การกบฏของดันแกน
ภาพวาด "ยุทธการที่แม่น้ำเว่ย"จากราชสำนักชิง
วันที่ ค.ศ. 1862–1877 ที่ตั้ง ส่านซี กานซูหนิงเซี่ยและซินเจียง ผลลัพธ์ ชัยชนะของราชวงศ์ชิง
คู่กรณี
ราชวงศ์ชิง ได้รับการสนับสนุนโดย :  รัสเซีย ผู้ภักดีต่อฮุย คำสั่ง คูฟิยาภายใต้การนำของหม่า จ้านอ้าวในกานซู (พ.ศ. 2415–2420) กองพันเกดิมู 11 กองแห่งมณฑลส่านซี (ค.ศ. 1872–1877) กองพันของชุยเว่ย (พ.ศ. 2415–2420) กองพันหัวต้าไฉ (พ.ศ. 2415-2420) [ 1 ] : 105	คัชกาเรีย (โคกันดี อุซเบก อันดิยานิส ภายใต้การนำของ ยากุบ เบ็ก) ได้รับการสนับสนุนโดย :  สหราชอาณาจักร  จักรวรรดิออตโตมัน รัฐสุลต่านทารันชีแห่งอิลิ กบฏ ดังกันในยาร์คัน ด์ อาณาจักรอิสลาม อุรุมฉี กบฏ โคทานี ส กบฏดุ งกันแห่งคัชการ์ กบฏคีร์กีซ กบฏ ตุนกันแห่งทาเฉิง	กบฏฮุย กองพันเกอดิมู่ 18 กองพันแห่งมณฑลฉานซี (ผู้นำกองพัน 11 คนยอมจำนนและแปรพักตร์ไปอยู่กับราชวงศ์ชิง 6 คนถูกสังหาร และอีก 1 คนคือไป๋เหยียนหู หนีไปรัสเซีย) กองพันของชุยเว่ย (ค.ศ. 1862–1872) กองพันหัวต้าไฉ (พ.ศ. 2405–2415) กองพันไป๋หยานหู Jahriyya สั่งภายใต้ Ma Hualong ในกานซู คำสั่งคูฟียาภายใต้การนำของหม่า จ้านอ้าวในกานซู่ (พ.ศ. 2405–2415)
ผู้บัญชาการและผู้นำ
จั่วจงถัง โดรองกา หลิวจินถัง หวังต้ากุ้ย ตง ฟู่เซียง หม่าจ้านเอ๋อ (1872–1877) หม่า อันเหลียง (1872–1877) หม่า เฉียนหลิง (1872–1877) หม่าไห่เอียน (พ.ศ. 2415–2420) ชุยเว่ย (1872–1877) หัวเต๋อไค (พ.ศ. 2415–2420)	ยาคูบ เบก Hsu Hsuehkung ไป๋หยานหู่	ชุยเว่ย (1862–1872) หัวเต๋อไค (พ.ศ. 2405–2415) ไป๋หยานหู่ หม่า ฮวาหลง โตหมิง หม่าจ้านเอ๋อ (1872–1877) หม่า อันเหลียง (1872–1877) หม่า เฉียนหลิง (1872–1877) หม่าไห่เอี้ยน (พ.ศ. 2405–2415)
ความแข็งแกร่ง
กองทัพหูหนานกองทัพจั่วจงถัง 120,000 นาย และกองทัพคาฟิยาฮุย	ทหารอุซเบกอันดิจานีและอาสาสมัครชาวอัฟกัน ชาวจีนฮั่นและชาวฮุยที่ถูกเกณฑ์เข้ากองทัพของยาคูบอย่างไม่เต็มใจ และกองกำลังติดอาวุธชาวจีนฮั่นอีกกลุ่มหนึ่ง	กลุ่มกบฏในมณฑลฉานซีและกานซู

การประท้วงตุงกัน (พ.ศ. 2405-2420)หรือที่รู้จักในชื่อการกบฏตงจือฮุย ( จีนตัวเต็ม :同治回亂; จีนตัวย่อ :同治回乱; พินอิน : Tóngzhì Huí Luàn , เซียวเอ๋อจิง : تجِي ۞وِ لَوَا , Dungan : Тунҗы Khуэй луан ) เป็นสงครามที่เกิดขึ้นในจีนตะวันตก ในคริสต์ศตวรรษ ที่ 19 ส่วนใหญ่อยู่ในรัชสมัยของจักรพรรดิถงจือ (ครองราชย์ พ.ศ. 2404-2418) แห่งราชวงศ์ชิงบางครั้งคำนี้รวมถึงกบฏปันเธย์ในยูนนานซึ่งเกิดขึ้นในช่วงเวลาเดียวกัน อย่างไรก็ตาม บทความนี้กล่าวถึงเฉพาะการลุกฮือสองระลอกของชาวมุสลิมจีน หลาย กลุ่ม ส่วนใหญ่ เป็นชาว หุยในมณฑลฉานซีกานซูและหนิงเซี่ย ในระลอกแรก และในซินเจียงในระลอกที่สอง ระหว่างปี 1862 ถึง 1877 การลุกฮือดังกล่าวถูกปราบปรามในที่สุดโดยกองกำลังชิงที่นำโดยจั่วจงถัง

ความขัดแย้งเริ่มต้นด้วยการจลาจลของชาวฮุยและการสังหารหมู่ชาวฮั่นตามมาด้วยการสังหารหมู่ชาวฮุยเพื่อแก้แค้นโดยชาวฮั่น^{[ 2 ]}ส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนแปลงทางประชากรครั้งใหญ่ในภาคตะวันตกเฉียงเหนือของจีนและนำไปสู่การสูญเสียประชากร 21 ล้านคนจากการรวมกันของการสังหารหมู่ การอพยพ ความอดอยาก และโรคระบาดที่แพร่กระจายทางศพ^{[ 3 ]}เนื่องจากความขัดแย้งนี้มณฑลกานซูสูญเสียประชากรไป 74.5% (14.55 ล้านคน) ^{[ 4 ]}มณฑลฉานซีสูญเสียประชากรไป 44.6% (6.2 ล้านคน) ^{[ 5 ]}และซินเจียงตอนเหนือสูญเสียประชากรไป 72.6% (0.34 ล้านคน) ^{[ 6 ] [ 7 ]}การลดลงของประชากรชาวฮุยในมณฑลฉานซีนั้นรุนแรงเป็นพิเศษ จากการวิจัยของนักประวัติศาสตร์สมัยใหม่ พบว่าก่อนการก่อกบฏมีชาวฮุยอย่างน้อย 4 ล้านคนอยู่ในมณฑลฉานซี แต่หลังจากนั้นเหลือเพียง 20,000 คนเท่านั้น โดยชาวฮุยส่วนใหญ่ถูกสังหารหมู่และตอบโต้โดยกองกำลังของรัฐบาลและกองกำลังทหาร หรือถูกเนรเทศออกจากมณฑล^{[ 8 ]}ชาวฮั่นจำนวนมากก็ถูกย้ายไปยังมองโกเลีย ใน หลังสงครามเช่นกัน ภูมิภาคหนิงเซี่ยและชิงไห่ ตะวันออกในปัจจุบัน เช่นซีหนิงฮวาหลงและซุนฮวาเคยเป็นส่วนหนึ่งของมณฑลกานซูมาก่อนศตวรรษที่ 20

ชาวแมนจูลงโทษชาวฮุยในมณฑลฉานซีอย่างรุนแรงเนื่องจากข้อพิพาทระหว่างชุมชนในเวลานั้น เพราะพวกเขาถือว่าชาวฮุยเป็นฝ่ายรุกราน ผู้ว่าราชการราชวงศ์ชิงแห่งฉานซีกล่าวโทษชาวฮุยในฉานซีทั้งหมดว่าเป็นต้นเหตุของการกบฏ เขาบอกว่าชาวฮุยในกานซูไม่มีความผิด ถูกบังคับให้เข้าร่วมการกบฏ และพวกเขามีความสัมพันธ์ที่ดีกับชาวฮั่น ต่างจากชาวฮุยในฉานซีที่เขากล่าวหาว่าก่อการสังหารหมู่ ดังนั้นเขาจึงบอกเจ้าหน้าที่กานซูว่าฉานซีจะไม่ยอมให้ชาวฮุยในฉานซีที่ถูกเนรเทศกลับไปยังกานซูอีก^{[ 9 ]}เจ้าหน้าที่ในฉานซีต้องการให้ใช้กำลังทหารปราบปรามกบฏชาวฮุย ในขณะที่เจ้าหน้าที่ในกานซูต้องการผ่อนปรนโทษให้แก่กบฏชาวฮุย^{[ 10 ]}

กบฏ ฮั่นเนียนร่วมมือกับกบฏฉานซีฮุยจนกระทั่งนายพลจั่วจงถังปราบปรามกบฏเนียนในมณฑลได้ในปี 1868 และกบฏฮุยในฉานซีก็หนีไปยังกานซูในปี 1869 ^{[ 11 ]}กองทัพหูหนานถูกแทรกซึมอย่างกว้างขวางโดยสมาคมลับฮั่นเกอเหลา ฮุย ซึ่งต่อต้านราชวงศ์ชิง ได้ก่อการกบฏหลายครั้ง ทำให้การรุกที่สำคัญล่าช้า จั่วปราบปรามการกบฏและประหารชีวิตผู้ที่เกี่ยวข้อง^{[ 12 ]}การกบฏครั้งหนึ่งเกิดขึ้นโดย ทหารเกอเหลาฮุย หูเป่ยในซุยเต๋อในปี 1867 ^{[ 13 ]}

ความขัดแย้งเริ่มปะทุขึ้นครั้งแรกบนฝั่งตะวันตกของแม่น้ำเหลืองในมณฑลฉานซี กานซู และหนิงเซี่ย ยกเว้นมณฑลซินเจียง เหตุการณ์นี้วุ่นวายมาก มักเกี่ยวข้องกับกลุ่มนักรบและผู้นำทางทหารที่หลากหลายซึ่งไม่มีจุดร่วมหรือเป้าหมายเฉพาะเจาะจง ความเข้าใจผิดทั่วไปคือการก่อกบฏมุ่งเป้าไปที่ราชวงศ์ชิงแต่หลักฐานไม่ได้แสดงให้เห็นว่ากลุ่มกบฏตั้งใจที่จะโค่นล้มรัฐบาลชิงหรือโจมตีเมืองหลวงปักกิ่งแต่กลับบ่งชี้ว่ากลุ่มกบฏต้องการแก้แค้นศัตรูส่วนตัวเนื่องจากความอยุติธรรม^{[ 14 ]}หลังความขัดแย้งสิ้นสุดลง ชาวตุนกันจำนวนมากได้อพยพจาก อีลี่ไปยังจักรวรรดิรัสเซีย

ในบทความนี้ " ชาวตุนกัน " หมายถึงชาวฮุยซึ่งเป็นกลุ่มชาติพันธุ์ที่นับถือศาสนาอิสลามและ พูดภาษา จีนในประเทศจีน บางครั้งพวกเขาถูกเรียกว่า "ชาวจีนมุสลิม" และไม่ควรสับสนกับ "ชาวเติร์กสถาน" หรือ " ชาวเติร์ก " ที่กล่าวถึง ซึ่งได้แก่ ชาวอุยกูร์ชาวคาซัคชาวคีร์กีซ ชาวตา ตาร์และชาวอุซเบกเป็นต้น

กลุ่มชาติพันธุ์ที่ปัจจุบันรู้จักกันในชื่อชาวอุยกูร์นั้นไม่ได้ใช้ชื่อนี้มาก่อนศตวรรษที่ 20 ในอดีต ชาวอุยกูร์ในลุ่มแม่น้ำทาริมถูกเรียกว่า "ชาวตุรกี" ส่วนผู้อพยพชาวอุยกูร์จากลุ่มแม่น้ำทาริมไปยังเมืองอีลีถูกเรียกว่า "ชาวทารันชี" ชื่อ "อุยกูร์" ในปัจจุบันนั้น สหภาพโซเวียตได้ตั้งให้กับกลุ่มชาติพันธุ์นี้ในปี 1921 ในการประชุมที่เมืองทาชเคนต์ โดยชื่อ "อุยกูร์" มาจากอาณาจักรข่านอุยกูร์ โบราณ ด้วยเหตุนี้ แหล่งข้อมูลจากยุคการกบฏของชาวดุงกันจึงไม่มีการกล่าวถึงชาวอุยกูร์เลย

