักษรกรีกทั้งหมด หน่วยงานได้พิจารณา ที่}จะตั้งชื่อรุ่นในอนาคตตามกลุ่มดาว [ ^{51 ]}

สายพันธุ์และกลุ่ม

แม้ว่าจะมี SARS-CoV-2 หลายพันสายพันธุ์^{[ 52 ]}แต่สายพันธุ์ย่อยของไวรัสสามารถจัดอยู่ในกลุ่มที่ใหญ่กว่า เช่น สายพันธุ์หรือกลุ่มย่อย [ ^{b ] มี} การเสนอ ระบบการตั้งชื่อหลักสามระบบที่ใช้กันโดยทั่วไป^{[ 53 ]}ดังนี้:

ข้อมูล ณ เดือนมกราคมพ.ศ. 2564 GISAID —โดยอ้างถึง SARS-CoV-2 ว่าเป็น hCoV-19 ^{[ 33 ]} —ได้ระบุกลุ่มสายพันธุ์ทั่วโลกแปดกลุ่ม (S, O, L, V, G, GH, GR และ GV) ^{[ 54 ]}
ในปี 2017 Hadfield และคณะได้ประกาศNextstrainซึ่งมีจุดประสงค์ "เพื่อติดตามวิวัฒนาการของเชื้อโรคแบบเรียลไทม์" ^{[ 55 ]}ต่อมา Nextstrain ได้ถูกนำมาใช้ในการติดตาม SARS-CoV-2 โดยระบุกลุ่มสายพันธุ์หลัก 13 กลุ่ม^{[ c ]} (19A–B, 20A–20J และ 21A) ณ เดือนมิถุนายน2021 [ ⁵⁶^]
ในปี 2020 Rambaut และคณะจาก ทีมซอฟต์แวร์ Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (PANGOLIN) ^{[ 57 ]}ได้เสนอในบทความ^{[ 19 ]} "ระบบการตั้งชื่อแบบไดนามิกสำหรับสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ที่เน้นสายพันธุ์ไวรัสที่หมุนเวียนอยู่และสายพันธุ์ที่แพร่กระจายไปยังสถานที่ใหม่" ^{[ 53 ]}ณ เดือนสิงหาคม2021 มีการกำหนดสายตระกูลจำนวน 1340 สาย^{[ 58 ]}^{[ 59 ]}

สถาบันสาธารณสุขแห่งชาติอาจสร้างระบบการตั้งชื่อของตนเองเพื่อวัตถุประสงค์ในการติดตามตัวแปรเฉพาะ ตัวอย่างเช่นPublic Health Englandกำหนดตัวแปรที่ติดตามแต่ละตัวตามปี เดือน และหมายเลขในรูปแบบ [YYYY] [MM]/[NN] (โดยที่ YYYY คือปี MM คือเดือน และ NN คือหมายเลขลำดับภายในเดือน) โดยมีคำนำหน้า 'VUI' หรือ 'VOC' สำหรับตัวแปรที่อยู่ระหว่างการตรวจสอบหรือตัวแปรที่น่าเป็นห่วงตามลำดับ^{[ 30 ]}ระบบนี้ได้รับการแก้ไขและปัจจุบันใช้รูปแบบ [YY] [MMM]-[NN] โดยที่เดือนจะเขียนด้วยรหัสสามตัวอักษร^{[ 30 ]}

ลำดับอ้างอิง

เนื่องจากปัจจุบันยังไม่ทราบแน่ชัดว่าผู้ป่วยรายแรกหรือ "ผู้ป่วยศูนย์" เกิดขึ้นเมื่อใด การเลือกซีเควนซ์อ้างอิงสำหรับการศึกษาใดๆ จึงค่อนข้างเป็นไปตามอำเภอใจ โดยการศึกษาทางวิจัยที่สำคัญต่างๆ มีการเลือกซีเควนซ์อ้างอิงที่แตกต่างกันดังนี้:

ลำดับแรกสุดWuhan-1ได้รับการเก็บรวบรวมเมื่อวันที่ 24 ธันวาคม พ.ศ. 2562 ^{[ 60 ]}
กลุ่มหนึ่ง (Sudhir Kumar et al.) ^{[ 60 ]}อ้างอิงถึงจีโนมอ้างอิง NCBI อย่างกว้างขวาง (GenBankID:NC_045512; GISAID ID: EPI_ISL_402125) ^[⁶¹^]ตัวอย่างนี้ถูกเก็บรวบรวมเมื่อวันที่ 26 ธันวาคม 2019 ^[⁶²^]แม้ว่าพวกเขาจะใช้ จีโนมอ้างอิง WIV04 GISAID (ID: EPI_ISL_402124) ^[⁶³^]ในการวิเคราะห์ของพวกเขา ด้วยก็ตาม ^[⁶⁴^]
ตามแหล่งข้อมูลอื่น (Zhukova et al.) ลำดับWIV04/2019ซึ่งอยู่ในกลุ่มGISAID S / สายพันธุ์PANGO A / กลุ่ม Nextstrain 19B ถือว่าสะท้อนลำดับของไวรัสดั้งเดิมที่ติดเชื้อในมนุษย์ได้ใกล้เคียงที่สุด ซึ่งรู้จักกันในชื่อ "ลำดับศูนย์" ^[³⁵^] WIV04/2019ได้รับตัวอย่างจากผู้ป่วยที่มีอาการเมื่อวันที่ 30 ธันวาคม 2019 และถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลาย (โดยเฉพาะผู้ที่ร่วมมือกับ GISAID) ^[⁶⁵^]เป็นลำดับอ้างอิง^[³⁵^]

สายพันธุ์ที่สุ่มตัวอย่างและระบุครั้งแรกในเมืองอู่ฮั่น ประเทศจีน นักวิจัยถือว่าแตกต่างจากจีโนมต้นกำเนิดด้วยการกลายพันธุ์ 3 ตำแหน่ง^{[ 60 ]}^{[ 66 ]}ต่อมา สายพันธุ์ที่แตกต่างกันหลายสายพันธุ์ของ SARS-CoV-2 ได้วิวัฒนาการขึ้น^{[ 58 ]}

ภาพรวมของสายพันธุ์ทางพันธุกรรมในอดีตที่น่าเป็นห่วงหรืออยู่ภายใต้การเฝ้าระวัง

ตารางต่อไปนี้แสดงข้อมูลและระดับความเสี่ยง สัมพัทธ์ ^{[ 67 ]}สำหรับสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง (VOC) ที่หมุนเวียนอยู่ในปัจจุบัน (ณ ปี 2021) และในอดีต ^{[ d ]}ช่วงเวลาดังกล่าวถือว่ามีความเชื่อมั่นหรือ ระดับ ความน่าเชื่อถือ 95% เว้นแต่จะระบุไว้เป็นอย่างอื่น ณ ปี 2021 การประมาณค่าทั้งหมดเป็นการประมาณเนื่องจากข้อมูลสำหรับการศึกษามีจำกัด สำหรับ Alpha, Beta, Gamma และ Delta ความแม่นยำของการทดสอบ ยังคงไม่เปลี่ยนแปลง [ ⁶⁸^]^[^{73 ]}และ กิจกรรม ของแอนติบอดีที่ทำให้เป็นกลางยังคงอยู่โดยแอนติบอดีโมโนโคลนอลบางชนิด^{[ 25 ]}^{[ 74 ]}การทดสอบ PCR ยังคงตรวจพบสายพันธุ์^Omicron^[⁷⁵^]

ตารางแสดงสายพันธุ์ต่างๆ ของไวรัส SARS-CoV-2
การระบุ^{[ 73 ]}			การเกิดขึ้น				การเปลี่ยนแปลงเมื่อเทียบกับสายพันธุ์ที่เคยแพร่ระบาดมาก่อน ณ เวลาและสถานที่ที่เกิดการระบาด				ฤทธิ์ ของแอนติบอดีในการยับยั้ง (หรือประสิทธิภาพ เมื่อมีข้อมูล)
ฉลากWHO	เชื้อสาย ปังโกะ	กลุ่มสายพันธุ์ถัดไป	การระบาดครั้งแรก	ตัวอย่างแรกสุด^{[ 76 ]}	สารประกอบอินทรีย์ระเหยง่ายที่กำหนด	การหมุนเวียนในปัจจุบัน	การกลายพันธุ์ที่น่าสนใจ	ความสามารถในการถ่ายทอด	การเข้ารักษาในโรงพยาบาล	การเสียชีวิต	จากการติดเชื้อตามธรรมชาติ^{[ A ]}	จากการฉีดวัคซีน
เดลต้า	B.1.617 .2	21A	อินเดีย	ตุลาคม 2020	6 พฤษภาคม 2021 ^{[ 77 ]}	เลขที่	L452R, T478K, P681R ^{[ 36 ]}	+97% (76 –117% )^{[ 78 ]}	+85% (39 –147% )เมื่อเทียบกับอัลฟา^{[ D ]}	+137% (50 –230% )^{[ B ]}	การติดเชื้อซ้ำเกิดขึ้น โดยมีอัตราการเกิดน้อยกว่าการติดเชื้อจากการฉีดวัคซีน^{[ E ]}^{[ 81 ]}	การลดประสิทธิภาพสำหรับโรคที่ไม่รุนแรง^{[ 73 ]}^{[ 81 ]}^{[ F ]}
โอไมครอน	บี.1.1.529	21,000 บาท	แอฟริกาใต้	9 พ.ย. 2021 ^{[ 83 ]}	26 พ.ย. 2021 ^{[ 75 ]}	ใช่	P681H, N440K, N501Y, S477N และอื่นๆ อีกมากมาย^{[ 84 ]}	อาจเพิ่มขึ้น^{[ 85 ]}	−57% (59 –61% )เมื่อเทียบกับเดลต้า^{[ 86 ]}	−63% (69 –74% )เมื่อเทียบกับเดลต้า^{[ 86 ]}	อัตราการติดเชื้อซ้ำที่เพิ่มขึ้น^{[ 85 ]}	ประสิทธิภาพในการลดโรคที่มีอาการ ไม่ทราบแน่ชัดสำหรับโรคที่รุนแรง^{[ 85 ]}
อัลฟ่า	บี.1.1.7	20I (V1)	สหราชอาณาจักร	20 ก.ย. 2020 ^{[ 87 ]}	18 ธันวาคม 2020 ^{[ 88 ]}	เลขที่	69–70del, N501Y, P681H ^{[ 28 ]}^{[ 89 ]}	+29% (24 –33% )^{[ 78 ]}^{[ G ]}	+52% (47 –57% )^{[ H ]}^{[ G ]}	+59% (44 –74% )^{[ H ]}^{[ G ]}	การลดลงขั้นต่ำ^{[ 25 ]}	การลดลงขั้นต่ำ^{[ 25 ]}
แกมมา	หน้า 1 (B.1.1.28.1)	20J (V3)	บราซิล	พฤศจิกายน 2020	15 ม.ค. 2021 ^{[ 91 ]}^{[ 92 ]}	เลขที่	K417T, E484K, N501Y ^{[ 28 ]}	+38% (29 –48% )^{[ 78 ]}	อาจเพิ่มขึ้น^{[ 73 ]}	+50% (50% CrI ,20 –90% ) ^{[ I ]}^{[ J ]}	ลดลง^{[ 25 ]}	คงอยู่ในวัคซีนหลายชนิด^{[ K ]}
เบต้า	บี.1.351	20H (V2)	แอฟริกาใต้	พฤษภาคม 2020	14 ม.ค. 2021 ^{[ 93 ]}	เลขที่	K417N, E484K, N501Y ^{[ 28 ]}	+25% (20 –30% )^{[ 78 ]}	เพิ่มขึ้น^{[ 94 ]}	อาจเพิ่มขึ้น^{[ 68 ]}^{[ 73 ]}	แม้จะลดลง แต่ การตอบสนอง ของเซลล์ Tที่เกิดจากไวรัส D614G ยังคงมีประสิทธิภาพ^{[ 25 ]}^{[ 73 ]}	ประสิทธิภาพในการลดโรคที่มีอาการ^{[ L ]}คงไว้ซึ่งการรักษาโรคที่รุนแรง^{[ 73 ]}
ความเสี่ยงสูงมาก ความเสี่ยงสูง ความเสี่ยงปานกลาง ความเสี่ยงต่ำ ความเสี่ยงที่ไม่ทราบแน่ชัด ↑ประสิทธิภาพของการติดเชื้อตามธรรมชาติในการป้องกันการติดเชื้อซ้ำเมื่อมีให้ใช้งาน 1 2 7 กุมภาพันธ์ – 22 มิถุนายน 2021 ออนแทรีโออัตราการเสียชีวิต 0.04% สำหรับกลุ่มอายุ <50 ปีที่ไม่ได้รับวัคซีน 6.5% สำหรับกลุ่มอายุ >50 ปีที่ไม่ได้รับวัคซีน^{[ 80 ]} 1 2ความแตกต่างอาจเกิดจากนโยบายและการแทรกแซงที่แตกต่างกันในแต่ละพื้นที่ที่ศึกษาในช่วงเวลาที่ต่างกัน ศักยภาพของระบบสาธารณสุขในท้องถิ่น หรือรูปแบบต่างๆ ที่แพร่หลายในช่วงเวลาและสถานที่ของการศึกษา ↑ 1 เมษายน – 6 มิถุนายน 2021 สกอตแลนด์^{[ 79 ]}การศึกษาเบื้องต้นอีกฉบับในออนแทรีโอพบว่าการเข้ารักษาในโรงพยาบาลโดยเดลต้าเพิ่มขึ้น 120% เมื่อเทียบกับสายพันธุ์ ที่ไม่ใช่ VOC ^{[ B ]}^{[ C ]} ↑การศึกษาในอิสราเอลติดตามผู้ที่หายป่วยแล้วแต่ไม่ได้รับการฉีดวัคซีนจำนวน 46,035 คน และผู้ที่ได้รับการฉีดวัคซีนจำนวน 46,035 คน ที่มีการกระจายอายุใกล้เคียงกัน เพื่อเปรียบเทียบการเกิดการติดเชื้อในช่วงระยะเวลาติดตามผล พบการติดเชื้อ 640 รายในกลุ่มที่ได้รับการฉีดวัคซีน และ 108 รายในกลุ่มที่หายป่วยแล้ว ↑การทำให้เป็นกลางลดลงปานกลางด้วย Covaxin^{[ 82 ]} 1 2 3 B.1.1.7 ที่มี E484K สันนิษฐานว่าแตกต่างจาก B.1.1.7 เฉพาะในด้านกิจกรรมแอนติบอดีที่ทำให้เป็นกลางเท่านั้น^{[ 69 ]} 1 2 23 พฤศจิกายน 2020 – 31 มกราคม 2021 ประเทศอังกฤษ^{[ 90 ]} CFR 0.06% สำหรับกลุ่มอายุ <50 ปี 4.8% สำหรับกลุ่มอายุ >50 ปี^{[ 80 ]} ↑ ช่วง ความเชื่อมั่นหรือช่วงความน่าเชื่อถือที่รายงานมานั้นมีความน่าจะเป็นต่ำ ดังนั้นค่าประมาณจึงสามารถเข้าใจได้เพียงว่าเป็นไปได้ ไม่ใช่แน่นอนหรือมีแนวโน้มสูง ↑มีนาคม 2020 – กุมภาพันธ์ 2021, มาเนาส์^{[ C ]} ↑ยกเว้น Pfizer–BioNTech^{[ 68 ]} ↑อ็อกซ์ฟอร์ด-แอสตราเซเนกา, โนวาแวกซ์

สายพันธุ์ที่เคยแพร่ระบาดและเคยได้รับการตรวจสอบมาก่อน (องค์การอนามัยโลก)

องค์การอนามัยโลกกำหนดนิยามของสายพันธุ์ที่เคยแพร่ระบาดมาก่อนว่าเป็นสายพันธุ์ที่ "ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าไม่ก่อให้เกิดความเสี่ยงเพิ่มเติมที่สำคัญต่อสุขภาพของประชาชนทั่วโลกเมื่อเทียบกับสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ที่แพร่ระบาดอื่นๆ" แต่ควรได้รับการติดตามต่อไป^{[ 95 ]}

เมื่อวันที่ 15 มีนาคม พ.ศ. 2566 องค์การอนามัยโลกได้เผยแพร่ข้อมูลอัปเดตเกี่ยวกับระบบติดตาม VOC โดยประกาศว่า VOC เท่านั้นที่จะได้รับการกำหนดตัวอักษรกรีก^{[ 26 ]}

สารประกอบอินทรีย์ระเหยง่าย (VOC) ที่เคยแพร่ระบาดมาก่อน

สายพันธุ์ที่ระบุไว้ด้านล่างนี้เคยถูกกำหนดให้เป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง แต่ถูกแทนที่ด้วยสายพันธุ์อื่นแล้วณ เดือนพฤษภาคม2565 องค์การอนามัยโลกได้ระบุรายการต่อไปนี้ภายใต้ "สายพันธุ์ที่แพร่ระบาดก่อนหน้านี้ที่น่าเป็นห่วง": ^{[ 95 ]}

อัลฟ่า (สายเลือด B.1.1.7)

