ในมนุษย์ ยีน FANCA มีความยาว 79 กิโลเบส (kb) และตั้งอยู่บนโครโมโซม 16 (16q24.3) โปรตีน FANCA ประกอบด้วยกรดอะมิโน 1455 ตัว^{[ 8 ]} ภายในเซลล์ หน้าที่หลักของ FANCA คือการมีส่วนร่วมในคอมเพล็กซ์ FA หลายหน่วยย่อย ซึ่งประกอบด้วย FANCA, FANCB , FANCC , FANCE , FANCF , FANCG , FANCL/PHF9 และ FANCM ในคอมเพล็กซ์กับ FANCF, FANCG และ FANCL นั้น FANCA จะมีปฏิสัมพันธ์กับ HES1 ปฏิสัมพันธ์นี้ได้รับการเสนอว่าเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับความเสถียรและการแปลตำแหน่งในนิวเคลียสของโปรตีนคอมเพล็กซ์หลักของ FA คอมเพล็กซ์กับ FANCC และ FANCG อาจรวมถึง EIF2AK2 และ HSP70 ด้วย^{[ 9 ]}ในเซลล์ การมีส่วนร่วมของ FANCA ใน 'คอมเพล็กซ์แกนกลาง FA' นี้จำเป็นสำหรับการกระตุ้น โปรตีน FANCD2ให้เป็นไอโซฟอร์มโมโนยูบิควิทิเนต (FANCD2-Ub) เพื่อตอบสนองต่อความเสียหายของ DNAซึ่งเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในการกระตุ้นเส้นทางตอบสนองต่อความเสียหายของ DNA FA/BRCA ^{[ 10 ]}นำไปสู่การซ่อมแซม^{[ 11 ]}

FANCA จับกับ DNA ทั้งแบบสายเดี่ยว (ssDNA) และสายคู่ (dsDNA) อย่างไรก็ตาม เมื่อทดสอบด้วยวิธีการ เปลี่ยนแปลงการเคลื่อนที่ของอิเล็กโทรฟอเรซิส ความสัมพันธ์ของ FANCA กับssDNAจะสูงกว่าdsDNA อย่าง มีนัยสำคัญ FANCA ยังจับกับ RNA ด้วยความสัมพันธ์ที่สูงกว่า DNA อีก ด้วย ^{[ 12 ]} FANCA ต้องการจำนวนนิวคลีโอไทด์ที่แน่นอนสำหรับการจับที่เหมาะสม โดยจำนวนขั้นต่ำสำหรับการจดจำของ FANCA อยู่ที่ประมาณ 30 สำหรับทั้ง DNA และ RNA Yuan et al. (2012) พบว่าผ่านการทดสอบความสัมพันธ์ของ FANCA กับโครงสร้าง DNA หลายชนิด โดยพบว่า 5'-flap หรือ 5'-tail บน DNA ช่วยอำนวยความสะดวกในการโต้ตอบกับ FANCA ในขณะที่ชิ้นส่วน C-terminal ที่เสริมกันของ Q772X คือ C772-1455 ยังคงรักษาความสามารถในการจับกรดนิวคลีอิกที่แตกต่างกัน (เช่น ชอบ RNA ก่อน ssDNA และ dsDNA) ซึ่งบ่งชี้ว่าโดเมนการจับกรดนิวคลีอิกของ FANCA นั้นตั้งอยู่ที่ปลาย C เป็นหลัก ซึ่งเป็นตำแหน่งที่พบการกลายพันธุ์ที่ก่อให้เกิดโรคหลายชนิด^{[ 12 ]}