แม้ว่า " ฮุย " จะเป็นชื่อเรียกชาวมุสลิมโดยทั่วไป (และยังคงเป็นเช่นนั้น) แต่ในที่นี้ คำนี้หมายถึงชุมชนชาวมุสลิมที่พูดภาษาจีนในประเทศจีนโดยเฉพาะ ซึ่งมีวัฒนธรรมหลายอย่างคล้ายคลึงกับชาวฮั่นชาวยุโรปมักเรียกคนกลุ่มนี้ว่า "ตุนกัน" หรือ "ถงกัน" ในช่วงการกบฏตุนกัน

กลุ่มคนที่ถูกเรียกว่า " อันดิยานิส " หรือ " โคกันดิส " นั้นรวมถึงพลเมืองของรัฐข่านโคกันด์ได้แก่ชาวอุซเบกชาวซาร์ ต ชาว คีร์กีซใต้ชาวคิปชัคเฟอร์กานาและชาวทาจิกกองทัพโคกันด์ส่วนใหญ่ประกอบด้วยชาวอุซเบก และชาวคีร์กีซและคิปชัคที่เป็นชนเผ่าเร่ร่อน

การกบฏของชาวดังกันเกิดขึ้นส่วนหนึ่งเนื่องจากความขัดแย้งทางชาติพันธุ์และสงครามชนชั้น^{[ 15 ]}ไม่ใช่เพียงเพราะความขัดแย้งทางศาสนา (ดังที่บางครั้งเข้าใจผิดกัน)

ชาวมุสลิมจีนมีบทบาทสำคัญในการต่อต้านราชวงศ์ชิง ในช่วงต้น หลังจากการได้รับชัยชนะเหนือราชวงศ์หมิงในปี ค.ศ. 1646 ผู้ภักดีต่อราชวงศ์หมิงที่เป็นชาวมุสลิมในมณฑลกานซู นำโดยมิลาหยิน^{[ 16 ]}และติงกัวตง ได้ก่อการกบฏโดยมีเป้าหมายเพื่อขับไล่ราชวงศ์ชิงออกไปและฟื้นฟูให้เจ้าชายจูซื่อฉวนแห่งเหยียนฉางกลับมาเป็นจักรพรรดิอีกครั้ง^{[ 17 ]}ผู้ภักดีต่อราชวงศ์หมิงที่เป็นชาวมุสลิมได้รับการสนับสนุนจากซาอิดบาบา สุลต่านแห่งฮามี และเจ้าชายตูรุมเตย์ พระโอรสของสุลต่าน^{[ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]}นอกจากนี้ ชาวฮั่นและชาวทิเบตยังเข้าร่วมกับผู้ภักดีต่อราชวงศ์หมิงที่เป็นชาวมุสลิมในการกบฏด้วย^{[ 21 ]}หลังจากการต่อสู้และการเจรจาอย่างดุเดือด ข้อตกลงสันติภาพก็ถูกร่างขึ้นในปี ค.ศ. 1649 มิลาหยินและติงให้คำมั่นว่าจะจงรักภักดีต่อราชวงศ์ชิง และได้รับยศเป็นสมาชิกของกองทัพชิง^{[ 22 ]}อย่างไรก็ตาม เมื่อราชวงศ์ชิงถอนกำลังออกจากกานซูเพื่อต่อสู้กับผู้ภักดีต่อราชวงศ์หมิงที่ฟื้นคืนชีพในจีนตอนใต้ มิลายินและติงจึงจับอาวุธขึ้นต่อสู้และก่อกบฏอีกครั้งโดยได้รับการสนับสนุนจากทูรุมเตย์ต่อต้านราชวงศ์ชิง^{[ 23 ]}ในที่สุดพวกเขาก็ถูกราชวงศ์ชิงปราบปราม และมีผู้เสียชีวิตในการรบถึง 100,000 คน รวมทั้งมิลายิน ติงกัวตง และทูรุมเตย์ นอกจากนี้ หม่าจู (ค.ศ. 1640–1710) นักวิชาการมุสลิมฮุยที่นับถือลัทธิขงจื๊อ ยังได้เข้าร่วมกับผู้ภักดีต่อราชวงศ์หมิงทางตอนใต้เพื่อต่อต้านราชวงศ์ชิงอีกด้วย^{[ 24 ]}

ในสมัยจักรพรรดิเฉียนหลง (ค.ศ. 1735–1796) นักวิชาการเว่ยซู่ (魏塾) ได้แสดงความคิดเห็นเกี่ยวกับบทความซีหรงหลุน (徙戎论) ของเจียงถง (江统) โดยกล่าวว่า หากชาวมุสลิมไม่อพยพ พวกเขาจะลงเอยเช่นเดียวกับพวกห้าหูที่โค่นล้มราชวงศ์จินตะวันตกและก่อให้เกิดความขัดแย้งทางชาติพันธุ์ระหว่างพวกห้าหูและชาวฮั่นในรัชสมัยของจักรพรรดิเฉียนหลง มีการปะทะกันระหว่างทางการของราชวงศ์ชิงกับ นิกายซูฟีจาห์ริ ยา แต่ไม่มีการปะทะกับ ชาวซุนนีส่วนใหญ่ที่ไม่ใช่ซูฟีหรือนิกายซูฟีคาฟิยา

ชาวจีนมุสลิมเดินทางไปยังเอเชียตะวันตกเป็นเวลาหลายปีก่อนสงครามชนกลุ่มน้อยฮุย ในศตวรรษที่ 18 นักบวชมุสลิมที่มีชื่อเสียงหลายคนจากกานซูศึกษาในเมกกะและเยเมนภายใต้ครูNaqshbandi Sufiผู้นับถือมุสลิมสองรูปแบบที่แตกต่างกันถูกนำกลับมาทางตะวันตกเฉียงเหนือของจีนโดยชีคฮุยที่ มีเสน่ห์สองคน ได้แก่ คูฟียา ซึ่งเกี่ยวข้องกับหม่าไลชี่ (ค.ศ. 1681–1766) และจาห์ริยะยะที่หัวรุนแรงกว่า ก่อตั้งโดยหม่า หมิงซิน (ค.ศ. 1719?–1781) สิ่งเหล่านี้อยู่ร่วมกับแนวทางปฏิบัติแบบดั้งเดิมที่ไม่ใช่ของนิกายซุฟี ซึ่งมีศูนย์กลางอยู่ที่มัสยิดในท้องถิ่น และรู้จักกันในชื่อเกดิมู (qadim,格底目หรือ格迪目) โรงเรียนคูฟียะและประเพณีเกดิมูที่ไม่ใช่แบบซูฟี ซึ่งทั้งสองได้รับการยอมรับจากทางการชิง ถูกเรียกว่า "การสอนแบบเก่า" (老教; lǎo jiào ) ในขณะที่จาห์ริยายะซึ่งเจ้าหน้าที่มองว่าเป็นผู้ต้องสงสัย กลายเป็นที่รู้จักในชื่อ "การสอนแบบใหม่" (新教; xīn jiào )

ความขัดแย้งระหว่างผู้ที่นับถือ Khufiyya และ Jahriya รวมถึงการบริหารจัดการที่ผิดพลาด การทุจริต และทัศนคติต่อต้านซูฟีของเจ้าหน้าที่ราชวงศ์ชิง ส่งผลให้เกิดการลุกฮือโดยผู้ติดตาม Hui และSalarของคำสอนใหม่ในปี 1781 และ 1783 แต่ก็ถูกปราบปรามอย่างรวดเร็ว ความเป็นปรปักษ์ระหว่างกลุ่มซูฟีต่างๆ มีส่วนทำให้เกิดบรรยากาศที่รุนแรงก่อนการกบฏ Dungan ระหว่างปี 1862 ถึง 1877 ^{[ 25 ]}

ในการกบฏ Jahriyyaความรุนแรงระหว่างนิกายย่อยสองนิกายของNaqshbandi Sufis คือ Jahriyya Sufi Muslims และคู่แข่งของพวกเขาคือ Khafiyya Sufi Muslims นำไปสู่การกบฏของ Jahriyya Sufi Muslims ซึ่งราชวงศ์ชิงในประเทศจีนปราบปรามด้วยความช่วยเหลือของ Khafiyya Sufi Muslims ^{[ 26 ]}

เมื่อกองทัพไท่ผิงรุก คืบเข้าใกล้ทางตะวันออกเฉียงใต้ ของมณฑลฉานซีในฤดูใบไม้ผลิปี 1862 ชาวฮั่นในท้องถิ่นซึ่งได้รับการสนับสนุนจากรัฐบาลชิง ได้จัดตั้ง กองกำลังติดอาวุธ หย่งหยิงขึ้นเพื่อปกป้องภูมิภาคจากผู้รุกราน ด้วยความหวาดกลัวชาวฮั่นที่ติดอาวุธแล้ว ชาวมุสลิมจึงจัดตั้งหน่วยทหารติดอาวุธของตนเองขึ้นเพื่อตอบโต้

ตามที่นักประวัติศาสตร์บางคนกล่าวไว้^{[ 27 ]}การกบฏตุนกันเริ่มต้นขึ้นในปี พ.ศ. 2405 ไม่ใช่การลุกฮือที่วางแผนไว้ แต่เป็นการทะเลาะวิวาทและการจลาจลในท้องถิ่นที่เกิดขึ้นต่อเนื่องกันโดยมีสาเหตุเล็กน้อยเป็นตัวกระตุ้น นอกจากนี้ยังมีข่าวลือ—ซึ่งต่อมาพิสูจน์แล้วว่าเป็นเท็จ—ที่แพร่กระจายว่าชาวมุสลิมฮุยให้ความช่วยเหลือกลุ่มกบฏไท่ผิง และยังมีการกล่าวอีกว่า หม่าเซียวซือแห่งฮุยอ้างว่าการกบฏของชาวมุสลิมฉานซีมีความเชื่อมโยงกับไท่ผิง^{[ 28 ]}

ทหาร กองทัพมาตรฐานสีเขียว ของกองทัพจักรวรรดิ หลายคนเป็นชาวฮุย ตามที่นักประวัติศาสตร์บางคนกล่าวไว้ เหตุการณ์หนึ่งที่นำไปสู่การก่อกบฏเกิดจากการทะเลาะวิวาทเรื่องราคาไม้ไผ่ที่พ่อค้าชาวฮั่นขายให้กับชาวฮุย หลังจากนั้น กลุ่มชาวฮุยก็โจมตีชาวฮั่นและชาวฮุยคนอื่นๆ ที่ไม่ได้เข้าร่วมการก่อกบฏ การทะเลาะวิวาทเรื่องไม้ไผ่ที่ดูเหมือนเล็กน้อยและไม่สำคัญนี้เองที่จุดชนวนให้เกิดการก่อกบฏเต็มรูปแบบ อย่างไรก็ตาม ตามบันทึกทางประวัติศาสตร์ในยุคนั้น ชาวฮุยซื้อไม้ไผ่จำนวนมากเพื่อทำหอกเป็นอาวุธ^{[ 29 ]}ยิ่งไปกว่านั้น ก่อนเหตุการณ์ไม้ไผ่ที่เซิงซาน ก็มีการโจมตีมณฑลของชาวฮั่นมาแล้ว บันทึกทางประวัติศาสตร์ในยุคนั้นแสดงให้เห็นว่าก่อนเกิดความขัดแย้งเรื่องราคาไม้ไผ่ ชุมชนชาวฮุยได้วางแผนที่จะจัดตั้งรัฐอิสลามในภาคตะวันตกของจีนแล้ว ชาวฮุยในมณฑลฉานซีเริ่มซื้อไม้ไผ่ในปริมาณมากโดยผ่านมัสยิดและมุลลาห์ เสาเหล่านี้ถูกนำมาใช้ทำหอก ก่อนเหตุการณ์ไม้ไผ่เซิงซาน ก็มีการโจมตีชาวฮั่นในอำเภอต้าหลี่และอำเภอเหวยหนานมาก่อนแล้ว^{[ 30 ]}ด้วยความกลัวการถูกกดขี่ข่มเหง ชาวฮั่นในมณฑลฉานซีจึงหนีชาวฮุยหรือซ่อนตัวอยู่ใต้ดินในห้องใต้ดิน