ตรวจพบครั้งแรกในเดือนตุลาคม 2020 ระหว่างการระบาดของ COVID-19 ในสหราชอาณาจักรจากตัวอย่างที่เก็บในเดือนก่อนหน้าในเคนต์^{[ 96 ]}สายพันธุ์ B.1.1.7 ^{[ 97 ]} ซึ่งองค์การอนามัยโลก ตั้งชื่อว่าAlpha variantก่อนหน้านี้รู้จักกันในชื่อ Variant Under Investigation ตัวแรกในเดือนธันวาคม 2020 (VUI – 202012/01) ^{[ 98 ]}และต่อมาถูกบันทึกเป็น VOC-202012/01 ^{[ 30 ]}นอกจากนี้ยังรู้จักกันในชื่อ 20I (V1) ^{[ 76 ]} 20I/501Y.V1 ^{[ 99 ]} (เดิมคือ 20B/501Y.V1) ^{[ 28 ]}^{[ 100 ]}^{[ 101 ]}หรือ 501Y.V1 ^{[ 102 ]}ตั้งแต่เดือนตุลาคมถึงธันวาคม 2020 อัตราการแพร่ระบาดเพิ่มขึ้นเป็นสองเท่าทุกๆ 6.5 วัน ซึ่งเป็นช่วงเวลารุ่นที่คาดการณ์ไว้^{[ 103 ]}^{[ 104 ]}มีความสัมพันธ์กับการเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญของอัตราการติดเชื้อ COVID-19 ในสหราชอาณาจักรซึ่งเกี่ยวข้องกับการกลายพันธุ์N501Y บางส่วน ^{[ 103 ]}มีหลักฐานบางอย่างที่แสดงว่าสายพันธุ์นี้มีการแพร่กระจายเพิ่มขึ้น 40–80% (โดยประมาณการส่วนใหญ่จะอยู่ประมาณช่วงกลางถึงปลายช่วงบน) ^{[ 105 ]}^{[ 106 ]}และการวิเคราะห์เบื้องต้นชี้ให้เห็นถึงการเพิ่มขึ้นของอัตราการเสียชีวิต^{[ 107 ]}^{[ 108 ]}แม้ว่างานวิจัยในภายหลังจะไม่พบหลักฐานของการเพิ่มขึ้นของความรุนแรง^{[ 109 ]}ณ เดือนพฤษภาคม 2021 สายพันธุ์อัลฟาถูกตรวจพบในประมาณ 120 ประเทศ^{[ 110 ]}

เมื่อวันที่ 16 มีนาคม 2022 องค์การอนามัยโลกได้ลดระดับความเสี่ยงของสายพันธุ์อัลฟาและสายพันธุ์ย่อยลงเหลือเพียง "สายพันธุ์ที่เคยแพร่ระบาดที่น่าเป็นห่วง" ^{[ 111 ]}^{[ 112 ]}

B.1.1.7 พร้อม E484K

Variant of Concern 21FEB-02 (เดิมเขียนว่าVOC -202102/02) ซึ่งอธิบายโดยPublic Health England (PHE) ว่าเป็น "B.1.1.7 ที่มี E484K" ^{[ 30 ]}มีสายพันธุ์เดียวกันในระบบการตั้งชื่อ Pango แต่มี การกลายพันธุ์ E484K เพิ่มเติม ณ วันที่ 17 มีนาคม 2021 มีผู้ป่วยVOC -21FEB-02 ที่ได้รับการยืนยันแล้ว 39 รายในสหราชอาณาจักร^{[ 30 ]}เมื่อวันที่ 4 มีนาคม 2021 นักวิทยาศาสตร์รายงานB.1.1.7ที่มี การกลายพันธุ์ E484Kในรัฐโอเรกอนในตัวอย่างทดสอบ 13 ตัวอย่างที่วิเคราะห์ พบว่ามีหนึ่งตัวอย่างที่มีการรวมกันนี้ ซึ่งดูเหมือนว่าจะเกิดขึ้นเองตามธรรมชาติและในพื้นที่ มากกว่าที่จะนำเข้าจากที่อื่น^{[ 113 ]}^{[ 114 ]}^{[ 115 ]}ชื่ออื่นสำหรับรูปแบบนี้ ได้แก่ B.1.1.7+E484K ^{[ 116 ]}และ B.1.1.7 สายพันธุ์ที่มี S:E484K ^{[ 117 ]}

เบต้า (สายพันธุ์ B.1.351)

เมื่อวันที่ 18 ธันวาคม พ.ศ. 2563 สายพันธุ์ 501.V2หรือที่รู้จักกันในชื่อ 501.V2, 20H (V2), ^{[ 76 ]} 20H/501Y.V2 ^{[ 99 ]} (เดิมคือ 20C/501Y.V2), 501Y.V2, ^{[ 118 ]} VOC-20DEC-02 (เดิมคือVOC -202012/02) หรือสายพันธุ์ B.1.351, ^{[ 28 ]}ถูกตรวจพบครั้งแรกในแอฟริกาใต้ และได้รับการรายงานโดย กระทรวงสาธารณสุขของประเทศ^{[ 119 ]}องค์การอนามัยโลกได้จัดให้เป็นสายพันธุ์เบต้า นักวิจัยและเจ้าหน้าที่รายงานว่าความชุกของสายพันธุ์นี้สูงกว่าในกลุ่มคนหนุ่มสาวที่ไม่มีภาวะสุขภาพพื้นฐาน และเมื่อเปรียบเทียบกับสายพันธุ์อื่นๆ พบว่าสายพันธุ์นี้มักส่งผลให้เกิดอาการป่วยร้ายแรงในกรณีเหล่านั้นบ่อยกว่า^{[ 120 ]}^{[ 121 ]}กระทรวงสาธารณสุขของแอฟริกาใต้ยังระบุด้วยว่าสายพันธุ์นี้อาจเป็นสาเหตุให้เกิดการระบาดระลอกที่สองของโควิด-19 ในประเทศเนื่องจากสายพันธุ์นี้แพร่กระจายได้เร็วกว่าสายพันธุ์อื่นๆ ก่อนหน้านี้^{[ 119 ]}^{[ 120 ]}

นักวิทยาศาสตร์ตั้งข้อสังเกตว่าสายพันธุ์นี้มีการกลายพันธุ์หลายอย่างที่ทำให้สามารถเกาะติดกับเซลล์มนุษย์ได้ง่ายขึ้นเนื่องจากการกลายพันธุ์สามตำแหน่งต่อไปนี้ในโดเมนการจับกับตัวรับ (RBD) ในไกลโคโปรตีนหนามของไวรัส: N501Y [ ¹¹⁹^]^[¹²²^] K417N และE484K ^[¹²³^]^[¹²⁴^]การกลายพันธุ์ N501Y ยังถูกตรวจพบในสหราชอาณาจักร^ด้วย^[¹¹⁹^]^[¹²⁵^]

เมื่อวันที่ 16 มีนาคม 2022 องค์การอนามัยโลกได้ลดระดับความเสี่ยงของสายพันธุ์เบต้าและสายพันธุ์ย่อยลงเป็น "สายพันธุ์ที่เคยแพร่ระบาดที่น่าเป็นห่วง" ^{[ 111 ]}^{[ 112 ]}

แกมมา (สายเลือด P.1)

สายพันธุ์แกมมาหรือสายพันธุ์ P.1 ซึ่งเรียกว่า Variant of Concern 21JAN-02 ^{[ 30 ]} (เดิมคือ VOC-202101/02) โดย Public Health England ^{[ 30 ]} 20J (V3) ^{[ 76 ]}หรือ 20J/501Y.V3 ^{[ 99 ]}โดยNextstrainหรือเรียกสั้นๆ ว่า 501Y.V3 ^{[ 102 ]}ถูกตรวจพบในโตเกียวเมื่อวันที่ 6 มกราคม 2021 โดยสถาบันโรคติดเชื้อแห่งชาติ (NIID) และองค์การอนามัยโลกได้กำหนดให้เป็นสายพันธุ์แกมมา สายพันธุ์ใหม่นี้ถูกระบุครั้งแรกในคน 4 คนที่เดินทางมาถึงโตเกียวหลังจากเดินทางมาจากรัฐอมาโซนัส ของบราซิล เมื่อวันที่ 2 มกราคม 2021 ^{[ 126 ]}เมื่อวันที่ 12 มกราคม 2021 ศูนย์ Brazil-UK CADDE ได้เก็บถาวรไว้เมื่อวันที่ 22 กรกฎาคม 2020 ที่Wayback Machineและยืนยันกรณีการติดเชื้อสายพันธุ์แกมมาใหม่ 13 รายในป่าฝนอเมซอน^{[ 127 ]}สายพันธุ์ของ SARS-CoV-2 นี้ได้รับการตั้งชื่อว่า lineage P.1 (แม้ว่าจะเป็นลูกหลานของ B.1.1.28 แต่ชื่อ B.1.1.28.1 ^{[ 68 ]}^{[ 128 ]}ไม่ได้รับอนุญาต ดังนั้นชื่อที่ได้จึงเป็น P.1) และมีการเปลี่ยนแปลงกรดอะมิโนที่ไม่ซ้ำกัน 17 ตำแหน่ง โดย 10 ตำแหน่งอยู่ในโปรตีนหนาม รวมถึงการกลายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง 3 ตำแหน่ง ได้แก่N501Y , E484Kและ K417T ^{[ 127 ]}^{[ 128 ]}^{[ 129 ]}^{[ 130 ]}^{:รูปที่ 5}

การกลายพันธุ์ N501Y และ E484K ส่งเสริมการก่อตัวของคอมเพล็กซ์ RBD-hACE2 ที่เสถียร จึงทำให้ความสามารถในการจับกันของ RBD กับ hACE2 เพิ่มขึ้น อย่างไรก็ตาม การกลายพันธุ์ K417T ไม่เอื้อต่อการก่อตัวของคอมเพล็กซ์ระหว่าง RBD และ hACE2 ซึ่งแสดงให้เห็นว่าลดความสามารถในการจับกันลง^{[ 1 ]}

สายพันธุ์ใหม่นี้ไม่พบในตัวอย่างที่เก็บรวบรวมตั้งแต่เดือนมีนาคมถึงพฤศจิกายน 2020 ในเมืองมาเนาส์รัฐอมาโซนาส แต่ตรวจพบใน 42% ของตัวอย่างในเมืองเดียวกันระหว่างวันที่ 15 ถึง 23 ธันวาคม 2020 ตามด้วย 52.2% ระหว่างวันที่ 15–31 ธันวาคม และ 85.4% ระหว่างวันที่ 1–9 มกราคม 2021 ^{[ 127 ]}การศึกษาพบว่าการติดเชื้อแกมมาสามารถสร้างปริมาณไวรัสได้มากกว่าเกือบสิบเท่าเมื่อเทียบกับผู้ที่ติดเชื้อสายพันธุ์อื่น ๆ ที่ระบุในบราซิล (B.1.1.28 หรือ B.1.195) แกมมายังแสดงให้เห็นถึงความสามารถในการแพร่เชื้อที่สูงกว่า 2.2 เท่า โดยมีความสามารถในการติดเชื้อทั้งในผู้ใหญ่และผู้สูงอายุเท่ากัน ซึ่งบ่งชี้ว่าสายพันธุ์ P.1 และ P.1-like ประสบความสำเร็จในการติดเชื้อในมนุษย์ที่อายุน้อยกว่าได้ดีกว่าโดยไม่คำนึงถึงเพศ^{[ 131 ]}

จากการศึกษาตัวอย่างที่เก็บรวบรวมในเมืองมาเนาส์ระหว่างเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2563 ถึงมกราคม พ.ศ. 2564 พบว่าสายพันธุ์แกมมาสามารถแพร่เชื้อได้มากกว่า 1.4–2.2 เท่า และสามารถหลบเลี่ยงภูมิคุ้มกันที่ได้รับสืบทอดมาจากโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ก่อนหน้าได้ถึง 25–61% ซึ่งนำไปสู่ความเป็นไปได้ของการติดเชื้อซ้ำหลังจากหายจากโรคโควิด-19 แล้ว สำหรับอัตราการเสียชีวิต พบว่าการติดเชื้อสายพันธุ์แกมมามีความรุนแรงกว่า 10–80% ^{[ 132 ]}^{[ 133 ]}^{[ 134 ]}

การศึกษาพบว่าผู้ที่ได้รับการฉีดวัคซีนครบถ้วนจากPfizerหรือModernaมี ผล การทำให้เป็นกลางต่อไวรัสแกมมาลดลงอย่างมีนัยสำคัญ แม้ว่าผลกระทบที่แท้จริงต่อการดำเนินของโรคจะยังไม่แน่นอนก็ตาม การศึกษาฉบับร่างที่เผยแพร่โดยมูลนิธิ Oswaldo Cruz ในช่วงต้นเดือนเมษายนพบว่าประสิทธิภาพในโลกแห่งความเป็นจริงของผู้ที่ได้รับ วัคซีน CoronavacของSinovac ในเข็มแรก มีอัตราประสิทธิภาพประมาณ 50% พวกเขาคาดว่าประสิทธิภาพจะสูงขึ้นหลังจากได้รับเข็มที่ 2 ณ เดือนกรกฎาคม 2021 การศึกษายังคงดำเนินต่อไป^[¹³⁵^]

ข้อมูลเบื้องต้นจากการศึกษาสองฉบับระบุว่าวัคซีน Oxford–AstraZenecaมีประสิทธิภาพต่อสายพันธุ์แกมมา แม้ว่าระดับประสิทธิภาพที่แน่นอนจะยังไม่ได้รับการเปิดเผยก็ตาม^{[ 136 ]}^{[ 137 ]}ข้อมูลเบื้องต้นจากการศึกษาที่ดำเนินการโดยInstituto Butantanชี้ให้เห็นว่าCoronaVacมีประสิทธิภาพต่อสายพันธุ์แกมมาเช่นกัน และ ณ เดือนกรกฎาคม 2021 ยังไม่ได้ขยายผลเพื่อให้ได้ข้อมูลที่แน่ชัด^{[ 138 ]}

เมื่อวันที่ 16 มีนาคม 2022 องค์การอนามัยโลกได้ลดระดับความเสี่ยงของสายพันธุ์แกมมาและสายพันธุ์ย่อยลงเหลือเพียง "สายพันธุ์ที่เคยแพร่ระบาดและน่าเป็นห่วง" ^{[ 111 ]}^{[ 112 ]}

เดลต้า (สายเลือด B.1.617.2)

สายพันธุ์เดลต้า หรือที่รู้จักกันในชื่อ B.1.617.2, G/452R.V3, 21A ^{[ 76 ]}หรือ 21A/S:478K ^{[ 99 ]}เป็นสายพันธุ์ที่แพร่หลายไปทั่วโลกและแพร่กระจายไปยังอย่างน้อย 185 ประเทศ^{[ 139 ]}สายพันธุ์นี้ถูกค้นพบครั้งแรกในอินเดียสืบเชื้อสายมาจากสายพันธุ์ B.1.617 ซึ่งรวมถึงสายพันธุ์แคปปาที่กำลังอยู่ระหว่างการตรวจสอบด้วย โดยถูกค้นพบครั้งแรกในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2563 และได้แพร่กระจายไปทั่วโลกตั้งแต่นั้นเป็นต้นมา^{[ 140 ]}^{[ 141 ]}^{[ 142 ]}^{[ 143 ]}^{[ 144 ]}เมื่อวันที่ 6 พฤษภาคม 2021 นักวิทยาศาสตร์ชาวอังกฤษประกาศให้ B.1.617.2 (ซึ่งขาดการกลายพันธุ์ที่ E484Q อย่างเห็นได้ชัด) เป็น "สายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง" โดยตั้งชื่อว่า VOC-21APR-02 หลังจากที่พวกเขาพบหลักฐานว่ามันแพร่กระจายได้เร็วกว่าไวรัสเวอร์ชันดั้งเดิม และอาจแพร่กระจายได้เร็วกว่าหรือเร็วเท่ากับ Alpha ^{[ 145 ]}^{[ 69 ]}^{[ 146 ]}^{[ 147 ]}มันมีการกลายพันธุ์ L452R และ P681R ใน Spike; ^{[ 36 ]}ซึ่งแตกต่างจาก Kappa ตรงที่มันมีการกลายพันธุ์ T478K แต่ไม่มี E484Q

เมื่อวันที่ 3 มิถุนายน 2021 หน่วยงานสาธารณสุขแห่งอังกฤษรายงานว่า ผู้เสียชีวิต 12 รายจากเชื้อไวรัสสายพันธุ์เดลต้าในอังกฤษ เป็นผู้ที่ได้รับการฉีดวัคซีนครบถ้วนแล้ว และเชื้อไวรัสสายพันธุ์นี้แพร่กระจายเร็วกว่าสายพันธุ์อัลฟ่าเกือบสองเท่า^{[ 148 ]}นอกจากนี้ เมื่อวันที่ 11 มิถุนายน ศูนย์การแพทย์ฟุตฮิลส์ในเมืองคาลการี ประเทศแคนาดา รายงานว่า ครึ่งหนึ่งของผู้ป่วย 22 รายที่ติดเชื้อไวรัสสายพันธุ์เดลต้า เป็นผู้ที่ได้รับการฉีดวัคซีนครบถ้วนแล้ว^{[ 149 ]}

ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2564 มีรายงานเริ่มปรากฏขึ้นเกี่ยวกับสายพันธุ์ Delta ที่มีการกลายพันธุ์ K417N ^{[ 150 ]}การกลายพันธุ์นี้พบได้ในสายพันธุ์ Beta และ Gamma เช่นกัน ทำให้เกิดความกังวลเกี่ยวกับความเป็นไปได้ที่วัคซีนและการรักษาด้วยแอนติบอดีจะมีประสิทธิภาพลดลง และมีความเสี่ยงต่อการติดเชื้อซ้ำเพิ่มขึ้น^{[ 151 ]}สายพันธุ์นี้เรียกว่า "Delta with K417N" โดย Public Health England ซึ่งประกอบด้วยสองกลุ่มย่อยที่สอดคล้องกับสายพันธุ์ Pango AY.1 และ AY.2 ^{[ 152 ]}และได้รับชื่อเล่นว่า "Delta plus" ^{[ 153 ]}จาก "Delta plus K417N" ^{[ 154 ]}ชื่อของการกลายพันธุ์ K417N หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่ไลซีน (K) ถูกแทนที่ด้วยแอสปาราจีน (N) ที่ตำแหน่ง 417 ^{[ 155 ]} เมื่อวันที่ 22 มิถุนายน กระทรวงสาธารณสุขและสวัสดิการครอบครัวของอินเดียประกาศว่าสายพันธุ์ "เดลต้าพลัส" ของ COVID-19 เป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง หลังจากมีรายงานผู้ป่วยสายพันธุ์นี้ 22 รายในอินเดีย^{[ 156 ]}หลังจากการประกาศ นักไวรัสวิทยาชั้นนำกล่าวว่ามีข้อมูลไม่เพียงพอที่จะสนับสนุนการติดฉลากสายพันธุ์นี้ว่าเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงที่แตกต่าง โดยชี้ให้เห็นถึงจำนวนผู้ป่วยที่ศึกษาจำนวนน้อย^{[ 157 ]}ในสหราชอาณาจักรในเดือนกรกฎาคม 2021 มีการระบุ AY.4.2 นอกเหนือจากที่กล่าวถึงก่อนหน้านี้แล้ว ยังได้รับชื่อเล่นว่า 'เดลต้าพลัส' เนื่องจากมีการกลายพันธุ์เพิ่มเติม Y145H และ A222V การกลายพันธุ์เหล่านี้ไม่ได้มีเฉพาะในสายพันธุ์นี้ แต่ทำให้แตกต่างจากสายพันธุ์เดลต้าดั้งเดิม^{[ 158 ]}

เมื่อวันที่ 7 มิถุนายน 2022 องค์การอนามัยโลกได้ลดระดับสายพันธุ์เดลต้าและสายพันธุ์ย่อยลงเป็น "สายพันธุ์ที่เคยแพร่ระบาดที่น่าเป็นห่วง" ^{[ 112 ]}^{[ 159 ]}

ตัวแปรที่น่าสนใจ (VOI) ที่เคยมีการหมุนเวียนมาก่อน

เชื้อสายปังโก	กลุ่ม GISAID	กลุ่มสายพันธุ์ถัดไป	ตัวอย่างแรกสุด	วันที่ของ VOI	วันที่กำหนด	หมายเหตุ
หน้า 2	GR/484K.V2	20B/S.484K	2020-04	2021-07-06	17 สิงหาคม 2021	ตัวแปรซีต้า
หน้า 3	GR/1092K.V1	21E	2021-01	2021-07-06	17 สิงหาคม 2021	ตัวแปรเธต้า
บี.1.427 บี.1.429	GH/452R.V1	21C	2020-03	2021-07-06	9 พฤศจิกายน 2021	ตัวแปรเอปซิลอน
B.1.617.1	จี/452อาร์.วี3	21บี	2020-10		2021-09-20	ตัวแปรแคปปา
บี.1.526	GH/253G.V1	21F	2020-11		2021-09-20	ตัวแปรไอโอตา
บี.1.525	จี/484เค.วี3	21D	2020-12		2021-09-20	ตัวแปรอีตา
ซี.37	GR/452Q.V1	21 กรัม	2020-12	14 มิถุนายน 2021	9 มีนาคม 2022	ตัวแปรแลมบ์ดา
บี.1.621	จีเอช	21 น.	2021-01	30 สิงหาคม 2021	9 มีนาคม 2022	ตัวแปรมิว

เอปซิลอน (สายพันธุ์ B.1.429, B.1.427, CAL.20C)

สายพันธุ์ Epsilon หรือสายพันธุ์ B.1.429 หรือที่รู้จักกันในชื่อ CAL.20C ^{[ 160 ]}หรือ CA VUI1, ^{[ 161 ]} 21C ^{[ 76 ]}หรือ 20C/S:452R, ^{[ 99 ]}ถูกกำหนดโดยการกลายพันธุ์ที่แตกต่างกันห้าแบบ (I4205V และ D1183Y ใน ยีน ORF1abและ S13I, W152C, L452R ในยีน S ของโปรตีนหนาม) ซึ่ง L452R (ซึ่งก่อนหน้านี้ตรวจพบในสายพันธุ์อื่นที่ไม่เกี่ยวข้อง) เป็นสิ่งที่น่ากังวลเป็นพิเศษ^{[ 38 ]}^{[ 162 ]}ตั้งแต่วันที่ 17 มีนาคมถึง 29 มิถุนายน 2021 CDC ได้ระบุ B.1.429 และ B.1.427 ที่เกี่ยวข้องว่าเป็น "สายพันธุ์ที่น่ากังวล" ^{[ 36 ]}^{[ 163 ]}^{[ 164 ]}^{[ 165 ]}ณ เดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2564 Epsilon ไม่ถือเป็นสายพันธุ์ที่น่าสนใจของ WHO อีกต่อไป^{[ 24 ]}เนื่องจากถูก Alpha แซงหน้าไปแล้ว^{[ 166 ]}

ตั้งแต่เดือนกันยายน พ.ศ. 2563 ถึงมกราคม พ.ศ. 2564 พบว่ามีการแพร่กระจายมากกว่าสายพันธุ์ก่อนหน้าในแคลิฟอร์เนีย 19% ถึง 24% การทำให้เป็นกลางโดยแอนติบอดีจากการติดเชื้อตามธรรมชาติและการฉีดวัคซีนลดลงในระดับปานกลาง^{[ 167 ]}แต่ยังคงตรวจพบได้ในการทดสอบวินิจฉัยส่วนใหญ่^{[ 168 ]}

ไวรัสสายพันธุ์ Epsilon (CAL.20C) ถูกตรวจพบครั้งแรกในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2563 โดยนักวิจัยที่ศูนย์การแพทย์ Cedars-Sinaiรัฐแคลิฟอร์เนียในตัวอย่างไวรัส 1 ใน 1,230 ตัวอย่างที่เก็บรวบรวมในเขตลอสแอนเจลิสตั้งแต่เริ่มการระบาดของ COVID - 19 ^{[ 169 ]}ไม่พบการตรวจพบอีกจนกระทั่งเดือนกันยายน เมื่อไวรัสสายพันธุ์นี้ปรากฏขึ้นอีกครั้งในตัวอย่างในรัฐแคลิฟอร์เนีย แต่จำนวนยังคงต่ำมากจนถึงเดือนพฤศจิกายน^{[ 170 ]}^{[ 171 ]}ในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2563 ไวรัสสายพันธุ์ Epsilon คิดเป็น 36 เปอร์เซ็นต์ของตัวอย่างที่เก็บรวบรวมที่ศูนย์การแพทย์ Cedars-Sinai และในเดือนมกราคม พ.ศ. 2564 ไวรัสสายพันธุ์ Epsilon คิดเป็น 50 เปอร์เซ็นต์ของตัวอย่าง^{[ 162 ]}ในข่าวประชาสัมพันธ์ร่วมของมหาวิทยาลัยแคลิฟอร์เนีย ซานฟรานซิสโกกรมสาธารณสุขแคลิฟอร์เนียและกรมสาธารณสุขเขตซานตาคลารา [ ^{172 ] ไวรัส}สายพันธุ์นี้ยังถูกตรวจพบในหลายเขตในแคลิฟอร์เนียตอนเหนือด้วย ตั้งแต่เดือนพฤศจิกายนถึงธันวาคม 2020 ความถี่ของตัวแปรในกรณีที่มีการจัดลำดับจากแคลิฟอร์เนียตอนเหนือเพิ่มขึ้นจาก 3% เป็น 25% ^{[ 173 ]}ในเอกสารก่อนตีพิมพ์ CAL.20C ถูกอธิบายว่าอยู่ในกลุ่ม 20C และมีส่วนร่วมประมาณ 36% ของตัวอย่าง ในขณะที่ตัวแปรที่เกิดขึ้นใหม่จากกลุ่ม 20G คิดเป็นประมาณ 24% ของตัวอย่างในการศึกษาที่มุ่งเน้นไปที่แคลิฟอร์เนียตอนใต้ อย่างไรก็ตาม โปรดทราบว่าในสหรัฐอเมริกาโดยรวม กลุ่ม 20G เป็นกลุ่มที่เด่นกว่า ณ เดือนมกราคม 2021 ^{[ 38 ]}หลังจากจำนวน Epsilon ที่เพิ่มขึ้นในแคลิฟอร์เนีย ตัวแปรนี้ได้รับการตรวจพบในความถี่ที่แตกต่างกันในรัฐส่วนใหญ่ของสหรัฐอเมริกา ตรวจพบจำนวนเล็กน้อยในประเทศอื่น ๆ ในอเมริกาเหนือ และในยุโรป เอเชีย และออสเตรเลีย^{[ 170 ]}^{[ 171 ]} หลังจากเพิ่มขึ้นในช่วงแรก ความถี่ของมันก็ลดลงอย่างรวดเร็วตั้งแต่เดือนกุมภาพันธ์ 2021 เนื่องจากถูก Alphaที่แพร่กระจายได้ง่ายกว่าแย่งชิง พื้นที่ ในเดือนเมษายน ไวรัสเอปซิลอนยังคงพบได้ค่อนข้างบ่อยในบางส่วนของแคลิฟอร์เนียตอนเหนือ แต่แทบจะหายไปจากทางใต้ของรัฐและไม่เคยสามารถตั้งหลักปักฐานที่อื่นได้เลย มีเพียง 3.2% ของผู้ป่วยทั้งหมดในสหรัฐอเมริกาที่เป็นไวรัสเอปซิลอน ในขณะที่มากกว่าสองในสามเป็นไวรัสอัลฟา^{[ 166 ]}

ซีต้า (สายเลือด P.2)

ภายใต้แผนการตั้งชื่อแบบง่ายที่เสนอโดยองค์การอนามัยโลก P.2 ได้รับการติดป้ายว่า "ตัวแปรซีตา" และถือว่าเป็นตัวแปรที่น่าสนใจ (VOI) แต่ไม่ใช่ตัวแปรที่น่าเป็นห่วง [ ^{174 ] คลื่น}ลูกที่สองเกิดขึ้นก่อนในเดือนพฤศจิกายน 2020 โดยมีการเพิ่มขึ้นของความชุกของตัวแปรซีตาในลำดับพันธุกรรมจากรัฐเซาเปาโล ซึ่งถูกฝากไว้ในฐานข้อมูลGISAID ^{[ 175 ]}ณ เดือนกรกฎาคม 2021 องค์การอนามัยโลกไม่ถือว่าซีตาเป็นตัวแปรที่น่าสนใจอีกต่อไป^{[ 176 ]}

เอตา (สายเลือด B.1.525)

สายพันธุ์ Eta หรือสายพันธุ์ B.1.525 หรือที่เรียกว่าVUI -21FEB-03 ^{[ 30 ]} (ก่อนหน้านี้คือ VUI-202102/03) โดย Public Health England (PHE) และเดิมรู้จักกันในชื่อ UK1188 ^{[ 30 ]} 21D ^{[ 76 ]}หรือ 20A/S:484K ^{[ 99 ]}ไม่ได้มีการกลายพันธุ์ N501Y เหมือนกับที่พบในAlpha , BetaและGammaแต่มีการกลายพันธุ์ E484K เหมือนกับที่พบในสายพันธุ์ Gamma, Zeta และ Beta และยังมีการลบ ΔH69/ΔV70 (การลบกรดอะมิโนฮิสติดีนและวาลีนในตำแหน่งที่ 69 และ 70) เหมือนกับที่พบใน Alpha, สายพันธุ์ N439K (B.1.141 และ B.1.258) และสายพันธุ์ Y453F ( คลัสเตอร์ 5 ) ^{[ 177 ]} Eta แตกต่างจากสายพันธุ์อื่นๆ ทั้งหมดโดยมีทั้งการกลายพันธุ์ E484K และการกลายพันธุ์ F888L ใหม่ (การแทนที่ฟีนิลอะลานีน (F) ด้วยลิวซีน (L) ในโดเมน S2 ของโปรตีนหนาม) ณ วันที่ 5 มีนาคม 2021 ตรวจพบใน 23 ประเทศ^{[ 178 ]}^{[ 179 ]}^{[ 180 ]}นอกจากนี้ยังพบในมายอต ซึ่งเป็นเขตปกครอง/ภูมิภาคโพ้นทะเลของฝรั่งเศส^{[ 178 ]}ตรวจพบผู้ป่วยรายแรกในเดือนธันวาคม 2020 ในสหราชอาณาจักรและไนจีเรีย และ ณ วันที่ 15 กุมภาพันธ์ 2021 พบว่ามีความถี่สูงสุดในตัวอย่างในประเทศหลัง^{[ 180 ]}ณ วันที่ 24 กุมภาพันธ์ พบผู้ป่วย 56 รายในสหราชอาณาจักร^{[ 30 ]}เดนมาร์กซึ่งจัดลำดับจีโนมของผู้ป่วย COVID-19 ทั้งหมด พบผู้ป่วยสายพันธุ์นี้ 113 ราย ตั้งแต่วันที่ 14 มกราคม ถึง 21 กุมภาพันธ์ 2021 โดย 7 รายมีความเกี่ยวข้องโดยตรงกับการเดินทางไปต่างประเทศที่ไนจีเรีย^{[ 179 ]}

ณ เดือนกรกฎาคม 2021 ผู้เชี่ยวชาญในสหราชอาณาจักรกำลังศึกษาเพื่อตรวจสอบว่ามีความเสี่ยงมากน้อยเพียงใด ในขณะนั้นถือว่าเป็น "สายพันธุ์ที่อยู่ระหว่างการตรวจสอบ" แต่คาดว่าจะกลายเป็น " สายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง " ขึ้นอยู่กับการศึกษาเพิ่มเติม ราวี กุปตาจากมหาวิทยาลัยเคมบริดจ์กล่าวใน การสัมภาษณ์กับ บีบีซีว่า สายพันธุ์ B.1.525 ดูเหมือนจะมี "การกลายพันธุ์ที่สำคัญ" ซึ่งพบเห็นแล้วในสายพันธุ์ใหม่ๆ บางสายพันธุ์ ซึ่งหมายความว่าผลกระทบที่อาจเกิดขึ้นนั้นสามารถคาดการณ์ได้ในระดับหนึ่ง^{[ 181 ]}

เธต้า (สายเลือด P.3)

เมื่อวันที่ 18 กุมภาพันธ์ 2021 กระทรวงสาธารณสุขของฟิลิปปินส์ยืนยันการตรวจพบการกลายพันธุ์ของ COVID-19 สองแบบในวิสยาตอนกลางหลังจากส่งตัวอย่างจากผู้ป่วยไปทำการลำดับจีโนม การกลายพันธุ์ดังกล่าวได้รับการตั้งชื่อในภายหลังว่า E484K และ N501Y ซึ่งตรวจพบใน 37 จาก 50 ตัวอย่าง โดยพบการกลายพันธุ์ทั้งสองแบบร่วมกันใน 29 ตัวอย่าง^{[ 182 ]}

เมื่อวันที่ 13 มีนาคม กระทรวงสาธารณสุขยืนยันว่าการกลายพันธุ์ดังกล่าวเป็นสายพันธุ์ย่อยที่ถูกกำหนดให้เป็นสายพันธุ์ P.3 ^{[ 183 ]}ในวันเดียวกันนั้น กระทรวงฯ ยังยืนยันกรณีแรกของ COVID-19 ที่เกิดจากสายพันธุ์แกมมาในประเทศอีกด้วย ฟิลิปปินส์มีผู้ป่วยสายพันธุ์เธต้า 98 รายเมื่อวันที่ 13 มีนาคม^{[ 184 ]}เมื่อวันที่ 12 มีนาคม มีการประกาศว่าตรวจพบสายพันธุ์เธต้าในญี่ปุ่นด้วย^{[ 185 ]}^{[ 186 ]}เมื่อวันที่ 17 มีนาคม สหราชอาณาจักรยืนยันผู้ป่วยสองรายแรก^{[ 187 ]}โดย PHE เรียกสายพันธุ์นี้ว่า VUI-21MAR-02 ^{[ 30 ]} เมื่อวันที่ 30 เมษายน 2021 มาเลเซียตรวจพบผู้ป่วยสายพันธุ์เธต้า 8 รายในซาราวัก^{[ 188 ]}

ณ เดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2564 Theta ไม่ถือเป็นสายพันธุ์ที่น่าสนใจของ WHO อีกต่อไป^{[ 24 ]}

ไอโอตา (สายเลือด B.1.526)

สายพันธุ์ไอโอตา [ ¹⁸⁹^{] หรือที่รู้จักกันใน}^ชื่อสายพันธุ์ B.1.526 เป็นหนึ่งในสายพันธุ์ของSARS-CoV-2ซึ่งเป็นไวรัสที่ก่อให้เกิดCOVID-19ตรวจพบครั้งแรกในนครนิวยอร์กในเดือนพฤศจิกายน 2020 สายพันธุ์นี้ปรากฏขึ้นพร้อมกับการกลายพันธุ์ที่โดดเด่นสองประการ ได้แก่ การกลายพันธุ์ของหนาม E484K ซึ่งอาจช่วยให้ไวรัสหลบเลี่ยงแอนติบอดี และการกลายพันธุ์ S477N ซึ่งช่วยให้ไวรัสจับกับเซลล์มนุษย์ได้แน่นขึ้น^{[ 190 ]}