FANCA ถูกแสดงออกอย่างแพร่หลายในระดับต่ำในเซลล์ทั้งหมด^{[ 13 ]}โดยมีตำแหน่งย่อยของเซลล์ในนิวเคลียส เป็นหลัก แต่ก็ พบในไซ โตพลาสซึม ด้วย ^{[ 14 ]}ซึ่งสอดคล้องกับบทบาทการดูแลที่คาดการณ์ไว้ในเส้นทางการตอบสนองต่อความเสียหายของ DNA และการก่อตัวของคอมเพล็กซ์ FA การกระจายตัวของโปรตีนในเนื้อเยื่อต่างๆ ยังไม่เป็นที่เข้าใจดีในปัจจุบัน การศึกษาทางภูมิเคมีของเนื้อเยื่อหนูบ่งชี้ว่า FANCA มีอยู่ในระดับที่สูงกว่าใน^{เนื้อเยื่อน้ำเหลือง อัณฑะ และรังไข่ [} 13 ] และถึงแม้ความ^{สำคัญของ}เรื่องนี้จะไม่ชัดเจน แต่ก็ชี้ให้เห็นว่าการมีอยู่ของโปรตีน FA อาจเกี่ยวข้องกับการเพิ่มจำนวนเซลล์ตัวอย่างเช่น ในเซลล์เม็ดเลือด ขาว และ เซลล์ มะเร็งเม็ดเลือดขาว ของมนุษย์ที่ได้รับการทำให้เป็นอมตะ โปรตีน FA สามารถตรวจพบได้ง่ายโดยการตกตะกอนด้วยภูมิคุ้มกัน^{[ 15 ]}

ในเซลล์จากผู้ป่วยโรคโลหิตจางแฟนโคนี ไม่พบการเหนี่ยวนำของคอมเพล็กซ์หลักของ FA ในการสร้างยูบิควิติน ของ FANCD2 ซึ่งสันนิษฐานว่าเป็นผลมาจากการสร้างคอมเพล็กซ์ที่บกพร่องเนื่องจากขาดโปรตีน FANCA ที่ทำงานได้ ^{[ 23 ] [ 24 ]}ในที่สุด ไม่ว่าจะมีการกลายพันธุ์เฉพาะเจาะจงใด การหยุดชะงักของเส้นทาง FA/BRCA นี้ส่งผลให้เกิดฟีโนไทป์ ของเซลล์และทางคลินิกที่ไม่พึงประสงค์ ซึ่งพบได้ทั่วไปในผู้ป่วยโรคโลหิตจางแฟนโคนีที่มีความบกพร่องของ FANCA ^{[ 6 ]}มีการศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่าง BRCA1 และโปรตีน FANC หลายชนิด ในบรรดาโปรตีน FANC ที่รู้จัก หลักฐานส่วนใหญ่ชี้ให้เห็นถึงปฏิสัมพันธ์โดยตรงระหว่างโปรตีน FANCA และ BRCA1 เป็นหลัก หลักฐานจากการวิเคราะห์ยีสต์ทูไฮบริด [ ^{25 ]}การตกตะกอนร่วมภูมิคุ้มกันจาก การสังเคราะห์ ในหลอดทดลอง^และการตกตะกอนร่วมภูมิคุ้มกันจากสารสกัดจากเซลล์แสดงให้เห็นว่าตำแหน่งของการโต้ตอบอยู่ระหว่างกลุ่มอะมิโนปลายสุดของ FANCA และส่วนกลางของ BRCA1 ซึ่งตั้งอยู่ภายในกรดอะมิโน 740–1083 ^{[ 16 ] [ 26 ]}

