โคเอนไซม์คิว – ไซโตโครมซีรีดักเทส
โคเอนไซม์ Q : ไซโตโครมซี – ออกซิโดรีดักเทสบางครั้งเรียกว่าคอมเพล็กซ์ไซโตโครมbc1และบางครั้งเรียกว่า IIIเป็นคอมเพล็กซ์ที่สามในห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอน ( EC 1.10.2.2 ) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการสร้าง ATP ทางชีวเคมี ( การฟอสฟอริเลชันแบบออกซิเดชัน ) คอมเพล็กซ์ III เป็นโปรตีนทรานส์เมมเบรนหลายหน่วยย่อยที่เข้ารหัสโดยทั้งจีโนมไมโทคอนเดรีย ( ไซโตโครม บี ) และจีโนมนิวเคลียร์ (หน่วยย่อยอื่นๆ ทั้งหมด) คอมเพล็กซ์ III มีอยู่ในไมโทคอนเดรียของสัตว์ทุกชนิดและยูคาริโอตแบบใช้ออกซิเจนทั้งหมด และเยื่อหุ้มชั้นในของแบคทีเรีย ส่วนใหญ่ การกลายพันธุ์ในคอมเพล็กซ์ III ทำให้เกิดภาวะทนต่อการออกกำลังกายได้ น้อยลง รวมถึงความผิดปกติของหลายระบบคอมเพล็กซ์ bc1 ประกอบด้วยหน่วยย่อย 11 หน่วย ได้แก่หน่วยย่อย การหายใจ 3 หน่วย (ไซโตโครม บี, ไซโตโครม ซี , โปรตีนรีสเก ), โปรตีน แกนกลาง 2 หน่วย และ โปรตีนน้ำหนักโมเลกุลต่ำ 6 หน่วย
ยูบิควิโนล—ไซโตโครม-ซี รีดักเทส เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาทางเคมี
- QH + 2 เฟอร์ริไซโตโครม ซีQ + 2 เฟอร์โรไซโตโครม ซี + 2 H +
ดังนั้นสารตั้งต้น สองชนิด ของเอนไซม์นี้คือ ควิโนล (QH ) และเฟอร์ริ- (Fe 3+ ) ไซโตโครม ซี ในขณะที่ ผลิตภัณฑ์ 3 ชนิดคือควิโนน (Q), เฟอร์โร- (Fe 2+ ) ไซโตโครม ซี และH +
เอนไซม์นี้อยู่ในกลุ่มของออกซิโดรีดักเทสโดยเฉพาะอย่างยิ่งกลุ่มที่ทำหน้าที่กับไดฟีนอลและสารที่เกี่ยวข้องในฐานะผู้ให้ (donor) โดยมีไซโตโครมเป็นตัวรับ (acceptor) เอนไซม์นี้มีส่วนร่วมในกระบวนการ ออกซิเด ทีฟฟอสโฟรีเลชัน (oxidative phosphorylation ) มันมีโคแฟคเตอร์ สี่ตัว ได้แก่ไซโตโครม ซีเฟอร์เรดอกซิน 2-เหล็กชนิดรีสเก (Rieske type)
การตั้งชื่อ
ชื่อทางระบบของเอนไซม์กลุ่มนี้คือยูบิควิโนล:เฟอร์ริไซโตโครม-ซี ออกซิโดรีดักเทสชื่ออื่นๆ ที่ใช้กันทั่วไป ได้แก่:
|
|
โครงสร้าง

เมื่อเปรียบเทียบกับหน่วยย่อยปั๊มโปรตอนหลักอื่นๆ ของห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอนจำนวนหน่วยย่อยที่พบอาจมีน้อย โดยอาจมีสายโพลีเปปไทด์เพียงสามสายเท่านั้น จำนวนนี้จะเพิ่มขึ้น และพบหน่วยย่อยสิบเอ็ดหน่วยในสัตว์ชั้นสูง[ 2 ]หน่วยย่อยสามหน่วยมีกลุ่มโปรสเตติกหน่วยย่อยไซโตโครมบี มี ฮีมชนิดบีสองตัว( b และb ) หน่วยย่อยไซโตโครมซีมีฮี มชนิด ซี หนึ่งตัว ( c ) และหน่วยย่อยโปรตีนเหล็กซัลเฟอร์ของรีสเก (ISP) มี คลัสเตอร์เหล็ก-ซัลเฟอร์สองเหล็กสองซัลเฟอร์(2Fe•2S)