สัดส่วนของกรณีในสหรัฐอเมริกาที่แสดงโดยตัวแปรไอโอตาได้ลดลงอย่างรวดเร็วในช่วงปลายเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2564 เนื่องจากตัวแปรเดลต้ากลายเป็นตัวแปรเด่น^{[ 191 ]}

คัปปะ (สายตระกูล B.1.617.1)

สายพันธุ์ Kappa ^{[ 192 ]}เป็นสายพันธุ์หนึ่งของSARS-CoV-2ซึ่ง เป็น ไวรัสที่ก่อให้เกิดCOVID-19เป็นหนึ่งในสามสายพันธุ์ย่อยของสายพันธุ์ Pango B.1.617สายพันธุ์ SARS-CoV-2 Kappa ยังเป็นที่รู้จักในชื่อสายพันธุ์ B.1.617.1 และตรวจพบครั้งแรกในอินเดียในเดือนธันวาคม 2020 ^{[ 193 ]}ภายในสิ้นเดือนมีนาคม 2021 สายพันธุ์ย่อย Kappa คิดเป็นสัดส่วนมากกว่าครึ่งหนึ่งของลำดับพันธุกรรมที่ส่งมาจากอินเดีย^{[ 194 ]}เมื่อวันที่ 1 เมษายน 2021 หน่วยงานสาธารณสุขแห่งอังกฤษได้กำหนดให้เป็นสายพันธุ์ที่อยู่ระหว่างการตรวจสอบ (VUI-21APR-01) ^{[ 195 ]}

แลมบ์ดา (สายพันธุ์ C.37)

สายพันธุ์แลมบ์ดาหรือที่รู้จักกันในชื่อสายพันธุ์ C.37 เป็นสายพันธุ์หนึ่งของSARS-CoV-2ซึ่ง เป็น ไวรัสที่ก่อให้เกิดCOVID-19 [ ^{196 ] ตรวจ}พบครั้งแรกในเปรูในเดือนสิงหาคม 2020 ^{[ 197 ]}เมื่อวันที่ 14 มิถุนายน 2021 องค์การอนามัยโลก (WHO) ได้ตั้งชื่อสายพันธุ์นี้ว่าสายพันธุ์แลมบ์ดา^{[ 196 ]}และกำหนดให้เป็นสายพันธุ์ที่น่าสนใจ [ ^{198 ] เมื่อ}วันที่ 16 มีนาคม 2022 WHO ได้ลดระดับความสำคัญของสายพันธุ์แลมบ์ดาลงเป็น "สายพันธุ์ที่เคยแพร่ระบาดและน่าเป็นห่วง" ^{[ 199 ]}^{[ 200 ]}

มู (สายเลือด B.1.621)

สายพันธุ์ Mu (B.1.621) เป็นสายพันธุ์หนึ่งของSARS-CoV-2ตรวจพบครั้งแรกในโคลอมเบียในเดือนมกราคม 2021 และได้รับการจัดประเภทโดยองค์การอนามัยโลก (WHO) ให้เป็นสายพันธุ์ที่น่าสนใจเมื่อวันที่ 30 สิงหาคม 2021 ^{[ 201 ]}เมื่อวันที่ 9 มีนาคม 2022 องค์การอนามัยโลกได้ลดระดับสายพันธุ์ Mu และสายพันธุ์ย่อยของมันกลับไปเป็นสายพันธุ์ที่น่าสนใจที่เคยแพร่ระบาดมาก่อน^{[ 202 ]}

สายพันธุ์ที่เคยได้รับการตรวจสอบ (องค์การอนามัยโลก)

ตัวแปรที่ระบุไว้ด้านล่างเคยถูกจัดอยู่ในกลุ่มตัวแปรที่อยู่ภายใต้การเฝ้าระวัง แต่ได้รับการจัดประเภทใหม่เนื่องจากไม่แพร่กระจายในระดับที่มีนัยสำคัญอีกต่อไป ไม่ได้ส่งผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญต่อสถานการณ์ หรือมีหลักฐานทางวิทยาศาสตร์ว่าตัวแปรดังกล่าวไม่มีคุณสมบัติที่น่าเป็นห่วง^{[ 95 ]}

ข้อมูล ณ วันที่ 26 พฤษภาคม2565 ^{[ 95 ]}
เชื้อสายปังโก	กลุ่ม GISAID	กลุ่มสายพันธุ์ถัดไป	ตัวอย่างแรกสุด	วันที่ของ VUM	วันที่กำหนด	ประเทศที่ทำการเก็บตัวอย่าง
เอวี.1	จีอาร์		2021-03	26 พฤษภาคม 2021	21 กรกฎาคม 2021	สหราชอาณาจักร
เอที.1	จีอาร์		2021-01	9 มิถุนายน 2021	21 กรกฎาคม 2021	รัสเซีย
อาร์.1	จีอาร์		2021-01	2021-04-07	9 พฤศจิกายน 2021	ญี่ปุ่น
บี.1.466.2	จีเอช		2020-11	28 เมษายน 2021	9 พฤศจิกายน 2021	อินโดนีเซีย
บี.1.1.519	จีอาร์	20B/S.732A	2020-11	2 มิถุนายน 2021	9 พฤศจิกายน 2021	หลายประเทศ
C.36.3	จีอาร์		2021-01	16 มิถุนายน 2021	9 พฤศจิกายน 2021	หลายประเทศ
B.1.214.2	จี		2020-11	30 มิถุนายน 2021	9 พฤศจิกายน 2021	หลายประเทศ
บี.1.1.523	จีอาร์		2020-05	14 กรกฎาคม 2021	9 พฤศจิกายน 2021	หลายประเทศ
บี.1.619	จี		2020-05	14 กรกฎาคม 2021	9 พฤศจิกายน 2021	หลายประเทศ
บี.1.620	จี	20A/S.126A	2020-11	14 กรกฎาคม 2021	9 พฤศจิกายน 2021	ลิทัวเนีย
บี.1.1.318 AZ.5	จีอาร์		2021-01		2 มิถุนายน 2021	อังกฤษ
C.1.2	จีอาร์		2021-05		1 กันยายน 2021	แอฟริกาใต้
บี.1.630	จีเอช		2021-03		2021-10-12	สาธารณรัฐโดมินิกัน
บี.1.640	GH/490R		2021-09		22 พฤศจิกายน 2021	สาธารณรัฐคองโก
เอ็กซ์ดี			2022-01		9 มีนาคม 2022	ฝรั่งเศส

โอไมครอน

ลำดับวงศ์ตระกูล บี.1.1.529

สายพันธุ์ Omicron ที่รู้จักกันในชื่อ lineage B.1.1.529 ได้รับการประกาศให้เป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงโดยองค์การอนามัยโลกเมื่อวันที่ 26 พฤศจิกายน 2021 ^{[ 203 ]}

สายพันธุ์นี้มี การกลายพันธุ์จำนวนมากซึ่งบางส่วนน่าเป็นห่วง มีหลักฐานบางอย่างแสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์นี้มีความเสี่ยงต่อการติดเชื้อซ้ำ เพิ่มขึ้น กำลังมีการศึกษาเพื่อประเมินผลกระทบที่แท้จริงต่อการแพร่กระจาย อัตราการเสียชีวิต และปัจจัยอื่นๆ^{[ 204 ]}

องค์การอนามัยโลกตั้งชื่อ ไวรัส ^นี้ ว่า Omicron ^{[ 203 ]}^{[ 205 ]}โดยตรวจพบในเดือนพฤศจิกายน 2021 ในบอตสวานาและแอฟริกาใต้[ ^{206 ] ผู้}ป่วยรายหนึ่งเดินทางไปฮ่องกง [ ²⁰⁷^]^[⁹⁵^]^[²⁰⁸^]พบผู้ป่วยยืนยัน 1 รายในอิสราเอลซึ่งเป็นผู้เดินทางกลับจากมาลาวี [ ²⁰⁹^]พร้อมกับผู้ป่วยอีก 2 รายที่เดินทางกลับจากแอฟริกาใต้ และอีก 1 รายจากมาดากัสการ์^[²¹⁰^]เบลเยียมยืนยันการตรวจพบผู้ป่วยรายแรกในยุโรปเมื่อวันที่ 26 พฤศจิกายน 2021 ในบุคคลที่เดินทางกลับจากอียิปต์เมื่อวันที่ 11 พฤศจิกายน^[²¹¹^]^{สมาคมจีโนมิกส์ SARS-CoV-2 ของอินเดีย (INSACOG) ระบุในประกาศ เดือน}มกราคม 2022 ว่า Omicron กำลังแพร่ระบาดในชุมชนในอินเดีย โดยมีจำนวนผู้ป่วยรายใหม่เพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็ว^[²¹²^]

สายย่อยของ BA

จากข้อมูลขององค์การอนามัยโลก (WHO) ณ เดือนกุมภาพันธ์2565สายพันธุ์ย่อย BA.1, BA.1.1 และ BA.2 เป็นสายพันธุ์ย่อยที่พบได้บ่อยที่สุดของโอไมครอนทั่วโลก [ ²¹³^{] BA.2 มีการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่ไม่ซ้ำกัน 28}^{รายการ}รวมถึง 4 รายการในโปรตีนหนาม เมื่อเทียบกับ BA.1 ซึ่งได้รับการกลายพันธุ์แล้ว 60 รายการนับตั้งแต่สายพันธุ์บรรพบุรุษอู่ฮั่น รวมถึง 32 รายการในโปรตีนหนาม [ ^{214 ] BA.2}แพร่กระจายได้ง่ายกว่า BA.1 ^{[ 215 ]}เป็นสาเหตุของกรณีส่วนใหญ่ในอังกฤษในช่วงกลางเดือนมีนาคม 2022 และภายในสิ้นเดือนมีนาคม BA.2 กลายเป็นสายพันธุ์ที่แพร่หลายในสหรัฐอเมริกา^{[ 216 ]}^{[ 214 ]}ณ เดือนพฤษภาคม2022 สายพันธุ์ย่อย BA.1 ถึง BA.5 รวมทั้งลูกหลานทั้งหมดจัดเป็นสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงโดย WHO ^{[ 95 ]} CDC ^{[ 25 ]}และECDC ^{[ 217 ]} (โดย ECDC ไม่รวม BA.3)

สายย่อย XBB

ในปี 2022 มีสายพันธุ์ใหม่เกิดขึ้นอีกหลายสายพันธุ์ในหลายพื้นที่ รวมถึง XBB.1.5 ซึ่งพัฒนามาจากการรวมตัวกันของ BJ.1 และ BM.1.1.1 ซึ่งทั้งสองสายพันธุ์สืบเชื้อสายมาจาก Omicron กรณีแรกที่เกี่ยวข้องกับ XBB ในอังกฤษถูกตรวจพบจากตัวอย่างที่เก็บเมื่อวันที่ 10 กันยายน 2022 และหลังจากนั้นก็พบผู้ป่วยเพิ่มเติมในเกือบทุกภูมิภาคของอังกฤษ เมื่อสิ้นปี XBB.1.5 คิดเป็น 40.5% ของผู้ป่วยรายใหม่ทั่วสหรัฐอเมริกา และเป็นสายพันธุ์ที่แพร่หลายที่สุด สายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วง BQ.1 คิดเป็น 18.3% และ BQ.1.1 คิดเป็น 26.9% ของผู้ป่วยรายใหม่ ในขณะที่สายพันธุ์ BA.5 ลดลงเหลือ 3.7% ในขั้นตอนนี้ สายพันธุ์นี้ยังพบได้ไม่บ่อยในหลายประเทศ ตัวอย่างเช่น ในสหราชอาณาจักร คิดเป็นประมาณ 7% ของผู้ป่วยรายใหม่ ตามข้อมูลการจัดลำดับจีโนมของ UKHSA ^{[ 218 ]} BQ.1 และ BQ1.1 กลายเป็นที่รู้จักอย่างไม่เป็นทางการในชื่อ "เซอร์เบอรัส" ^{[ 219 ]}^{[ 220 ]}

เมื่อวันที่ 22 ธันวาคม พ.ศ. 2565 ศูนย์ควบคุมโรคแห่งยุโรปได้เขียนสรุปว่าเชื้อสายพันธุ์ XBB คิดเป็นประมาณ 6.5% ของผู้ป่วยรายใหม่ใน 5 ประเทศของสหภาพยุโรปที่มีปริมาณการจัดลำดับหรือจีโนไทป์เพียงพอที่จะให้การประมาณการได้^{[ 218 ]}

EG.5 ซึ่งเป็นสายพันธุ์ย่อยของ XBB.1.9.2 (บางสื่อเรียกเล่นๆ ว่า "Eris" ^{[ 221 ]} ) ปรากฏขึ้นในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2566 ^{[ 222 ]}เมื่อวันที่ 6 สิงหาคม พ.ศ. 2566 หน่วยงานความปลอดภัยด้านสุขภาพของสหราชอาณาจักรรายงานว่าสายพันธุ์ EG.5 เป็นสาเหตุของกรณีใหม่หนึ่งในเจ็ดรายในสหราชอาณาจักรในช่วงสัปดาห์ที่สามของเดือนกรกฎาคม^{[ 223 ]}

สายเลือด BA.2.86

ในระหว่างปี 2023 ไวรัส SARS-CoV-2 ยังคงแพร่ระบาดในประชากรโลกและวิวัฒนาการต่อไป โดยมีสายพันธุ์ย่อยใหม่จำนวนมาก อัตราการทดสอบ การจัดลำดับ และการรายงานลดลง^{[ 224 ]}

BA.2.86ตรวจพบครั้งแรกในตัวอย่างเมื่อวันที่ 24 กรกฎาคม 2023 และได้รับการกำหนดให้เป็นสายพันธุ์ที่อยู่ภายใต้การเฝ้าระวังโดยองค์การอนามัยโลกเมื่อวันที่ 17 สิงหาคม 2023 ^{[ 225 ]}

JN.1 (บางครั้งเรียกว่า "Pirola") ซึ่งเป็นสายพันธุ์ย่อยของ BA.2.86 ปรากฏขึ้นในเดือนสิงหาคม 2023 ในลักเซมเบิร์ก ภายในเดือนธันวาคม 2023 ตรวจพบใน 12 ประเทศ รวมถึงสหราชอาณาจักรและสหรัฐอเมริกา^{[ 226 ]}^{[ 227 ]}เมื่อวันที่ 19 ธันวาคม องค์การอนามัยโลกประกาศว่า JN.1 เป็นสายพันธุ์ที่น่าสนใจโดยอิสระจากสายพันธุ์หลัก BA.2.86 แต่ความเสี่ยงโดยรวมต่อสุขภาพของประชาชนนั้นถือว่าต่ำ^{[ 228 ]}เนื่องจาก JN.1 คิดเป็นประมาณ 60% ของผู้ป่วยในสิงคโปร์ ในเดือนธันวาคม 2023 สิงคโปร์และอินโดนีเซียจึงแนะนำให้สวมหน้ากากอนามัยที่สนามบิน^{[ 229 ]} CDC ประมาณการว่าสายพันธุ์ นี้คิดเป็น 44% ของผู้ป่วยในสหรัฐอเมริกาเมื่อวันที่ 22 ธันวาคม 2023 และ 62% ของผู้ป่วยเมื่อวันที่ 5 มกราคม 2024 ^{[ 230 ]}

ข้อมูล ณ วันที่ 9 กุมภาพันธ์2567 องค์การอนามัยโลกประเมินว่า JN.1 เป็นสายพันธุ์ที่แพร่หลายที่สุดของ SARS-CoV-2 (ความชุก 70–90% ในสี่จากหกภูมิภาคทั่วโลก ข้อมูลไม่เพียงพอในภูมิภาคเมดิเตอร์เรเนียนตะวันออกและแอฟริกา) คาดว่าระดับภูมิคุ้มกันทั่วไปของประชากรและภูมิคุ้มกันจาก วัคซีน กระตุ้นXBB.1.5 ของ COVID-19จะให้การป้องกันบางส่วน (ปฏิกิริยาข้ามสายพันธุ์) ต่อ JN.1 ^{[ 231 ]}

สายเลือด BA.3.2

BA.3.2เป็น สายพันธุ์ย่อย Omicron ที่กลายพันธุ์อย่างมาก ของSARS-CoV-2ซึ่งเป็นไวรัสที่ก่อให้เกิดCOVID-19สายพันธุ์นี้สืบเชื้อสายมาจากสายพันธุ์ย่อย Omicron BA.3 ดั้งเดิม ที่ไม่ได้แพร่ระบาดมาตั้งแต่ต้นปี 2022 BA.3.2 มีลักษณะเด่นคือมีการกลายพันธุ์มากกว่า 50 ตำแหน่งบนโปรตีนหนามเมื่อเทียบกับ BA.3 และมีการกลายพันธุ์มากกว่า 70 ตำแหน่งบนโปรตีนหนามเมื่อเทียบกับไวรัสสายพันธุ์ดั้งเดิมจากอู่ฮั่น^{[ 232 ]}^{[ 233 ]}สายพันธุ์ย่อยนี้ ซึ่งตรวจพบครั้งแรกในตัวอย่างจากแอฟริกาใต้ เมื่อวันที่ 22 พฤศจิกายน 2024 นักวิจัยพบ ว่าน่าเป็นห่วงเนื่องจากจำนวนการกลายพันธุ์ที่มากมายมหาศาล ภายในเดือนพฤศจิกายน 2025 พบว่าสายพันธุ์นี้แพร่ระบาดในหลายประเทศ รวมถึง ออสเตรเลียเยอรมนีและสหรัฐอเมริกา^[²³²^]^[²³⁴^]เมื่อวันที่ 5 ธันวาคม พ.ศ. 2568 องค์การอนามัยโลก (WHO) ประกาศให้ BA.3.2 เป็นสายพันธุ์ที่อยู่ภายใต้การเฝ้าระวัง (VUM) ^[²³⁵^]นักวิจัยตั้งชื่อเล่นสายพันธุ์นี้อย่างไม่เป็นทางการว่า Cicada ^[²³⁶^]

