ลิงลีเมอร์ ได้ รับการจำแนกประเภทครั้งแรกในปี 1758 โดยคาร์ล ลินเนียสและการจำแนกประเภททางอนุกรมวิธานยังคงเป็นที่ถกเถียงกันอยู่จนถึงปัจจุบัน โดยมีการยอมรับประมาณ 70 ถึง 100  ชนิดและชนิดย่อย ขึ้นอยู่กับว่าคำว่า "ชนิด" นั้นมีความหมายอย่างไร ลิงลีเมอร์ ได้วิวัฒนาการอย่างอิสระบนเกาะมาดากัสการ์และมีความหลากหลายเพื่อเติมเต็มช่องว่างทางนิเวศวิทยา หลายแห่งที่ปกติแล้วเป็นที่อยู่อาศัยของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดอื่น พวกมันเป็น ลิงที่มีขนาดเล็กที่สุดในโลก และครั้งหนึ่งเคยเป็นลิงที่มีขนาดใหญ่ที่สุด นับตั้งแต่มนุษย์เข้ามาเมื่อประมาณ 2,000 ปีที่แล้ว ลิงลีเมอร์ก็เหลืออยู่เพียง 10% ของเกาะ หรือประมาณ 60,000 ตารางกิโลเมตร (23,000 ตารางไมล์) และหลายชนิดกำลังเผชิญกับการสูญ พันธุ์ ความกังวลเกี่ยวกับการอนุรักษ์ลิงลีเมอร์ส่งผลกระทบต่อการจำแนกประเภททางอนุกรมวิธานของลิงลีเมอร์ เนื่องจากชนิดที่แตกต่างกันได้รับการเอาใจใส่ในการอนุรักษ์มากกว่าชนิดย่อย

ความสัมพันธ์ระหว่างลิงไอไอและลิงลีเมอร์ชนิดอื่นๆ มีผลกระทบมากที่สุดต่อการจำแนกประเภทของลิงลีเมอร์ใน ระดับ วงศ์ขึ้นไป การวิเคราะห์ทางพันธุกรรมของความสัมพันธ์นี้ยังช่วยให้ เข้าใจ วิวัฒนาการของ ลิงลีเมอร์ได้ชัดเจนขึ้น และสนับสนุนสมมติฐานที่ว่าลิงลีเมอร์อพยพมายังมาดากัสการ์โดยอาศัยแพ แม้ว่าจะมีความเห็นพ้องกันโดยทั่วไปเกี่ยวกับวิวัฒนาการ แต่การจำแนกประเภทก็ยังคงเป็นที่ถกเถียงกันอยู่ ใน ระดับ สกุลการจำแนกประเภทค่อนข้างคงที่มาตั้งแต่ปี 1931 แต่ก็มีการยอมรับสกุลเพิ่มเติมอีกหลายสกุลนับตั้งแต่นั้นมา

นับตั้งแต่ทศวรรษ 1990 เป็นต้นมา จำนวนชนิดและชนิดย่อยของลีเมอร์ที่ได้รับการยอมรับได้ เพิ่มขึ้นอย่างมาก เนื่องจากการค้นพบชนิดใหม่ การยกระดับชนิดย่อยที่มีอยู่ให้เป็นชนิดเต็มรูปแบบ และการยอมรับชนิดใหม่ในประชากรที่รู้จักกันมาก่อนหน้านี้ซึ่งไม่ได้เป็นชนิดย่อยที่แตกต่างกัน ปัจจุบัน ลีเมอร์ที่ยังมีชีวิตอยู่แบ่งออกเป็น 5 วงศ์ และ 15 สกุล หาก รวม ลีเมอร์ที่สูญพันธุ์ไปแล้วในรูปซากดึกดำบรรพ์จะเพิ่มขึ้นเป็น 3 วงศ์ 8 สกุล และ 17 ชนิด การเพิ่มขึ้นของจำนวนชนิดในปัจจุบันเป็นผลมาจากการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมที่ดีขึ้นและการผลักดันด้านการอนุรักษ์เพื่อส่งเสริมการปกป้องประชากรลีเมอร์ที่แยกตัวและแตกต่างกัน ไม่ใช่ทุกคนในแวดวงวิทยาศาสตร์ที่สนับสนุนการเปลี่ยนแปลงทางอนุกรมวิธานเหล่านี้ โดยบางคนเห็นว่าควรประมาณการว่ามีลีเมอร์ที่ยังมีชีวิตอยู่ประมาณ 50 ชนิด

นับตั้งแต่การมาถึงของพวกมันบนเกาะมาดากัสการ์ซึ่งเป็นเกาะที่แยกตัวทางชีวภูมิศาสตร์ และมี สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่เป็นเอกลักษณ์ลีเมอร์ได้มีความหลากหลายทั้งในด้านพฤติกรรมและรูปร่าง ความหลากหลายของพวกมันเทียบได้กับลิงและอุรังอุตังที่พบได้ทั่วโลก โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อพิจารณาลีเมอร์ซากดึกดำบรรพ์ ที่สูญพันธุ์ไปเมื่อไม่นานมานี้ ^{[ 1 ]} ลีเมอ ร์มีขนาดตั้งแต่ลีเมอร์หนูของมาดามแบร์ธที่ มีน้ำหนัก 30 กรัม (1.1 ออนซ์) ซึ่งอาจเป็นไพรเมตที่เล็กที่สุดในโลก^{[ 2 ]} ไปจนถึงอา ร์คีโออินดริส ฟอนทอย นอนติที่สูญพันธุ์ไปแล้ว ซึ่งมีน้ำหนัก ^160–200กิโลกรัม (350–440 ปอนด์) ซึ่งเป็น โปรซิเมียนที่ใหญ่ที่สุดเท่าที่รู้จัก[ ^{3 ] [ 4 ] [ 5 ]}ลีเมอร์ได้วิวัฒนาการรูปแบบการเคลื่อนที่ที่หลากหลาย ระดับความซับซ้อนทางสังคมที่แตกต่างกัน และการปรับตัวที่เป็นเอกลักษณ์ให้เข้ากับสภาพภูมิอากาศในท้องถิ่น พวกมันเข้าไปเติมเต็มช่องว่างต่างๆ ที่ปกติแล้วมักถูกครอบครองโดยลิง กระรอกนกหัวขวานและสัตว์กีบกินพืชขนาดใหญ่[ 6 ^{] [ 7 ]นอกจากความ} หลากหลายที่น่าทึ่งระหว่างตระกูลลีเมอร์แล้ว ยังมีการกระจายตัวอย่างมากในหมู่ลีเมอร์ที่มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกันอีกด้วย^{[ 1 ]}