องค์ประกอบของสารประกอบเชิงซ้อน
ในสัตว์มีกระดูกสันหลัง คอมเพล็กซ์ bc หรือคอมเพล็กซ์ III ประกอบด้วยซับยูนิต 11 ซับยูนิต ได้แก่ ซับยูนิตการหายใจ 3 ซับยูนิต โปรตีนแกนกลาง 2 ซับยูนิต และโปรตีนที่มีน้ำหนักโมเลกุลต่ำ 6 ซับยูนิต [ 3 ] [ 4 ]คอมเพล็กซ์ของโปรตีโอแบคทีเรียอาจมีซับยูนิตเพียง 3 ซับยูนิต[ 5 ]
ตารางแสดงองค์ประกอบย่อยของคอมเพล็กซ์ III
| เลขที่ | ชื่อหน่วยย่อย | สัญลักษณ์ยีนของมนุษย์ | คำอธิบายโปรตีนจากUniProt | ตระกูล Pfamที่มีโปรตีนของมนุษย์ |
|---|---|---|---|---|
| โปรตีนหน่วยย่อยระบบหายใจ | ||||
| 1 | เอ็มที-ไซบี / ไซที บี | เอ็มที-ไซบี | ไซโตโครม บี | พีแฟม พีเอฟ13631 |
| 2 | ไซซีซี1 / ไซท์ซี1 | ไซซี1 | ไซโตโครม ซี1 โปรตีนฮีม ไมโตคอนเดรีย | พีแฟม พีเอฟ02167 |
| 3 | รีสเก้ / ยูซีอาร์1 | ยูคิวซีอาร์เอฟเอส1 | หน่วยย่อยของคอมเพล็กซ์ไซโตโครม b-c1 Rieske, ไมโทคอนเดรียEC 1.10.2.2 | Pfam PF02921 , Pfam PF00355 |
| หน่วยย่อยโปรตีนหลัก | ||||
| 4 | QCR1 / SU1 | ยูคิวซีอาร์ซี1 | ไซโตโครม บี-ซี1 คอมเพล็กซ์ ซับยูนิต 1 ไมโตคอนเดรีย | Pfam PF00675 , Pfam PF05193 |
| 5 | QCR2 / SU2 | ยูคิวซีอาร์ซี2 | ไซโตโครม บี-ซี1 คอมเพล็กซ์ ซับยูนิต 2 ไมโตคอนเดรีย | Pfam PF00675 , Pfam PF05193 |
| หน่วยย่อยโปรตีนที่มีน้ำหนักโมเลกุลต่ำ | ||||
| 6 | QCR6 / SU6 | ยูคิวซีอาร์เอช | ไซโตโครม บี-ซี1 คอมเพล็กซ์ ซับยูนิต 6 ไมโตคอนเดรีย | พีแฟม พีเอฟ02320 |
| 7 | QCR7 / SU7 | ยูคิวซีอาร์บี | ไซโตโครม บี-ซี1 คอมเพล็กซ์ ซับยูนิต 7 | Pfam PF02271 |
| 8 | QCR8 / SU8 | ยูคิวซีอาร์คิว | ไซโตโครม บี-ซี1 คอมเพล็กซ์ ซับยูนิต 8 | พีแฟม พีเอฟ02939 |
| 9 | QCR9 / SU9 | UQCRFS1 a | (ปลาย N ของ Rieske ไม่มีรายการแยกต่างหาก) | พีแฟม พีเอฟ09165 |
| 10 | QCR10 / SU10 | ยูคิวซีอาร์10 | ไซโตโครม บี-ซี1 คอมเพล็กซ์ ซับยูนิต 9 | พีแฟม พีเอฟ05365 |
| 11 | QCR11 / SU11 | ยูคิวซีอาร์11 | ไซโตโครม บี-ซี1 คอมเพล็กซ์ ซับยูนิต 10 | พีแฟมPF08997 |
