โดเมน C2
โดเมน C2 ของ อัลฟา-ท็อกซิน C.absonum (PDB 1OLP) สายเบต้าแสดงด้วยสีเหลือง อัลฟาเฮลิกซ์แสดงด้วยสีแดง และลูปแสดงด้วยสีเขียว ไอออน แคลเซียม ที่เชื่อมต่อ อยู่แสดงด้วยสีฟ้า
ตัวระบุ
เครื่องหมาย	ซี2
พีแฟม	PF00168
ตระกูลพีแฟม	ซีแอล0154
อีโคด	11.2.1
อินเตอร์โปร	IPR000008
ปราดเปรื่อง	ซี2
โปรไซต์	PDOC00380
สโคป2	1qas / SCOPe / SUPFAM
ซูเปอร์แฟมิลี OPM	45
โปรตีน OPM	1ugk
ซีดีดี	ซีดี00030
โครงสร้างโปรตีนที่มีอยู่: พีดีบี   IPR000008 PF00168 ( ECOD ; PDBsum )   อัลฟาโฟลด์ IPR000008 PF00168

ฟอสโฟอิโนซิไทด์ 3-ไคเนส C2
โครงสร้างของฟอสโฟอิโนซิไทด์ 3-ไคเนส[ 1 ]
ตัวระบุ
เครื่องหมาย	PI3K_C2
พีแฟม	PF00792
ตระกูลพีแฟม	ซีแอล0154
อีโคด	11.2.1
อินเตอร์โปร	IPR002420
ปราดเปรื่อง	PI3K_C2
โปรไซต์	พีดีโอซี50004
สโคป2	1e8x / SCOPe / SUPFAM
ซีดีดี	ซีดี08380
โครงสร้างโปรตีนที่มีอยู่: พีดีบี   1e7u ​, 1e7v ​, 1e8w ​, 1e8x ​, 1e8y ​, 1e8z ​, 1e90 ​, 1he8 ​, 2a4z ​, 2a5u ​, 2chw ​, 2chx ​, 2chz ​, 2rd0 ​, 2v4l ​, 3csf ​, 3cst ​, 3dbs ​, 3dpd ​, 3ene ​IPR002420 PF00792 ( ECOD ; PDBsum )   อัลฟาโฟลด์ IPR002420 PF00792

โดเมนC2เป็นโดเมนโครงสร้างโปรตีน ที่เกี่ยวข้องกับการกำหนดเป้าหมายโปรตีนไปยังเยื่อหุ้มเซลล์ เวอร์ชันทั่วไป (PKC-C2) มีเบต้าแซนด์วิชที่ประกอบด้วยβ-strand 8 เส้น ที่ประสาน ไอออน แคลเซียม สองหรือสาม ไอออน ซึ่งจะจับในช่องว่างที่เกิดจากลูปแรกและลูปสุดท้ายของโดเมนบนด้านที่จับกับเยื่อหุ้มเซลล์ ตระกูลโดเมน C2 อื่นๆ อีกมากมายไม่มีกิจกรรมการจับแคลเซียม^{[ 2 ] [ 3 ]}

โดเมน C2 มักพบร่วมกับ โดเมน เอนไซม์ตัวอย่างเช่น โดเมน C2 ในPTENจะนำ โดเมน ฟอสฟาเทสมาสัมผัสกับเยื่อหุ้มเซลล์ ซึ่งสามารถกำจัดหมู่ฟอสเฟตออกจากสารตั้งต้นฟอสฟาติดิลอิโนซิทอล (3,4,5)-ไตรฟอสเฟต (PIP ₃ )โดยไม่ต้องนำออกจากเยื่อหุ้มเซลล์ ซึ่งจะต้องใช้พลังงานสูงมาก PTEN ประกอบด้วยสองโดเมน คือ โดเมน โปรตีนไทโรซีนฟอสฟาเทสและโดเมน C2 โดเมนคู่นี้ประกอบเป็นซูเปอร์โดเมน ซึ่งเป็นหน่วยที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมได้ และพบในโปรตีนต่างๆ ในเชื้อรา พืช และสัตว์^{[ 4 ]} นอกจากนี้ฟอสฟาติดิลอิโนซิทอล 3-ไคเนส (PI3-ไคเนส) ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่เติมหมู่ฟอสโฟอิโนซิทิด บน หมู่ไฮดรอกซิล 3 ของ วงแหวน อิโนซิทอลก็ใช้โดเมน C2 ในการจับกับเยื่อหุ้มเซลล์เช่นกัน (เช่น รายการ 1e8w ใน PDB)

