คุณภาพของโปรตีนหมายถึงความสามารถในการย่อยและปริมาณของกรดอะมิโนจำเป็นที่ให้โปรตีนในอัตราส่วนที่เหมาะสมสำหรับการบริโภคของมนุษย์ มีวิธีการต่างๆ มากมายที่ใช้จัดอันดับคุณภาพของโปรตีน ประเภทต่างๆ ซึ่งบางวิธีนั้นล้าสมัยและไม่ได้ใช้แล้ว หรือไม่ถือว่ามีประโยชน์เท่าที่เคยคิดไว้คะแนนกรดอะมิโนที่ปรับปรุงแล้วตามความสามารถในการย่อยโปรตีน (PDCAAS) ซึ่งได้รับการแนะนำโดยองค์การอาหารและเกษตรแห่งสหประชาชาติ (FAO) ได้กลายเป็นมาตรฐานอุตสาหกรรมในปี 1993 ล่าสุด FAO ได้แนะนำคะแนนกรดอะมิโนจำเป็นที่ย่อยได้ (DIAAS) ที่ใหม่กว่าเพื่อใช้แทนที่ PDCAAS

คะแนนกรดอะมิโนขึ้นอยู่กับสัดส่วนของกรดอะมิโนในอาหารเมื่อเทียบกับความต้องการทางโภชนาการดังนั้น เฉพาะกรดอะมิโนจำเป็นเท่านั้นที่จะถูกนำมาพิจารณาในการวัดคุณภาพที่ใช้กันทั่วไปสองวิธี ได้แก่ PDCAAS และ DIAAS ^{[ 1 ] [ 2 ]}

ต่อไปนี้เป็นตารางแสดงรายละเอียดกรดอะมิโนของแหล่งโปรตีนทั่วไปบางชนิด โดยไม่คำนึงถึงการย่อยได้ รายละเอียดความต้องการคือปริมาณกรดอะมิโนที่จำเป็นในโปรตีนทุกๆ 100 กรัม ตามปริมาณสารอาหารอ้างอิงที่ควรได้รับต่อวันแต่ละรายละเอียดสะท้อนถึงปริมาณกรดอะมิโนต่อโปรตีน 100 กรัม ไม่ใช่ต่อแหล่งอาหาร 100 กรัม

ในการพิจารณาคุณภาพของโปรตีน กรดอะมิโนที่มีกำมะถัน (เมไทโอนีน + ซิสทีน) และกรดอะมิโนอะโรมาติก (ฟีนิลอะลานีน + ไทโรซีน) จะถูกจัดกลุ่มเข้าด้วยกัน เนื่องจากเมไทโอนีนและฟีนิลอะลานีนเป็นกรดอะมิโนที่จำเป็น ในขณะที่ซิสทีนและไทโรซีนถูกสังเคราะห์จากเมไทโอนีนและฟีนิลอะลานีนตามลำดับ^{[ 3 ]}อย่างไรก็ตาม วิธีการวิเคราะห์โปรตีนทั่วไป เช่น ISO 13903 สามารถแยกแยะกรดอะมิโนคู่เหล่านี้ได้อย่างง่ายดาย

นอกจากนี้ กรดกลูตามิกสามารถเปลี่ยนรูปได้ง่ายกับกลูตามีน และกรดแอสปาร์ติกสามารถเปลี่ยนรูปได้ง่ายกับแอสปาร์จินีน โดยผ่านกระบวนการไฮโดรไลซิสด้วยกรด^{[ 3 ]}ดังนั้น วิธีการวิเคราะห์กรดอะมิโนทั่วไป เช่น ISO 13903 จึงวัดเฉพาะกรดกลูตามิกและกรดแอสปาร์ติกเท่านั้น ไม่ได้วัดกลูตามีนหรือแอสปาร์จินีน และค่าที่วัดได้เหล่านี้อาจถือเป็นผลรวมของทั้งสอง^{[ 4 ]}