เนื่องจากราชวงศ์ชิงมีชื่อเสียงไม่ดีและกองทัพของราชวงศ์ชิงกำลังปฏิบัติภารกิจอื่น การก่อกบฏที่เริ่มต้นในฤดูใบไม้ผลิปี 1862 ใน หุบเขา แม่น้ำเว่ยจึงแพร่กระจายอย่างรวดเร็วไปทั่วมณฑลฉานซีตอนใต้ ในช่วงปลายเดือนมิถุนายนปี 1862 กลุ่มมุสลิมได้ปิดล้อมเมืองซีอานซึ่งไม่ได้รับการช่วยเหลือจากนายพลโดรองกา (บางครั้งเขียนว่า โตหลงอา) ของราชวงศ์ชิงจนกระทั่งฤดูใบไม้ร่วงปี 1863 โดรองกาเป็นขุนศึกชาวแมนจู ที่บัญชาการกองทัพในมณฑลหูหนานกองกำลังของเขาเอาชนะกลุ่มกบฏมุสลิมและทำลายตำแหน่งของพวกเขาในมณฑลฉานซีอย่างสิ้นเชิง ขับไล่พวกเขาออกจากมณฑลไปยังมณฑลกานซู ต่อมาโดรองกาถูกสังหารในการรบในเดือนมีนาคมปี 1864 โดยกลุ่มกบฏไท่ผิงในมณฑลฉานซี^{[ 31 ]}

เอ็นหลิน ผู้ว่าราชการประจำภูมิภาค ได้แนะนำรัฐบาลจักรวรรดิไม่ให้กีดกันชาวมุสลิม เขาชี้แจงอย่างเป็นทางการว่าไม่ควรมีการปฏิบัติอย่างไม่เป็นธรรมหรือเลือกปฏิบัติต่อชาวมุสลิม ส่งผลให้มีการนำ "นโยบายการปรองดอง" มาใช้ กบฏมุสลิมพยายามยึดเมืองหลิงโจว (ปัจจุบันคือเมืองหลิงหวู่ ) และเมืองกู่หยวนในการโจมตีหลายครั้ง อันเป็นผลมาจากข่าวลือเท็จที่แพร่กระจายโดยชาวมุสลิมบางกลุ่มว่ารัฐบาลจะสังหารชาวมุสลิมทั้งหมด^{[ 32 ]}

ผู้ลี้ภัยชาวมุสลิมจำนวนมากจากมณฑลฉานซีได้หลบหนีไปยังมณฑลกานซู บางส่วนได้ก่อตั้ง "กองพันใหญ่สิบแปดกอง" ในกานซูตะวันออก โดยตั้งใจจะต่อสู้เพื่อกลับไปยังบ้านเกิดของตนในฉานซี ในขณะที่กลุ่มกบฏฮุยกำลังเตรียมโจมตีกานซูและฉานซียาคูบ เบกผู้ซึ่งหลบหนีจากอาณาจักรโคกัน ด์ ในปี 1865 หรือ 1866 หลังจากเสียเมืองทาชเคนต์ให้กับรัสเซีย ได้ประกาศตนเป็นผู้ปกครองเมืองคัชการ์และในไม่ช้าก็สามารถควบคุมแอ่งทาริมใน ซิ น เจียง ได้อย่างสมบูรณ์

ในปี ค.ศ. 1867 รัฐบาลชิงได้ส่งแม่ทัพผู้มีความสามารถมากที่สุดคนหนึ่ง คือ นายพลจั่วจงถังผู้ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการปราบปรามกบฏไท่ผิง ไปยังมณฑลฉานซี แนวทางของจั่วคือการสร้างความสงบสุขในภูมิภาคโดยการส่งเสริมการเกษตร โดยเฉพาะการปลูกฝ้ายและธัญพืช รวมถึงการสนับสนุน การศึกษาตามหลัก ขงจื๊อ แบบดั้งเดิม เนื่องจากภูมิภาคนี้ยากจนอย่างมาก จั่วจึงต้องพึ่งพาการสนับสนุนทางการเงินจากภายนอกภาคตะวันตกเฉียงเหนือของจีน

จั่วจงถังเรียกร้องให้รัฐบาล "สนับสนุนกองทัพในภาคตะวันตกเฉียงเหนือด้วยทรัพยากรจากภาคตะวันออกเฉียงใต้" และจัดการด้านการเงินสำหรับการวางแผนการรบเพื่อพิชิตกานซูโดยการกู้ยืมเงินหลายล้านตำลึงจากธนาคารต่างประเทศในมณฑลทางตะวันออกเฉียงใต้ เงินกู้จากธนาคารจะถูกชำระคืนด้วยค่าธรรมเนียมและภาษีที่ทางการจีนเรียกเก็บจากสินค้าที่นำเข้าผ่านท่าเรือของพวกเขา จั่วยังจัดเตรียมเสบียงจำนวนมากให้พร้อมก่อนที่เขาจะเริ่มการรุก^{[ 33 ]} ทหาร 10,000 นายจากกองทัพหู หนานเก่า ภายใต้การบัญชาการของพลเอกเจิ้งกัวฟานถูกส่งโดยเขาภายใต้พลเอกหลิวซงซานไปยังฉานซีเพื่อช่วยเหลือพลเอกจั่ว ซึ่งได้รวบรวมกองทัพ 55,000 นายในหูหนานก่อนที่เขาจะเริ่มการรุกครั้งสุดท้ายเพื่อยึดกานซูคืนจากกบฏตุนกัน พวกเขาเข้าร่วมพร้อมกับกองทัพในภูมิภาคอื่นๆ (กองทัพเสฉวน อานฮุย และเหอหนานก็เข้าร่วมการรบด้วย) ^{[ 34 ]}

กองกำลังของจั่วประกอบด้วยกองทัพจากหูหนาน เสฉวน อานฮุย และเหอหนาน พร้อมด้วยทหารม้าอีกหลายพันนาย ทหารหูหนานเป็นนักแม่นปืนที่เชี่ยวชาญและมีความสามารถในการวางแผนการรบในสนามรบภายใต้การบัญชาการของพลเอกหลิวซงซาน^{[ 35 ]}มีการทดลองใช้การฝึกซ้อมทางทหารแบบตะวันตก แต่จั่วตัดสินใจยกเลิก กองทหารฝึกซ้อม "วันละสองครั้งเป็นเวลาสิบวัน" ด้วยปืนที่ผลิตในตะวันตก^{[ 36 ]}

คลังแสงหลานโจวก่อตั้งขึ้นในปี 1872 โดยจั่วจงถังในช่วงการก่อกบฏและมีเจ้าหน้าที่เป็นชาวกวางตุ้ง^{[ 37 ]}เจ้าหน้าที่ชาวกวางตุ้งที่รับผิดชอบคลังแสงคือไล่ฉาง ซึ่งมีความเชี่ยวชาญด้านปืนใหญ่^{[ 38 ]}โรงงานแห่งนี้ผลิต "ปืนบรรจุท้ายลำกล้องเหล็ก" และจัดหากระสุนสำหรับปืนใหญ่และปืน^{[ 39 ]}หม่าฮวาหลง ผู้นำชาวมุสลิมจาห์ริยา ควบคุมเครือข่ายการค้าของชาวมุสลิมขนาดใหญ่ที่มีพ่อค้าจำนวนมาก ควบคุมเส้นทางการค้าไปยังหลายเมืองบนภูมิประเทศที่หลากหลาย เขาผูกขาดการค้าในพื้นที่และใช้ความมั่งคั่งของเขาในการซื้อปืน จั่วจงถังเริ่มสงสัยในเจตนาของหม่า คิดว่าเขาต้องการยึดครองมองโกเลียทั้งหมด^{[ 40 ]} หลิวซงซานเสียชีวิตในการต่อสู้ระหว่างการโจมตีป้อมปราการกบฏหลายร้อยแห่งที่ได้รับการปกป้องโดยภูมิประเทศที่ยากลำบาก หลิว จินถัง หลานชายของเขา เข้ามารับตำแหน่งผู้บัญชาการ ทำให้การรุกหยุดชะงักชั่วคราว^{[ 41 ]} หลังจากปราบปรามการก่อจลาจลในมณฑลฉานซีและสะสมเสบียงธัญพืชเพียงพอที่จะเลี้ยงกองทัพของเขา จั่วก็โจมตีหม่า ฮวาหลง นายพลหลิว จินถังนำทัพปิดล้อมเมือง โดยระดมยิงใส่กำแพงเมือง ชาวเมืองต้องกินศพและกินรากหญ้าเพื่อความอยู่รอด^{[ 42 ]}กองทัพของจั่วมาถึงป้อมปราการของหม่า ฮวาหลง ที่ชื่อ จินจี้เป่า (金积堡; Jinji Bao ; 'ป้อมจินจี้', 'บางครั้งเขียนเป็นJinjipu ', 'โดยใช้การอ่านอักษรจีนอีกแบบหนึ่ง堡') ซึ่งในขณะนั้นอยู่ในมณฑลกานซูตะวันออกเฉียงเหนือ^{[ 43 ] [ 44 ] [ 45 ]} ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2413 โดยนำปืนใหญ่ปิดล้อมของครุปป์ มาด้วย จั่วและไล่ฉางเป็นผู้สั่งการยิงปืนใหญ่ใส่เมืองด้วยตนเอง นอกจากนี้ยังมีการใช้ทุ่นระเบิดด้วย^{[ 46 ]} หลังจากปิดล้อมนานสิบหกเดือน หม่าฮวาหลงถูกบังคับให้ยอมจำนนในเดือนมกราคม พ.ศ. 2414 จั่วตัดสินประหารชีวิตหม่าและเจ้าหน้าที่ของเขากว่าแปดสิบคนด้วยการฟันชาวมุสลิมหลายพันคนถูกเนรเทศไปยังส่วนอื่นๆ ของจีน