การมาถึงของมนุษย์บนเกาะเมื่อ 1,500 ถึง 2,000 ปีก่อนได้ส่งผลกระทบอย่างมาก ไม่เพียงแต่ต่อขนาดของประชากรลีเมอร์เท่านั้น แต่ยังรวมถึงความหลากหลายของพวกมันด้วย^{[ 7 ]} เนื่องจากการทำลายถิ่นที่อยู่และการล่าสัตว์ ทำให้ลีเมอร์อย่างน้อย 17 ชนิดและ 8 สกุลสูญพันธุ์ไป และอีกหลายชนิดก็ตกอยู่ในภาวะเสี่ยงต่อการสูญพันธุ์^{[ 8 ]} ในอดีต ลีเมอร์เคยอาศัยอยู่ทั่วทั้งเกาะในหลากหลายถิ่นที่อยู่ รวมถึงป่าผลัดใบแห้งป่าที่ราบต่ำ ป่าละเมาะ มีหนาม ป่ากึ่งชื้น ป่า^บนภูเขาและป่าชายเลนปัจจุบัน พื้นที่อยู่อาศัยของพวกมันถูกจำกัดเหลือเพียง 10% ของเกาะ หรือประมาณ 60,000 ตารางกิโลเมตร⁽ 23,000 ตารางไมล์⁾ [ 9 ^]ป่า และลีเมอร์ที่เหลืออยู่ส่วนใหญ่พบได้ตามบริเวณรอบนอกของเกาะ บริเวณใจกลางเกาะHauts-Plateauxถูกเปลี่ยนโดยผู้ตั้งถิ่นฐานยุคแรกให้เป็นนาข้าวและทุ่งหญ้าโดยใช้วิธีการทำไร่เลื่อนลอยและเผาซึ่งเป็นที่รู้จักในท้องถิ่นว่าtavyเมื่อการกัดเซาะทำให้ดินเสื่อมโทรม วงจรการงอกใหม่ของป่าและการเผาก็สิ้นสุดลง เนื่องจากป่าค่อยๆ ไม่สามารถกลับมาเติบโตได้อีก^{[ 10 ]} ในปี 2551 ลิงลีเมอร์ 41% ของสายพันธุ์ทั้งหมดเสี่ยงต่อการสูญพันธุ์ ในขณะที่ 42% ถูกจัดอยู่ในบัญชีแดงของ IUCNว่า " ข้อมูลไม่เพียงพอ " ^{[ 11 ]}

ในเล่มแรกของSystema Naturaeฉบับที่ 10 (1758) คาร์ล ลินเนียสผู้ก่อตั้งระบบการตั้งชื่อแบบทวิภาค สมัยใหม่ ได้สร้างสกุลLemur ขึ้นมา เพื่อรวมสามชนิด ได้แก่Lemur tardigradus ( ลอริสแดงเพรียวบางซึ่งปัจจุบันรู้จักกันในชื่อLoris tardigradus ), Lemur catta ( ลีเมอร์หางวงแหวน ) และLemur volans ( โคลูโกฟิลิปปินส์ซึ่งปัจจุบันรู้จักกันในชื่อCynocephalus volans ) ^{[ 12 ]} แม้ว่าคำว่า "ลีเมอร์" ในตอนแรกจะหมายถึงลอริสแต่ในไม่ช้าก็ถูกนำไปใช้กับ ไพรเมต พื้นเมืองของมาดากัสการ์ ซึ่งเป็นที่รู้จักกันในชื่อ "ลีเมอร์" นับตั้งแต่นั้นเป็นต้นมา^{[ 13 ] [ 14 ]}ชื่อนี้มาจากคำภาษาละตินlemuresซึ่งหมายถึง "วิญญาณของผู้ตาย" จากเทพนิยายโรมัน^{[ 1 ]} ตามคำอธิบายของลินเนียสเอง ชื่อนี้ถูกเลือกเนื่องจากกิจกรรมในเวลากลางคืนและการเคลื่อนไหวที่ช้าของลอริสผอมบาง^{[ 14 ]}ด้วยความคุ้นเคยกับผลงานของเวอร์จิลและโอวิดและเห็นความคล้ายคลึงที่เข้ากับรูปแบบการตั้งชื่อของเขา ลินเนียสจึงดัดแปลงคำว่า "ลีเมอร์" สำหรับไพรเมตที่ออกหากินในเวลากลางคืนเหล่านี้^{[ 15 ]}อย่างไรก็ตาม เป็นที่เข้าใจกันโดยทั่วไปและผิดพลาดว่าลินเนียสหมายถึงรูปลักษณ์ที่เหมือนผี ดวงตาที่สะท้อนแสงและเสียงร้องที่เหมือนผีของลีเมอร์^{[ 14 ]}นอกจากนี้ยังมีการคาดเดาว่าลินเนียสอาจรู้ว่าชาวมาลากัสซีบางกลุ่มมีตำนานที่ว่าลีเมอร์เป็นวิญญาณของบรรพบุรุษของพวกเขา^{[ 16 ]}แต่สิ่งนี้ไม่น่าเป็นไปได้เนื่องจากชื่อนี้ถูกเลือกสำหรับลอริสผอมบางจากอินเดีย^{[ 14 ]}

นับตั้งแต่มีการจัดจำแนก ทางอนุกรมวิธาน ของลีเมอร์ครั้งแรก มีการเปลี่ยนแปลงมากมายในอนุกรมวิธานของลีเมอร์ ภายในอันดับไพรเมตกระรอกต้นไม้ (อันดับ Scandentia) เคยถูกพิจารณาว่าเป็นไพรเมตพื้นฐานในกลุ่มโปรซิเมียน ซึ่งเป็นญาติใกล้ชิดของลีเมอร์ จนกระทั่งถึงทศวรรษ 1980 ^{[ 17 ]}โคลูโกซึ่งเรียกอย่างไม่ถูกต้องว่า "ลีเมอร์บิน" เคยถูกพิจารณาว่าเป็นไพรเมตที่คล้ายลีเมอร์ แต่ถูกจัดประเภทใหม่เป็นญาติใกล้ชิดของค้างคาว [ ^{18 ]}และเมื่อไม่นานมานี้เป็นญาติใกล้ชิดของไพรเมตภายในอันดับ Dermoptera ของพวกมันเอง^{[ 19 ] ไพรเมต พร้อมด้วยญาติใกล้ชิดที่สุดของพวกมัน ได้แก่ กระรอก} ต้นไม้ โคลูโก และเพลเซียดาพิฟอร์ม ที่สูญพันธุ์ไปนานแล้ว ก่อตัว เป็น กลุ่ม Euarchontaที่ไม่มีลำดับชั้น ทางอนุกรมวิธาน ภายในEuarchontoglires โลริสิดส์ซึ่งบางส่วนเดิมทีจัดอยู่ในสกุลเลมูร์โดยคาร์ล ลินเนียส ได้ถูกย้ายไปอยู่ในอันดับย่อยของตัวเอง (Lorisiformes) หรือวงศ์ใหญ่ของตัวเอง (Lorisoidea) ภายใน Lemuriformes ^{[ 20 ] [ 21 ]}

สำหรับสัตว์จำพวกไพรเมตของมาดากัสการ์ การตั้งชื่อทางอนุกรมวิธานแพร่หลายในช่วงทศวรรษ 1800 โดยได้รับความช่วยเหลือจากนักอนุกรมวิธาน ของพิพิธภัณฑ์ เช่นอัลเบิร์ต กุนเธอร์และจอห์น เอ็ดเวิร์ด เกรย์รวมถึงนักธรรมชาติวิทยาและนักสำรวจ เช่นอัลเฟรด แกรนดิดิเยร์ [ ^{22 ] [ 23 ] การ} ตั้งชื่อนี้ยังไม่ได้รับการจัดระเบียบจนกระทั่งหลายทศวรรษต่อมา เมื่อเอิร์นส์ ชวาร์ซได้กำหนดมาตรฐานในปี 1931 ^{[ 24 ] [ 25 ]} จนกระทั่งทศวรรษ 1990 การตั้งชื่อนี้จึงเริ่มเห็นการเปลี่ยนแปลงทางอนุกรมวิธานครั้งใหม่^{[ 26 ]}