โดยปกติแล้วซีลีโนซิสเทอีนจะไม่ถูกวัดเป็นส่วนหนึ่งของการวิเคราะห์กรดอะมิโน โดยทั่วไปจะวิเคราะห์โดยตรงเป็นปริมาณของซีลีเนียมซึ่งส่วนใหญ่พบในรูปของซีลีโนเมไทโอนีนและซีลีโนซิสเทอีนในอาหาร^{[ 5 ]}

*กึ่งจำเป็น ภายใต้เงื่อนไขบางประการ **กรดอะมิโนสายโซ่กิ่ง ( BCAA )

สำหรับอาหารหลายชนิด ปริมาณกรดอะมิโนที่ร่างกายดูดซึมอาจแตกต่างจากปริมาณกรดอะมิโนที่มีอยู่ในอาหารแต่เดิมอย่างมีนัยสำคัญ อันเป็นผลมาจากกระบวนการย่อยอาหารต่างๆ การย่อยโปรตีนเริ่มต้นในกระเพาะอาหารและเสร็จสมบูรณ์เป็นส่วนใหญ่เมื่ออาหารออกจากลำไส้เล็ก^{[ 22 ] [ 23 ]}อย่างไรก็ตาม การย่อยอาจลดลงเนื่องจากปัจจัยต้านโภชนาการหรือส่วนประกอบอาหารอื่นๆ เช่นใยอาหาร [ ^{24 ] จุลินทรีย์}ในลำไส้อาจส่งผลต่อการย่อยโปรตีนเนื่องจากการย่อยโปรตีนของพวกมันเองด้วย^{[ 25 ]}

การย่อยได้อาจแตกต่างกันระหว่างกรดอะมิโน ในขณะที่การย่อยได้ในอุจจาระของโปรตีนทั้งหมดน่าจะเป็นค่าประมาณที่ดีของการย่อยได้ของกรดอะมิโนแต่ละชนิดสำหรับโปรตีนที่ไม่ใช่พืชตระกูลถั่ว (ถั่วต่างๆ ถั่วลันเตา ถั่วเลนทิล) โดยมีความแตกต่างสูงสุด 10% แต่สำหรับโปรตีนจากพืชตระกูลถั่ว การย่อยได้ของเมไทโอนีน ซิสทีน และทริปโตเฟนอาจถูกประเมินสูงเกินไป^{[ 26 ] [ 27 ]}

การปรุงอาหาร โดยเฉพาะโปรตีนจากสัตว์ อาจเปลี่ยนแปลงองค์ประกอบและการย่อยได้ของกรดอะมิโนอย่างมีนัยสำคัญ เนื่องจากข้อมูลทางโภชนาการไม่ได้สะท้อนถึงการเปลี่ยนแปลงนี้เสมอไป^{[ 28 ]}การเปลี่ยนแปลงระหว่างการปรุงอาหารจึงอาจถูกนำมาพิจารณาในการวัดคุณภาพของโปรตีน ตัวอย่างเช่น การทำให้เนื้อสัตว์หลายชนิดมีสีน้ำตาลจะทำให้เกิดปฏิกิริยา Maillardซึ่งอาจลดปริมาณไลซีน ซึ่งเป็นกรดอะมิโนที่จำกัดสำหรับอาหารหลายชนิด^{[ 29 ]}ด้วยเหตุนี้ จึงแนะนำให้ใช้ไลซีนเป็นกรดอะมิโนที่จำกัดสำหรับอาหารใดๆ ที่อาจเกิดปฏิกิริยา Maillard ^{[ 30 ]}