- ใน สัตว์มีกระดูกสันหลัง ผลิตภัณฑ์ที่เกิดจากการแตกตัวของโปรตีน Rieske ที่มีน้ำหนักโมเลกุล 8 kDa (เปปไทด์สัญญาณ ) จะยังคงอยู่ในคอมเพล็กซ์เป็นซับยูนิตที่ 9 ดังนั้น ซับยูนิตที่ 10 และ 11 จึงสอดคล้องกับ QCR9p และ QCR10p ของเชื้อรา
ปฏิกิริยา

เอนไซม์นี้ทำหน้าที่เร่งปฏิกิริยารีดักชันของไซโตโครมซีโดยการออกซิเดชันของโคเอนไซม์คิว (CoQ) และการปั๊มโปรตอน 4 ตัว จากเมทริกซ์ของไมโทคอนเดรียไปยังช่องว่างระหว่างเยื่อหุ้มเซลล์พร้อมกัน:
- QH + 2 ไซโตโครมซี (Fe III ) + 2 H + → Q + 2 ไซโตโครมซี (Fe II ) + 4 H +
ในกระบวนการที่เรียกว่าวงจร Q [ 6 ] [ 7 ] โปรตอนสองตัวจะถูกบริโภคจากเมทริกซ์ (M) โปรตอนสี่ตัวจะถูก ปล่อย เข้าไปในช่องว่างระหว่างเยื่อหุ้มเซลล์ (IM) และอิเล็กตรอนสอง ตัวจะถูกส่งผ่านไปยังไซโตโครมซี
กลไกปฏิกิริยา

กลไกการเกิดปฏิกิริยาของคอมเพล็กซ์ III (ไซโตโครม bc1, โคเอนไซม์ Q: ไซโตโครม C ออกซิโดรีดักเทส) เรียกว่า วัฏจักรยูบิควิโนน ("Q") ในวัฏจักรนี้ โปรตอนสี่ตัวจะถูกปล่อยออกมาทางด้านบวก "P" (ช่องว่างระหว่างเยื่อหุ้มเซลล์) แต่โปรตอนเพียงสองตัวเท่านั้นที่จะถูกรับเข้ามาจากด้านลบ "N" (เมทริกซ์) ส่งผลให้ เกิด ความแตกต่างของความเข้มข้นของโปรตอนข้ามเยื่อหุ้มเซลล์ ในปฏิกิริยาโดยรวม ยูบิควิโนลสองตัวจะถูกออกซิไดซ์เป็นยูบิควิโนนและยูบิควิโนน หนึ่งตัว จะถูกรีดิวซ์เป็นยูบิควิโนลในกลไกที่สมบูรณ์ อิเล็กตรอนสองตัวจะถูกถ่ายโอนจากยูบิควิโนลไปยังยูบิควิโนน ผ่านตัวกลางไซโตโครม c สองตัว
โดยรวม :
- 2 x QH ถูกออกซิไดซ์เป็น Q
- 1 x Q ลดลงเหลือ QH
- ไซโตซี 2 เท่าลดลง
- 4 x H +ถูกปล่อยเข้าสู่ช่องว่างระหว่างเยื่อหุ้มเซลล์
- 2 x H +หยิบมาจากเมทริกซ์
ปฏิกิริยาเกิดขึ้นตามขั้นตอนดังต่อไปนี้:
รอบที่ 1 :
- ไซโตโครม บี จับกับยูบิควิโนลและยูบิควิโนน
- ศูนย์ 2Fe/2S และฮีม B แต่ละอันจะดึงอิเล็กตรอนออกจากยูบิควิโนลที่จับอยู่ ปล่อยโปรตอนสองตัวเข้าสู่ช่องว่างระหว่างเยื่อหุ้มเซลล์
- อิเล็กตรอนหนึ่งตัวถูกถ่ายโอนไปยังไซโตโครม c จากศูนย์ 2Fe/2S ในขณะที่อิเล็กตรอนอีกตัวหนึ่งถูกถ่ายโอนจากฮีม B ไปยัง ฮีมB
- ไซโตโครม ซีถ่ายโอนอิเล็กตรอนไปยังไซโตโครม ซี (อย่าสับสนกับไซโตโครม ซี 1) และฮีม บีช ถ่ายโอนอิเล็กตรอนไปยังยูบิควิโนนที่อยู่ใกล้เคียง ส่งผลให้เกิดการสร้างยูบิเซมิควิโนนขึ้น