แม้ว่าเดิมทีคาร์ล ลินเนียสจะจัดกลุ่ม "ลีเมอร์" กลุ่มแรกที่เขาจัดประเภทไว้ภายใต้ลำดับไพรเมต^{[ 27 ]}แต่ต่อมาลีเมอร์และไพรเมตที่ไม่ใช่มนุษย์อื่นๆ ก็ถูกแยกออกจากมนุษย์โดยจัดไว้ในลำดับควอดรูมานาโดยโยฮันน์ ฟรีดริช บลูเมนบัคในปี 1775 (เขายังจัดมนุษย์ไว้ในลำดับบิมานาด้วย) ^{[ 28 ]} มุมมองนี้ได้รับการสนับสนุนจากนักธรรมชาติวิทยาและนักสัตววิทยา ที่มีชื่อเสียงคนอื่นๆ ในยุคนั้น รวมถึงเอเตียน จอฟฟรอย แซงต์-ฮิแลร์ (ผู้ซึ่งจัดลีเมอร์ไว้ในสเตรปซิรินีเป็นครั้งแรกในปี 1812) ^{[ 29 ]}จอร์จ คูเวียร์ [ ^{30 ] และ} (ในตอนแรก) จอห์น เอ็ดเวิร์ด เกรย์^{[ 31 ]} ในปี พ.ศ. 2405 วิลเลียม เฮนรี ฟลาวเวอร์นักกายวิภาคเปรียบเทียบได้โต้แย้งการย้ายสเตรปซิไรน์ออกจากควอดรูมานาไปอยู่ในอินเซ็กทิโวรา (ซึ่งเป็นการจัดกลุ่มทางชีววิทยาที่ถูกยกเลิกไปแล้ว) โดยอ้างว่าสมองของพวกมันมีลักษณะที่อยู่ระหว่างไพรเมตอื่นๆ และสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่ "ด้อยกว่า" ^{[ 32 ]} ในปี พ.ศ. 2406 โทมัส เฮนรี ฮักซ์ลีย์ได้ฟื้นฟูอันดับไพรเมตให้รวมถึงมนุษย์ ลิงใหญ่ชนิดอื่นๆ ลิง ลีเมอร์ และแม้แต่โคลูกอต^{[ 33 ]} อย่างไรก็ตาม การต่อต้านยังคงดำเนินต่อไป โดยผู้เชี่ยวชาญหลายคนโต้แย้งว่าลีเมอร์ (หรือ "ลิงครึ่งตัว") ควรอยู่ในอันดับของตนเอง ในปี พ.ศ. 2416 เซนต์ จอร์จ แจ็กสัน มิวาร์ต นักกายวิภาคเปรียบเทียบชาวอังกฤษ ได้โต้แย้งข้อโต้แย้งเหล่านี้และดำเนินการกำหนดไพรเมตโดยใช้รายการลักษณะทางกายวิภาค^{[ 34 ]}

ตั้งแต่ศตวรรษที่ 19 การจำแนกประเภทของลีเมอร์เหนือระดับสกุลมีการเปลี่ยนแปลงมากมาย นักอนุกรมวิธานยุคแรกเสนอการจำแนกประเภทลีเมอร์ที่หลากหลาย แต่โดยทั่วไปแล้วจะแยกอินดริอิดออกจากลีเมอร์อื่นๆ และจัดให้เอเย-เอเยอยู่ในกลุ่มใหญ่ของตัวเอง บางคนจัดลีเมอร์แคระและลีเมอร์หนูไว้กับกาลาโก^{[ 37 ]}ในปี พ.ศ. 2458 วิลเลียม คิง เกรกอรี ได้ ตีพิมพ์การจำแนกประเภท^{[ 38 ]}ซึ่งยังคงได้รับการยอมรับโดยทั่วไปในอีกหลายทศวรรษต่อมา เขาจัดลีเมอร์ทั้งหมดไว้ด้วยกันใน "ชุด" Lemuriformes และยอมรับสามวงศ์ ได้แก่ Daubentoniidae, Indriidae และ Lemuridae (รวมถึง Cheirogaleidae และ Lepilemuridae ในปัจจุบัน) ^{[ 37 ]} การจำแนกประเภทสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่มีอิทธิพลของ George Gaylord Simpsonในปี 1945 ได้จัดให้กระรอกต้นไม้และฟอสซิลAnagale (ซึ่งปัจจุบันจัดอยู่ในกลุ่มนอก Primates) อยู่ใน Lemuriformes และจัดกลุ่มฟอสซิลวงศ์PlesiadapidaeและAdapidae ไว้ ในวงศ์ใหญ่ Lemuroidea ร่วมกับลีเมอร์ส่วนใหญ่^{[ 39 ]}

แม้ว่าปัจจุบันกระรอกต้นไม้ เพลเซียดาปิด และสัตว์ในวงศ์เดียวกันจะไม่ถือว่ามีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับลีเมอร์อีกต่อไปแล้ว แต่ความขัดแย้งยังคงมีอยู่เกี่ยวกับการจำแนกประเภทของลีเมอร์และกลุ่มที่เกี่ยวข้อง ส่งผลให้มีการจัดเรียงอันดับย่อยและวงศ์ใหญ่ภายใน Strepsirrhini ที่แข่งขันกัน ในการจำแนกประเภทหนึ่ง อันดับย่อย Lemuriformes ประกอบด้วย Strepsirrhini ที่ยังมีชีวิตอยู่ทั้งหมดในสองวงศ์ใหญ่ ได้แก่ Lemuroidea สำหรับลีเมอร์ทั้งหมด และ Lorisoidea สำหรับลอริสอยด์ ( ลอริสิดและกาลาโก) ^{[ 21 ] [ 40 ]}หรืออีกทางหนึ่ง บางครั้งลอริสอยด์ถูกจัดไว้ในอันดับย่อยของตนเอง คือ Lorisiformes แยกจากลีเมอร์^{[ 41 ]} การจำแนกประเภทอีกแบบหนึ่งที่ตีพิมพ์โดย Colin Groves ได้จัดให้เอเย่-เอเย่ อยู่ในอันดับย่อยของตนเอง คือ Chiromyiformes ในขณะที่ลีเมอร์ที่เหลือถูกจัดไว้ใน Lemuriformes และลอริสอยด์อยู่ใน Lorisiformes ^{[ 20 ]}