แม้ว่าคะแนนกรดอะมิโนสำหรับ PDCAAS และ DIAAS จะอิงตามความต้องการของเด็กวัยหัดเดิน (อายุ 1–3 ปี) ^{[ 6 ]}แต่ความต้องการกรดอะมิโนจำเป็นนั้นแตกต่างกันสำหรับผู้ใหญ่และทารก^{[ 6 ]}ความต้องการกรดอะมิโนจำเป็นที่สูงที่สุดคือสำหรับทารก เมื่อเด็กโตเป็นผู้ใหญ่ พวกเขาต้องการสัดส่วนของกรดอะมิโนจำเป็นที่น้อยลง นอกจากนี้ยังหมายความว่าแหล่งโปรตีนมังสวิรัติหลายชนิดที่จำกัดกรดอะมิโนจำเป็นอย่างน้อยหนึ่งชนิดนั้น จริงๆ แล้วมีกรดอะมิโนจำเป็นสำหรับผู้ใหญ่น้อยกว่า หรืออาจจะไม่ขาดแคลนเลยก็ได้ วัยชราและการตั้งครรภ์ยังเปลี่ยนแปลงความต้องการกรดอะมิโนด้วย เนื่องจากความจำเป็นในการบำรุงทารกในครรภ์หรือชะลอการสูญเสียกล้ามเนื้อเนื่องจากอายุ^{[ 31 ] [ 29 ] [ 24 ]}ความต้องการกรดอะมิโนจำเป็นสำหรับทารกนั้นอิงตามสัดส่วนของกรดอะมิโนจำเป็นในน้ำนมแม่^{[ 6 ]}

วิธีการวัดคุณภาพโปรตีนแบบดั้งเดิมใช้การวัดเกี่ยวกับร่างกายเพียงไม่กี่อย่าง ส่วนใหญ่เป็นการวัดมวล

• อัตราส่วนประสิทธิภาพโปรตีน (PER) คืออัตราส่วนของน้ำหนักที่เพิ่มขึ้นต่อปริมาณโปรตีนที่รับประทานเข้าไป โดยปกติจะทดสอบกับหนูทดลอง
• ค่าทางชีวภาพ (Biological Value หรือ BV) โดยพื้นฐานแล้วเป็นการประมาณสัดส่วนของไนโตรเจนจากอาหารที่ร่างกายเก็บสะสมไว้ โดยหักลบไนโตรเจนที่พบในปัสสาวะและอุจจาระออกไป โดยถือว่าไนโตรเจนส่วนใหญ่มาจากโปรตีน
• การใช้ประโยชน์โปรตีนสุทธิ (NPU) คล้ายกัน เพียงแต่หักลบเฉพาะไนโตรเจนในปัสสาวะเท่านั้น วิธีการเหล่านี้อิงตามสมดุลของไนโตรเจน

การวัดสมัยใหม่จะวิเคราะห์สองด้านที่แยกจากกัน ได้แก่ การย่อยได้ของโปรตีนและความสมดุลของกรดอะมิโน ด้านแรกวัดโดยการเปรียบเทียบปริมาณโปรตีนในอาหารก่อนและหลังผ่านระบบย่อยอาหารหรือบางส่วนของระบบย่อยอาหาร ด้านที่สองวัดโดยการนำข้อมูลกรดอะมิโนของโปรตีนมาเปรียบเทียบกับ ความต้องการ กรดอะมิโนจำเป็นของสิ่งมีชีวิต โดยทั่วไปคือมนุษย์

การวัด "สมัยใหม่" ก่อนหน้านี้คือPDCAASในปี 1989 ^{[ 26 ]}สำหรับการย่อยโปรตีน จะเปรียบเทียบปริมาณโปรตีน-ไนโตรเจนที่เข้าสู่ร่างกายหนูและออกจากร่างกายหนูผ่านทางอุจจาระโดยมีการแก้ไขสำหรับ "โปรตีนในอุจจาระจากการเผาผลาญ": ปริมาณโปรตีนที่เกิดขึ้นในอุจจาระเมื่อหนูกินอาหารที่ปราศจากโปรตีน^{[ 32 ]}สำหรับคะแนนกรดอะมิโน จะพิจารณาปริมาณของกรดอะมิโนจำเป็นแต่ละชนิดในอาหารเป็นสัดส่วนของปริมาณโปรตีนในอาหาร และเปรียบเทียบกับคำแนะนำทางโภชนาการสำหรับเด็กก่อนวัยเรียน คะแนนกรดอะมิโนที่ใช้คือคะแนนของกรดอะมิโนที่ต่ำที่สุด หรือ 'จำกัด' จากนั้นคะแนนกรดอะมิโนจะถูกคูณด้วยคะแนนการย่อยในอุจจาระเพื่อให้ได้คะแนนโดยรวมระหว่างศูนย์ถึงหนึ่ง^{[ 26 ]}