- ไซโตโครมซีแพร่กระจาย ยูบิควิโนลตัวแรก (ซึ่งถูกออกซิไดซ์เป็นยูบิควิโนนแล้ว) ถูกปล่อยออกมา ในขณะที่เซมิควิโนนยังคงยึดติดอยู่
รอบที่ 2 :
- ยูบิควิโนลตัวที่สองถูกจับโดยไซโตโครมบี
- ศูนย์ 2Fe/2S และฮีม B แต่ละอันจะดึงอิเล็กตรอนออกจากยูบิควิโนลที่จับอยู่ ปล่อยโปรตอนสองตัวเข้าสู่ช่องว่างระหว่างเยื่อหุ้มเซลล์
- อิเล็กตรอนหนึ่งตัวถูกถ่ายโอนไปยังไซโตโครม c จากศูนย์ 2Fe/2S ในขณะที่อิเล็กตรอนอีกตัวหนึ่งถูกถ่ายโอนจากฮีม B ไปยัง ฮีมB
- จากนั้น ไซโตโครมซีจะถ่ายโอนอิเล็กตรอนไปยังไซโตโครมซีในขณะที่เซมิควินอนที่อยู่ใกล้เคียงซึ่งเกิดจากรอบที่ 1 จะรับอิเล็กตรอนตัวที่สองจากฮีมบีเอชกับโปรตอนสองตัวจากเมทริกซ์
- ยูบิควิโนลตัวที่สอง (ซึ่งตอนนี้ถูกออกซิไดซ์เป็นยูบิควิโนน) พร้อมกับยูบิควิโนลที่เกิดขึ้นใหม่จะถูกปล่อยออกมา[ 8 ]
สารยับยั้งของคอมเพล็กซ์ III
สารยับยั้งคอมเพล็กซ์ III แบ่งออกเป็นสามกลุ่มที่แตกต่างกันอย่างชัดเจน
- แอนติไมซิน เอจับกับไซต์ Qi ยับยั้งการถ่ายโอนอิเล็กตรอนในคอมเพล็กซ์ III จากฮีมบีไปยังคิวที่ถูกออกซิไดซ์ (สารยับยั้งไซต์ Qi)
- ไมโซไทอะโซลและสติ๊กมาเทลลินจับกับตำแหน่ง Qo ยับยั้งการถ่ายโอนอิเล็กตรอนจาก QH2 ที่ถูกรีดิวซ์ยังโปรตีนเหล็กซัลเฟอร์ของรีสเก ไมโซไทอะโซลและสติ๊กมาเทลลินจับกับช่องว่างที่แตกต่างกันแต่ทับซ้อนกันภายในตำแหน่ง
- ไมโซไทอะโซลจับกับไซโตโครม bL ได้ใกล้กว่า (จึงเรียกว่าสารยับยั้งแบบ " ใกล้เคียง ")
- สติ๊กมาเทลลินจะจับกับบริเวณที่อยู่ห่างจากฮีม bL และอยู่ใกล้กับโปรตีนเหล็กซัลเฟอร์ของรีสเก ซึ่งมีการโต้ตอบกันอย่างแน่นหนา
บางชนิดได้รับการจำหน่ายในเชิงพาณิชย์ในฐานะสารฆ่าเชื้อรา ( อนุพันธ์ของ สโตรบิลูรินซึ่งที่รู้จักกันดีที่สุดคืออะโซซิสโทรบิน ; สารยับยั้ง QoI ) และในฐานะสารต้านมาลาเรีย ( อะโทวาควอน ) สารยับยั้งไซต์ Qo บางชนิดรับการจำหน่ายในเชิงพาณิชย์ในฐานะยาฆ่าแมลง ( กลุ่ม IRAC 20) [ 9 ]
นอกจากนี้โพรพิลเฮกเซดรีนยังยับยั้งไซโตโครมซีรีดักเทส ด้วย [ 10 ]
อนุมูลอิสระออกซิเจน