การจำแนกประเภทของลิงลีเมอร์หลายชนิดก่อให้เกิดการถกเถียงกันอย่างมาก ที่สำคัญที่สุดคือ การจัดวางตำแหน่งของลิงไอไอเป็นที่ถกเถียงกันมาตั้งแต่มีการนำเสนอสู่โลกวิทยาศาสตร์ตะวันตกในปี 1782 และยังคงเป็นหัวข้อถกเถียงกันมาจนถึงเมื่อไม่นานมานี้^{[ 1 ] [ 37 ] [ 43 ]} ในปี 1863 ริชาร์ด โอเวน ได้ โต้แย้ง ทฤษฎี การคัดเลือกโดยธรรมชาติของดาร์วินโดยอ้างว่าลักษณะเฉพาะของลิงไอไอ รวมถึงฟันหน้าที่งอก ขึ้นเรื่อยๆ และนิ้วกลางที่มีความยืดหยุ่นสูงเป็นพิเศษนั้น เหมาะสมอย่างยิ่งสำหรับการใช้งานในการหาอาหาร แบบดึงเอาสิ่งต่างๆ ออกมา จนไม่น่าจะวิวัฒนาการขึ้นทีละน้อยผ่านการคัดเลือกโดยธรรมชาติได้^{[ 44 ]} เมื่อไม่นานมานี้ การจัดวางตำแหน่งของลิงไอไอได้ก่อให้เกิดปัญหาสำหรับสมมติฐานการล่องแพสำหรับการตั้งถิ่นฐานของไพรเมตในมาดากัสการ์ หากสายพันธุ์นี้ไม่ได้สร้างกลุ่มโมโนฟิเลติกกับลีเมอร์ที่เหลือแล้ว จะต้องมีเหตุการณ์การตั้งถิ่นฐานหลายครั้งเกิดขึ้นเพื่ออธิบายการปรากฏตัวของลีเมอร์ในมาดากัสการ์^{[ 1 ]}

จนกระทั่งโอเวนตีพิมพ์งานวิจัยทางกายวิภาคศาสตร์ที่แน่ชัดในปี พ.ศ. 2409 นักธรรมชาติวิทยาในยุคแรกๆ ยังไม่แน่ใจว่าเอเย-เอเย (สกุลDaubentonia ) เป็นไพรเมตสัตว์ฟันแทะหรือสัตว์มีถุงหน้าท้อง^{[ 43 ] [ 45 ] [ 46 ] [ 47 ]} ตัวอย่างเช่น ในช่วงปลายศตวรรษที่ 18 เอเย-เอเยถูกจัดอยู่ในสกุลกระรอกSciurus [ ^{48 ] โดย} การเน้นลักษณะของไพรเมต เช่นแท่งหลังเบ้าตาการมองเห็นแบบสามมิติและนิ้วหัวแม่เท้าที่สามารถงอได้มากกว่าฟันที่คล้ายสัตว์ฟันแทะ โอเวนได้แสดงให้เห็นถึงความสัมพันธ์ของมันกับไพรเมตอื่นๆ^{[ 43 ] [ 49 ]} ในปี พ.ศ. 2539 Ankel-Simons ได้แสดงให้เห็นว่ารูปร่างและการจัดเรียงของฟันตัดน้ำนม ขนาดเล็กของเอเย-เอเยบ่ง ชี้ว่าสกุลนี้มีบรรพบุรุษร่วมกันกับไพรเมตที่มีฟัน หวี ^{[ 50 ]} อย่างไรก็ตาม การจัดวางตำแหน่งของเอเย-เอเยภายในไพรเมตยังคงเป็นปัญหาจนกระทั่งเมื่อไม่นานมานี้คาริโอไทป์ของเอเย-เอเยแตกต่างอย่างเห็นได้ชัดจากญาติสนิทที่สุด ได้แก่ ลอริสและลีเมอร์อื่นๆ โดยมี จำนวน โครโมโซมแบบดิพลอยด์ 2n=30 ^{[ 51 ]} จากกายวิภาคศาสตร์ นักวิจัยพบหลักฐานสนับสนุนการจำแนกสกุลDaubentonia เป็น อินดริอิดเฉพาะทางกลุ่มพี่น้องกับสเตรปซิไรน์ทั้งหมด และเป็นกลุ่มอนุกรมวิธานที่ไม่แน่นอนภายในไพรเมต^{[ 52 ]}ในปี พ.ศ. 2474 Schwarz ได้จัดให้เอเย-เอเยเป็นกลุ่มย่อยของ Indriidae โดยอ้างว่าลิงลีเมอร์ทั้งหมดเป็นกลุ่มโมโนฟิเลติก^{[ 53 ]}ในขณะที่Reginald Innes Pocockเคยจัดให้เอเย-เอเยอยู่นอกกลุ่มลิงลีเมอร์มาก่อน^{[ 54 ]} ในปีเดียวกันนั้น Anthony และ Coupin ได้จัดจำแนกเอเย-เอเยไว้ภายใต้กลุ่มย่อย Chiromyiformes ซึ่งเป็นกลุ่มพี่น้องกับลิงสเตรปซิไรน์อื่นๆ Colin Groves ยืนยันการจัดจำแนกนี้ในปี พ.ศ. 2548 เนื่องจากเขาไม่แน่ใจนักว่าเอเย-เอเยก่อตัวเป็นกลุ่มเดียวกันกับลิงลีเมอร์มาดากัสการ์ที่เหลือ^{[ 55 ]}แม้ว่าการทดสอบทางโมเลกุลจะแสดงให้เห็นว่า Daubentoniidae เป็นกลุ่มพื้นฐานของ Lemuroidea ทั้งหมด^{[ 56 ]}

การตีความต้นกำเนิดของเอเย-เอเยอีกแบบหนึ่งได้ตั้งคำถามถึงต้นกำเนิดเดียวของลีเมอร์อีกครั้ง เอเย-เอเยและไพรเมตสเตรปซิไรน์ฟอสซิลจากแอฟริกาPlesiopithecusมีความคล้ายคลึงกันในรูปทรงของกะโหลกศีรษะและสัณฐานวิทยาของขากรรไกรล่าง ซึ่งบ่งชี้ว่า Plesiopithecus อาจเป็นญาติยุคแรกของเอเย-เอเย อย่างไรก็ตาม การระบุบรรพบุรุษของเอเย-เอเยในแอฟริกาจะต้องอาศัยการตั้งถิ่นฐานหลายครั้งในมาดากัสการ์โดยไพรเมตสเตรปซิไรน์ การทดสอบทางโมเลกุลอาจให้การสนับสนุน เนื่องจากแสดงให้เห็นว่าเอเย-เอเยเป็นกลุ่มแรกที่แยกตัวออกจากกลุ่มลีเมอร์ และตระกูลลีเมอร์อื่นๆ ไม่ได้แยกตัวออกจนกระทั่งในภายหลัง^{[ 59 ] [ 60 ]}