PDCAAS มีแนวโน้มที่จะประเมินความสามารถในการย่อยสูงเกินไป เนื่องจากวัดจากอุจจาระแทนที่จะวัดจากสิ่งที่เหลืออยู่ที่ปลายลำไส้เล็กซึ่งเชื่อกันว่ามีการดูดซึมโปรตีนมากที่สุด^{[ 33 ]} ปัจจัยต้านสารอาหาร เช่น กรดไฟติกและสารยับยั้งทริปซินอาจลดการดูดซึมโปรตีน เช่นเดียวกับการดูดซึมโปรตีนโดยแบคทีเรียในลำไส้ใหญ่ ของสัตว์ ทดลอง^{[ 22 ]}นอกจากนี้ หนูที่มีอายุมากจะแสดงความสามารถในการย่อยในอุจจาระที่ประเมินโดย PDCAAS ต่ำกว่าหนูอายุน้อยเมื่อแหล่งโปรตีนมีปัจจัยต้านสารอาหาร^{[ 32 ]}

เพื่อแก้ไขปัญหาของ PDCAAS จึงมีการนำ DIAASมาใช้ในปี 2013 โดยจะวัดการย่อยได้ตั้งแต่ปากจนถึงปลายลำไส้เล็กส่วน ปลาย (ส่วนสุดท้ายของลำไส้เล็ก) สำหรับกรดอะมิโนแต่ละชนิด ปริมาณที่ดูดซึมของกรดอะมิโนจำเป็นแต่ละชนิดจะถูกเปรียบเทียบกับรูปแบบอ้างอิง กล่าวอีกนัยหนึ่งคือ จะให้คะแนนโปรไฟล์กรดอะมิโนที่ดูดซึมได้จริง^{[ 2 ] [ 34 ] [ 35 ]}นอกจากนี้ยังพิจารณาอายุโดยใช้รูปแบบอ้างอิงที่แตกต่างกันสำหรับทารก เด็กเล็ก และผู้ที่มีอายุมากกว่า 3 ปี^{[ 36 ] : 29} DIAAS ถือเป็นวิธีการที่เหนือกว่า PDCAAS ^{[ 34 ] [ 37 ]}

DIAAS นั้นวัดได้ยากกว่า PDCAAS ส่วนหนึ่งเป็นเพราะการเก็บตัวอย่างจากลำไส้เล็ก ส่วนปลาย ทำได้ยากกว่าการเก็บอุจจาระธรรมดา นอกจากนี้ DIAAS ยังนิยมใช้ค่าการย่อยได้ที่วัดในมนุษย์ แม้ว่าการใช้หมูหรือหนูที่กำลังเจริญเติบโตเป็นทางเลือกที่ยอมรับได้ก็ตาม^{[ 36 ]}สำหรับการวัดในมนุษย์ ได้มีการพัฒนาวิธีการติดตามแบบคู่ที่ไม่รุกรานมากนักสำหรับวิธี DIAAS ^{[ 27 ]}

หมายเหตุ:

• สำหรับคะแนนที่มากกว่าหรือเท่ากับ 1.0 หรือ 100% แนวคิดเรื่อง "กรดอะมิโนจำกัด" ยังคงใช้ได้ในทางเทคนิค เนื่องจากเป็นกรดอะมิโนที่มีอัตราส่วนต่ำที่สุดเมื่อเทียบกับปริมาณในโปรตีนอ้างอิง อย่างไรก็ตาม เรื่องนี้แทบไม่มีความสำคัญ ดังนั้นคอลัมน์ดังกล่าวจึงอยู่ในวงเล็บ
• ค่า PD จะถูกกำหนดตาม PDCAAS ("ค่า fecal ที่แท้จริง") เว้นแต่จะระบุไว้เป็นอย่างอื่น
• AAS ไม่ได้คำนึงถึงความสามารถในการย่อยอาหารอย่างชัดเจน โดยจะเปรียบเทียบโปรไฟล์กรดอะมิโนกับโปรไฟล์อ้างอิง ซึ่งก็คือโปรไฟล์ PDCAAS เว้นแต่จะระบุไว้เป็นอย่างอื่น
• ค่า AA ที่จำกัดอาจถูกกำหนดโดยวิธี PDCAAS (หรือวิธีที่คล้ายกันซึ่งใช้เพียงข้อมูลโปรไฟล์) หรือวิธี DIAAS (ซึ่งให้ค่า AA ที่ดูดซึมได้ จำกัด ) หากไม่ได้ระบุไว้ มักจะเป็นวิธี PDCAAS มากกว่า
• ค่า PDCAAS ถูกกำหนดขีดจำกัดอย่างเป็นทางการ แต่สามารถลบขีดจำกัดได้โดยการคำนวณ PD × AAS ด้วยตนเอง ตัวอย่างค่าที่ไม่ถูกจำกัด 5 ค่าสามารถดูได้ใน Schaafsma (2000) ^{[ 38 ]}

นับตั้งแต่มีการนำเสนอ มาตรการวัดคุณภาพโปรตีนสมัยใหม่ได้ถูกนำมาใช้เพื่อเป็นเหตุผลในการให้คำแนะนำด้านโภชนาการเกี่ยวกับการเลือกแหล่งโปรตีนและนโยบายสาธารณะที่เกี่ยวข้อง เนื่องจากค่าทั่วไปของแหล่งโปรตีนจากพืชมักจะต่ำกว่าโปรตีนจากสัตว์อย่างมาก^{[ 57 ]} PDCAAS และ DIAAS จึงถูกนำมาใช้ในการอภิปรายถึงคุณค่าของอาหารจากพืช และข้อโต้แย้งเกี่ยวกับอาหารจากพืชได้ถูกนำมาใช้เพื่อประเมินคุณค่าของการวัดคุณภาพโปรตีน^{[ 30 ] [ 58 ]}ผู้สนับสนุนความสำคัญของโปรตีนจากสัตว์ชี้ให้เห็นถึงประโยชน์ต่อสุขภาพของอาหารดังกล่าว รวมถึงศักยภาพในการขาดโปรตีนในอาหารจากพืช^{[ 30 ] [ 58 ]}ในทางกลับกัน ผู้สนับสนุนอาหารจากพืชมากขึ้นชี้ให้เห็นถึงผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมของการผลิตเนื้อสัตว์^{[ 58 ]}ความเสี่ยงต่อสุขภาพของอาหารที่อุดมไปด้วยเนื้อแดงหรือเนื้อแปรรูป^{[ 58 ]}รวมถึงประโยชน์ต่อสุขภาพอื่นๆ ที่ไม่เกี่ยวข้องของแหล่งโปรตีนจากพืช^{[ 58 ] [ 59 ]}

การเลือกวิธีการวัดคุณภาพโปรตีนยังมีผลต่อการถกเถียงเกี่ยวกับอาหารจากพืชด้วย แหล่งโปรตีนจากพืชมีแนวโน้มที่จะมีค่า DIAAS ต่ำกว่า PDCAAS มากกว่าแหล่งโปรตีนจากสัตว์ ดังนั้นการใช้ DIAAS แทน PDCAAS อาจทำให้ความคลาดเคลื่อนในคุณภาพโปรตีนระหว่างแหล่งโปรตีนจากพืชและสัตว์เพิ่มมากขึ้น ในระดับการกำกับดูแล สิ่งนี้อาจส่งผลต่อวิธีการทำการตลาดแหล่งโปรตีนจากพืช ตัวอย่างเช่น กระทรวงเกษตรของสหรัฐอเมริกาอนุญาตให้ติดฉลากอาหารที่มีโปรตีนอย่างน้อย 10% ของปริมาณที่แนะนำต่อวัน (RDI) ว่าเป็น "แหล่งโปรตีนที่ดี" และสำหรับอาหารที่จะถูกติดฉลากว่า "มีโปรตีนสูง" จะต้องมีโปรตีนอย่างน้อย 20% ของ RDI โดยคำนึงถึงคุณภาพด้วย การใช้ DIAAS จะเปลี่ยนอาหารจากพืชที่อาจทำการตลาดว่าเป็นอาหารที่มีโปรตีนสูง และส่งผลต่อการรับรู้ของผู้บริโภคเกี่ยวกับทางเลือกด้านอาหารของพวกเขา^{[ 58 ]}