เป้าหมายต่อไปของจั่วคือเหอโจว (ปัจจุบันรู้จักกันในชื่อหลินเซี่ย ) ซึ่งเป็นศูนย์กลางหลักของชาวฮุยทางตะวันตกของหลานโจว และเป็นจุดสำคัญบนเส้นทางการค้าระหว่างกานซูและทิเบต เหอโจวได้รับการป้องกันโดยกองกำลังฮุยของหม่าจ้านอ้าว ในฐานะสมาชิกที่เน้นการปฏิบัติจริงของนิกายคาฟิยา (คำสอนเก่า) เขาพร้อมที่จะสำรวจหนทางสู่การอยู่ร่วมกันอย่างสันติกับรัฐบาลชิง เมื่อการกบฏปะทุขึ้น หม่าจ้านอ้าวได้พาชาวจีนฮั่นไปยังที่ปลอดภัยในอี้ซิน และไม่ได้พยายามยึดครองดินแดนเพิ่มเติมในระหว่างการกบฏ^{[ 47 ]} หลังจากขับไล่การโจมตีครั้งแรกของจั่วจงถังได้สำเร็จในปี 1872 และสร้างความเสียหายอย่างหนักให้กับกองทัพของจั่ว หม่าจ้านอ้าวเสนอที่จะยอมจำนนป้อมปราการของเขาให้กับชิง และให้ความช่วยเหลือแก่ราชวงศ์ตลอดช่วงสงคราม เขาสามารถรักษาชุมชนตุนกันของเขาไว้ได้ด้วยทักษะทางการทูตของเขา ในขณะที่จั่วจงถังปราบปรามพื้นที่อื่นๆ โดยการเนรเทศชาวมุสลิมในท้องถิ่น (ด้วยนโยบาย " ชำระล้างชาวมุสลิม" (洗回; Xǐ Huí ) ซึ่งเป็นนโยบายที่เจ้าหน้าที่บางคนสนับสนุนมานานแล้ว) แต่ในเหอโจว ชาวฮั่นที่ไม่ใช่มุสลิมกลับเป็นกลุ่มที่จั่วจงถังเลือกที่จะย้ายถิ่นฐานเพื่อเป็นการตอบแทนที่หม่าจ้านอ้าวและกองทหารมุสลิมของเขาช่วยราชวงศ์ชิงปราบปรามกบฏมุสลิม เหอโจว (หลินเซี่ย) ยังคงมีประชากรมุสลิมหนาแน่นมาจนถึงทุกวันนี้ โดยได้รับสถานะเป็นเขตปกครองตนเองหลินเซี่ยหุยภายใต้สาธารณรัฐประชาชน จีน นายพลตุน กันคนอื่นๆ รวมถึงหม่าเฉียนหลิงและหม่าไห่หยานก็แปรพักตร์ไปอยู่ฝ่ายชิงพร้อมกับหม่าจ้านอ้าว หม่าอันเหลียง บุตรชายของหม่า ก็แปรพักตร์เช่นกัน และกองกำลังตุนกันของพวกเขาได้ช่วยกองกำลังชิงของจั่วจงถังในการปราบปรามตุนกันกบฏตงฟู่เซียงก็แปรพักตร์ไปอยู่ฝ่ายชิงเช่นกัน^{[ 48 ]}เขาไม่ได้เป็นมุสลิมหัวรุนแรงหรือสนใจการก่อกบฏแต่อย่างใด เขาเพียงแต่ได้รับการสนับสนุนในช่วงที่เกิดความวุ่นวายและต่อสู้เช่นเดียวกับคนอื่นๆ อีกมากมาย เขาเข้าร่วมกองทัพชิงของจั่วจงถังเพื่อแลกกับการได้ตำแหน่งขุนนาง เขาได้รับที่ดินผืนใหญ่^{[ 49 ]}

ด้วยการสนับสนุนจากชาวตุนกันแห่งเหอโจว จั่วจงถังวางแผนที่จะรุกคืบไปทางตะวันตกตามเส้นทางเหอซีไปยังซินเจียง อย่างไรก็ตาม เขารู้สึกว่าจำเป็นต้องรักษาแนวปีกซ้ายไว้ก่อนโดยการยึดซีหนิงซึ่งไม่เพียงแต่มีชุมชนมุสลิมขนาดใหญ่ของตนเองเท่านั้น แต่ยังให้ที่พักพิงแก่ผู้ลี้ภัยจำนวนมากจากฉานซีอีกด้วย ในปีที่สิบเอ็ดแห่งรัชสมัยถงจือ (สิงหาคม 1872) หลิวจินถังนำกองทัพของเขาเข้าสู่ดินแดนของศัตรูอย่างลึกซึ้ง โดยใช้กลยุทธ์การรุกคืบอย่างมั่นคงและการแบ่งกำลังเพื่อโอบล้อมและปราบปราม เพื่อเผชิญหน้ากับกองกำลังกบฏที่นำโดยไป่เหยียนหูและปี้ต้าไฉ เมื่อเผชิญกับการคุกคามและการป้องกันจากกองกำลังติดอาวุธมุสลิมฮุย เขาจึงแบ่งกำลังพลไปตั้งค่าย เสริมกำลังป้องกัน ปรับกำลังพลอย่างต่อเนื่อง และสั่งการให้หลายหน่วยโจมตีเนินเขา ป้อมปราการ และช่องเขาอย่างต่อเนื่อง กองทัพของรัฐบาลได้ปะทะกับศัตรูอย่างดุเดือดหลายครั้ง โดยอาศัยปืนใหญ่และการประสานงานของทหารราบและทหารม้าเพื่อปราบปรามตำแหน่งของศัตรู พวกเขาเอาชนะกองกำลังมุสลิมฮุยได้ครั้งแล้วครั้งเล่า สังหารทหารศัตรูเป็นจำนวนมาก และล่อลวงศัตรูให้เข้ามาลึกเพื่อล้อมและทำลายล้างหลายครั้ง

ระหว่างการสู้รบ หลิวจินถังได้ใช้กลยุทธ์และภูมิประเทศอย่างชาญฉลาดในการตอบโต้การปิดล้อมของฝ่ายกบฏ โดยประสานงานกับความเหนือกว่าของปืนใหญ่ เขาได้ทะลวงแนวป้องกันของชาวมุสลิมฮุยอย่างต่อเนื่อง จนในที่สุดก็บีบให้กองกำลังหลักของศัตรูต้องล่าถอยและเผาทำลายฐานที่มั่นของพวกเขา ตลอดหลายวันของการสู้รบ กองทัพรัฐบาลได้รับชัยชนะอย่างต่อเนื่องในหลายพื้นที่ สร้างความเสียหายอย่างหนักต่อกำลังหลักของกองกำลังมุสลิมฮุย พวกเขาค่อยๆ ขับไล่ศัตรูออกจากฐานที่มั่นสำคัญ และในที่สุดก็สามารถควบคุมพื้นที่สงครามได้

ต้นเดือนสิงหาคม หลิว จินถังนำทัพเข้าปิดล้อมและปราบปรามกองกำลังมุสลิมฮุยในสถานที่ต่างๆ เช่น กวนหยินถังโกวและเซี่ยโข่ว อู๋ ฮวนและเหอ จั่วหลินปะทะกับศัตรูหลายครั้ง เอาชนะและสังหารทหารมุสลิมฮุยหลายร้อยนาย และจับกุมผู้นำศัตรูได้ กองกำลังฮุยภายใต้การนำของไป่ หยานหูและอู๋ เต๋อหยานแบ่งกำลังพลเข้าโจมตี อาศัยภูมิประเทศที่อันตรายในการตั้งป้อมปราการและต่อต้านอย่างดื้อรั้น หลิว จินถังสั่งซุ่มโจมตีตามเส้นทางต่างๆ และระดมยิงป้อมปราการของศัตรู จนสามารถยึดชิกาได้สำเร็จ ต่อมา กองทัพรัฐบาลได้สร้างความเสียหายอย่างหนักแก่กองกำลังฮุยที่เกาเจียงโกว ทำลายล้างศัตรูจำนวนมาก กองทัพรัฐบาลเสริมกำลังค่าย ป้องกันการโจมตีร่วมกันหลายครั้งของทหารราบและทหารม้ามุสลิมฮุย และสกัดกั้นและสังหารศัตรูที่หลบหนีตามจุดข้ามแม่น้ำ ภายในปลายเดือนสิงหาคม พวกเขาได้สังหารหรือจับกุมทหารมุสลิมฮุยได้มากกว่าสองพันนาย

ในเวลานั้น หม่า กุ้ยหยวน ผู้นำมุสลิมฮุย สมคบคิดกับพวกพ้องเพื่อระดมกำลังมุสลิมฮุย วางแผนที่จะรวมตัวกันต่อต้านกองทัพรัฐบาล ชาวจีนฮั่นในเมืองซีหนิงฉวยโอกาสเมื่อนำกองทัพฮุยออกจากเมืองเพื่อปิดล้อมเมืองและป้องกัน โดยแต่งตั้งกัว เซียงจือและคนอื่นๆ ให้ดูแลการป้องกัน เมื่อทราบเรื่องนี้ หลิว จินถังจึงตั้งใจแน่วแน่ที่จะกำจัดพวกกบฏเพื่อป้องกันไม่ให้พวกเขาฉวยโอกาสในช่วงเก็บเกี่ยวฤดูใบไม้ร่วงขยายการกบฏและเพื่อรักษาเสถียรภาพสถานการณ์ในซีหนิง

ในวันที่ 24 สิงหาคม ทหารราบมุสลิมฮุยหลายพันนายแบ่งออกเป็นสองกลุ่ม กลุ่มหนึ่งโจมตีค่ายป้องกันของหลี่ซวงเหลียงโดยตรง และอีกกลุ่มเคลื่อนพลออกจากเหยียนไฉ่โกวเพื่อสกัดกั้นกองทัพรัฐบาล หลิวจินถังนำซงหลงหมิงและคนอื่นๆ เข้าปะทะกับศัตรูและเอาชนะกองกำลังฮุยนอกค่ายได้ ตันเหออี้และหน่วยอื่นๆ มาถึง เมื่อตระหนักว่าตนเองเสียเปรียบ กองกำลังฮุยจึงถอยกลับเข้าไปในหุบเขา กองทัพรัฐบาลฉวยโอกาสไล่ล่า ทำให้กองกำลังฮุยแตกพ่ายอย่างหนัก ในคืนนั้น กองทัพรัฐบาลได้วางกำลังซุ่มโจมตี แต่กองกำลังฮุยก็ไม่ได้ออกมาอีก

เมื่อวันที่ 25 สิงหาคม ทหารมุสลิมฮุยกว่าพันนายจากหยางเจียวหวันได้โจมตีค่ายของถานชางเหลียน เหอจั่วหลินและคนอื่นๆ ได้ช่วยกันขับไล่กองกำลังฮุย หลิวจินถังสั่งให้สร้างป้อมปราการและตำแหน่งปืนใหญ่เพื่อป้องกัน

ในวันที่ 26 สิงหาคม กองกำลังฮุยไม่ยอมออกมา กองทัพรัฐบาลจึงระดมยิงค่ายของพวกเขา ทำให้กองกำลังฮุยละทิ้งที่ตั้งและหนีไป วันรุ่งขึ้น กองทัพรัฐบาลได้วางแผนซุ่มโจมตี ล่อกองกำลังฮุยลงมาจากภูเขา และเอาชนะพวกเขาได้

วันที่ 28 สิงหาคม กองทัพรัฐบาลยังคงตั้งซุ่มโจมตีอย่างต่อเนื่อง และกองกำลังฮุยก็ไม่กล้าออกมา หลิว จินถังส่งทหารไปยังเหยียนไฉ่โกวในเวลากลางคืน วันที่ 29 กองทัพรัฐบาลแสร้งทำเป็นพ่ายแพ้เพื่อล่อให้กองกำลังฮุยเข้ามาลึกกว่าเดิม กองกำลังซุ่มโจมตีจึงปรากฏตัวขึ้นอย่างกะทันหัน ไล่ล่าและสังหารกองกำลังฮุยเป็นระยะทางกว่าสิบไมล์ ในช่วงเย็น พวกเขายึดค่ายของกองกำลังฮุยได้ วันรุ่งขึ้น พวกเขาพบศพชาวมุสลิมฮุยกว่าห้าร้อยศพ จับกุมผู้นำฮุยในท้องถิ่น และทราบว่าผู้นำมุสลิมฮุยอย่างไป่เหยียนหูและหม่าเจิ้นหยวนได้รับบาดเจ็บ แต่กองกำลังฮุยก็ยังคงต่อต้านอย่างดื้อรั้น

วันที่ 5 กันยายน สือหลงซีฉิงนำกองพันซุยติงขับไล่กองกำลังฮุยที่ป้อมกัวเอ๋อร์ ต่อมาพวกเขายึดค่ายของกองกำลังฮุยที่ซาโกวได้ แต่ถูกกองกำลังฮุยจำนวนมากล้อมโจมตีอย่างไม่คาดคิด ทำให้ได้รับความสูญเสียอย่างหนัก นายทหารหลี่เอินหลิงเสียชีวิตในสมรภูมิ เมื่อได้ยินข่าว หลิวจินถังจึงส่งทหารม้าไปช่วยเหลือในวันรุ่งขึ้น หลังจากสู้รบอย่างดุเดือด พวกเขาก็ปลดการล้อมได้สำเร็จ และหลงซีฉิงก็ถอนกำลังกลับไปยังค่าย