ลิงชีโรกาเลด ( ลิงลีเมอร์แคระและลิงลีเมอร์หนู ) มักถูกจัดอยู่ในกลุ่มเดียวกับลิงลีเมอร์กาลาโกโดยนักศึกษาในยุคแรกๆ และถูกจัดอยู่ในกลุ่มเดียวกับลิงลีเมอร์อื่นๆ ตั้งแต่การจำแนกประเภทของเกรกอรีในปี 1915 จนถึงต้นทศวรรษ 1970 เมื่อนักมานุษยวิทยาหลายคนเสนอว่าพวกมันมีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับลิงลีเมอร์ลอริสอยด์มากกว่า โดยอิงจากข้อมูลทางสัณฐานวิทยา^{[ 37 ] [ 61 ]}อย่างไรก็ตาม การศึกษาทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องได้จัดให้ลิงชีโรกาเลดอยู่ในกลุ่มลิงลีเมอร์อย่างเป็นเอกฉันท์ และโกรฟส์เองซึ่งเคยส่งเสริมความสัมพันธ์ระหว่างลิงชีโรกาเลดและลิงลีเมอร์ลอริสอยด์ในบทความปี 1974 ก็ถือว่าแนวคิดนี้ถูกหักล้างไปแล้วในปี 2001 ^{[ 62 ] [ 61 ]}

การจำแนกประเภทในช่วงครึ่งแรกของศตวรรษที่ 20 แบ่งลีเมอร์ออกเป็นสามวงศ์ ได้แก่ Daubentoniidae, Indriidae และ Lemuridae โดยวงศ์หลังนี้รวมถึง Cheirogaleidae และ Lepilemuridae ในปัจจุบัน^{[ 37 ]}เนื่องจากมีความกังวลว่า Lemuridae อาจไม่ใช่กลุ่มโมโนฟิเลติก วงศ์นี้จึงถูกแยกออกในภายหลัง ในปี 1982 Tattersall ได้แยก Cheirogaleidae สำหรับลีเมอร์แคระ ลีเมอร์หนู และญาติๆ ออกจากกัน และแยก Lepilemuridae สำหรับลีเมอร์สปอร์ตและลีเมอร์ไม้ไผ่ (รวมถึงลีเมอร์ไม้ไผ่ขนาดใหญ่ ) ^{[ 63 ]}การจำแนกประเภทนี้ยังคงใช้อยู่ ยกเว้นว่าลีเมอร์ไม้ไผ่ถูกย้ายกลับไปอยู่ใน Lemuridae ^{[ 64 ] [ 42 ]}

ตั้งแต่ช่วงปี 1970 ถึง 1990 มีข้อเสนอแนะว่าลีเมอร์ขนฟูอาจมีความเกี่ยวข้องกับอินดริอิดหรือเป็นกลุ่มพี่น้องกับ Lemuridae และ Indriidae และลีเมอร์ไม้ไผ่มีความเกี่ยวข้องกับลีเมอร์สปอร์ตทีฟ^{[ ​​65 ]}แต่ทั้งสองมุมมองนี้ไม่ได้รับการสนับสนุนจากวิวัฒนาการระดับโมเลกุล^{[ 57 ]}ลีเมอร์สปอร์ตทีฟและลีเมอร์โคอาลา ที่สูญพันธุ์ไปแล้ว (Megaladapidae) ต่างก็ไม่มีฟันตัดบนในฟันแท้^{[ 66 ] [ 67 ]}และในปี 1981 Groves ได้จัดทั้งสองชนิดไว้ด้วยกันในวงศ์ Megaladapidae ซึ่งเขาเปลี่ยนชื่อเป็น Lepilemuridae ในปี 2005 เนื่องจากชื่อเดิมนั้นมีความสำคัญกว่า [ ^{68 ] การ}วิจัยทางพันธุกรรมไม่สนับสนุนความสัมพันธ์ใกล้ชิดระหว่างลีเมอร์สปอร์ตทีฟและลีเมอร์โคอาลา แต่กลับจัดให้ลีเมอร์โคอาลาเป็นกลุ่มพี่น้องกับ Lemuridae ดังนั้น ปัจจุบันทั้งสองชนิดจึงถูกจัดอยู่ในวงศ์ที่แยกจากกัน (Lepilemuridae สำหรับลีเมอร์สปอร์ต และ Megaladapidae สำหรับลีเมอร์โคอาลา) ^{[ 69 ] [ 70 ] [ 71 ]}ลีเมอร์สลอธ (Palaeopropithecidae) และลีเมอร์ลิง (Archaeolemuridae) ถูกจัดเป็นวงศ์ย่อยภายใน Indriidae เมื่อปี 1982 ^{[ 63 ]}แต่ปัจจุบันได้รับการยอมรับว่าเป็นวงศ์ที่แยกจากกัน^{[ 72 ]}

ความสัมพันธ์ระหว่างวงศ์ของลีเมอร์เป็นปัญหาและยังไม่ได้รับการแก้ไขอย่างแน่ชัดมีแผนภูมิวิวัฒนาการ ที่แข่งขันกันสองแบบโดยอิงจากข้อมูลทางพันธุกรรมและโมเลกุล แนวทางหนึ่ง (Horvath et al .) พิจารณายีนจำนวนมากขึ้น แต่ในสายพันธุ์ที่น้อยกว่า ส่งผลให้ Lemuridae เป็นกลุ่มพี่น้องกับ Lepilemuridae, Cheirogaleidae และ Indriidae ^{[ 57 ]} อีกแนวทางหนึ่ง (Orlando et al .) พิจารณายีนจำนวนน้อยลง แต่ในสายพันธุ์ลีเมอร์ที่มากกว่า จากการวิเคราะห์นี้ Lepilemuridae จึงกลายเป็นกลุ่มพี่น้องกับ Lemuridae, Cheirogaleidae และ Indriidae ^{[ 58 ]}แผนภูมิวิวัฒนาการทั้งสองแบบเห็นพ้องกันว่าไพรเมตมาดากัสการ์เป็นกลุ่มโมโนฟิเลติก และ Daubentoniidae (เอเย-เอเย) เป็นฐานของกลุ่มลีมูรอยด์ โดยแยกตัวออกมาเร็วกว่าวงศ์อื่นๆ อย่างมีนัยสำคัญ^{[ 56 ] [ 57 ] [ 58 ]} อย่างไรก็ตาม ปัญหาสองประการทำให้เกิดความซับซ้อนสำหรับทั้งสองแนวทาง ประการแรก ครอบครัวลีเมอร์ที่ยังมีชีวิตอยู่สี่ครอบครัวที่มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกันที่สุดแยกตัวออกจากกันภายในช่วงเวลาแคบๆ ประมาณ 10 ล้านปี ทำให้การแยกแยะการแยกตัวด้วยหลักฐานทางโมเลกุลทำได้ยากขึ้นมาก นอกจากนี้ ครอบครัวเหล่านี้แยกตัวออกจากบรรพบุรุษร่วมกันครั้งสุดท้ายเมื่อประมาณ 42 ล้านปีก่อน การแยกตัวที่ห่างไกลเช่นนี้ทำให้เกิดสัญญาณรบกวน จำนวนมาก สำหรับเทคนิคทางโมเลกุล^{[ 73 ]}