สายย่อยตามปี

2024

ในช่วงปลายเดือนเมษายน พ.ศ. 2567 ข้อมูลจาก CDC แสดงให้เห็นว่า KP.2 เป็นสายพันธุ์ที่พบได้บ่อยที่สุดในสหรัฐอเมริกา โดยคิดเป็นหนึ่งในสี่ของทุกกรณี รองจาก JN.1 KP1.1 คิดเป็น 7 เปอร์เซ็นต์ของกรณีในสหรัฐอเมริกา^{[ 237 ]} บางครั้งเรียกสองสายพันธุ์นี้ว่าสายพันธุ์ 'FLiRT' เนื่องจากมีลักษณะเฉพาะคือ การกลายพันธุ์จาก ฟีนิล อะลานีน (F) เป็น ลิว ซีน (L) และ การกลายพันธุ์จาก อาร์จินีน (R) เป็นทรีโอนีน (T) ในโปรตีนหนามของไวรัส^{[ 238 ]}ภายในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2567 สายพันธุ์ที่สืบเชื้อสายมาจาก KP.2 ซึ่งมีการเปลี่ยนแปลงกรดอะมิโนเพิ่มเติมในโปรตีนหนาม Q493E ได้รับชื่อว่า KP.3 และเรียกอย่างไม่เป็นทางการว่า 'FLuQE' และกลายเป็นสายพันธุ์หลักในรัฐนิวเซาท์เวลส์ในช่วงฤดูหนาวของออสเตรเลีย การวิจัยเบื้องต้นชี้ให้เห็นว่าการเปลี่ยนแปลง Q493E อาจช่วยให้ KP.3 มีประสิทธิภาพในการจับกับเซลล์มนุษย์ได้ดีกว่า KP.2 ^{[ 239 ]}

ต้นเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2567 มีการค้นพบ XEC ในประเทศเยอรมนี^{[ 240 ]} XEC เป็นการรวมตัวกันของสายพันธุ์ย่อยสองสายพันธุ์ ได้แก่ KS.1.1 และ KP.3.3 ในช่วงต้นเดือนธันวาคม พ.ศ. 2567 ข้อมูลจาก CDC แสดงให้เห็นว่า XEC เป็นสายพันธุ์ที่พบได้บ่อยที่สุดในสหรัฐอเมริกา คิดเป็น 45% ของผู้ป่วยทั้งหมด นำหน้า KP3.1.1 ซึ่งคิดเป็น 24% ของผู้ป่วยทั้งหมด^{[ 241 ]}

2025

ปลายเดือนมกราคม พ.ศ. 2568 XFG (บางครั้งเรียกว่า "Stratus") ^{[ 242 ]}ถูกค้นพบในแคนาดา^{[ 243 ]} XFG เป็นการรวมตัวกันของสองสายพันธุ์ย่อย ได้แก่ LF.7 และ LP.8.1.2 ปลายเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2568 องค์การอนามัยโลกรายงานว่า XFG เป็นสายพันธุ์ที่พบมากเป็นอันดับ 2 ของโลก คิดเป็น 22.7% ของผู้ป่วยทั่วโลก รองจาก NB.1.8.1 (ชื่อ "Nimbus" มักมีอาการเจ็บคออย่างรุนแรง) ^{[ 244 ]}ซึ่งคิดเป็น 24.9% ของผู้ป่วยทั่วโลก และตามมาด้วย LP.8.1 ซึ่งคิดเป็น 22.6% ของผู้ป่วยทั่วโลก^{[ 245 ]}ในช่วงปลายเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2568 ข้อมูลประมาณการของ CDC แสดงให้เห็นว่า XFG เป็นสายพันธุ์ที่พบมากเป็นอันดับ 3 ในสหรัฐอเมริกา คิดเป็น 14% ของผู้ป่วยทั้งหมด รองจาก NB.1.8.1 และ LP.8.1 ซึ่งคิดเป็น 43% และ 31% ของผู้ป่วยทั้งหมดตามลำดับ

เมื่อวันที่ 14 กันยายน 2025 องค์การอนามัยโลก (WHO) ระบุ JN.1 เป็นVOIและ KP.3.1.1, LP.8.1, NB.1.8.1, XEC และ XFG เป็นVUMอัตราการแพร่ระบาดโดยประมาณสำหรับสัปดาห์สิ้นสุดวันที่ 7 กันยายน 2025 คือ 68% สำหรับ XFG (เพิ่มขึ้นเมื่อเทียบกับ 61% สำหรับสัปดาห์สิ้นสุดวันที่ 10 สิงหาคม) 20% สำหรับ NB.1.8.1 (ลดลงเมื่อเทียบกับ 24% สำหรับสัปดาห์สิ้นสุดวันที่ 10 สิงหาคม) และ 4% หรือต่ำกว่าสำหรับสายพันธุ์อื่นอีกสี่สายพันธุ์^{[ 246 ]}ในช่วงปลายเดือนกันยายนECDCไม่ได้ระบุVOC ใดๆ และระบุ BA.2.86 เป็น VOI และ NB.1.8.1 และ XFG เป็น VUM ^{[ 247 ]}

2026

ในช่วงปลายเดือนเมษายน ECDC ระบุอีกครั้งว่าไม่มี VOCs, BA.2.86 เป็น VOI และ NB.1.8.1 และ XFG เป็น VUMs และเพิ่ม BA.3.2 ซึ่งตรวจพบครั้งแรกในแอฟริกาใต้ในเดือนพฤศจิกายน 2024 เป็น VUM อีกตัวหนึ่ง^{[ 248 ]}

สายพันธุ์โอไมครอนที่อยู่ภายใต้การเฝ้าระวัง (องค์การอนามัยโลก, 2022/2023)

เมื่อวันที่ 25 พฤษภาคม 2022 องค์การอนามัยโลกได้แนะนำหมวดหมู่ใหม่สำหรับสายพันธุ์ย่อยที่อาจก่อให้เกิดความกังวลของสายพันธุ์ที่แพร่หลาย ซึ่งในเบื้องต้นเรียกว่าสายพันธุ์ VOC ที่อยู่ภายใต้การเฝ้าระวัง (VOC-LUMs) การตัดสินใจนี้เกิดขึ้นเพื่อสะท้อนให้เห็นว่าในเดือนกุมภาพันธ์ 2022 ตัวอย่างที่ได้รับการจัดลำดับจีโนมโดย GISAID มากกว่า 98% เป็นของตระกูล Omicron ซึ่งวิวัฒนาการของสายพันธุ์ส่วนใหญ่เกิดขึ้นภายในตระกูลนี้^{[ 249 ]}ภายในวันที่ 9 กุมภาพันธ์ 2023 หมวดหมู่นี้ได้รับการเปลี่ยนชื่อเป็น "สายพันธุ์ Omicron ที่อยู่ภายใต้การเฝ้าระวัง" ^{[ 250 ]}

ข้อมูล ณ วันที่ 9 กุมภาพันธ์2566 ^{[ 250 ]}
เชื้อสายปังโก	กลุ่ม GISAID	กลุ่มสายพันธุ์ถัดไป	ความสัมพันธ์กับสาร VOC ที่หมุนเวียนอยู่ในร่างกาย	บันทึกครั้งแรก	คุณสมบัติเด่น
บีเอฟ.7	จีเอ	22บี	สายย่อย BA.5	24 มกราคม 2022	BA.5 + S:R346T
BQ.1	จีเอ	22E	สายย่อย BA.5	2022-02-07	BQ.1 และ BQ.1.1: BA.5 + S:R346T, S:K444T, S:N460K
BA.2.75	จีเอ	22D	สายย่อย BA.2	31 ธันวาคม 2021	BA.2.75: BA.2 + S:K147E, S:W152R, S:F157L, S:I210V, S:G257S, S:D339H, S:G446S, S:N460K, S:Q493R ย้อนกลับ
บทที่ 1.1	จีเอ	22D	สายย่อย BA.2	2022-07-20	BA.2.75 + S:L452R, S:F486S
เอ็กซ์บีบี	จีเอ	22F	เป็นรีคอมบิแนนท์ของสายพันธุ์ย่อย BA.2.10.1 และ BA.2.75 หรือก็คือ BJ1 และ BM.1.1.1 โดยมีจุดแตกหักอยู่ที่ S1	13 สิงหาคม 2022	BA.2+ S:V83A, S:Y144-, S:H146Q, S:Q183E, S:V213E, S:G252V, S:G339H, S:R346T, S:L368I, S:V445P, S:G446S, S:N460K, S:F486S, S:F490S
เอ็กซ์บีบี 1.5	จีเอ	23A	เป็นรีคอมบิแนนท์ของสายพันธุ์ย่อย BA.2.10.1 และ BA.2.75 หรือก็คือ BJ1 และ BM.1.1.1 โดยมีจุดแตกหักอยู่ที่ S1	5 มกราคม 2022	XBB + S:F486P
เอ็กซ์บีเอฟ	จีเอ		รีคอมบิแนนท์ของ BA.5.2.3 และ CJ.1 (สายพันธุ์ย่อย BA.2.75.3)	2022-07-20	BA.5 + S:K147E, S:W152R, S:F157L, S:I210V, S:G257S, S:G339H, S:R346T, S:G446S, S:N460K, S:F486P, S:F490S
ยน.1	จีเอ	24A	สายพันธุ์ย่อย BA.2.86; ลักษณะทางพันธุกรรม ได้แก่ S:L455S	25 สิงหาคม 2566	ข้อมูล ณ วันที่ 28 มิถุนายน2567 จัดเป็น VOI; หมวดหมู่ "Omicron VOC" ไม่ได้ประกาศอีกต่อไป^{[ 251 ]}

รูปแบบอื่นๆ ที่น่าสนใจ

สายพันธุ์ B.1.1.207 ได้รับการจัดลำดับครั้งแรกในเดือนสิงหาคม 2020 ในประเทศไนจีเรีย^{[ 252 ]}ผลกระทบต่อการแพร่กระจายและความรุนแรงยังไม่ชัดเจน แต่ได้รับการขึ้นทะเบียนเป็นสายพันธุ์ใหม่โดยศูนย์ควบคุมและป้องกันโรค ของสหรัฐอเมริกา [ ²⁸^{] สายพันธุ์นี้ได้รับการจัดลำดับโดยศูนย์ความเป็นเลิศแห่งแอฟริกาด้านจีโนมิกส์ของโรคติด}^{เชื้อ}ในประเทศไนจีเรีย และมีการกลายพันธุ์ P681H ซึ่งพบร่วมกับสายพันธุ์อัลฟาไม่มีการกลายพันธุ์อื่นใดที่เหมือนกับสายพันธุ์อัลฟา และ ณ ปลายเดือนธันวาคม 2020 สายพันธุ์นี้คิดเป็นประมาณ 1% ของจีโนมไวรัสที่ได้รับการจัดลำดับในประเทศไนจีเรีย แม้ว่าอาจเพิ่มขึ้นได้^{[ 252 ]}ณ เดือนพฤษภาคม 2021 สายพันธุ์ B.1.1.207 ได้รับการตรวจพบใน 10 ประเทศ^{[ 253 ]}

สายพันธุ์ B.1.1.317 แม้ว่าจะไม่ถือว่าเป็นสายพันธุ์ที่น่ากังวลแต่ก็เป็นที่น่าสังเกต เนื่องจากหน่วยงานสาธารณสุขควีนส์แลนด์บังคับให้บุคคล 2 คนที่เข้ารับการกักตัวในโรงแรมที่บริสเบนประเทศออสเตรเลีย ต้องกักตัวเพิ่มอีก 5 วัน นอกเหนือจาก 14 วันตามข้อกำหนด หลังจากได้รับการยืนยันว่าติดเชื้อสายพันธุ์นี้^{[ 254 ]}

สายพันธุ์ B.1.616 ซึ่งถูกระบุในบริตตานีทางตะวันตกของฝรั่งเศสในช่วงต้นเดือนมกราคม พ.ศ. 2564 ^{[ 255 ]}และองค์การอนามัยโลกกำหนดให้เป็น "สายพันธุ์ที่อยู่ระหว่างการตรวจสอบ" ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2564 มีรายงานว่าตรวจจับได้ยากจาก วิธีการเก็บตัวอย่างจาก โพรงจมูกเพื่อตรวจหาไวรัสโคโรนา และการตรวจหาไวรัสจำเป็นต้องอาศัยตัวอย่างจากทางเดินหายใจส่วนล่าง^{[ 256 ]}

สายพันธุ์ B.1.618 ถูกแยกได้เป็นครั้งแรกในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2563 มีการกลายพันธุ์ E484K เหมือนกับสายพันธุ์อื่นๆ อีกหลายสายพันธุ์ และแสดงให้เห็นการแพร่กระจายอย่างมีนัยสำคัญในเดือนเมษายน พ.ศ. 2564 ในรัฐเวสต์เบงกอลประเทศอินเดีย^{[ 257 ]}^{[ 258 ]}ณ วันที่ 23 เมษายน พ.ศ. 2564 ฐานข้อมูล PANGOLIN แสดงให้เห็นว่าตรวจพบลำดับ 135 ลำดับในอินเดีย โดยมีจำนวนหลักเดียวในอีก 8 ประเทศทั่วโลก^{[ 259 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2564 นักวิทยาศาสตร์รายงานในเอกสารฉบับร่างซึ่งตีพิมพ์ในวารสารในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2565 เกี่ยวกับการตรวจพบสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ที่ผิดปกติซึ่งไม่มีชื่อและไม่ทราบแหล่งที่มาผ่านการเฝ้าระวังน้ำเสียในนครนิวยอร์ก พวกเขาตั้งสมมติฐานว่า "สายพันธุ์เหล่านี้มาจากการติดเชื้อ COVID-19 ในมนุษย์ที่ไม่ได้เก็บตัวอย่าง หรือบ่งชี้ถึงการมีอยู่ของแหล่งกักเก็บเชื้อในสัตว์ ที่ไม่ใช่มนุษย์ " ^{[ 260 ]}^{[ 261 ]}

สายพันธุ์ B.1.640.2 (หรือที่รู้จักกันในชื่อสายพันธุ์ IHU ^{[ 262 ]} ) ถูกตรวจพบในเดือนตุลาคม 2021 โดยนักวิจัยที่Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) ในเมืองมาร์เซย์^{[ 263 ]}พวกเขาพบสายพันธุ์นี้ในนักเดินทางที่เดินทางกลับฝรั่งเศสจากแคเมรูนและมีรายงานว่าแพร่เชื้อไปยัง 12 คน^{[ 264 ]}^{[ 265 ]}สายพันธุ์ B.1.640ซึ่งรวมถึง B.1.640.2 ได้รับการกำหนดให้เป็นสายพันธุ์ที่อยู่ภายใต้การเฝ้าระวัง (VUM) โดยองค์การอนามัยโลก (WHO) เมื่อวันที่ 22 พฤศจิกายน 2021 ^{[ 266 ]}อย่างไรก็ตาม WHO รายงานว่าสายพันธุ์ B.1.640.2 แพร่กระจายช้ากว่าสายพันธุ์ Omicron มาก ดังนั้นจึงมีความกังวลค่อนข้างน้อย^{[ 265 ]}^{[ 267 ]} จากการศึกษาเอกสารก่อนตีพิมพ์ สายพันธุ์ B.1.640.2 มี การกลายพันธุ์ ของโปรตีนหนาม ที่ทราบแล้ว 2 ตำแหน่ง ได้แก่E484KและN501Yจากการแทนที่นิวคลีโอไทด์ทั้งหมด 46 ตำแหน่ง และการลบ 37 ตำแหน่ง^{[ 264 ]}^{[ 268 ]}^{[ 269 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2565 นักวิจัยรายงานไวรัสลูกผสม สายพันธุ์ SARS-CoV-2 ที่มีองค์ประกอบของDeltaและOmicron – Deltacron (เรียกอีกอย่างว่า "Deltamicron") ^{[ 270 ]}^{[ 271 ]}^{[ 272 ]}^{[ 273 ]}^{[ 274 ]}การเกิดลูกผสมเกิดขึ้นเมื่อไวรัสรวมส่วนต่างๆ จากไวรัสที่เกี่ยวข้องเข้ากับลำดับพันธุกรรมของมันในขณะที่มันสร้างสำเนาของตัวเอง ยังไม่ชัดเจนว่า Deltacron – ซึ่งไม่ควรสับสนกับ"Deltacron" ที่รายงานในเดือนมกราคมแม้ว่าการตรวจพบครั้งแรกจะเกิดขึ้นในเดือนมกราคมเช่นกัน^{[ 274 ]}^{[ 275 ]} – จะสามารถแข่งขันกับ Omicron ได้หรือไม่ และนั่นจะเป็นอันตรายต่อสุขภาพหรือไม่^{[ 276 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2566 ลอว์เรนซ์ ยัง นักไวรัสวิทยาจากมหาวิทยาลัยวอร์วิค ประกาศ การค้นพบสายพันธุ์เดลต้ากลายพันธุ์ขั้นสุดยอดจากตัวอย่างสารคัดหลั่งของผู้ป่วยชาวอินโดนีเซียที่มีการกลายพันธุ์ที่ไม่ซ้ำกัน 113 รายการ โดย 37 รายการมีผลต่อโปรตีนหนาม^{[ 277 ]}