เมื่อวันที่ 8 กันยายน กองกำลังฮุยสองกลุ่มจากเซี่ยเซี่ยได้โจมตีทหารรัฐบาล หลิวจินถังสั่งให้เติ้งเจิ้งเปิดฉากยิงและขับไล่ศัตรู จากนั้นนำทหารไล่ล่า ทำให้กองกำลังฮุยต้องล่าถอยไปยังยอดเขา หลังจากวันที่ 10 กันยายน หลิวจินถังสั่งให้แต่ละกองพันซ่อมแซมสะพานและสร้างป้อมปราการเพื่อให้แน่ใจว่าการลำเลียงเสบียงอาหารไปยังป้อมเว่ยหยวนเป็นไปอย่างราบรื่น ในวันที่ 14 กองทหารม้าฮุยมาจากกวนหยินถังโกวเพื่อโจมตี ทหารรัฐบาลอาศัยป้อมปราการในการต้านทาน ซงหลงหมิงและหน่วยอื่นๆ ได้เสริมกำลังอย่างเร่งด่วน กองกำลังฮุยถูกขับไล่และถูกล้อมและไล่ล่า ส่งผลให้มีการตัดหัวหลายร้อยคนและจับกุมได้สิบคน เมื่อวันที่ 16 กันยายน กองกำลังฮุยได้ก่อกวนด่านผิงหรง หลิวจินถังนำแต่ละกองพันเข้าโจมตีตอบโต้ ระดมยิงใส่กองกำลังฮุยอย่างหนัก ทำให้พ่ายแพ้อย่างราบคาบ และไล่ล่าพวกเขาไปยังอ่าวมาหยิง

วันที่ 20 กันยายน กองทัพรัฐบาลได้แบ่งค่ายและข้ามแม่น้ำหวง สร้างป้อมปราการเพื่อสกัดกั้นศัตรู ทหารม้าฮุยหลายร้อยนายเข้าโจมตีแต่ถูกปืนใหญ่ตีโต้กลับ หลังจากวันที่ 22 กองทัพฮุยได้สร้างป้อมปราการบนฝั่งตรงข้ามของแม่น้ำหงจวงเพื่อป้องกันการโจมตีจากทางเหนือ หลิวจินถังแสร้งทำเป็นไม่รู้เรื่องและเร่งสร้างสะพานและป้อมปราการ วันที่ 28 กองทัพฮุยหลายพันนายเข้าโจมตีป้อมปราการใหม่ กองทัพรัฐบาลแบ่งกำลังเข้าโจมตีอย่างหนัก กองทัพฮุยจึงหนีอย่างแตกตื่น กองทัพฮุยจากเซี่ยเซี่ยได้นำปืนใหญ่มาโจมตีค่ายของเหอจั่วหลิน แต่ถูกโต้กลับและปืนใหญ่ถูกยึดไป

ต้นเดือนตุลาคม กองทัพฮุยได้ปิดล้อมเมืองเซี่ยเซี่ยซ้ำแล้วซ้ำเล่า และกองทัพรัฐบาลก็ต่อต้านอย่างกล้าหาญ ในวันที่เก้า หลิวจินถังได้เคลื่อนกำลังพลไปยังเกาจ้ายอย่างลับๆ และร่วมกันโจมตีค่ายทหารฮุยที่เซี่ยเซี่ย ยึดป้อมปราการบนภูเขาได้สามแห่ง วันรุ่งขึ้น กองทัพฮุยกว่าหมื่นนายได้เข้ามาเสริมกำลัง หลังจากการต่อสู้ที่ดุเดือดกินเวลานานจนถึงเวลาเที่ยง (15.00-17.00 น.) กองทัพฮุยก็ล่าถอยในที่สุด หลิวจินถังสั่งให้แต่ละกองพันเสริมกำลังป้องกันป้อมปราการของตน

ในวันที่ 12 ตุลาคม หลิวจินถังทราบว่ากองกำลังฮุยซ่อนตัวอยู่ในหุบเขา จึงคัดเลือกทหารหาญไปโจมตีป้อมปราการทางทิศใต้และทิศเหนือ พวกเขาทำการโจมตีในเวลากลางคืนและประสบความสำเร็จ สามารถทะลวงป้อมปราการได้สามแห่ง และสังหารกองกำลังฮุยไปกว่าพันนาย กองทหารของรัฐบาลตั้งค่ายพักแรมค้างคืนที่ป้อมปราการทั้งสามแห่งที่ยึดมาได้

เมื่อวันที่ 13 ตุลาคม กองกำลังฮุยได้เปิดฉากโจมตีโต้กลับครั้งใหญ่ หลิวจินถังสั่งให้ป้องกันป้อมปราการทั้งสามแห่ง ขณะที่กองกำลังอื่นๆ ตั้งรับเพื่อรับมือกับศัตรู และเสริมกำลังและซ่อมแซมป้อมปราการฮุยที่ยึดมาได้ เพื่อให้การลำเลียงเสบียงอาหารเป็นไปอย่างราบรื่น

วันที่ 17 ตุลาคม กัวเซียงจือ ขุนนางประจำมณฑลซีหนิง ร้องขอความช่วยเหลือ โดยระบุว่าเมืองถูกปิดล้อมมาสองเดือนแล้ว และกำลังตกอยู่ในอันตรายอย่างเร่งด่วนเนื่องจากขาดแคลนอาหาร หลิวจินถังตระหนักว่าศัตรูตั้งใจจะถ่วงเวลา ดังนั้นในวันรุ่งขึ้นเขาจึงนำกองทัพเคลื่อนพลไปยังภูเขาทางเหนือ กองกำลังฮุยแบ่งกำลังออกเป็นสามเส้นทางเพื่อโจมตี โดยพยายามจะโจมตีทหารรัฐบาลที่อยู่ฝั่งใต้ของแม่น้ำอย่างไม่ทันตั้งตัว หลิวจินถังสั่งให้ระดมยิงปืนใหญ่ใส่ป้อมปราการของกองกำลังฮุย หลังจากกำแพงของศัตรูพังทลายลง กองกำลังฮุยก็ล่าถอยอย่างรวดเร็ว ทหารรัฐบาลบุกทะลวงป้อมปราการกว่าสิบแห่งบนภูเขาทางเหนืออย่างต่อเนื่อง บังคับให้กองกำลังฮุยหนีไปยังทางเหนือของแม่น้ำหวงและฝั่งใต้ และทำลายป้อมปราการภายในหุบเขาจนราบเรียบ

ในวันที่ 19 หลิว จินถังเห็นไฟไหม้บริเวณชานเมืองซีหนิง จึงรีบเคลื่อนกำลังพลไปยังตงกวน ผู้นำมุสลิมฮุย หม่าเปิ่นหยวนและหม่ากุ้ยหยวนหนีไปพร้อมกับครอบครัวไปยังตงฉวน ส่วนกองทัพรัฐบาลไล่ล่าศัตรูที่เหลืออยู่ หลังจากการสู้รบหลายวัน กองทัพรัฐบาลสังหารทหารฮุยได้สามถึงสี่พันนาย และยึดยุทโธปกรณ์และปศุสัตว์ได้เป็นจำนวนมาก ชาวเมืองซีหนิงต่างซาบซึ้งและหลั่งน้ำตาต้อนรับหลิว จินถัง มุสลิมฮุยผู้สูงอายุและอ่อนแอมากกว่าพันคนนอกเมืองขอความเมตตา และหลิว จินถังอนุญาตให้พวกเขาตั้งถิ่นฐานและกลับไปใช้ชีวิตตามปกติ

ในการรบครั้งนี้ กองกำลังฮุยต่อสู้อย่างกล้าหาญและดื้อรั้น โดยอาศัยภูมิประเทศที่อันตรายในการสร้างป้อมปราการและโต้กลับซ้ำแล้วซ้ำเล่า การสู้รบดุเดือดอย่างยิ่ง ทำให้เป็นการรบที่ยากที่สุดในการกบฏของฮุยทั้งหมด ภายใต้การบัญชาการของหลิว จินถัง กองทัพชิงได้ใช้ประโยชน์จากภูมิประเทศในการวางกำลังซุ่มโจมตี เอาชนะศัตรูอย่างต่อเนื่อง และในที่สุดก็ยึดครองตำแหน่งทางยุทธศาสตร์ต่างๆ ได้ ทำให้กองกำลังฮุยได้รับความเสียหายอย่างหนัก ในช่วงเวลานี้ เนื่องจากความตึงเครียดระหว่างฮั่นและฮุยภายในเมืองซีหนิง หลังจากที่กองกำลังฮุยออกจากเมืองไปแล้ว ชาวฮั่นได้ปิดประตูเมือง ทำให้หม่า กุ้ยหยวนสูญเสียฐานที่มั่นและถูกโจมตีจากทั้งด้านหน้าและด้านหลัง ซึ่งยิ่งเร่งกระบวนการปราบปรามให้เร็วขึ้น ตามบันทึกของจั่วจงถังระบุว่า: "หม่ากุ้ยหยวนยังคงอ้างตัวว่าเป็นผู้ว่าการเมืองซีหนิง รวบรวมชาวมุสลิมฮุยในท้องถิ่นนอกเมือง และนำทหารและพลเรือนฮุยทั้งหมดออกจากเมือง หลังจากที่หม่ากุ้ยหยวนออกจากเมืองและไม่กลับมาเป็นเวลาสองวัน พลเรือนฮั่นที่ลี้ภัยอยู่ในเมืองซีหนิงจึงรู้ถึงการหลอกลวงของเขา ฉวยโอกาสปิดเมืองและป้องกันเมือง ขอให้กัวเซียงจือ เจ้าเมืองซีหนิง รับผิดชอบการป้องกันเมือง และปฏิเสธไม่ให้หม่ากุ้ยหยวนและคนอื่นๆ เข้ามาในเมือง เมือง..."（“……马桂源仍称西宁知府，在关外调集土回，尽带城中回兵回民以出。马桂源出城两日不返，西宁城内避难汉民习知其诈，乘机闭城拒守，请西宁道郭襄之主办城防，不准马桂源等入城……”）^{[ 50 ]}

กองทัพชิงสังหารทหารฮุยไปทั้งหมด 5,000 ถึง 6,000 นาย ขณะที่สูญเสียนายทหารยศ "youji" (พลตรี) ขึ้นไป 137 นาย^{[ 51 ] [ 52 ]} ซีหนิงตกอยู่ภายใต้การยึดครองหลังจากการปิดล้อมนาน 3 เดือนในช่วงปลายปี 1872 ผู้บัญชาการ Ma Guiyuan ถูกจับ และผู้ป้องกันเมืองถูกสังหารไปหลายพันคน^{[ 38 ]}ประชากรมุสลิมในซีหนิงรอดชีวิต แต่ผู้ลี้ภัยจากมณฑลฉานซีที่หลบภัยอยู่ที่นั่นถูกย้ายไปตั้งถิ่นฐานในพื้นที่เพาะปลูกทางตะวันออกและทางใต้ของมณฑลกานซู ซึ่งแยกตัวออกจากพื้นที่มุสลิมอื่นๆ