การเปรียบเทียบแหล่งโปรตีนที่แตกต่างกันมีนัยสำคัญทั้งในระดับผู้บริโภคและระดับนโยบาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งเนื่องจากฉลากโภชนาการโดยทั่วไปจะอธิบายผลิตภัณฑ์อาหารตามที่ขาย^{[ 60 ]}ซึ่งไม่จำเป็นต้องสะท้อนถึงคุณภาพของโปรตีนหรือการเปลี่ยนแปลงอันเนื่องมาจากการเตรียมอาหาร ดังนั้นผู้บริโภคอาจใช้การวัดคุณภาพของโปรตีนในอาหารที่ปรุงแล้วเป็นแหล่งข้อมูลเพิ่มเติมสำหรับคำแนะนำด้านโภชนาการ ในประเทศกำลังพัฒนา ภาวะทุพโภชนาการอาจมีลักษณะเฉพาะคือการขาดโปรตีน การวัดคุณภาพของโปรตีนอาจให้รายละเอียดเพิ่มเติมเกี่ยวกับลักษณะของภาวะทุพโภชนาการนี้และมีผลต่อการรักษา^{[ 30 ]}นอกจากนี้ ในบริบทของการพัฒนาทั่วโลก การวิจัยเกี่ยวกับคุณค่าสัมพัทธ์ของโปรตีนจากพืชและสัตว์มีความสำคัญต่อสิ่งแวดล้อม เนื่องจากเส้นทางการปรับปรุงด้านอาหารในประเทศกำลังพัฒนาอาจส่งผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมอย่างมาก^{[ 61 ]}

แม้ว่าจะมีความแม่นยำมากขึ้น แต่การกำหนดความสามารถในการย่อยของโปรตีนแหล่งต่างๆ ในลำไส้เล็กส่วนปลายนั้นจำเป็นต้องใช้มนุษย์หรือสุกรเป็นตัวอย่าง ทำให้การวิจัยยากกว่าในหนูมาก ในขณะที่งานวิจัยเกี่ยวกับความสามารถในการย่อยอาหารในลำไส้เล็กส่วนปลายได้เพิ่มขึ้นนับตั้งแต่มีการนำ DIAAS มาใช้ แต่ในปี 2025 ก็ยังคงต้องการการวิจัยเพิ่มเติม โดยเฉพาะอย่างยิ่งเกี่ยวกับอาหารนอกเหนือจากอาหารตะวันตกหรือตะวันออก^{[ 30 ]}

ข้อวิจารณ์ทั่วไปของทั้ง PDCAAS และ DIAAS คือ การคำนวณ PDCAAS/DIAAS ของอาหารโดยอาศัย PDCAAS/DIAAS ของส่วนประกอบแต่ละอย่างเพียงอย่างเดียวอาจทำให้เข้าใจผิดได้ เนื่องจากอาหารชนิดหนึ่งอาจมีกรดอะมิโนในปริมาณมาก ในขณะที่อีกชนิดหนึ่งขาด ซึ่งในกรณีนี้ PDCAAS/DIAAS ของอาหารจะสูงกว่าของส่วนประกอบใดส่วนประกอบหนึ่ง เพื่อให้ได้ผลลัพธ์สุดท้าย จะต้องนำกรดอะมิโนแต่ละชนิดมาพิจารณาด้วย ดังนั้นคุณภาพโปรตีนของส่วนประกอบแต่ละอย่างจึงไม่จำเป็น^{[ 30 ]}