^{การกระจายตัวของสายพันธุ์ลีเมอร์ใน ยุค}แรกๆ ระหว่างสกุลต่างๆ แตกต่างจากอนุกรมวิธานในปัจจุบันในหลายๆ ด้าน ตัวอย่างเช่นลีเมอร์ที่มีเครื่องหมายรูปส้อมถูกจัดไว้ในสกุล Lemurก่อน จากนั้นจึงจัดไว้ในสกุล Microcebus ร่วมกับลีเมอร์หนู ก่อนที่จะถูกจัดไว้ในสกุล Phanerของตัวเอง[ ^{74 ] [ 75 ] [ 76 ] [ 77 ]}และCharles Immanuel Forsyth Majorได้แยก กลุ่มสายพันธุ์ Cheirogaleus mediusของลีเมอร์แคระออกเป็นสกุลOpolemur แยกต่างหาก แต่การจัดจำแนกนี้ไม่ได้รับการยอมรับ^{[ 78 ] [ 77 ]}อนุกรมวิธานระดับสกุลได้รับการทำให้เสถียรโดย Schwarz ในปี 1931 เป็นส่วนใหญ่^{[ 25 ]}แต่การเปลี่ยนแปลงในภายหลังจำนวนหนึ่งได้รับการยอมรับแล้ว

• ลิงหางวงแหวนลิงคอปกและลิงสีน้ำตาลเคยถูกจัดกลุ่มไว้ด้วยกันในสกุลLemurเนื่องจากมีความคล้ายคลึงกันทางสัณฐานวิทยาหลายประการ ตัวอย่างเช่น โครงกระดูกของลิงหางวงแหวนและลิงสีน้ำตาลแทบจะแยกไม่ออก^{[ 79 ]}อย่างไรก็ตาม ลิงคอปกถูกจัดให้อยู่ในสกุลVareciaในปี 1962 ^{[ 80 ]}และเนื่องจากความคล้ายคลึงกันระหว่างลิงหางวงแหวนและลิงไม้ไผ่ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในแง่ของหลักฐานทางโมเลกุลและความคล้ายคลึงกันของต่อมกลิ่น ลิงสีน้ำตาลจึงถูกย้ายไปอยู่ในสกุลEulemurในปี 1988 ^{[ 79 ] [ 81 ] [ 82 ]}ปัจจุบันสกุลLemur เป็น สกุลที่มีเพียงชนิดเดียว คือ ลิงหางวงแหวน
• ในปี 2001 Colin Groves สรุปว่าถึงแม้จะมีความคล้ายคลึงกัน แต่ลิงลีเมอร์ไม้ไผ่ขนาดใหญ่ก็มีความแตกต่างจากลิงลีเมอร์ไม้ไผ่ในสกุลHapalemur มากพอ ที่จะสมควรได้รับการจัดเป็นสกุลเดียวคือProlemur [ ^{83 ] [ 84 ] ซึ่ง ขัดแย้งกับความเห็นต่างของ Schwarz ใน} ปี 1931 ที่มีต่อการตัดสินใจของ Pocock ที่จะแยกProlemur ออก จากHapalemur [ ^{85 ]}
• เดิมที หนูเลมูร์ยักษ์ถูกจัดอยู่ในสกุลMicrocebus ( หนูเลมูร์ ) แต่ ในปี 1985 หนูเลมูร์ยักษ์ ถูกย้ายไปอยู่ในสกุลMirza ของตัวเอง เนื่องจากมีขนาดใหญ่กว่า มีความแตกต่างทางสัณฐานวิทยา ลักษณะทางทันตกรรม และพฤติกรรม^{[ 86 ] [ 87 ]}
• ลีเมอร์แคระหูมีขนถูกจัดอยู่ในสกุลCheirogaleus ( ลีเมอร์แคระ ) เป็นครั้งแรกในปี พ.ศ. 2418 และต่อมาพบว่ามีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับMicrocebus มากกว่า อย่างไรก็ตาม ฟันและโครงสร้างกะโหลกศีรษะของมันถือว่ามีความแตกต่างกันมากพอที่จะยกระดับไปอยู่ในสกุลของตัวเองคือAllocebus ^{[ 86 ] [ 88 ]}
• ในปี พ.ศ. 2491 นักบรรพชีวินวิทยาชาร์ลส์ แลมเบอร์ตันได้เสนอสกุลย่อยใหม่สำหรับเลมูร์ขนฟูยักษ์ คือPachylemurซึ่งก่อนหน้านี้ถูกจัดอยู่ในสกุลLemurตั้งแต่ปี พ.ศ. 2503 เป็นต้นมา สกุลนี้ถือเป็นสกุลแยกต่างหาก แม้ว่าเลมูร์ขนฟูยักษ์สองชนิดที่สูญพันธุ์ไปแล้วบางครั้งจะถูกจัดกลุ่มไว้ภายใต้สกุลVareciaร่วมกับญาติสนิทของพวกมันก็ตาม^{[ 89 ]}
• สกุลใหม่ของเลมูร์สลอธ Babakotia ได้รับการตั้งชื่อในปี 1990 ^{[ 90 ]}

มีการถกเถียงกันอย่างกว้างขวางเกี่ยวกับแง่มุมต่างๆ ของการจำแนกประเภทลีเมอร์ในระดับชนิด โดยเฉพาะอย่างยิ่งเกี่ยวกับจำนวนชนิดที่ได้รับการยอมรับที่เพิ่มขึ้นเมื่อเร็วๆ นี้^{[ 91 ] [ 92 ] [ 93 ]} ตามที่Russell MittermeierประธานของConservation International (CI) นักอนุกรมวิธานColin Grovesและคนอื่นๆ กล่าวไว้ ปัจจุบันมีลีเมอร์ที่ยังมีชีวิตอยู่ 101 ชนิดหรือชนิดย่อยที่ได้รับการยอมรับ แบ่งออกเป็น 5 วงศ์ และ 15 สกุล^{[ 94 ]} ในทางกลับกัน ผู้เชี่ยวชาญคนอื่นๆ ในสาขานี้มองว่านี่อาจเป็นตัวอย่างของภาวะเงินเฟ้อทางอนุกรมวิธาน [ ^{95 ] และ}ต้องการประมาณการว่ามีอย่างน้อย 50 ชนิดแทน^{[ 92 ]} โดยทั่วไปแล้วทุกฝ่ายเห็นพ้องต้องกันว่าลีเมอร์ซากดึกดำบรรพ์ที่สูญพันธุ์ไปเมื่อไม่นานมานี้ควรได้รับการจำแนกเป็น 3 วงศ์ 8 สกุลและ 17 ชนิด^{[ 96 ] [ 97 ]}

ในช่วงสองทศวรรษที่ผ่านมา จำนวนชนิดของลีเมอร์ที่ได้รับการยอมรับเพิ่มขึ้นมากกว่าสามเท่า ตามที่ผู้เชี่ยวชาญบางคนกล่าวไว้ ในปี 1994 มีการตั้งชื่อชนิดที่แตกต่างกัน 32 ชนิดในฉบับแรกของคู่มือภาคสนาม Lemurs of Madagascar ของConservation International [ ^{98 ] และ}มีการอธิบาย 68 ชนิดในฉบับที่ 2 ซึ่งตีพิมพ์ในปี 2006 ^{[ 99 ]} ในเดือนธันวาคม 2008 Russell Mittermeier, Colin Groves และผู้เชี่ยวชาญคนอื่นๆ ได้ร่วมกันเขียนบทความในInternational Journal of Primatologyโดยจำแนกชนิดและชนิดย่อย 99 ชนิด^{[ 100 ]} ในช่วงปลายปี 2010 ฉบับที่ 3 ของLemurs of Madagascarได้ระบุรายชื่อ 101 กลุ่ม อนุกรมวิธาน ^{[ 101 ]} จำนวนชนิดของลีเมอร์มีแนวโน้มที่จะเพิ่มขึ้นอย่างต่อเนื่องในอีกหลายปีข้างหน้า เนื่องจากมีการศึกษาภาคสนาม การวิจัยทางด้านพันธุศาสตร์ เซลล์และพันธุศาสตร์โมเลกุลอย่างต่อเนื่อง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในชนิดที่ซ่อนเร้น เช่น ลีเมอร์หนู ซึ่งไม่สามารถแยกแยะ ได้ด้วยสายตา^{[ 102 ]}