แม้จะมีการเสนอการนิรโทษกรรมซ้ำแล้วซ้ำเล่า แต่ชาวมุสลิมจำนวนมากยังคงต่อต้านอยู่ที่ซูโจว ( จิ่วฉวน) ป้อมปราการสุดท้ายของพวกเขาในระเบียงเหอซีทางตะวันตกของมณฑลกานซู เมืองนี้อยู่ภายใต้การบัญชาการของหม่า เหวินลู่ ซึ่งมีถิ่นกำเนิดจากซีหนิง ชาวฮุยจำนวนมากที่ถอยร่นมาจากฉานซีก็อยู่ในเมืองนี้ด้วย หลังจากรักษาเส้นทางส่งเสบียงไว้ได้แล้ว จั่วจงถังก็ปิดล้อมซูโจวในเดือนกันยายน ค.ศ. 1873 ด้วยทหาร 15,000 นาย ป้อมปราการไม่สามารถต้านทานปืนใหญ่ของจั่วได้ และเมืองก็แตกในวันที่ 24 ตุลาคม จั่วสั่งประหารชีวิตชาวฮุย 7,000 คน และย้ายที่เหลือไปตั้งถิ่นฐานทางตอนใต้ของมณฑลกานซู เพื่อให้แน่ใจว่าระเบียงกานซูทั้งหมดตั้งแต่หลานโจวถึงตุนหวงจะปราศจากชาวฮุย ป้องกันความเป็นไปได้ของการสมรู้ร่วมคิดในอนาคตระหว่างชาวมุสลิมในกานซูและฉานซีกับชาวมุสลิมในซินเจียง ชาวฮั่นและชาวฮุยที่ภักดีต่อราชวงศ์ชิงยึดครองดินแดนของกบฏฮุยในมณฑลฉานซี ดังนั้นชาวฮุยในฉานซีจึงถูกย้ายไปตั้งถิ่นฐานที่จ้านเจียฉวนในมณฑลกานซู^{[ 53 ]}

หม่าจ้านอ้าวช่วยเหลือชาวฮั่นให้หลบหนีออกจากเหอโจวในช่วงการก่อกบฏ^{[ 54 ]}

กลุ่มกบฏขาดระเบียบและไม่มีเป้าหมายร่วมกัน ชาวฮั่นบางส่วนก่อกบฏต่อรัฐชิงในช่วงการกบฏ และกลุ่มกบฏก็ต่อสู้กันเอง ผู้นำกบฏชาวฮุยคนสำคัญอย่างหม่าฮวาหลงได้รับยศและตำแหน่งทางทหารจากราชวงศ์ชิงในช่วงการกบฏ ต่อมาเมื่อจั่วจงถังเริ่มการรณรงค์ปราบปรามในภูมิภาค เขาจึงตัดสินใจว่ากบฏที่ยอมจำนนคนใดจะถูกประหารชีวิตหรือไว้ชีวิต^{[ 1 ] : 98}

ตำแหน่งเฉาชิงในปี พ.ศ. 2408 ได้รับการพระราชทานโดยมู่ตูซาน นายพลแห่งราชวงศ์ชิง ให้แก่หม่าฮวาหลง หลังจากที่เขายอมจำนนต่อราชวงศ์ชิงอย่างเป็นทางการ แต่จั่วจงถังถือว่าตำแหน่งนี้เป็นของปลอม^{[ 55 ]}

โดยทั่วไปแล้ว จั่วจงถังจะสังหารหมู่กบฏญะริยาห์นิกายคำสอนใหม่ แม้ว่าพวกเขาจะยอมจำนนก็ตาม แต่ไว้ชีวิตกบฏคาฟิยาห์นิกายคำสอนเก่าและกบฏเกดิมูนิกายซุนนี หม่าฮวาหลงเป็นสมาชิกของสำนักคิดคำสอนใหม่ และจั่วจงถังได้ประหารชีวิตเขา ในขณะที่แม่ทัพฮุยที่อยู่ในกลุ่มคำสอนเก่า เช่น หม่าเฉียนหลิง หม่าจ้านอ้าว และหม่าอันเหลียง ได้รับการนิรโทษกรรมและได้รับการเลื่อนตำแหน่งในกองทัพชิง ยิ่งไปกว่านั้น กองทัพกบฏชาวฮั่นที่นำโดยตงฟู่เซียงได้ยอมจำนนและเข้าร่วมกับจั่วจงถัง^{[ 1 ]} แม่ทัพจั่วรับการยอมจำนนของชาวฮุยที่อยู่ในสำนักคิดคำสอนเก่า โดยมีเงื่อนไขว่าพวกเขาต้องมอบยุทโธปกรณ์และเสบียงจำนวนมาก และยอมรับการย้ายถิ่นฐาน เขาปฏิเสธที่จะรับการยอมจำนนของชาวมุสลิมนิกายคำสอนใหม่ที่ยังคงเชื่อในหลักคำสอนของตน เนื่องจากราชวงศ์ชิงจัดพวกเขาเป็นลัทธินอกรีตที่เป็นอันตราย คล้ายกับชาวพุทธดอกบัวขาวจั่วกล่าวว่า "ความแตกต่างเพียงอย่างเดียวคือระหว่างผู้บริสุทธิ์และผู้ก่อกบฏ ไม่มีความแตกต่างระหว่างฮั่นและฮุย" ^{[ 56 ]}

ทางการชิงออกประกาศว่าพวกกบฏฮุยที่ก่อเหตุโจมตีรุนแรงเป็นเพียงพวกนอกรีตและไม่ได้เป็นตัวแทนของประชากรฮุยทั้งหมด เช่นเดียวกับกลุ่มดอกบัวขาวนอกรีตที่ไม่ได้เป็นตัวแทนของชาวพุทธทั้งหมด^{[ 57 ]}ทางการชิงออกประกาศว่ามีศาสนาอิสลามสองนิกายที่แตกต่างกัน คือศาสนา "เก่า" และศาสนา "ใหม่" นิกายใหม่เป็นพวกนอกรีตและเบี่ยงเบนจากศาสนาอิสลามในลักษณะเดียวกับที่กลุ่มดอกบัวขาวเบี่ยงเบนจากพุทธศาสนาและลัทธิเต๋า และระบุเจตนารมณ์ที่จะแจ้งให้ชุมชนฮุยทราบว่าพวกเขาทราบดีว่าศาสนาอิสลามดั้งเดิมเป็นนิกายเดียวที่รวมกันก่อนการมาของ "พวกนอกรีต" ใหม่ โดยกล่าวว่าจะแยกพวกกบฏมุสลิมตามนิกายที่พวกเขาเป็นสมาชิก^{[ 58 ]}

ระหว่างการก่อกบฏ ชาวฮุยบางส่วนต่อสู้เพื่อราชวงศ์ชิงต่อต้านกลุ่มกบฏตั้งแต่เริ่มต้น มีการมอบรางวัลให้แก่หวังต้ากุ้ย ผู้นำมุสลิมฮุยที่สนับสนุนราชวงศ์ชิงซึ่งต่อสู้กับกลุ่มกบฏฮุย ญาติของหวังต้ากุ้ยและตัวหวังเองถูกสังหารโดยกลุ่มกบฏฮุยต่อต้านราชวงศ์ชิงกลุ่มอื่น^{[ 59 ]} นอกจากนี้ ผู้นำกบฏชาวจีนฮุยไม่เคยเรียกร้องให้ทำญิฮาดและไม่เคยอ้างว่าพวกเขาต้องการสถาปนารัฐอิสลาม ซึ่งแตกต่างจากชาวมุสลิมเติร์กซินเจียงที่เรียกร้องให้ทำญิฮาด แทนที่จะโค่นล้มรัฐบาล กลุ่มกบฏต้องการแก้แค้นเจ้าหน้าที่ทุจริตในท้องถิ่นและคนอื่นๆ ที่กระทำการอยุติธรรมต่อพวกเขา^{[ 14 ]}

เมื่อหม่าฮวาหลงเจรจากับทางการชิงในปี พ.ศ. 2409 เขาตกลงที่จะ "ยอมจำนน" โดยมอบอาวุธต่างชาติ หอก ดาบ และปืนใหญ่ 26 กระบอก หม่าใช้ชื่อใหม่เพื่อแสดงถึงความจงรักภักดีต่อราชวงศ์ คือ หม่าเฉาฉิง มู่ตูซาน ข้าราชการแมนจู หวังว่านี่จะนำไปสู่การที่ชาวมุสลิมคนอื่นๆ ทำตามและยอมจำนน แต่การยอมจำนนของหม่าฮวาหลงไม่มีผล และการกบฏยังคงแพร่กระจายต่อไป^{[ 60 ] [ 61 ]} แม้หลังจากที่หม่าฮวาหลงถูกตัดสินประหารชีวิต จั่วก็ยกเลิกการประหารเมื่อหม่ายอมจำนนเป็นครั้งที่สองในปี พ.ศ. 2414 โดยมอบอาวุธทั้งหมด เช่น ปืนใหญ่ กิงกัล ปืนลูกซอง และอาวุธตะวันตก จั่วยังสั่งให้เขาชักชวนผู้นำคนอื่นๆ ให้ยอมจำนนด้วย จากนั้น Zuo ค้นพบคลังอาวุธตะวันตกที่ซ่อนไว้ 1,200 ชิ้นในกองบัญชาการของ Ma Hualong ใน Jinjipao และ Ma ก็ไม่สามารถโน้มน้าวให้คนอื่นๆ ยอมจำนนได้ หลังจากนั้น Ma พร้อมด้วยสมาชิกชายในครอบครัวและเจ้าหน้าที่จำนวนมากของเขาก็ถูกสังหาร^{[ 62 ]}จากนั้น Zuo ก็กล่าวว่าเขาจะยอมรับการยอมจำนนของชาวมุสลิมกลุ่มใหม่ที่ยอมรับว่าพวกเขาถูกหลอกลวง ถูกปลุกระดม และถูกชักนำไปในทางที่ผิดโดยหลักคำสอนของกลุ่มนี้ Zuo ไม่รวมเคาะลีฟะฮ์และมุลลาห์ในการยอมจำนน^{[ 63 ] [ 64 ]}

Zuo Zongtang ได้รับแต่งตั้งให้เป็นข้าหลวงใหญ่ของมณฑลส่านซีและกานซูในปี พ.ศ. 2409 ^{[ 65 ]}

หม่า จ้านเหยาและหม่า อันเหลียง บุตรชายของเขาแปรพักตร์ไปเข้าร่วมกับราชวงศ์ชิงในช่วงกบฏตุนกัน^{[ 66 ]}ดังที่กล่าวไว้ในส่วนก่อนหน้า จั่วได้ย้ายชาวฮั่นจากเหอโจวเพื่อเป็นรางวัลแก่หม่า จ้านเหยา ผู้นำชาวฮุย หลังจากที่เขาและผู้ติดตามยอมจำนนและเข้าร่วมกับราชวงศ์ชิงเพื่อปราบปรามกบฏ จั่วยังได้ย้ายผู้ลี้ภัยชาวมุสลิมจากฉานซีจากเหอโจว โดยอนุญาตให้เฉพาะชาวมุสลิมพื้นเมืองจากกานซูเท่านั้นที่ยังคงอยู่ หม่า จ้านเหยาและกองกำลังชาวฮุยของเขาถูกเกณฑ์เข้าสู่กองทัพมาตรฐานเขียวของกองทัพชิง^{[ 67 ]}

ชาวมุสลิมฮุยที่อาศัยอยู่ในพื้นที่ที่ไม่ได้มีส่วนร่วมในการก่อจลาจลนั้นไม่ได้รับผลกระทบใดๆ เลย ไม่มีการจำกัดใดๆ ต่อพวกเขา และพวกเขาก็ไม่ได้พยายามเข้าร่วมกับกลุ่มกบฏ ศาสตราจารย์ฮิวจ์ ดีอาร์ เบเกอร์ กล่าวไว้ในหนังสือของเขาเรื่องHong Kong Images: People and Animalsว่าประชากรมุสลิมฮุยในปักกิ่งยังคงไม่ได้รับผลกระทบจากกลุ่มกบฏมุสลิมในช่วงการก่อจลาจลตุนกัน^{[ 68 ]} เอลิซาเบธ อัลเลส เขียนว่าความสัมพันธ์ระหว่างชาวมุสลิมฮุยและชาวฮั่นยังคงดำเนินไปตามปกติใน พื้นที่ เหอหนานโดยไม่มีผลกระทบหรือความร่วมมือใดๆ จากการก่อจลาจลของชาวมุสลิมในพื้นที่อื่นๆ อัลเลสเขียนไว้ในเอกสารNotes on some joking relationships between Hui and Han villages in Henanซึ่งตีพิมพ์โดยศูนย์วิจัยฝรั่งเศสเกี่ยวกับจีนร่วมสมัยว่า "การก่อจลาจลของชาวมุสลิมครั้งใหญ่ในช่วงกลางศตวรรษที่ 19 ซึ่งเกี่ยวข้องกับชาวฮุยในฉานซี กานซู และยูนนาน รวมถึงชาวอุยกูร์ในซินเจียง ดูเหมือนว่าจะไม่มีผลกระทบโดยตรงต่อภูมิภาคนี้ของที่ราบภาคกลาง" ^{[ 69 ]}เจ้าหน้าที่และข้าราชการมุสลิมฮุยMa Xinyiรับใช้ราชวงศ์ชิง^{[ 70 ] [ 71 ]}ในช่วงการกบฏตุนกัน