ระหว่างเดือนพฤศจิกายน 2023 ถึงกรกฎาคม 2024 มีการค้นพบสายพันธุ์กลายพันธุ์ที่ซ่อนเร้นอย่างมากในรัฐนิวเจอร์ซีย์สายพันธุ์นี้มี ฤทธิ์ในการจับกับ ACE2 ที่แข็งแกร่งที่สุด ในบรรดาสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ที่เคยพบมา มีโครงสร้างโปรตีนหนามที่แตกต่างมากที่สุดเท่าที่เคยพบ และยังมีความต้านทานสูงต่อแอนติบอดีทุกชนิดที่นักวิจัยทดสอบ สายพันธุ์ที่ซ่อนเร้นในรัฐนิวเจอร์ซีย์มีลำดับความเหมือนเพียง 80.6% เมื่อเทียบกับไวรัสสายพันธุ์ดั้งเดิมจากอู่ฮั่น ซึ่งเป็นค่าต่ำที่สุดที่พบในสายพันธุ์ COVID ใดๆ จนถึงปัจจุบัน สายพันธุ์ที่ซ่อนเร้นนี้อาจมีต้นกำเนิดมาจากสายพันธุ์ B.1 ที่มาก่อนสายพันธุ์ Omicron โดยสายพันธุ์ดั้งเดิมอาจแพร่ระบาดในปี 2021 หรือก่อนหน้านั้น และไม่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์ B.1.1 สายพันธุ์ที่ซ่อนเร้นนี้มีการกลายพันธุ์ 39 ตำแหน่งในโดเมนการจับกับตัวรับ (RBD) ของโปรตีนหนาม เมื่อเทียบกับไวรัสสายพันธุ์ดั้งเดิมจากอู่ฮั่น มีเพียงการกลายพันธุ์ของสไปค์สี่รายการ (R403K, S477N, V483del และ Y505H) เท่านั้นที่พบใน VOC และ VOIs อื่นๆ ของ COVID ที่น่าสังเกตคือ การกลายพันธุ์ของ RBD ที่เหลืออีก 13 รายการนั้นพบในสายพันธุ์ COVID ที่ซ่อนเร้นอื่นๆ ตามที่ระบุโดยการจัดลำดับน้ำเสีย การกลายพันธุ์ของ RBD ใหม่สามรายการ ได้แก่ S477N, Q493L และ G496N ถูกระบุว่าน่าจะมีส่วนทำให้สายพันธุ์ที่ซ่อนเร้นนี้มีแรงยึดเกาะกับ ACE2 สูง ซึ่งแข็งแกร่งกว่า RBD ของสายพันธุ์อู่ฮั่นดั้งเดิมถึง 11.4 เท่า แม้ว่าสายพันธุ์นี้จะมีข้อดี แต่ก็ไม่ได้แพร่กระจายมาตั้งแต่กลางปี 2024 และคาดว่าสูญพันธุ์ไปแล้ว^{[ 278 ]}

ตัวแปรลูกผสม

ในปี 2022 รัฐบาลอังกฤษได้รายงานสายพันธุ์ลูกผสมของ SARS-CoV-2 จำนวนหนึ่ง^{[ 279 ]}สายพันธุ์ลูกผสมเหล่านี้ได้รับรหัสระบุสายพันธุ์ Pango คือ XD, XE และ XF ^{[ 280 ]}

XE เป็นสายพันธุ์ลูกผสมของสายพันธุ์ Pango BA.1 และ BA.2 ^{[ 281 ]}ณ เดือนมีนาคมพ.ศ. 2565 เชื่อกันว่า XE มีอัตราการเติบโตสูงกว่า BA.2 ถึง 9.8% ^{[ 279 ]}

ทฤษฎีการฟักตัวสำหรับตัวแปรกลายพันธุ์หลายตัว

นักวิจัยแนะนำว่าการกลายพันธุ์หลายครั้งสามารถเกิดขึ้นได้ในระหว่างการติดเชื้อเรื้อรังใน ผู้ป่วย ที่มีภูมิคุ้มกันบกพร่องโดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อไวรัสพัฒนาการกลายพันธุ์หลบหนีภายใต้แรงกดดันจากการคัดเลือกของแอนติบอดีหรือการรักษาด้วยพลาสมาของผู้ป่วยที่หายดีแล้ว^{[ 282 ]}^{[ 283 ]}โดยมีการลบแอนติเจนบนพื้นผิวแบบเดียวกันเกิดขึ้นซ้ำๆ ในผู้ป่วยที่แตกต่างกัน^{[ 284 ]}

การกลายพันธุ์แบบมิสเซนส์ที่น่าสนใจ

มี การตรวจพบ การกลายพันธุ์แบบมิสเซนส์ หลายตำแหน่ง ในไวรัส SARS-CoV-2

เดล 69-70

ชื่อของการกลายพันธุ์ del 69-70 หรือ 69-70 del หรือสัญลักษณ์ที่คล้ายกันอื่นๆ หมายถึงการลบกรดอะมิโนที่ตำแหน่ง 69 ถึง 70 การกลายพันธุ์นี้พบในตัวแปรอัลฟา และอาจนำไปสู่ "ความล้มเหลวของเป้าหมายยีนสไปค์" และส่งผลให้ผลการทดสอบไวรัส PCR เป็นลบเท็จ^{[ 285 ]}

RSYLTPGD246-253N

หรือเรียกอีกอย่างว่า del 246-252 หรือการแสดงออกที่คล้ายคลึงกันอื่นๆ หมายถึงการลบกรดอะมิโนจากตำแหน่งที่ 246 ถึง 252 ในโดเมน N-terminal ของโปรตีนหนาม พร้อมกับการแทนที่กรดแอสปาร์ติก (D) ที่ตำแหน่ง 253 ด้วยแอสปาราจีน (N) ^{[ 286 ]}^{[ 287 ]}

การกลายพันธุ์แบบลบกรดอะมิโน 7 ตัวในปัจจุบัน (กันยายน 2021) ได้รับการอธิบายว่าเป็นเอกลักษณ์ในสายพันธุ์แลมบ์ดา และได้รับการระบุว่าเป็นสาเหตุหนึ่งที่ทำให้สายพันธุ์นี้มีความสามารถในการหลบหนีจากแอนติบอดีที่ทำให้เป็นกลางได้มากขึ้น ตามเอกสารฉบับร่าง^{[ 288 ]}

อาร์346ที

ชื่อของการกลายพันธุ์ R346T หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่อาร์จินีน (R) ถูกแทนที่ด้วยทรีโอนีน (T) ที่ตำแหน่ง 346 ^{[ 289 ]}

การกลายพันธุ์นี้พบว่าเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับกับ ACE2 และเพิ่มความต้านทานต่อแอนติบอดี ในการทดสอบการเพาะเลี้ยงเซลล์ R346T ปรากฏว่าช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการจับกับตัวรับ ACE2 ได้มากขึ้นประมาณ 1.5 เท่า ซึ่งส่งผลให้ความสามารถในการติดเชื้อของไวรัสเพิ่มขึ้นเล็กน้อย การกลายพันธุ์นี้ปรากฏในสายพันธุ์ย่อย Omicron และJN.1 จำนวนมากขึ้นเรื่อยๆ ซึ่งแสดงให้เห็นถึงตัวอย่างของวิวัฒนาการแบบบรรจบกัน^{[ 289 ]}

เอ็น440เค

ชื่อของการกลายพันธุ์ N440K หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่แอสปาราจีน (N) ถูกแทนที่ด้วยไลซีน (K) ที่ตำแหน่ง 440 ^{[ 290 ]}

การกลายพันธุ์นี้ได้รับการสังเกตในเซลล์เพาะเลี้ยงว่ามีฤทธิ์ในการติดเชื้อมากกว่าสายพันธุ์ A2a ที่แพร่หลายก่อนหน้านี้ (การแทนที่ A97V ในลำดับ RdRP) ถึง 10 เท่า และมากกว่าสายพันธุ์ A3i ที่แพร่หลายน้อยกว่า (การแทนที่ D614G ใน Spike และ P323L ใน RdRP) ถึง 1,000 เท่า^{[ 291 ]}การกลายพันธุ์นี้เกี่ยวข้องกับการระบาดของ COVID-19 อย่างรวดเร็วในอินเดียในเดือนพฤษภาคม 2021 ^{[ 292 ]}อินเดียมีสัดส่วนของสายพันธุ์กลายพันธุ์ N440K มากที่สุด รองลงมาคือสหรัฐอเมริกาและเยอรมนี^{[ 293 ]}

จี446วี

ชื่อของการกลายพันธุ์ G446V หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่ไกลซีน (G) ถูกแทนที่ด้วยวาลีน (V) ที่ตำแหน่ง 446 ^{[ 290 ]}

การกลายพันธุ์ที่ระบุในญี่ปุ่นในกลุ่มผู้เดินทางเข้าประเทศตั้งแต่เดือนพฤษภาคม และในตัวอย่าง 33 ตัวอย่างจากบุคคลที่เกี่ยวข้องกับการแข่งขันกีฬาโอลิมปิกโตเกียว 2020และการแข่งขันกีฬาพาราลิมปิกโตเกียว 2020กล่าวกันว่าอาจส่งผลกระทบต่อความสัมพันธ์ของแอนติบอดีโมโนโคลนอล หลายชนิด แม้ว่าผลกระทบทางคลินิกต่อการใช้ยาแอนติบอดีจะยังไม่เป็นที่ทราบแน่ชัดก็ตาม^{[ 294 ]}

แอล452อาร์

ชื่อของการกลายพันธุ์ L452R หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่ลิวซีน (L) ถูกแทนที่ด้วยอาร์จินีน (R) ที่ตำแหน่ง 452 ^{[ 290 ]}

การกลายพันธุ์ L452R พบได้ทั้งในสายพันธุ์เดลต้าและแคปปา ซึ่งแพร่ระบาดครั้งแรกในอินเดีย แต่ได้แพร่กระจายไปทั่วโลกแล้ว การกลายพันธุ์ L452R เป็นการกลายพันธุ์ที่สำคัญในสายพันธุ์นี้ ซึ่งช่วยเพิ่มความสามารถในการจับกับตัวรับ ACE2 และอาจลดโอกาสที่แอนติบอดีที่กระตุ้นโดยวัคซีนจะจับกับโปรตีนหนามที่เปลี่ยนแปลงไปนี้ได้

จากการศึกษาบางชิ้นพบว่า L452R อาจทำให้ไวรัสโคโรนาต้านทานต่อเซลล์ Tซึ่งจำเป็นต่อการโจมตีและทำลายเซลล์ที่ติดเชื้อไวรัสได้ เซลล์ T เหล่านี้แตกต่างจากแอนติบอดีซึ่งมีประโยชน์ในการปิดกั้นอนุภาคไวรัสโคโรนาและป้องกันการแพร่กระจาย^{[ 141 ]}

วาย453เอฟ

ชื่อของการกลายพันธุ์ Y453F หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่ไทโรซีน (Y) ถูกแทนที่ด้วยฟีนิลอะลานีน (F) ที่ตำแหน่ง 453 การกลายพันธุ์นี้พบว่าอาจเชื่อมโยงกับการแพร่กระจายของ SARS-CoV-2 ในหมู่มิงค์ในเนเธอร์แลนด์ในปี 2020 ^{[ 295 ]}

เอส477จี/เอ็น

มีการระบุบริเวณที่มีความยืดหยุ่นสูงในโดเมนการจับตัวรับ (RBD) ของ SARS-CoV-2 โดยเริ่มจากกรดอะมิโนลำดับที่ 475 และต่อเนื่องไปจนถึงกรดอะมิโนลำดับที่ 485 โดยใช้วิธีการทางชีวสารสนเทศและสถิติในการศึกษาหลายครั้ง มหาวิทยาลัยกราซ^{[ 296 ]}และบริษัทเทคโนโลยีชีวภาพ Innophore ^{[ 297 ]}ได้แสดงให้เห็นในสิ่งพิมพ์ล่าสุดว่าในเชิงโครงสร้าง ตำแหน่ง S477 แสดงความยืดหยุ่นสูงสุดในบรรดาตำแหน่งเหล่านั้น^{[ 298 ]}

ในขณะเดียวกัน S477 ก็เป็นกรดอะมิโนที่ถูกแลกเปลี่ยนบ่อยที่สุดใน RBD ของ SARS-CoV-2 กลายพันธุ์ โดยใช้การจำลองพลศาสตร์โมเลกุลของ RBD ในระหว่างกระบวนการจับกับ hACE2 พบว่าทั้ง S477G และ S477N ช่วยเสริมความแข็งแรงในการจับกันของสไปค์ SARS-CoV-2 กับตัวรับ hACE2 บริษัทพัฒนาวัคซีน BioNTech ^{[ 299 ]}ได้อ้างอิงถึงการแลกเปลี่ยนกรดอะมิโนนี้ว่ามีความเกี่ยวข้องกับการออกแบบวัคซีนในอนาคตในบทความที่ตีพิมพ์ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2564 ^{[ 300 ]}

อี484คิว

ชื่อของการกลายพันธุ์ E484Q หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่กรดกลูตามิก (E) ถูกแทนที่ด้วยกลูตามีน (Q) ที่ตำแหน่ง 484 ^{[ 290 ]}

สาย พันธุ์ Kappaที่แพร่กระจายในอินเดียมี E484Q สายพันธุ์เหล่านี้ในตอนแรก (แต่เป็นการเรียกที่ทำให้เข้าใจผิด) ถูกเรียกว่า "ตัวกลายพันธุ์คู่" ^{[ 301 ]} E484Q อาจเพิ่มความสามารถในการจับกับตัวรับ ACE2 และอาจลดความสามารถของแอนติบอดีที่กระตุ้นด้วยวัคซีนในการจับกับโปรตีนหนามที่เปลี่ยนแปลงไปนี้^{[ 141 ]}

อี484เค

ชื่อของการกลายพันธุ์ E484K หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่กรดกลูตามิก (E) ถูกแทนที่ด้วยไลซีน (K) ที่ตำแหน่ง 484 ^{[ 290 ]}มีชื่อเล่นว่า "Eeek" ^{[ 302 ]}

มีรายงานว่า E484K เป็นการกลายพันธุ์หลบหนี (เช่น การกลายพันธุ์ที่ช่วยเพิ่มความสามารถของไวรัสในการหลบเลี่ยงระบบภูมิคุ้มกัน ของโฮสต์ ^{[ 303 ]}^{[ 304 ]} ) จาก แอนติบอดีโมโนโคลนอลอย่างน้อยหนึ่งรูปแบบต่อ SARS-CoV-2 ซึ่งบ่งชี้ว่าอาจมี "การเปลี่ยนแปลงที่เป็นไปได้ในแอนติเจนิก " ^{[ 305 ]}สายพันธุ์แกมมา (สายพันธุ์ P.1) ^{[ 127 ]}สายพันธุ์ซีตา (สายพันธุ์ P.2 หรือที่รู้จักกันในชื่อสายพันธุ์ B.1.1.28.2) ^{[ 130 ]}และสายพันธุ์เบตา (501.V2) แสดงการกลายพันธุ์นี้^{[ 305 ]}นอกจากนี้ยังตรวจพบจีโนมสายพันธุ์ B.1.1.7 จำนวนจำกัดที่มีการกลายพันธุ์ E484K ด้วย^{[ 306 ]}มีรายงานว่าแอนติบอดีโมโนโคลนอลและแอนติบอดีที่ได้จากซีรั่มมีประสิทธิภาพในการทำให้ไวรัสที่มีการกลายพันธุ์ E484K เป็นกลางได้น้อยกว่า 10 ถึง 60 เท่า^{[ 307 ]}^{[ 308 ]}เมื่อวันที่ 2 กุมภาพันธ์ 2021 นักวิทยาศาสตร์การแพทย์ในสหราชอาณาจักรรายงานการตรวจพบ E484K ใน 11 ตัวอย่าง (จากทั้งหมด 214,000 ตัวอย่าง) ซึ่งเป็นการกลายพันธุ์ที่อาจส่งผลกระทบต่อประสิทธิภาพของวัคซีนในปัจจุบัน^{[ 309 ]}^{[ 310 ]}

เอฟ490เอส

F490S หมายถึงการเปลี่ยนแปลงจากฟีนิลอะลานีน (F) เป็นซีรีน (S) ในตำแหน่งกรดอะมิโน ที่ 490 ^{[ 311 ]}

เป็นการกลายพันธุ์ชนิดหนึ่งที่พบในแลมบ์ดา และมีความเกี่ยวข้องกับความไวต่อแอนติบอดีที่ลดลงซึ่งสร้างขึ้นโดยผู้ที่ติดเชื้อสายพันธุ์อื่น ซึ่งหมายความว่าการรักษาด้วยแอนติบอดีต่อผู้ที่ติดเชื้อสายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ดังกล่าวจะมีประสิทธิภาพน้อยลง^{[ 312 ]}

เอ็น501วาย

N501Y หมายถึงการเปลี่ยนแปลงจากแอสปาราจีน (N) เป็นไทโรซีน (Y) ในตำแหน่งกรดอะมิโน ที่ 501 ^{[ 313 ]} N501Y ได้รับฉายาว่า "เนลลี่" ^{[ 302 ]}