การเพิ่มขึ้นสามเท่าในเวลาไม่ถึงสองทศวรรษนี้ไม่ได้รับการสนับสนุนอย่างเป็นเอกฉันท์จากนักอนุกรมวิธานและนักวิจัยลีเมอร์ ในหลายกรณี การจัดประเภทขึ้นอยู่กับแนวคิดของสายพันธุ์ที่ใช้ เนื่องจากสภาพที่วิกฤตของประชากรไพรเมตส่วนใหญ่ในมาดากัสการ์นักอนุกรมวิธานและนักอนุรักษ์บางครั้งจึงนิยมแยกพวกมันออกเป็นสายพันธุ์ที่แยกจากกันเพื่อพัฒนากลยุทธ์ที่มีประสิทธิภาพสำหรับการอนุรักษ์ความหลากหลายของลีเมอร์ทั้งหมด^{[ 92 ] [ 103 ]}โดยนัยแล้ว หมายความว่าสถานะสายพันธุ์เต็มรูปแบบจะช่วยให้ประชากรที่มีความแตกต่างทางพันธุกรรมได้รับการคุ้มครองสิ่งแวดล้อมเพิ่มเติม^{[ 92 ]}

การบรรยายลักษณะของสายพันธุ์ลีเมอร์ใหม่ครั้งใหญ่ครั้งแรกเกิดขึ้นในปี 2000 เมื่อ Colin Groves แยกสายพันธุ์ลีเมอร์แคระ ( Cheirogaleus ) สองสายพันธุ์ออกเป็นเจ็ดสายพันธุ์^{[ 104 ]}ในขณะที่Rodin Rasoloarisonและเพื่อนร่วมงานได้จำแนกสายพันธุ์ลีเมอร์หนูเจ็ดสายพันธุ์ในมาดากัสการ์ตะวันตก^{[ 105 ]} จากนั้นในปี 2001 Groves ได้ยกระดับลีเมอร์คอแดง ( Varecia rubra ) ^{[ 106 ] [ 107 ]}ลีเมอร์สีน้ำตาลห้าสายพันธุ์ย่อย ( Eulemur albifrons , E. albocollaris , E. collaris , E. rufusและE. sanfordi ) ^{[ 108 ]}และซิฟากา สี่สายพันธุ์ย่อย ( Propithecus coquereli , P. deckenii , P. edwardsiและP. perrieri ) ให้เป็นสายพันธุ์เต็มรูปแบบ^{[ 109 ]} การยกระดับเพิ่มเติมของสายพันธุ์ย่อยที่เหลือทั้งหมดภายใน สกุล EulemurและPropithecusได้เกิดขึ้นในปีต่อๆ มา^{[ 110 ] [ 111 ]} การเปลี่ยนแปลงทางอนุกรมวิธานเหล่านี้และที่ตามมาส่วนใหญ่เกิดจากการเปลี่ยนไปใช้ แนวคิดส ^ปีชีส์เชิงวิวัฒนาการ [ ^{112 ]}และไม่ได้รับการยอมรับอย่างเป็นสากล^{[ 113 ]}

การเติบโตอย่างรวดเร็วที่สุดในจำนวนชนิด (ในแง่สัมบูรณ์) เกิดขึ้นในสกุลMicrocebusและLepilemurในปี 2549 มีการบรรยายลักษณะ ของ Lepilemur ใหม่ 15 ชนิด โดยมีรายงานชนิดใหม่ 3 ชนิดในเดือนกุมภาพันธ์ ^{[ 114 ]} 1 ชนิดในเดือนมิถุนายน^{[ 115 ]}และ 11 ชนิดในเดือนกันยายน^{[ 116 ]} ตั้งแต่นั้นมา มีการบรรยายลักษณะของชนิดเพิ่มเติมอีก 3 ชนิด ซึ่งหนึ่งในนั้นพบว่าเหมือนกับชนิดที่เคยบรรยายไว้ก่อนหน้านี้^{[ 117 ]}ความแตกต่างทางพันธุกรรมและสัณฐานวิทยาดูเหมือนจะบ่งชี้ว่าพวกมันเป็นชนิดที่ซ่อนเร้น แต่ยังคงมีการถกเถียงกันอยู่ว่าพวกมันสมควรได้รับสถานะเป็นชนิดเต็มรูปแบบหรือไม่ หรือควรได้รับการพิจารณาว่าเป็นชนิดย่อยของชนิด "หลัก" ที่ระบุไว้ก่อนหน้านี้^{[ 70 ] [ 118 ]}

เดิมทีทั้งลีเมอร์สีน้ำตาลและลีเมอร์หนูถูกแบ่งออกเป็นสปีชีส์จำนวนเล็กน้อย โดยอาจไม่มีสปีชีส์ย่อย ที่แยกแยะได้ (ในกรณีของลีเมอร์หนู) ^{[ 119 ]}หรือมีสปีชีส์ย่อยที่แยกแยะได้หลายสปีชีส์ (ในกรณีของลีเมอร์สีน้ำตาล) ^{[ 120 ]} จากการวิจัยทางโมเลกุลที่ชี้ให้เห็นถึงการแยกตัวที่ไกลออกไปในทั้งสองสกุล สปีชีส์ย่อยหรือประชากรที่ไม่สามารถแยกแยะได้เหล่านี้จึงได้รับการยกระดับเป็นสปีชีส์^{[ 119 ] [ 121 ]}

ในกรณีของหนูเลมูร์ การเพิ่มขึ้นของจำนวนสายพันธุ์นั้นค่อนข้างฉับพลันและน่าทึ่งไม่แพ้กันErnst Schwarz จัดให้เป็นสายพันธุ์เดียว ในปี 1931 (ไม่รวมหนูเลมูร์ยักษ์ Coquerelซึ่งปัจจุบันไม่ได้จัดอยู่ในสกุลMicrocebus อีกต่อไป ) ^{[ 122 ]}ต่อมามีการแก้ไขสกุลนี้ให้ประกอบด้วยสองสายพันธุ์ คือหนูเลมูร์สีเทา ( Microcebus murinus ) และหนูเลมูร์สีน้ำตาล ( M. rufus ) หลังจากการศึกษาภาคสนามอย่างกว้างขวางในปี 1972 แสดงให้เห็นว่าทั้งสองสายพันธุ์อาศัยอยู่ร่วมกันในทางตะวันออกเฉียงใต้ของมาดากัสการ์^{[ 123 ]} ในขณะนั้น หนูเลมูร์สีเทาเป็นที่รู้จักในพื้นที่แห้งแล้งทางตอนเหนือ ตะวันตก และใต้ ในขณะที่หนูเลมูร์สีน้ำตาลอาศัยอยู่ในป่าฝนชื้นทางตะวันออก อย่างไรก็ตาม ปัจจุบันเป็นที่ทราบกัน ว่าความหลากหลายของสายพันธุ์และการกระจายตัวมีความซับซ้อนมากกว่ามาก^{[ 124 ]} การแก้ไขตลอดช่วงทศวรรษ 1990 และ 2000 ได้ระบุสายพันธุ์ใหม่จำนวนมากผ่านการทดสอบทางพันธุกรรมโดยใช้ดีเอ็นเอไมโทคอนเดรียซึ่งแสดงให้เห็นว่าสกุลนี้ประกอบด้วยสายพันธุ์ที่ซ่อนเร้นจำนวนมาก^{[ 125 ] [ 126 ] [ 127 ] [ 128 ]} สายพันธุ์ที่กำหนดเหล่านี้จำนวนมาก แต่ไม่ใช่ทั้งหมด ได้รับการสนับสนุนโดยการทดสอบดีเอ็นเอนิวเคลียร์^{[ 129 ]}