อิเล็กตรอนเพียงส่วนน้อยจะออกจากห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอนก่อนที่จะไปถึงคอมเพล็กซ์ IVการรั่วไหลของอิเล็กตรอนก่อนกำหนดไปยังออกซิเจนส่งผลให้เกิดซูเปอร์ออกไซด์ความสำคัญของปฏิกิริยาข้างเคียงเล็กน้อยนี้คือซูเปอร์ออกไซด์และออกซิเจนชนิดอื่น ๆ ที่มีปฏิกิริยาสูงนั้นเป็นพิษอย่างมากและเชื่อกันว่ามีบทบาทในพยาธิสภาพหลายอย่าง รวมถึงการแก่ชรา ( ทฤษฎีอนุมูลอิสระของการแก่ชรา ) [ 11 ]การรั่วไหลของอิเล็กตรอนเกิดขึ้นส่วนใหญ่ที่ไซต์ Q และถูกกระตุ้นโดยแอนติไมซิน A แอนติไมซิน Aล็อกฮี ม bไว้ในสถานะลดลงโดยป้องกันการออกซิเดชันซ้ำที่ไซต์ Q ซึ่งในทางกลับกันทำให้ความเข้มข้นของเซมิควิโนน Q ในสภาวะคง ที่เพิ่มขึ้น โดยชนิดหลังนี้จะทำปฏิกิริยากับออกซิเจนเพื่อสร้างซูเปอร์ออกไซด์เชื่อกันว่าผลของศักย์เยื่อหุ้มเซลล์สูงมีผลคล้ายกัน[ 12 ]ซูเปอร์ออกไซด์ที่ผลิตที่ไซต์ Qo สามารถถูกปล่อยออกมาได้ทั้งในเมทริกซ์ของไมโทคอนเดรีย[ 13 ] [ 14 ]และในช่องว่างระหว่างเยื่อหุ้มเซลล์ ซึ่งจากนั้นจะสามารถเข้าถึงไซโตโซลได้[ 13 ] [ 15 ]สิ่งนี้สามารถอธิบายได้จากข้อเท็จจริงที่ว่าคอมเพล็กซ์ III อาจผลิตซูเปอร์ออกไซด์ ในรูปของ HOO • ที่สามารถ ซึมผ่านเยื่อ หุ้มเซลล์ได้ แทนที่จะเป็นO − ที่ไม่สามารถซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ได้ . [ 14 ]
ชื่อยีนของมนุษย์
- MT-CYB : ไซโตโครม บี ที่เข้ารหัส โดย mtDNA ; การกลายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องกับภาวะทนต่อการออกกำลังกายได้ไม่ดี
- CYC1 : ไซโตโครม ซี1
- CYCS : ไซโตโครมซี
- UQCRFS1 : โปรตีนเหล็กซัลเฟอร์ของรีสเก้
- UQCRB : โปรตีนจับยูบิควิโนน การกลายพันธุ์ที่เชื่อมโยงกับภาวะขาดเอนไซม์คอมเพล็กซ์ III ในไมโทคอนเดรีย ชนิดนิวเคลียร์ 3
- UQCRH : โปรตีนบานพับ
- UQCRC2 : แกนหลัก 2 การกลายพันธุ์ที่เชื่อมโยงกับภาวะพร่องของไมโทคอนเดรียคอมเพล็กซ์ III ชนิดนิวเคลียร์ 5
- UQCRC1 : แกนหลัก 1
- UQCR : หน่วยย่อย 6.4KD
- UQCR10 : หน่วยย่อย 7.2KD
- TTC19 : หน่วยย่อยที่ระบุใหม่ การกลายพันธุ์ที่เชื่อมโยงกับภาวะขาดคอมเพล็กซ์ III ชนิดนิวเคลียร์ 2 ช่วยกำจัดชิ้นส่วนปลาย N ของ UQCRFS1 ซึ่งหากไม่กำจัดออกไปจะรบกวนการทำงานของคอมเพล็กซ์ III [ 16 ]
การกลายพันธุ์ในยีนคอมเพล็กซ์ III ในโรคของมนุษย์