PHE เชื่อว่าการเปลี่ยนแปลงนี้จะเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับเนื่องจากตำแหน่งภายในโดเมนการจับตัวรับของไกลโคโปรตีนหนามซึ่งจับกับACE2ในเซลล์มนุษย์ ข้อมูลยังสนับสนุนสมมติฐานของความสัมพันธ์ในการจับที่เพิ่มขึ้นจากการเปลี่ยนแปลงนี้^[⁸⁹^]การสร้างแบบจำลองปฏิสัมพันธ์ระดับโมเลกุลและการคำนวณพลังงานอิสระของการจับแสดงให้เห็นว่าการกลายพันธุ์ N501Y มีความสัมพันธ์ในการจับสูงสุดในตัวแปร RBD ที่น่าเป็นห่วงกับ hACE2 ^[¹^]ตัวแปรที่มี N501Y ได้แก่ แกมมา^[³⁰⁵^]^[¹²⁷^]อัลฟา (VOC 20DEC-01) เบต้า และ COH.20G/501Y (ระบุในโคลัมบัสโอไฮโอ) ^[¹^]ตัวแปรสุดท้ายนี้กลายเป็นรูปแบบที่โดดเด่นของไวรัสในโคลัมบัสในช่วงปลายเดือนธันวาคม 2020 และเดือนมกราคม และดูเหมือนว่าจะวิวัฒนาการอย่างอิสระจากตัวแปรอื่นๆ^[³¹⁴^]^[³¹⁵^]

เอ็น501เอส

N501S หมายถึงการเปลี่ยนแปลงจากแอสปาราจีน (N) เป็นซีรีน (S) ในตำแหน่งกรดอะมิโน ที่ 501 ^{[ 316 ]}

ณ เดือนกันยายน พ.ศ. 2564 มีผู้ป่วย 8 รายทั่วโลกที่ติดเชื้อไวรัสสายพันธุ์เดลต้าที่มีการกลายพันธุ์ N501S นี้ เนื่องจากถือว่าเป็นการกลายพันธุ์ที่คล้ายกับ N501Y จึงคาดว่ามีลักษณะคล้ายคลึงกับการกลายพันธุ์ N501Y ซึ่งเชื่อกันว่าจะเพิ่มความสามารถในการแพร่เชื้อของไวรัส อย่างไรก็ตาม ผลกระทบที่แท้จริงยังไม่เป็นที่ทราบแน่ชัด^{[ 317 ]}

ดี614จี

D614G เป็นการกลายพันธุ์แบบมิสเซนส์ที่ส่งผลต่อโปรตีนหนามของ SARS-CoV-2 จากการปรากฏตัวครั้งแรกในภาคตะวันออกของจีนในช่วงต้นปี 2020 ความถี่ของการกลายพันธุ์นี้ในประชากรไวรัสทั่วโลกเพิ่มขึ้นตั้งแต่ช่วงแรกของการระบาดใหญ่^{[ 319 ]} G ( ไกลซีน ) เข้ามาแทนที่ D ( กรดแอสปาร์ติก ) อย่างรวดเร็วที่ตำแหน่ง 614 ในยุโรป แม้ว่าจะช้ากว่าในจีนและส่วนอื่นๆ ของเอเชียตะวันออก ซึ่งสนับสนุนสมมติฐานที่ว่า G เพิ่มอัตราการแพร่กระจาย ซึ่งสอดคล้องกับระดับไวรัสและความสามารถในการติดเชื้อในหลอดทดลองที่สูงขึ้น^{[ 35 ]}นักวิจัยที่ใช้ เครื่องมือ PANGOLINตั้งชื่อเล่นการกลายพันธุ์นี้ว่า "Doug" ^{[ 302 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2563 มีรายงานว่าสายพันธุ์ D614G ของ SARS-CoV-2 ที่แพร่เชื้อได้ง่ายกว่าได้กลายเป็นสายพันธุ์ที่แพร่หลายที่สุดในช่วงการระบาด^{[ 320 ]}^{[ 321 ]}^{[ 322 ]}^{[ 323 ]} PHE ยืนยันว่าการกลายพันธุ์ D614G มี "ผลกระทบปานกลางต่อการแพร่กระจาย" และกำลังถูกติดตามในระดับสากล^{[ 313 ]}^{[ 324 ]}

ความชุกทั่วโลกของ D614G สัมพันธ์กับความชุกของการสูญเสียการรับกลิ่น ( anosmia ) ซึ่งเป็นอาการหนึ่งของ COVID-19 อาจเกิดจากการจับกันของ RBD กับตัวรับ ACE2 ที่สูงขึ้น หรือความเสถียรของโปรตีนที่สูงขึ้น และด้วยเหตุนี้จึงทำให้เยื่อบุผิวรับกลิ่นมีการติดเชื้อสูงขึ้น^{[ 325 ]}

ตัวแปรที่มีการกลายพันธุ์ D614G พบใน กลุ่ม G โดย GISAID ^{[ 35 ]}และ กลุ่ม B.1 โดยเครื่องมือPANGOLIN ^{[ 35 ]}

Q677P/H

ชื่อของการกลายพันธุ์ Q677P/H หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่กลูตามีน (Q) ถูกแทนที่ด้วยโพรลีน (P) หรือฮิสติดีน (H) ที่ตำแหน่ง 677 ^{[ 290 ]}มีสายพันธุ์ย่อยหลายสายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ Q677P โดยหกสายพันธุ์นี้ ซึ่งประกอบด้วยการกลายพันธุ์อื่นๆ ในรูปแบบต่างๆ กัน จะถูกเรียกตามชื่อนก ตัวอย่างเช่น สายพันธุ์หนึ่งที่สังเกตเห็นในช่วงแรกๆ มีชื่อว่า "Pelican" ในขณะที่สายพันธุ์ที่พบได้บ่อยที่สุดในช่วงต้นปี 2021 ได้รับการตั้งชื่อชั่วคราวว่า "Robin 1" ^{[ 326 ]}

มีการรายงานการกลายพันธุ์ในสายพันธุ์ต่างๆ ที่แพร่กระจายอยู่ภายในสหรัฐอเมริกาในช่วงปลายปี 2020 และบางสายพันธุ์ที่อยู่นอกประเทศด้วย 'Pelican' ถูกตรวจพบครั้งแรกในโอเรกอน และในช่วงต้นปี 2021 'Robin 1' พบได้บ่อยในแถบมิดเวสต์ของสหรัฐอเมริกาในขณะที่สายพันธุ์ย่อย Q667H อีกสายพันธุ์หนึ่งคือ 'Robin 2' พบมากในแถบตะวันออกเฉียงใต้ของสหรัฐอเมริกา^{[ 326 ]}ความถี่ของการบันทึกการกลายพันธุ์ดังกล่าวเพิ่มขึ้นตั้งแต่ปลายปี 2020 ถึงต้นปี 2021 ^{[ 327 ]}

พี681เอช

ชื่อของการกลายพันธุ์ P681H หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่โพรลีน (P) ถูกแทนที่ด้วยฮิสติดีน (H) ที่ตำแหน่ง 681 ^{[ 318 ]}

ในเดือนมกราคม 2021 นักวิทยาศาสตร์รายงานในเอกสารก่อนตีพิมพ์ว่าการกลายพันธุ์ P681H ซึ่งเป็นลักษณะเฉพาะของสายพันธุ์ Alpha และสายพันธุ์ B.1.1.207 (ที่ระบุในไนจีเรีย) แสดงให้เห็นถึงการเพิ่มขึ้นแบบทวีคูณอย่างมีนัยสำคัญในความถี่ทั่วโลก ซึ่งเป็นไปตามแนวโน้มที่คาดหวังได้ในส่วนล่างของเส้นโค้งโลจิสติกส์ สิ่งนี้อาจเปรียบเทียบได้กับแนวโน้มของ D614G ที่แพร่หลายทั่วโลกในปัจจุบัน^{[ 318 ]}^{[ 328 ]}

พี681อาร์

ชื่อของการกลายพันธุ์ P681R หมายถึงการแลกเปลี่ยนที่โพรลีน (P) ถูกแทนที่ด้วยอาร์จินีน (R) ที่ตำแหน่ง 681 ^{[ 290 ]}

กลุ่มวิจัยจีโนมิกส์ SARS-CoV-2 ของอินเดีย ( INSACOG ) พบว่านอกเหนือจากการกลายพันธุ์สองตำแหน่งคือ E484Q และ L452R แล้ว ยังมีการกลายพันธุ์ที่สำคัญอีกตำแหน่งหนึ่งคือ P681R ในสายพันธุ์ B.1.617 การกลายพันธุ์ทั้งสามตำแหน่งนี้อยู่บนโปรตีนหนาม ซึ่งเป็นส่วนสำคัญของไวรัสโคโรนาที่จับกับเซลล์ตัวรับของร่างกาย^{[ 141 ]}

เอ701วี

ตามรายงานข่าวเบื้องต้นกระทรวงสาธารณสุข มาเลเซีย ประกาศเมื่อวันที่ 23 ธันวาคม 2020 ว่าได้ค้นพบการกลายพันธุ์ในจีโนมของ SARS-CoV-2 ซึ่งกำหนดให้เป็น A701B (sic) ในตัวอย่าง 60 ตัวอย่างที่เก็บรวบรวมจากกลุ่มผู้ติดเชื้อที่เบนเต็ง ลาฮัด ดาตู ในรัฐซาบาห์การกลายพันธุ์นี้มีลักษณะคล้ายกับการกลายพันธุ์ที่พบเมื่อเร็วๆ นี้ในแอฟริกาใต้ ออสเตรเลีย และเนเธอร์แลนด์ แม้ว่าจะไม่แน่ใจว่าสายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์นี้จะแพร่เชื้อได้มากกว่าปกติหรือไม่^[³²⁹^]รัฐบาลจังหวัดซูลูในประเทศฟิลิปปินส์ ที่อยู่ใกล้เคียง ได้ระงับการเดินทางไปยังซาบาห์ชั่วคราวเพื่อตอบสนองต่อการค้นพบ 'A701B' เนื่องจากความไม่แน่นอนเกี่ยวกับลักษณะของการกลายพันธุ์^[³³⁰^]

เมื่อวันที่ 25 ธันวาคม พ.ศ. 2563 กระทรวงสาธารณสุขมาเลเซียได้อธิบายว่าการกลายพันธุ์ A701V กำลังแพร่ระบาดและพบใน 85% ของผู้ป่วย (D614G พบใน 100% ของผู้ป่วย) ในมาเลเซีย^{[ 331 ]}^{[ 332 ]}รายงานเหล่านี้ยังอ้างถึงตัวอย่างที่เก็บรวบรวมจากกลุ่มผู้ป่วยในเบนเต็ง ลาฮัด ดาตู^{[ 331 ]}^{[ 332 ]}ข้อความของประกาศดังกล่าวถูกคัดลอกอย่างครบถ้วนบนหน้าเฟซบุ๊กของนูร์ ฮิชาม อับดุลลาห์อธิบดีกรมอนามัยมาเลเซีย ซึ่งถูกอ้างถึงในบทความข่าวบางฉบับ^{[ 332 ]}

การกลายพันธุ์ A701V เกิดจากการแทนที่กรดอะมิโนอะลานีน (A) ด้วยวาลีน (V) ที่ตำแหน่ง 701 ในโปรตีนหนาม ทั่วโลก ประเทศแอฟริกาใต้ ออสเตรเลีย เนเธอร์แลนด์ และอังกฤษ ก็รายงานการกลายพันธุ์ A701V ในเวลาใกล้เคียงกับมาเลเซียเช่นกัน^{[ 331 ]}ใน GISAID พบว่าความชุกของการกลายพันธุ์นี้อยู่ที่ประมาณ 0.18% ของผู้ป่วย^{[ 331 ]}

เมื่อวันที่ 14 เมษายน 2564 กระทรวงสาธารณสุขมาเลเซียรายงานว่าคลื่นลูกที่สามซึ่งเริ่มต้นในซาบาห์เกี่ยวข้องกับการแพร่กระจายของสายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ D614G และ A701V ^{[ 333 ]}

ข้อมูลและวิธีการ

การจัดลำดับดีเอ็นเอสมัยใหม่หากมีให้บริการ อาจช่วยให้สามารถตรวจจับตัวแปรทางพันธุกรรมที่ปรากฏในเชื้อโรคระหว่างการระบาดของโรคได้อย่างรวดเร็ว (บางครั้งเรียกว่า 'การตรวจจับแบบเรียลไทม์') ^{[ 334 ]}ด้วยการใช้ซอฟต์แวร์แสดงภาพแผนภูมิวิวัฒนาการบันทึกของลำดับจีโนมสามารถจัดกลุ่มเป็นกลุ่มของจีโนมที่เหมือนกันทั้งหมดซึ่งมีชุดการกลายพันธุ์เดียวกัน แต่ละกลุ่มแสดงถึง 'ตัวแปร' 'กลุ่ม' หรือ 'สายพันธุ์' และการเปรียบเทียบลำดับทำให้สามารถอนุมานเส้นทางวิวัฒนาการของไวรัสได้ สำหรับ SARS-CoV-2 จนถึงเดือนมีนาคม 2021 มีการสร้างลำดับจีโนมของไวรัสมากกว่า 330,000 ลำดับโดยการศึกษาทางระบาดวิทยาโมเลกุลทั่วโลก^{[ 335 ]}

การตรวจจับและประเมินตัวแปรใหม่

เมื่อวันที่ 26 มกราคม 2021 รัฐบาลอังกฤษกล่าวว่าจะแบ่งปัน ความสามารถในการจัดลำดับ จีโนมกับประเทศอื่น ๆ เพื่อเพิ่ม อัตรา การจัดลำดับจีโนมและติดตามตัวแปรใหม่ และประกาศ "แพลตฟอร์มการประเมินตัวแปรใหม่" ^{[ 336 ]}ณ เดือนมกราคม2021 การจัดลำดับจีโนมของ COVID-19 มากกว่าครึ่งหนึ่งดำเนินการในสหราชอาณาจักร^{[ 337 ]}

การเฝ้าระวังน้ำเสียได้รับการพิสูจน์แล้วว่าเป็นเทคนิคหนึ่งในการตรวจจับสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ^{[ 261 ]}และติดตามการเพิ่มขึ้นของสายพันธุ์เหล่านั้นเพื่อศึกษาพลวัตการติดเชื้อที่เกี่ยวข้องอย่างต่อเนื่อง^{[ 338 ]}^{[ 339 ]}^{[ 340 ]}

การทดสอบ

การกลายพันธุ์หนึ่งรายการหรือมากกว่าที่มองเห็นได้ในการทดสอบ RT-PCR สามารถนำมาใช้ระบุตัวแปรได้อย่างน่าเชื่อถือหรือไม่นั้น ขึ้นอยู่กับความชุกของตัวแปรอื่นๆ ที่แพร่กระจายอยู่ในประชากรเดียวกันในเวลาเดียวกัน^{[ 341 ]}^{[ 342 ]}

การกลายพันธุ์ที่ใช้ในการระบุตัวแปรที่น่าเป็นห่วงในการทดสอบเชิงพาณิชย์^{[ 343 ]}
การกลายพันธุ์	อัลฟ่า	เบต้า	แกมมา	เดลต้า	โอไมครอน
Δ69–70 ^{[ e ]}
ins214EPE ^{[ f ]}
S371L/S373P ^{[ f ]}
เอ็น501วาย
อี484เค
E484A ^{[ f ]}
แอล452อาร์
nsp6:Δ106–108

การแพร่เชื้อข้ามสายพันธุ์

มีความเสี่ยงที่ COVID-19 อาจแพร่จากมนุษย์ไปยังประชากรสัตว์อื่นๆ และอาจรวมตัวกับไวรัสสัตว์อื่นๆ เพื่อสร้างสายพันธุ์ใหม่ที่เป็นอันตรายต่อมนุษย์ได้อีก^{[ 344 ]} การแพร่กระจาย แบบย้อนกลับ จากสัตว์ สู่คนอาจทำให้เกิดแหล่งสะสมของสายพันธุ์ที่กลายพันธุ์ซึ่งแพร่กลับมาสู่มนุษย์ ซึ่งเป็นแหล่งที่มาของสายพันธุ์ที่น่าเป็นห่วงอีกแหล่งหนึ่ง นอกเหนือจากผู้ที่มีภูมิคุ้มกันบกพร่อง^{[ 345 ]}

กลุ่มที่ 5

ในช่วงต้นเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2563 คลัสเตอร์ 5 หรือที่ สถาบันเซรุ่มแห่งรัฐ เดนมาร์ก (SSI) เรียกอีกอย่างว่า ΔFVI-spike ^{[ 346 ]}ถูกค้นพบในจัตแลนด์เหนือ ประเทศเดนมาร์ก เชื่อกันว่าเชื้อนี้แพร่จากตัวมิงค์สู่มนุษย์ผ่านฟาร์มมิงค์เมื่อวันที่ 4 พฤศจิกายน พ.ศ. 2563 มีการประกาศว่าจะมีการกำจัด ประชากรมิงค์ในเดนมาร์กเพื่อป้องกันการแพร่กระจายของการกลายพันธุ์นี้และลดความเสี่ยงของการเกิดการกลายพันธุ์ใหม่ มีการประกาศล็อกดาวน์และจำกัดการเดินทางใน 7 เทศบาลของจัตแลนด์เหนือเพื่อป้องกันการแพร่กระจายของการกลายพันธุ์ ซึ่งอาจส่งผลกระทบต่อ การรับมือกับ การระบาดใหญ่ของ COVID-19 ทั้งในระดับชาติและระดับนานาชาติภายในวันที่ 5 พฤศจิกายน พ.ศ. 2563 ตรวจพบผู้ป่วยที่เกี่ยวข้องกับมิงค์ประมาณ 214 ราย^[³⁴⁷^]