ปัจจุบันโดเมน C2 เป็นที่รู้จักเฉพาะในยูคาริโอตและโปรคาริโอตClostridium perfringensซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของอัลฟา-ท็อกซิน [ ^{5 ] มี}การระบุกลุ่มย่อยที่แตกต่างกันมากกว่า 17 กลุ่มของโดเมน C2 ^{[ 2 ] [ 3 ]}ตระกูล C2 ส่วนใหญ่สามารถสืบย้อนกลับไปถึง สปีชีส์ยูคาริโอต พื้นฐานซึ่งบ่งชี้ถึงการกระจายตัวในช่วงต้นก่อนบรรพบุรุษร่วมของยูคาริโอตสุดท้าย (LECA) มีเพียงตระกูลโดเมน PKC-C2 เท่านั้นที่มีสารตกค้างที่จับกับแคลเซียมที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ ซึ่งชี้ให้เห็นว่าปฏิสัมพันธ์ของเยื่อหุ้มเซลล์ที่ขึ้นอยู่กับแคลเซียมโดยทั่วไปเป็นคุณลักษณะที่ได้มาซึ่งจำกัดอยู่ในโดเมน PKC-C2 ^{[ 2 ]}

โดเมน C2 มีเอกลักษณ์เฉพาะตัวในบรรดาโดเมนที่กำหนดเป้าหมายไปยังเยื่อหุ้มเซลล์ เนื่องจากแสดงให้เห็นถึงความสามารถในการเลือกจับกับลิปิดในวงกว้างสำหรับส่วนประกอบหลักของเยื่อหุ้มเซลล์ รวมถึงฟอสฟาติดิลเซอรีนและฟอสฟาติดิลโคลีน โดเมน C2 นี้มีกรดอะมิโนประมาณ 116 ตัว และตั้งอยู่ระหว่างโดเมน C1 สองชุดในโปรตีนไคเนส C (ที่จับกับฟอร์บอลเอสเทอร์และไดอะซิลกลีเซอรอล) (ดูPDOC00379 ) และโดเมนเร่งปฏิกิริยาของโปรตีนไคเนส (ดูPDOC00100 ) พบว่ามีบริเวณที่มีความคล้ายคลึงกันอย่างมีนัยสำคัญ^{[ 6 ] กับโดเมน C2 ในโปรตีนหลายชนิด เชื่อกันว่าโดเมน C2 มีส่วนเกี่ยวข้องกับการจับกับฟอสโฟลิปิดที่ขึ้นอยู่กับแคลเซียม [ 7 ]}และในกระบวนการกำหนดเป้าหมายไปยังเยื่อหุ้มเซลล์ เช่น การกำหนดตำแหน่งภายในเซลล์ แม้ว่าโดเมน C2 ส่วนใหญ่จะโต้ตอบกับเยื่อหุ้มเซลล์ (ฟอสโฟลิปิด) ในลักษณะที่ขึ้นอยู่กับ Ca2 ⁺แต่โดเมน C2 บางโดเมนสามารถโต้ตอบกับเยื่อหุ้มเซลล์ได้โดยไม่ต้องจับกับCa2 ⁺ในทำนองเดียวกัน โดเมน C2 ได้รับการวิวัฒนาการเพื่อให้มีความจำเพาะต่อลิปิดที่แตกต่างกัน โดเมน C2 จำนวนมาก เช่นซินาปโตแท็กมิน C2A จะจับกับฟอสโฟลิปิดประจุลบ (ฟอสโฟลิปิดที่มี PS หรือ PIP2) อย่างไรก็ตาม โดเมน C2 อื่นๆ เช่น โดเมน cPLA2-α C2 จะจับกับลิปิดประจุคู่ (เช่น PC) ความหลากหลายและความจำเพาะในการจับ Ca ²⁺และลิปิดนี้บ่งชี้ว่าโดเมน C2 ได้รับการวิวัฒนาการเพื่อให้มีหน้าที่ที่แตกต่างกัน^{[ 8 ]}