อย่างไรก็ตาม ยังคงมีความกังวลว่าสายพันธุ์ต่างๆ กำลังถูกระบุอย่างไม่ถูกต้องก่อนเวลา อันควร เอียน แทตเตอร์ซอลล์ นักมานุษยวิทยาผู้จำแนกสายพันธุ์ลีเมอร์ได้ 42 สายพันธุ์ในปี 1982 ^{[ 130 ]}ได้แสดงความกังวลว่าความหลากหลายที่จัดระเบียบตามภูมิศาสตร์ในประชากรลีเมอร์กำลังได้รับการยอมรับว่าเป็นสายพันธุ์เต็มรูปแบบ ในขณะที่จำนวนสายพันธุ์ย่อยในสกุลลีเมอร์แทบจะหายไป เขาโต้แย้งว่านักอนุกรมวิธานกำลังสับสนระหว่างการแยกสายพันธุ์และการเกิดสายพันธุ์ใหม่ซึ่งเป็นสองกระบวนการที่มักไม่เกี่ยวข้องกัน ในขณะเดียวกันก็ปฏิเสธบทบาทของวิวัฒนาการระดับจุลภาคในกระบวนการวิวัฒนาการ^{[ 91 ]} นักวิจัยคนอื่นๆ ที่เน้นกรอบแนวคิดของ "แนวคิดสายพันธุ์ทั่วไป" โต้แย้งว่าการแยกสายพันธุ์หรือการแยกสายพันธุ์บ่งบอกถึงจุดเริ่มต้นของสายพันธุ์ใหม่^{[ 131 ]}

มีการระบุชนิดพันธุ์ใหม่เนื่องจากความแตกต่างในสัณฐานวิทยาคาริโอไทป์ ลำดับไซโตโครมบีและการทดสอบทางพันธุกรรมอื่นๆ รวมถึงการผสมผสานหลายอย่างของสิ่งเหล่านี้^{[ 132 ]} เมื่อทดสอบดีเอ็นเอในนิวเคลียส (nDNA) ร่วมกับดีเอ็นเอในไมโทคอนเดรีย (mtDNA) ในหนูเลมูร์ พบว่าบางชนิด เช่นหนูเลมูร์ของแคลร์ ( Microcebus mamiratra ) ไม่สามารถแยกแยะได้จากชนิดพันธุ์อื่นๆ ที่ใกล้เคียงกัน ในกรณีเช่นนี้ nDNA ไม่เปลี่ยนแปลง แต่ mtDNA ที่ใช้ในการกำหนดชนิดพันธุ์นั้นยังคงแตกต่างกัน ความแตกต่างในผลลัพธ์ระหว่าง nDNA ซึ่งได้รับสืบทอดมาจากทั้งพ่อและแม่ และ mtDNA ซึ่งได้รับสืบทอดมาจากแม่ เกิดจากพฤติกรรมการอยู่อาศัยในถิ่นกำเนิดของเพศเมียโดยเพศเมียจะอยู่ภายในหรือใกล้กับถิ่นกำเนิดที่ตนเกิด ในขณะที่เพศผู้จะกระจายตัวออกไป เนื่องจากประชากรที่แยกตัวออกมาซึ่งรู้จักกันในชื่อหนูเลมูร์ของแคลร์มี mtDNA ที่แตกต่างกัน แต่ไม่มี nDNA จึงมีแนวโน้มที่จะประกอบด้วยประชากรที่สืบเชื้อสายมาจากกลุ่มเพศเมียที่เกี่ยวข้อง แต่ยังคงกระจายตัวและผสมพันธุ์กับประชากรใกล้เคียง^{[ 133 ]}

ตามธรรมเนียมแล้ว การศึกษาโครโมโซมจะถูกนำมาพิจารณาเมื่อกำหนดสถานะของสายพันธุ์^{[ 51 ]} ตัวอย่างเช่น ในปี 2549 มีการตั้งชื่อสายพันธุ์ใหม่ของลีเมอร์สปอร์ต 3 สายพันธุ์โดยอิงจากลักษณะโครโมโซมบางส่วน^{[ 114 ]} จากลีเมอร์ที่ศึกษามาจนถึงปัจจุบัน จำนวนโครโมโซมแบบดิพลอยด์จะแตกต่างกันไปตั้งแต่ 2n=20 ถึง 2n=66 ในกรณีของลีเมอร์สีน้ำตาล จำนวนโครโมโซมแบบดิพลอยด์จะอยู่ในช่วงตั้งแต่ 2n=44 ถึง 2n=60 ในขณะที่ขนาดของโครโมโซมแต่ละตัวจะแตกต่างกันอย่างมาก แม้ว่าจะมีลักษณะทางสัณฐานวิทยาที่คล้ายคลึงกันมากก็ตาม^{[ 134 ]}

บางครั้งการแบ่งแยกเกิดขึ้นเนื่องจากความแตกต่างเพียงเล็กน้อยใน สี ขนตัวอย่างเช่น มีการค้นพบหนูเลมูร์สามชนิดที่มีสีแตกต่างกันอย่างชัดเจนในการศึกษาหลายปีในเขตอนุรักษ์เบซา มาฮาฟาลีทางตอนใต้ของมาดากัสการ์ แต่แทนที่จะเป็นสายพันธุ์ที่แยกจากกัน การทดสอบดีเอ็นเอเผยให้เห็นว่าพวกมันทั้งหมดเป็นสายพันธุ์เดียวกันคือ หนูเลมูร์สีเทาอมแดง ( Microcebus griseorufus ) ^{[ 135 ]}ด้วยเหตุนี้ จึงจำเป็นต้องมีการวิจัยเพิ่มเติมเพื่อยืนยันหรือปฏิเสธการแบ่งสายพันธุ์ล่าสุด มีเพียงการศึกษาอย่างละเอียดเกี่ยวกับสัณฐานวิทยา นิเวศวิทยา พฤติกรรม และพันธุกรรมเท่านั้นที่จะสามารถกำหนดจำนวนสายพันธุ์เลมูร์ที่แท้จริงได้^{[ 136 ]}