ตัวอย่างเช่น ธัญพืชหลายชนิดมีค่าโปรตีนระหว่าง 0.4 ถึง 0.8 และโดยทั่วไปจะมีไลซีน เป็นส่วนประกอบหลัก แต่มีเมไทโอนีนมากกว่า เพียงพอ ^{[ 62 ]}พืชตระกูลถั่วยกเว้นถั่วเหลือง โดยทั่วไปจะมีค่าโปรตีนระหว่าง 0.5 ถึง 0.8 และจะมีเมไทโอนีนเป็นส่วนประกอบหลักมากกว่าไลซีน เมื่อรับประทานร่วมกันในอัตราส่วนที่เหมาะสม ค่าโปรตีนของส่วนประกอบที่รวมกันอาจสูงถึง 1.0 เนื่องจากโปรตีนของแต่ละส่วนประกอบจะเสริมซึ่งกันและกัน^{[ 57 ] [ 63 ]}

ตัวอย่างที่รุนแรงกว่านั้นคือการผสมผสานระหว่างเจลาติน (ซึ่งแทบไม่มีทริปโตแฟน เลย และมีค่า PDCAAS ใกล้เคียงกับ 0) ^{[ 57 ]}กับทริปโตแฟนที่แยกออกมา (ซึ่งขาดกรดอะมิโนจำเป็นอื่นๆ ทั้งหมด จึงมีค่า PDCAAS เท่ากับ 0) แม้ว่าคะแนนแต่ละอย่างจะเป็น 0 แต่การผสมผสานของทั้งสองอย่างในปริมาณที่เพียงพอจะมีค่า PDCAAS เป็นบวก โดยมีกรดอะมิโนที่จำกัดคือไอโซลิวซีน ทรีโอนีนและเมไทโอนีนนอกจากนี้ จากการศึกษาในปี 2000 โดย Gerjan Schaafsma ระบุว่า "คำถามเกี่ยวกับความถูกต้องของรูปแบบการให้คะแนนกรดอะมิโนและการประยุกต์ใช้การแก้ไขการย่อยได้ในอุจจาระที่แท้จริงมากกว่าการแก้ไขการย่อยได้ในลำไส้เล็กส่วนปลายที่แท้จริง รวมถึงการตัดทอนค่า PDCAAS จำเป็นต้องมีการประเมิน PDCAAS ในรูปแบบปัจจุบันอย่างละเอียดถี่ถ้วนในฐานะมาตรวัดคุณภาพโปรตีนในอาหารของมนุษย์" ^{[ 38 ]}

แม้ว่า DIAAS จะเข้ามาแทนที่ PDCAAS ในฐานะวิธีการวัดที่เลือกใช้ แต่คำแนะนำดั้งเดิมของ FAO เมื่อเสนอ DIAAS คือให้ถือว่ากรดอะมิโนจำเป็นแต่ละชนิดเป็นสารอาหารแยกต่างหาก^{[ 36 ]}วิธีนี้จะช่วยขจัดความจำเป็นในการพิจารณาปริมาณหรือคุณภาพของโปรตีน และอาจทำให้การวิเคราะห์คุณค่าทางโภชนาการของมื้ออาหารง่ายขึ้นกว่าการวิเคราะห์อาหารแต่ละชนิด^{[ 30 ]}ข้อเสนอหนึ่งในแนวทางนี้คือคะแนน EAA-9 ซึ่งจะวัดเปอร์เซ็นต์ของ RDI ของกรดอะมิโนที่จำกัดในอาหารหนึ่งหน่วยบริโภค โดยจะนำมาใช้ในการกำหนดปริมาณเทียบเท่า EAA-9 หรือปริมาณอาหารที่จำเป็นเพื่อให้ได้กรดอะมิโนในปริมาณเท่ากับไข่หนึ่งฟอง^{[ 64 ]}