อย่างไรก็ตาม เนื่องจาก FANCA และBRCA1มีปฏิสัมพันธ์กันอย่างต่อเนื่อง จึงอาจไม่ได้ขึ้นอยู่กับการตรวจจับความเสียหายของ DNA ที่แท้จริงเพียงอย่างเดียว แต่โปรตีน BRCA1 อาจมีความสำคัญมากกว่าในการตรวจจับการแตกของ DNA สองสาย หรือเป็นตัวกลางใน การซ่อมแซม การเชื่อมโยง ข้ามสาย (ICL) และทำหน้าที่นำโปรตีนซ่อมแซม DNA จำนวนมากที่มันมีปฏิสัมพันธ์ด้วยไปยังบริเวณนั้น โปรตีนหนึ่งในนั้นคือ FANCA ซึ่งอาจทำหน้าที่เป็นจุดเชื่อมต่อหรือจุดยึดที่บริเวณความเสียหายของ ICL สำหรับคอมเพล็กซ์หลักของ FA ^{[ 26 ]} จากนั้น โปรตีน FANC อื่นๆ เช่นFANCC , FANCEและFANCGจะถูกประกอบเข้าด้วยกันในคอมเพล็กซ์นิวเคลียร์นี้เมื่อมี FANCA อยู่ด้วยตามที่จำเป็นสำหรับการทำงานของFANCD2กลไกนี้ยังได้รับการสนับสนุนจากปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีนระหว่าง BRG1 และทั้ง BRCA1 และ FANCA ซึ่งทำหน้าที่ปรับจังหวะการทำงานของวงจรเซลล์ควบคู่กันไป^{[ 27 ]}อีกทางเลือกหนึ่ง BRCA1 อาจกำหนดตำแหน่งของ FANCA ไปยังบริเวณที่เกิดความเสียหายของ DNA แล้วจึงปล่อย FANCA เพื่อเริ่มต้นการสร้างคอมเพล็กซ์^{[ 10 ] [ 26 ]}คอมเพล็กซ์จะช่วยให้เกิดการยูบิควิตินของ FANCD2 ซึ่งเป็นโปรตีนที่ทำหน้าที่ในภายหลังในเส้นทาง FA ส่งเสริม ICL และการซ่อมแซม DNA

หน้าที่ที่คาดการณ์ได้และชัดเจนของ FANCA ในการกระตุ้นคอมเพล็กซ์หลักของ FA ยังให้คำอธิบายถึงความสัมพันธ์ที่สูงเป็นพิเศษกับการกลายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรคโลหิตจางแฟนโคนี แม้ว่าการกลายพันธุ์ของโปรตีน FANC จำนวนมากจะคิดเป็นเพียง 1% ของกรณีที่สังเกตทั้งหมด^{[ 6 ]}แต่การกลายพันธุ์เหล่านั้นก็ได้รับการทำให้เสถียรโดย FANCA ภายในคอมเพล็กซ์ ตัวอย่างเช่น FANCA ทำให้FANCG เสถียร ภายในคอมเพล็กซ์หลัก ดังนั้นการกลายพันธุ์ใน FANCG จึงได้รับการชดเชยเนื่องจากคอมเพล็กซ์ยังคงสามารถเร่งปฏิกิริยายูบิ ควิตินของ FANCD2 ต่อไปได้การเพิ่มระดับ FANCA ยังเพิ่มการแสดงออกของ FANCG ในเซลล์ และข้อเท็จจริงที่ว่าการถ่ายทอดนี้ไม่ได้เป็นไปในทิศทางเดียวกัน – การเพิ่มระดับ FANCG ไม่ได้ทำให้การแสดงออกของ FANCA เพิ่มขึ้น – ชี้ให้เห็นว่า FANCA ไม่เพียงแต่เป็นโปรตีนหลักที่ทำให้คอมเพล็กซ์หลักเสถียรเท่านั้น แต่ยังอาจทำหน้าที่เป็นตัวควบคุมตามธรรมชาติในผู้ป่วยที่อาจต้องทนทุกข์ทรมานจากการกลายพันธุ์ในยีน FANC อื่นๆ นอกเหนือจาก FANCA หรือ FANCD2 ^{[ 28 ] [ 29 ]}