การกลายพันธุ์ในยีนที่เกี่ยวข้องกับคอมเพล็กซ์ III มักแสดงอาการเป็นภาวะทนต่อการออกกำลังกายไม่ได้[ 17 ] [ 18 ] มีรายงานว่าการกลายพันธุ์อื่นๆ ทำให้เกิดภาวะ septo-optic dysplasia [ 19 ]และความผิดปกติของหลายระบบ[ 20 ]อย่างไรก็ตาม การกลายพันธุ์ในBCS1Lซึ่งเป็นยีนที่รับผิดชอบต่อการเจริญเติบโตที่เหมาะสมของคอมเพล็กซ์ III อาจส่งผลให้เกิดกลุ่มอาการ Björnstadและกลุ่มอาการ GRACILEซึ่งในทารกแรกเกิดเป็นภาวะที่ร้ายแรงถึงชีวิตที่มีอาการแสดงของหลายระบบและระบบประสาทซึ่งเป็นลักษณะเฉพาะของความผิดปกติของไมโทคอนเดรียอย่างรุนแรง ความสามารถในการก่อโรคของการกลายพันธุ์หลายชนิดได้รับการตรวจสอบแล้วในระบบจำลองเช่นยีสต์[ 21 ]
ปัจจุบันยังไม่ทราบแน่ชัดว่าความผิดปกติทางพยาธิสภาพต่างๆ เหล่านี้เกิดจากความบกพร่องทางชีวพลังงานหรือการผลิตซูเปอร์ออกไซด์ มากเกินไปมากน้อยเพียงใด
ดูเพิ่มเติม
รูปภาพเพิ่มเติม
- อีทีซี
อ่านเพิ่มเติม
- Marres CM, Slater EC (1977). "องค์ประกอบของพอลิเปปไทด์ของ QH2:ไซโตโครมซีออกซิโดรีดักเทสที่บริสุทธิ์จากไมโตคอนเดรียหัวใจวัว" Biochim. Biophys. Acta . 462 (3): 531– 548. doi : 10.1016/0005-2728(77)90099-8 . PMID 597492 .
- Rieske JS (1976). "องค์ประกอบ โครงสร้าง และหน้าที่ของคอมเพล็กซ์ III ของห่วงโซ่การหายใจ" . Biochim. Biophys. Acta . 456 (2): 195– 247. doi : 10.1016/0304-4173(76)90012-4 . PMID 788795 .
- Wikstrom M, Krab K, Saraste M (1981). "คอมเพล็กซ์ไซโตโครมที่เคลื่อนย้ายโปรตอน" Annu. Rev. Biochem . 50 : 623–655 . doi : 10.1146/annurev.bi.50.070181.003203 . PMID 6267990 .
ลิงก์ภายนอก
- เว็บไซต์ของคอมเพล็กซ์ ไซโตโครมbc (Edward A. Berry) บนWayback Machine (เก็บถาวรเมื่อวันที่ 9 ตุลาคม 2549)ที่ lbl.gov
- ไซต์คอมเพล็กซ์ ไซโตโครมbc (แอนโทนี อาร์. ครอฟต์ส) เก็บถาวรเมื่อ 17 กันยายน 2007 ที่Wayback Machineที่ uiuc.edu
- ลิงก์ที่ล้าสมัยที่archive.today (เก็บถาวรเมื่อวันที่ 27 สิงหาคม 1999)ที่ scripps.edu
- แบบจำลองโมเลกุลเชิงโต้ตอบของคอมเพล็กซ์ III ที่Wayback Machine (เก็บถาวรเมื่อวันที่ 12 มกราคม 2552) (ต้องใช้MDL Chime )
- การจัดเรียงตัวของโปรตีนในเยื่อหุ้มเซลล์ของมหาวิทยาลัยมิชิแกน (UMich) ตระกูล/ซูเปอร์แฟมิลี-3 - ตำแหน่งที่คำนวณได้ของ bc1 และคอมเพล็กซ์ที่เกี่ยวข้องในเยื่อหุ้มเซลล์
- Coenzyme+Q-Cytochrome-c+Reductase ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
- #124000 ภาวะขาดเอนไซม์คอมเพล็กซ์ III ในไมโทคอนเดรีย ชนิดนิวเคลียร์ 1; MC3DN1บนOMIM ; แสดงรายการภาวะขาดเอนไซม์คอมเพล็กซ์ III ชนิดอื่นๆ ทั้งหมด