องค์การอนามัยโลก (WHO) ระบุว่าคลัสเตอร์ 5 มี "ความไวต่อแอนติบอดีที่ทำให้เป็นกลางลดลงปานกลาง" ^{[ 348 ]} SSI เตือนว่าการกลายพันธุ์อาจลดประสิทธิภาพของวัคซีนโควิด-19ที่อยู่ระหว่างการพัฒนา แม้ว่าจะไม่น่าจะทำให้วัคซีนไร้ประโยชน์ก็ตาม หลังจากการล็อกดาวน์และการตรวจหาเชื้อจำนวนมาก SSI ประกาศเมื่อวันที่ 19 พฤศจิกายน 2020 ว่าคลัสเตอร์ 5 น่าจะสูญพันธุ์ไปแล้ว^{[ 349 ]} ภายในวันที่ 1 กุมภาพันธ์ 2021 ผู้เขียน บทความ ที่ได้รับการตรวจสอบโดยผู้ทรงคุณวุฒิซึ่งทั้งหมดมาจาก SSI ได้ประเมินว่าคลัสเตอร์ 5 ไม่ได้แพร่กระจายอยู่ในประชากรมนุษย์^{[ 350 ]}

วัคซีน

ในช่วงการระบาดของโควิด-19 มีการพัฒนาวัคซีนหลายชนิด วัคซีนเหล่านี้ถูกนำมาใช้ฉีดให้กับกลุ่มเป้าหมายที่หลากหลาย โดยทั่วไปแล้วจะเริ่มจากกลุ่มประชากรที่มีความเสี่ยงสูงที่สุดก่อน

ประสิทธิภาพของวัคซีนที่แตกต่างกัน

ปฏิสัมพันธ์ระหว่างไวรัส SARS-CoV-2 กับโฮสต์ที่เป็นมนุษย์ในตอนแรกเป็นไปตามธรรมชาติ แต่ต่อมาเริ่มเปลี่ยนแปลงไปเนื่องจากวัคซีน มีให้ใช้มากขึ้น ในปี 2021 ^{[ 351 ]}การเกิดขึ้นของสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ที่มีความต้านทานต่อการตอบสนองของแอนติบอดีที่เกิดจากวัคซีน COVID-19 ในระดับปานกลางหรือเต็มที่ อาจทำให้จำเป็นต้องมีการปรับเปลี่ยนวัคซีน^{[ 352 ]}การเกิดขึ้นของสายพันธุ์ที่ต้านทานวัคซีนมีแนวโน้มที่จะเกิดขึ้นในประชากรที่ได้รับการฉีดวัคซีนในระดับสูงและมีการแพร่กระจายที่ไม่สามารถควบคุมได้^{[ 353 ]}

ณ เดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2564 สำนักงานคณะกรรมการอาหารและยา ของสหรัฐอเมริกา เชื่อว่าวัคซีนที่ได้รับอนุญาตจาก FDA ทั้งหมดยังคงมีประสิทธิภาพในการป้องกันเชื้อ SARS-CoV-2 ที่แพร่ระบาดอยู่^{[ 352 ]}

การหลบเลี่ยงระบบภูมิคุ้มกันโดยสายพันธุ์ต่างๆ

เมื่อเปรียบเทียบกับสายพันธุ์อื่น ๆ ที่ได้รับการตรวจสอบก่อนหน้านี้สายพันธุ์ SARS-CoV-2 Omicron ^{[ 354 ]}^{[ 355 ]}และสายพันธุ์ย่อย BA.4/5 ^{[ 356 ]}ได้หลบเลี่ยงภูมิคุ้มกันที่เกิดจากวัคซีน ซึ่งอาจนำไปสู่การติดเชื้อแม้ จะได้รับ การฉีดวัคซีนเมื่อเร็ว ๆ นี้ก็ตาม อย่างไรก็ตาม เชื่อกันว่าวัคซีนสามารถป้องกันการเจ็บป่วยรุนแรง การเข้ารักษาในโรงพยาบาล และการเสียชีวิตจาก Omicron ได้^{[ 357 ]}

การปรับเปลี่ยนวัคซีน

ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2565 บริษัท PfizerและModernaได้พัฒนาวัคซีนแบบไบวาเลนต์เพื่อป้องกันเชื้อSARS-CoV-2 สายพันธุ์ป่าและสายพันธุ์ Omicron วัคซีนแบบไบวาเลนต์ได้รับการยอมรับเป็นอย่างดีและให้ภูมิคุ้มกันต่อ Omicron ได้ดีกว่าวัคซีน mRNA รุ่นก่อนๆ^{[ 358 ]} ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2565 องค์การอาหารและยาแห่งสหรัฐอเมริกา(FDA) ได้อนุมัติวัคซีนแบบไบวาเลนต์^{[ 359 ]}^{[ 360 ]}^{[ 361 ]}

ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2566 องค์การอาหารและยา (FDA) ได้แนะนำผู้ผลิตว่าสูตรวัคซีนโควิด-19 สำหรับปี พ.ศ. 2566–2567 ที่จะใช้ในสหรัฐอเมริกาควรได้รับการปรับปรุงให้เป็นวัคซีนโควิด-19 ชนิดโมโนวาเลนต์ โดยใช้สายพันธุ์ XBB.1.5 ของโอไมครอน^{[ 362 ]}^{[ 363 ]}ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2567 องค์การอาหารและยา (FDA) ได้แนะนำผู้ผลิตว่าสูตรวัคซีนโควิด-19 สำหรับปี พ.ศ. 2567–2568 ที่จะใช้ในสหรัฐอเมริกาควรได้รับการปรับปรุงให้เป็นวัคซีนโควิด-19 ชนิดโมโนวาเลนต์โดยใช้สายพันธุ์ JN.1 ^{[ 364 ]}

ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2567 คณะกรรมการผลิตภัณฑ์ยาสำหรับมนุษย์ของสำนักงานยาแห่งยุโรป (EMA) ได้ให้ความเห็นเชิงบวกในการปรับปรุงองค์ประกอบของ Bimervax ซึ่งเป็นวัคซีนที่มุ่งเป้าไปที่สายพันธุ์ย่อย Omicron XBB.1.16 ^{[ 365 ]}

ณ เดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2568 องค์การอนามัยโลกแนะนำว่าวัคซีนโมโนวาเลนต์ JN.1 หรือ KP.2 ยังคงเป็นแอนติเจนวัคซีนที่เหมาะสม และวัคซีนโมโนวาเลนต์ LP.8.1 เป็นแอนติเจนวัคซีนทางเลือกที่เหมาะสม^{[ 366 ]} EMA แนะนำให้ปรับปรุงวัคซีน COVID-19 โดยกำหนดเป้าหมายที่ LP.8.1 สำหรับแคมเปญการฉีดวัคซีนปี พ.ศ. 2568/2569 ^{[ 367 ]}

ดูเพิ่มเติม

ไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์โอไมครอน
GX P2Vเป็นสายพันธุ์กลายพันธุ์ของไวรัสโควิด-19 ที่เป็นอันตรายถึงชีวิตต่อหนูทดลองที่ได้รับการดัดแปลงพันธุกรรมให้มี hACE2 ของมนุษย์
RaTG13เป็นญาติที่ใกล้เคียงที่สุดอันดับสองของ SARS-CoV-2 ที่รู้จักกัน
การป้องกันการระบาดใหญ่ § การเฝ้าระวังและการทำแผนที่
ชื่อเรียกแบบไม่เป็นทางการของสายพันธุ์ต่างๆ ของไวรัสโควิด-19
วัคซีนโควิด-19 § ประสิทธิภาพ

หมายเหตุ

1 2ในแหล่งข้อมูลอื่น GISAID ตั้งชื่อกลุ่มสายพันธุ์ 7 กลุ่มโดยไม่มี กลุ่มสายพันธุ์ O แต่รวมถึง กลุ่มสายพันธุ์^{GV ด้วย [ 21 ]}
↑ตามที่ WHO ระบุไว้ว่า "สายพันธุ์หรือกลุ่มสายพันธุ์สามารถกำหนดได้จากไวรัสที่มีบรรพบุรุษร่วมกันที่กำหนดโดยวิวัฒนาการ"^{[ 53 ]}
↑
ณ เดือนมกราคม 2021จะต้องตรงตามเกณฑ์อย่างน้อยหนึ่งข้อต่อไปนี้จึงจะนับเป็นกลุ่มในระบบ Nextstrain (อ้างอิงจากแหล่งที่มา):^[²⁰^]
1. กลุ่มสายพันธุ์หนึ่งมีสัดส่วนการแพร่หลายทั่วโลกมากกว่า 20% เป็นเวลา 2 เดือนขึ้นไป
2. กลุ่มสายพันธุ์หนึ่งมีสัดส่วนความถี่ในระดับภูมิภาคมากกว่า 30% เป็นเวลา 2 เดือนขึ้นไป
3. มีการระบุ VOC ('ตัวแปรที่น่าเป็นห่วง') (ปัจจุบัน [6 มกราคม 2021] ใช้กับ 501Y.V1 และ 501Y.V2)
↑อ้างอิงจากตัวติดตามต่างๆ^{[ 24 ]}^{[ 25 ]}^{[ 30 ]}^{[ 68 ]}^{[ 69 ]}และรายงานเป็นระยะ^{[ 70 ]}^{[ 71 ]}^{[ 72 ]}
↑ทำให้เกิด ความล้มเหลวในการกำหนดเป้าหมาย ยีน S (SGTF) ใน TaqPath
1 2 3ตรวจจับได้ด้วยการทดสอบ TIB MolBiol โดยใช้วิธีเส้นโค้งการหลอมเหลว

External links

Scholia has a profile for variants of SARS-CoV-2 (Q104450895).

CoVariants
Cov-Lineages
GISAID – hCov19 Variants

[81] ประสิทธิภาพของการติดเชื้อตามธรรมชาติในการป้องกันการติดเชื้อซ้ำเมื่อมีให้ใช้งาน

[delta-ontario-85] 1 2 7 กุมภาพันธ์ – 22 มิถุนายน 2021 ออนแทรีโออัตราการเสียชีวิต 0.04% สำหรับกลุ่มอายุ <50 ปีที่ไม่ได้รับวัคซีน 6.5% สำหรับกลุ่มอายุ >50 ปีที่ไม่ได้รับวัคซีน^{[ 80 ]}

[different-conditions-86] 1 2ความแตกต่างอาจเกิดจากนโยบายและการแทรกแซงที่แตกต่างกันในแต่ละพื้นที่ที่ศึกษาในช่วงเวลาที่ต่างกัน ศักยภาพของระบบสาธารณสุขในท้องถิ่น หรือรูปแบบต่างๆ ที่แพร่หลายในช่วงเวลาและสถานที่ของการศึกษา

[87] 1 เมษายน – 6 มิถุนายน 2021 สกอตแลนด์^{[ 79 ]}การศึกษาเบื้องต้นอีกฉบับในออนแทรีโอพบว่าการเข้ารักษาในโรงพยาบาลโดยเดลต้าเพิ่มขึ้น 120% เมื่อเทียบกับสายพันธุ์ ที่ไม่ใช่ VOC ^{[ B ]}^{[ C ]}

[89] การศึกษาในอิสราเอลติดตามผู้ที่หายป่วยแล้วแต่ไม่ได้รับการฉีดวัคซีนจำนวน 46,035 คน และผู้ที่ได้รับการฉีดวัคซีนจำนวน 46,035 คน ที่มีการกระจายอายุใกล้เคียงกัน เพื่อเปรียบเทียบการเกิดการติดเชื้อในช่วงระยะเวลาติดตามผล พบการติดเชื้อ 640 รายในกลุ่มที่ได้รับการฉีดวัคซีน และ 108 รายในกลุ่มที่หายป่วยแล้ว

[92] การทำให้เป็นกลางลดลงปานกลางด้วย Covaxin^{[ 82 ]}

[same-alpha-100] 1 2 3 B.1.1.7 ที่มี E484K สันนิษฐานว่าแตกต่างจาก B.1.1.7 เฉพาะในด้านกิจกรรมแอนติบอดีที่ทำให้เป็นกลางเท่านั้น^{[ 69 ]}

[alpha-severity-102] 1 2 23 พฤศจิกายน 2020 – 31 มกราคม 2021 ประเทศอังกฤษ^{[ 90 ]} CFR 0.06% สำหรับกลุ่มอายุ <50 ปี 4.8% สำหรับกลุ่มอายุ >50 ปี^{[ 80 ]}

[low-confidence-105] ช่วง ความเชื่อมั่นหรือช่วงความน่าเชื่อถือที่รายงานมานั้นมีความน่าจะเป็นต่ำ ดังนั้นค่าประมาณจึงสามารถเข้าใจได้เพียงว่าเป็นไปได้ ไม่ใช่แน่นอนหรือมีแนวโน้มสูง

[106] มีนาคม 2020 – กุมภาพันธ์ 2021, มาเนาส์^{[ C ]}

[107] ยกเว้น Pfizer–BioNTech^{[ 68 ]}

[110] อ็อกซ์ฟอร์ด-แอสตราเซเนกา, โนวาแวกซ์

[O/GV-36] 1 2ในแหล่งข้อมูลอื่น GISAID ตั้งชื่อกลุ่มสายพันธุ์ 7 กลุ่มโดยไม่มี กลุ่มสายพันธุ์ O แต่รวมถึง กลุ่มสายพันธุ์^{GV ด้วย [ 21 ]}

[55] ตามที่ WHO ระบุไว้ว่า "สายพันธุ์หรือกลุ่มสายพันธุ์สามารถกำหนดได้จากไวรัสที่มีบรรพบุรุษร่วมกันที่กำหนดโดยวิวัฒนาการ"^{[ 53 ]}

[Nextstrain_criteria-58] ณ เดือนมกราคม 2021จะต้องตรงตามเกณฑ์อย่างน้อยหนึ่งข้อต่อไปนี้จึงจะนับเป็นกลุ่มในระบบ Nextstrain (อ้างอิงจากแหล่งที่มา):^[²⁰^]
กลุ่มสายพันธุ์หนึ่งมีสัดส่วนการแพร่หลายทั่วโลกมากกว่า 20% เป็นเวลา 2 เดือนขึ้นไป
กลุ่มสายพันธุ์หนึ่งมีสัดส่วนความถี่ในระดับภูมิภาคมากกว่า 30% เป็นเวลา 2 เดือนขึ้นไป
มีการระบุ VOC ('ตัวแปรที่น่าเป็นห่วง') (ปัจจุบัน [6 มกราคม 2021] ใช้กับ 501Y.V1 และ 501Y.V2)

[mwDf8] กลุ่มสายพันธุ์หนึ่งมีสัดส่วนการแพร่หลายทั่วโลกมากกว่า 20% เป็นเวลา 2 เดือนขึ้นไป

[mwDgA] กลุ่มสายพันธุ์หนึ่งมีสัดส่วนความถี่ในระดับภูมิภาคมากกว่า 30% เป็นเวลา 2 เดือนขึ้นไป

[mwDgE] มีการระบุ VOC ('ตัวแปรที่น่าเป็นห่วง') (ปัจจุบัน [6 มกราคม 2021] ใช้กับ 501Y.V1 และ 501Y.V2)

[76] อ้างอิงจากตัวติดตามต่างๆ^{[ 24 ]}^{[ 25 ]}^{[ 30 ]}^{[ 68 ]}^{[ 69 ]}และรายงานเป็นระยะ^{[ 70 ]}^{[ 71 ]}^{[ 72 ]}

[360] ทำให้เกิด ความล้มเหลวในการกำหนดเป้าหมาย ยีน S (SGTF) ใน TaqPath

[tibmolbiol-assay-361] 1 2 3ตรวจจับได้ด้วยการทดสอบ TIB MolBiol โดยใช้วิธีเส้นโค้งการหลอมเหลว

[mwDf8] กลุ่มสายพันธุ์หนึ่งมีสัดส่วนการแพร่หลายทั่วโลกมากกว่า 20% เป็นเวลา 2 เดือนขึ้นไป

[mwDgA] กลุ่มสายพันธุ์หนึ่งมีสัดส่วนความถี่ในระดับภูมิภาคมากกว่า 30% เป็นเวลา 2 เดือนขึ้นไป

[mwDgE] มีการระบุ VOC ('ตัวแปรที่น่าเป็นห่วง') (ปัจจุบัน [6 มกราคม 2021] ใช้กับ 501Y.V1 และ 501Y.V2)

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[

[

[

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ก]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

[ 50 ]

ในกรณีที่องค์การอนามัยโลกใช้ตัวอักษรกรีกทั้งหมด หน่วยงานได้พิจารณา ที่

[ 52 ]

b ] มี

[ 53 ]

[ 54 ]

[ 55 ]

[ c ]

56

[ 57 ]

[ 58 ]

[ 59 ]

[ 60 ]

[

[

[

[

[

[ 66 ]

[ 67 ]

[ d ]

68

73 ]

[ 74 ]

Omicron

[ 76 ]

[ A ]

[ 77 ]

[ 78 ]

[ D ]

[ B ]

[ E ]

[ 81 ]

[ F ]

[ 83 ]

[ 84 ]

[ 85 ]

[ 86 ]

[ 87 ]

[ 88 ]

[ 89 ]

[ G ]

[ H ]

[ 91 ]

[ 92 ]

[ I ]

[ J ]

[ K ]

[ 93 ]

[ 94 ]

[ L ]

[ 80 ]

[ 79 ]

[ C ]