มีการตั้งสมมติฐานว่า FANCA มีบทบาทสำคัญในการสร้างเม็ดเลือด ในผู้ใหญ่ (ขั้นสุดท้าย) ในระหว่างการพัฒนาของตัวอ่อน และเชื่อว่ามีการแสดงออกในทุกตำแหน่งของการสร้างเม็ดเลือดที่สนับสนุนการสร้างเซลล์ต้นกำเนิดเม็ดเลือดและเซลล์ต้นกำเนิด (HSPCs) ผู้ป่วยส่วนใหญ่ที่มีการกลายพันธุ์จะมีภาวะผิดปกติทางโลหิตวิทยาภายในทศวรรษแรกของชีวิต^{[ 7 ]}และจะแย่ลงเรื่อยๆ จนกระทั่งเกิดผลข้างเคียงที่พบได้บ่อยที่สุด คือภาวะเม็ดเลือดต่ำ ทุกชนิด ซึ่งอาจนำไปสู่การเสียชีวิตได้^{[ 6 ]}โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ผู้ป่วยจำนวนมากจะมีภาวะโลหิตจางชนิด เมกะโลบลาสติก เมื่ออายุประมาณ 7 ขวบ โดยภาวะเม็ดเลือดแดงขนาดใหญ่นี้เป็นตัวบ่งชี้ทางโลหิตวิทยาตัวแรก^{[ 7 ]} มีการบันทึกความบกพร่อง ของการสร้าง เม็ดเลือด ในหลอดทดลอง มานานกว่าสองทศวรรษ ซึ่งเป็นผลมาจากโปรตีน FANCA ที่กลายพันธุ์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งความบกพร่องในการพัฒนา เช่น การสร้างเม็ดเลือดขาวชนิด แกรนูโลโมโนไซต์บกพร่องเนื่องจากการกลายพันธุ์ของ FANCA ^{[ 30 ]}

การศึกษาโดยใช้ เซลล์ต้นกำเนิด ไมอีลอยด์ แบบโคลน (CFU-GM) ยังแสดงให้เห็นว่าความถี่ของ CFU-GM ในไขกระดูก ปกติ เพิ่มขึ้นและศักยภาพในการเพิ่มจำนวนลดลงแบบทวีคูณตามอายุ โดยเฉพาะอย่างยิ่งพบความบกพร่องในการเพิ่มจำนวนอย่างเห็นได้ชัดในเด็กที่เป็นโรคโลหิตจางแฟนโคนีเมื่อเทียบกับกลุ่มควบคุมที่มีสุขภาพดีในวัยเดียวกัน^{[ 31 ] [ 32 ]} เนื่องจากการทำงานของเซลล์ต้นกำเนิดเม็ดเลือดเริ่มต้นตั้งแต่แรกเกิดและดำเนินต่อไปตลอดชีวิต จึงอนุมานได้ง่ายว่าการที่การผลิตโปรตีน FANCA หยุดชะงักเป็นเวลานานส่งผลให้เกิดภาวะเม็ดเลือดล้มเหลวโดยสิ้นเชิงในผู้ป่วย

การกลายพันธุ์ของ FANCA ยังเกี่ยวข้องกับความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของโรคมะเร็งและมะเร็งร้าย^{[ 7 ]}ตัวอย่างเช่น ผู้ป่วยที่มีการกลายพันธุ์แบบโฮโมไซกัสใน FANCA มีความเสี่ยงต่อโรคมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิด เฉียบพลันเพิ่ม ขึ้น อย่างมาก ^{[ 21 ]}นอกจากนี้ เนื่องจากการกลายพันธุ์ของ FANC โดยทั่วไปส่งผลต่อการซ่อมแซม DNAทั่วร่างกายและมีแนวโน้มที่จะส่งผลต่อการแบ่งเซลล์ แบบไดนามิก โดยเฉพาะในไขกระดูกจึงไม่น่าแปลกใจที่ผู้ป่วยมีแนวโน้มที่จะเกิดกลุ่มอาการไมอีโลดิสพลาสติก (MDS) และโรคมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดเฉียบพลัน มากขึ้น ^{[ 6 ]}