เนื่องจากโดยทั่วไปแล้วกลุ่มกบฏชาวฮุยในมณฑลฉานซีไม่ได้เข้าร่วมกับชาวฮุยในซีอานซึ่งยังคงอยู่ภายใต้การควบคุมของรัฐบาลชิง ชาวฮุยในซีอานจึงรอดพ้นจากสงครามโดยรัฐบาลชิง และรอดพ้นจากการสู้รบและยังคงอยู่ในซีอานหลังสงคราม^{[ 72 ]}กำแพงเมืองซีอานต้านทานการปิดล้อมของกลุ่มกบฏเป็นเวลาสองปีในปี พ.ศ. 2413 และ พ.ศ. 2414 และไม่พังทลายลง^{[ 73 ]}

ระหว่างการกบฏปันเทย์ ชาวมุสลิมฮุยจากเจ้ อเจียงและเสฉวนที่ได้รับเชิญจากราชวงศ์ชิงมายังยูนนานในปี พ.ศ. 2491 ได้เจรจาสันติภาพ และไม่ได้มีส่วนร่วมในการกบฏ ^{[ 74 ]}ราชวงศ์ชิงไม่ได้สังหารหมู่ชาวมุสลิมที่ยอมจำนน นายพลหม่า รู่หลงซึ่งเป็นชาวมุสลิมที่ยอมจำนนและเข้าร่วมการรณรงค์ของราชวงศ์ชิงเพื่อปราบปรามชาวมุสลิมที่ก่อกบฏ ได้รับการเลื่อนตำแหน่ง และในบรรดานายทหารของยูนนานที่รับใช้ราชวงศ์ชิง เขาเป็นผู้ที่แข็งแกร่งที่สุด^{[ 75 ] [ 76 ]}กองทัพชิงปล่อยชาวมุสลิมที่ไม่ได้ก่อกบฏไว้ตามลำพัง เช่นในเขตจ้าวถงทางตะวันออกเฉียงเหนือของยูนนาน ซึ่งมีประชากรมุสลิมหนาแน่นมากหลังสงคราม^{[ 77 ]}

ผู้ภักดีต่อฮุยและฮั่นต่างเข้ายึดครองดินแดนของชาวฮุยแห่งฉานซี ซึ่งย้ายไปอยู่ที่กานซู และถูกนายพลจั่วจงถางย้ายไปที่จางเจียฉวนหลังจากสงครามสิ้นสุดลง^{[ 54 ]}

ภายในทศวรรษ 1860 ซินเจียงอยู่ภายใต้การปกครองของราชวงศ์ชิงมาเป็นเวลาหนึ่งศตวรรษ พื้นที่นี้ถูกพิชิตในปี 1759 จากอาณาจักรจุงการ์^{[ 78 ]}ซึ่งประชากรหลักคือชาวโออิรัตซึ่งต่อมากลายเป็นเป้าหมายของการฆ่าล้างเผ่าพันธุ์ อย่างไรก็ตาม เนื่องจากซินเจียงส่วนใหญ่ประกอบด้วยพื้นที่กึ่งแห้งแล้งหรือทะเลทราย จึงไม่ดึงดูดผู้ตั้งถิ่นฐานชาวฮั่น ยกเว้นพ่อค้าบางส่วน ดังนั้นผู้คนอื่นๆ เช่น ชาวอุยกูร์จึงเข้ามาตั้งถิ่นฐานในพื้นที่นี้ ซินเจียงทั้งหมดถูกแบ่งออกเป็นสามเขต การปกครอง : ^{[ 79 ] [ 80 ]}

• เส้นทาง สายเหนือของเทือกเขาเทียนซาน (天山北路; Tianshan Beilu ) ซึ่งรวมถึง ลุ่มน้ำ อีลีและจุงกาเรียภูมิภาคนี้โดยประมาณตรงกับเขตปกครองตนเองคาซัคอีลี ในปัจจุบัน และรวมถึงเขตปกครองต่างๆ ที่อยู่ภายใต้การควบคุมของเขตปกครองนี้ ตลอดจนเขตปกครองขนาดเล็กที่อยู่ติดกันอีกหลายแห่ง
• เส้นทางสายใต้ของเทือกเขาเทียนซาน (天山南路; Tianshan Nanlu ) ซึ่งประกอบด้วย "แปดเมือง" ได้แก่ "สี่เมืองทางตะวันตก" คือโคตันยาร์คันด์ยางิฮิสซาร์และคัชการ์และ "สี่เมืองทางตะวันออก" คือ อุช อักซูคูชาและคาราชาห์ร
• เส้นทางคมนาคมสายตะวันออก (东路; Donglu ) ในเขตซินเจียงตะวันออก โดยมีเมืองอุรุมฉีเป็น ศูนย์กลาง

อำนาจบัญชาการทหารโดยรวมของทั้งสามเขตตกอยู่กับแม่ทัพอีลี่ซึ่งประจำการอยู่ที่เมืองฮุยหยวนเฉิงเขายังรับผิดชอบการบริหารราชการพลเรือนด้วย (โดยตรงในเขตทางเหนือของเทือกเขาเทียนซาน และผ่านทางผู้ปกครองท้องถิ่นชาวมุสลิม (อุยกูร์) ในเขตทางใต้) อย่างไรก็ตาม เขตทางตะวันออกอยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของมณฑลกานซูในเรื่องการบริหารราชการพลเรือน

ในปี ค.ศ. 1765 เกิด การกบฏอุชขึ้นที่อุชตูร์ฟาน การกบฏครั้งนี้เป็นผลมาจากการปกครองที่ไม่เป็นธรรมและการเอารัดเอาเปรียบอย่างรุนแรงของราชวงศ์ชิงในช่วงต้นปีหลังจากการยึดครองซินเจียงในปี ค.ศ. 1759 หลังจากการพิชิต เจ้าหน้าที่อุยกูร์ท้องถิ่นที่ได้รับการแต่งตั้งจากราชวงศ์ชิง รวมถึงอับดุลลาห์ ฮาคิม เบก แห่งอุชตูร์ฟาน ได้ใช้อำนาจในตำแหน่งของตนเพื่อรีดไถเงินจากประชากรอุยกูร์ในท้องถิ่น ตำนานอุยกูร์เรื่องหนึ่งเกี่ยวกับหญิงสาวเจ็ดคนมาจากเหตุการณ์กบฏครั้งนี้ ซึ่งหญิงสาวอุยกูร์ต่อต้านการข่มขืนโดยชาวแมนจู ชาวแมนจูถูกกล่าวโทษอย่างชัดเจน ในขณะที่ชาวฮั่นไม่ได้ถูกกล่าวถึงว่าเป็นผู้กระทำผิดในตำนานนี้^{[ 81 ] [ 82 ] [ 83 ] [ 84 ]}นอกจากนี้ยังมีตำนานอุยกูร์อีกเรื่องหนึ่งเกี่ยวกับหญิงสาวเจ็ดคนจาก สงคราม คาราคานิดกับอาณาจักรพุทธ เช่นโคโชซึ่งไม่เกี่ยวข้องกับตำนานเกี่ยวกับหญิงสาวอุยกูร์ที่ต่อต้านการข่มขืนของชาวแมนจู^{[ 85 ] [ 86 ]}

ผลที่ตามมาคือ ในปี ค.ศ. 1765 เมื่อซูเฉิง เจ้าหน้าที่แมนจู สั่งให้ชาย 240 คนนำของขวัญราชการไปปักกิ่ง ทาสแบกหามและชาวเมืองจึงก่อการจลาจล อับดุลลาห์ ผู้ร่วมมือกับชาวอุยกูร์ ซูเฉิง กองกำลังแมนจูของราชวงศ์ชิงที่ประจำการอยู่ และเจ้าหน้าที่แมนจูของราชวงศ์ชิงคนอื่นๆ ถูกสังหารหมู่ และพวกกบฏก็เข้ายึดป้อมปราการของราชวงศ์ชิงได้สำเร็จ เพื่อตอบโต้การจลาจล ราชวงศ์ชิงจึงส่งกองกำลังขนาดใหญ่เข้ามาในเมืองและปิดล้อมพวกกบฏในบริเวณนั้นเป็นเวลาหลายเดือนจนกระทั่งพวกเขายอมจำนน จากนั้นเจ้าหน้าที่แมนจูก็ตอบโต้พวกกบฏอุยกูร์อย่างโหดร้ายด้วยการประหารชีวิตชายกว่า 2,000 คน และเนรเทศหญิงประมาณ 8,000 คน^{[ 87 ] [ 88 ] [ 89 ] [ 90 ]}

ในช่วงการก่อกบฏของอาฟากี โคจามีการรุกรานหลายครั้งจากโคกันด์เข้าสู่คัชกาเรีย คล้ายกับการรุกรานของจาฮันกีร์ โคจาในทศวรรษ 1820 และวาลิ ข่านในปี 1857 ส่งผลให้รัฐบาลต้องเพิ่มกำลังทหารในซินเจียงเป็นประมาณ 50,000 นาย ทั้งหน่วยทหารแมนจูและฮั่นประจำการอยู่ในมณฑล โดยหน่วยฮั่นส่วนใหญ่เกณฑ์มาจากฉานซีและกานซู และมีส่วนประกอบของชาวฮุย (ตุนกัน) จำนวนมาก กองทัพชิงส่วนใหญ่ในซินเจียงประจำการอยู่ที่ป้อมปราการเก้าแห่งในเขตอีลีแต่ก็ยังมีป้อมปราการและกองกำลังชิงประจำการอยู่ในเมืองอื่นๆ ส่วนใหญ่ของซินเจียงด้วย

การรักษากองทัพนี้ไว้ต้องใช้ค่าใช้จ่ายสูงกว่าที่ภาษีจากเศรษฐกิจท้องถิ่นจะสามารถจัดหาได้อย่างยั่งยืน และจำเป็นต้องได้รับการอุดหนุนจากรัฐบาลกลาง การสนับสนุนดังกล่าวเป็นไปไม่ได้ในช่วงทศวรรษ 1850-1860 เนื่องจากค่าใช้จ่ายในการปราบปรามกบฏไท่ผิงและกบฏอื่นๆ ในใจกลางจีน ทางการชิงในซินเจียงจึงตอบโต้ด้วยการขึ้นภาษี แนะนำภาษีใหม่ และขายตำแหน่งราชการให้กับผู้เสนอราคาสูงสุด (เช่น ตำแหน่งผู้ว่าการเมืองยาร์คัน ด์ ให้กับรุสตัม เบกแห่งโคตันในราคา 2,000 ยัมบูและตำแหน่ง ผู้ว่าการเมือง คูชาให้กับซาอิด เบกในราคา 1,500 ยัมบู) จากนั้นผู้ดำรงตำแหน่งใหม่ก็จะดำเนินการชดเชยการลงทุนของตนโดยการรีดไถประชาชนในอาณาจักรของตน