โดเมนนี้ก่อตัวเป็นเบต้าแซนด์วิชแปดสายที่สร้างขึ้นรอบโมทีฟสี่สายที่อนุรักษ์ไว้ ซึ่งกำหนดให้เป็นคีย์ C2 ^{[ 9 ]}แคลเซียมจะจับในแอ่งรูปถ้วยที่เกิดจากลูปปลาย N และ C ของโมทีฟคีย์ C2 การวิเคราะห์โครงสร้างของโดเมน C2 หลายโดเมนแสดงให้เห็นว่าประกอบด้วยโครงสร้างสามส่วนที่คล้ายกัน ซึ่งมีลูปจับ Ca ²⁺ สาม ลูปอยู่ที่ปลายของเบต้าแซนด์วิชแบบขนานแปดสาย

ABR ; BAIAP3 ; BCR ; C2CD2 ; C2CD3 ; CADPS ; CADPS2 ; CAPN5 ; CAPN6 ; CC2D1A ; CC2D1B ; CPNE1 ; CPNE2 ; CPNE3 ; CPNE4 ; CPNE5 ; CPNE6 ; CPNE7 ; CPNE8 ; CPNE9 ; DAB2IP ; DOC2A ; DOC2B ; DYSF ; ESYT1 ; ESYT3 ; FAM62A ; FAM62B ; FAM62C ; FER1L3 ; FER1L5 ; HECW1 ; HECW2 ; ITCH ; ITSN1 ; ITSN2 ; MAP3K20 ; MCTP1 ; MCTP2 ; MTAC2D1 ; NEDD4 ; NEDD4L ; NEDL1 ; OTOF ; PKN1 ; PKN2 ; PKN3 ; PCLO ; PIK3C2A ; PIK3C2B ; PIK3C2G ; PLA2G4A ; PLA2G4B ; PLA2G4D ; PLA2G4E ; PLA2G4F ; PLCB1 ; PLCB2 ; PLCB3 ; PLCB4 ; PLCD1 ; PLCD3 ; PLCD4 ; PLCE1 ; PLCG1 ; PLCG2 ; PLCH1 ; PLCH2 ; PLCL1 ; PLCL2 ; PLCZ1 ; PRF1 ; PRKCA ; PRKCB1 ; PRKCD ; PRKCE ; PRKCG ; PRKCH ; PRKCQ ; RAB11FIP1 ; RAB11FIP2 ; RAB11FIP5 ;RASA1 ; RASA2 ; RASA3 ; RASA4 ; RASAL1 ; RASAL2 ; RGS3 ; RIMS1 ; RIMS2 ; RIMS3 ; RIMS4 ; RPGRIP1 ; RPGRIP1L ; RPH3A ; SGA72M ; SMURF1 ; SMURF2 ; SYNGAP1 ; SYT1 ; SYT10 ; SYT11 ; SYT12 ; SYT13 ; SYT14 ; SYT14L ; SYT15 ; SYT16 ; SYT17 ; SYT2 ; SYT3 ; SYT4 ; SYT5 ; SYT6 ; SYT7 ; SYT8 ; SYT9 ; SYTL1 ; SYTL2 ; SYTL3 ; SYTL4 ; SYTL5 ; TOLLIP ; UNC13A ; UNC13B ; UNC13C ; UNC13D ; WWC2 ; WWP1 ; WWP2 ; PTEN

• ตระกูลฟอสโฟอิโนซิไทด์ 3-ไคเนส C2 ใน Pfam
• UMich Orientation of Proteins in Membranes families/superfamily-47 - Orientations of C2 domains in membranes (OPM)