ภาระภาษีที่เพิ่มขึ้นและการทุจริตคอร์รัปชันยิ่งเพิ่มความไม่พอใจให้กับประชาชนในซินเจียง ซึ่งต้องทนทุกข์ทรมานมานานทั้งจากการบริหารที่ผิดพลาดของข้าราชการราชวงศ์ชิงและ ผู้ใต้ บังคับบัญชา ที่เป็นขุนนางท้องถิ่น รวมถึงการรุกรานที่สร้างความเสียหายของพวกโคจาอย่างไรก็ตาม ทหารราชวงศ์ชิงในซินเจียงยังคงไม่ได้รับเงินเดือนตรงเวลาหรืออุปกรณ์ที่เหมาะสม

เมื่อการก่อจลาจลเริ่มต้นขึ้นในมณฑลกานซูและฉานซีในปี 1862 ข่าวลือแพร่กระจายในหมู่ชาวฮุย (ตุนกัน) แห่งซินเจียงว่าทางการราชวงศ์ชิงกำลังเตรียมการสังหารหมู่ชาวฮุยในซินเจียงหรือในชุมชนใดชุมชนหนึ่งโดยเฉพาะ ความคิดเห็นเกี่ยวกับความจริงของข่าวลือเหล่านี้แตกต่างกันไป ในขณะที่จักรพรรดิถงจือทรงอธิบายว่าข่าวลือเหล่านี้ "ไร้สาระ" ในพระราชกฤษฎีกาเมื่อวันที่ 25 กันยายน 1864 นักประวัติศาสตร์มุสลิมโดยทั่วไปเชื่อว่าการสังหารหมู่ได้ถูกวางแผนไว้จริง หากไม่ใช่โดยรัฐบาลจักรวรรดิ ก็โดยเจ้าหน้าที่ท้องถิ่นต่างๆ ดังนั้นจึงเป็นชาวตุนกันที่มักจะก่อจลาจลในเมืองต่างๆ ของซินเจียง แม้ว่าชาวเติร์กท้องถิ่น—ชาวทารันชี ชาวคีร์กีซ และชาวคาซัค—มักจะเข้าร่วมการต่อสู้ในไม่ช้าก็ตาม

การก่อกบฏครั้งแรกในซินเจียงนั้นเล็กน้อยมากจนทางการราชวงศ์ชิงสามารถปราบปรามได้อย่างง่ายดาย เมื่อวันที่ 17 มีนาคม ค.ศ. 1863 ชาวตุนกันประมาณ 200 คนจากหมู่บ้านซานเตาเหอ (ห่างจากซุยติ้ง ไปทางตะวันตกไม่กี่ไมล์ ) ซึ่งคาดว่าถูกยั่วยุจากข่าวลือเรื่องการสังหารหมู่ชาวตุนกันล่วงหน้า ได้โจมตีทาร์ชี (塔勒奇城; Tǎlēiqí Chéngซึ่งปัจจุบันเป็นส่วนหนึ่งของอำเภอฮั่วเฉิง ) หนึ่งในเก้าป้อมปราการของแอ่งอีลี่ พวกกบฏยึดอาวุธจากคลังแสงของป้อมและสังหารทหารที่ประจำการอยู่ แต่ในไม่ช้าก็พ่ายแพ้ต่อกองกำลังของรัฐบาลจากป้อมอื่นๆ และถูกสังหารหมู่ในที่สุด

การจลาจลปะทุขึ้นอีกครั้งในปีถัดมา คราวนี้เกิดขึ้นเกือบพร้อมกันในทั้งสามเขตของซินเจียง และมีขนาดใหญ่เกินกว่าที่ทางการจะปราบปรามได้

ในคืนวันที่ 3-4 มิถุนายน ค.ศ. 1864 ชาวดุงกันแห่งเมืองคูชาหนึ่งในเมืองทางใต้ของเทือกเขาเทียนซาน ได้ลุกฮือขึ้น และในไม่ช้าก็มีชาวเติร์กในท้องถิ่นเข้าร่วมด้วย ป้อมปราการของชาวฮั่น ซึ่งแตกต่างจากสถานที่อื่นๆ ในซินเจียงหลายแห่งที่ตั้งอยู่ภายในเมืองแทนที่จะอยู่นอกเมือง ได้แตกภายในไม่กี่วัน อาคารของรัฐบาลถูกเผาทำลาย และชาวฮั่นประมาณ 1,000 คน และชาวมองโกล 150 คน ถูกสังหาร เนื่องจากทั้งผู้นำชาวดุงกันและชาวเติร์กของการก่อกบฏไม่มีอำนาจมากพอเหนือชุมชนทั้งหมดที่จะได้รับการยอมรับโดยทั่วไปในฐานะผู้นำ พวกกบฏจึงเลือกบุคคลที่ไม่ได้เข้าร่วมในการก่อกบฏ แต่เป็นที่รู้จักในบทบาททางจิตวิญญาณของเขา คือ ราชีดิน (Rashīdīn) โคจานักบวชและผู้ดูแลสุสานของบรรพบุรุษผู้มีชื่อเสียงในฐานะนักบุญ อาร์ชาด-อัล-ดิน (? – ค.ศ. 1364 หรือ 1365) ตลอดสามปีต่อมา เขาได้ส่งกองกำลังทหารไปทางตะวันออกและตะวันตกเพื่อพยายามยึดครองแอ่งทาริม ทั้งหมด แต่แผนการขยายอำนาจของเขากลับถูกขัดขวางโดยยาคูบ เบก

เพียงสามสัปดาห์หลังจากเหตุการณ์ในคูฉา การกบฏก็ปะทุขึ้นในเขตตะวันออก ทหารตุนกันแห่ง ป้อม อูรุมฉีได้ก่อกบฏในวันที่ 26 มิถุนายน ค.ศ. 1864 ไม่นานหลังจากทราบข่าวการกบฏในคูฉา ผู้นำตุนกันสองคนคือตู่หมิง (หรือที่รู้จักกันในชื่อ ตู่เต๋อหลิน) อา หงนิกายคำสอนใหม่จากมณฑลกานซู และซัวฮวนจางนายทหารที่มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับผู้นำทางศาสนาของชาวฮุย ส่วนใหญ่ของเมืองถูกทำลาย คลังเก็บชาถูกเผา และป้อมปราการของชาวแมนจูถูกล้อม จากนั้นกลุ่มกบฏอูรุมฉีก็รุกคืบไปทางตะวันตกผ่านพื้นที่ซึ่งปัจจุบันคือเขตปกครองตนเองฉางจี้ฮุยยึดเมืองมานัส (หรือที่รู้จักกันในชื่อซุยไหลในขณะนั้น) ได้ในวัน ที่ 17 กรกฎาคม (ป้อมปราการของชาวแมนจูที่นั่นแตกในวันที่ 16 กันยายน ) และ เมือง อูซู (กุรุซู) ใน วันที่ 29 กันยายน

เมื่อวันที่ 3 ตุลาคม ค.ศ. 1864 ป้อมปราการแมนจูแห่งอูรุมฉีก็ตกอยู่ภายใต้การยึดครองของกองกำลังร่วมระหว่างอูรุมฉีและกบฏกูเจี้ยน ในรูปแบบที่เกิดขึ้นซ้ำในป้อมปราการฮั่นอื่นๆ ทั่วทั้งภูมิภาค ผู้บัญชาการแมนจู ผิงจุ่ย เลือกที่จะจุดระเบิดดินปืนของตนเอง สังหารตนเองและครอบครัว แทนที่จะยอมจำนน

หลังจากที่ทหารดุงกันในเมือง ยาร์คันด์ในแคว้นคัชกาเรียทราบแผนการของทางการชิงที่จะปลดอาวุธหรือสังหารพวกเขา พวกเขาก็ลุกขึ้นต่อต้านในช่วงเช้ามืดของวัน ที่ 26 กรกฎาคม ค.ศ. 1864 การโจมตีครั้งแรกของพวกเขาต่อป้อมปราการแมนจู (ซึ่งอยู่นอกกำแพงเมืองมุสลิม) ล้มเหลว แต่ก็ยังทำให้ทหารชิงและครอบครัวเสียชีวิตไป 2,000 นาย ในตอนเช้า ทหารดุงกันได้เข้าไปในเมืองมุสลิม ซึ่งชาวฮั่นประมาณ 7,000 คนถูกบังคับให้เปลี่ยนศาสนาเป็นมุสลิมหรือถูกสังหารหมู่ เนื่องจากจำนวนทหารดุงกันมีน้อยเมื่อเทียบกับชาวมุสลิมเชื้อสายเติร์กในท้องถิ่น พวกเขาจึงเลือกบุคคลที่เป็นกลางคนหนึ่ง คือกูลาห์ม ฮุเซนชายผู้เคร่งศาสนาจาก ตระกูลขุนนาง ในคาบูลให้เป็นประมุข หุ่น เชิด

ในช่วงต้นฤดูใบไม้ร่วงปี 1864 ชาวดุงกันในลุ่มน้ำอีลี่ในเขตภาคเหนือก็ลุกฮือขึ้นเช่นกัน โดยได้รับแรงหนุนจากความสำเร็จของกบฏอูรุมฉีที่วูซูและมานัสและด้วยความกังวลต่อการปราบปรามล่วงหน้าโดยทางการแมนจูในท้องถิ่นแม่ทัพแห่งอีลี่ชางชิง (常清; Cháng Qīng ) ซึ่งเป็นที่เกลียดชังของประชาชนในท้องถิ่นในฐานะผู้กดขี่ที่ฉ้อฉล ถูกรัฐบาลชิงปลดออกจากตำแหน่งหลังจากกองทัพของเขาพ่ายแพ้ต่อกบฏที่วูซู ความพยายามของหมิงซุ่ยผู้สืบทอดตำแหน่งของชางชิง ในการเจรจากับชาวดุงกันนั้นล้มเหลว ในวัน ที่ 10 พฤศจิกายน 1864 ชาวดุงกันได้ลุกฮือขึ้นทั้งในหนิงหยวน ("ทารันชี คุลจา") ศูนย์กลางการค้าของภูมิภาค และฮุยหยวน ("แมนจู คุลจา") ศูนย์กลางทางทหารและการบริหารชาวทารันชีแห่งคุลจา(ชาวนาที่พูดภาษาเตอร์กิก ซึ่งต่อมากลายเป็นส่วนหนึ่งของชาวอุยกูร์ ) เข้าร่วมในการก่อกบฏ เมื่อชาวมุสลิมคาซัคและคีร์กีซในท้องถิ่นรู้สึกว่าฝ่ายกบฏได้เปรียบ พวกเขาก็เข้าร่วมด้วย ในทางกลับกัน ชาวพุทธคาลมิกและชาวซีเบสส่วนใหญ่ยังคงจงรักภักดีต่อรัฐบาลชิง

หนิงหยวนตกอยู่ภายใต้การยึดครองของกบฏตุนกันและเติร์กในทันที แต่กองกำลังรัฐบาลที่แข็งแกร่งในฮุยหยวนได้ขับไล่กบฏถอยทัพหลังจากการต่อสู้อย่างหนักหน่วงในเมืองเป็นเวลา 12 วัน ชาวฮั่นในท้องถิ่นเห็นว่าชาวแมนจูกำลังได้เปรียบจึงเข้าร่วมกับพวกเขา อย่างไรก็ตาม การโจมตีตอบโต้ของกองทัพชิงล้มเหลว กองทหารจักรวรรดิสูญเสียปืนใหญ่ ขณะที่หมิงซุ่ยเกือบถูกจับกุม เมื่ออู่ซูและอักซู ตก อยู่ภายใต้การยึดครอง กองทหารชิงที่ตั้งมั่นอยู่ในป้อมฮุยหยวนจึงถูกตัดขาดจากดินแดนที่อยู่ภายใต้การควบคุมของจักรวรรดิโดยสิ้นเชิง ทำให้หมิงซุ่ยต้องส่งข่าวสารไปยังปักกิ่งผ่านทาง รัสเซีย

แม้ว่ากองกำลังชิงในเมืองฮุยหยวนจะสามารถขับไล่การโจมตีครั้งต่อไปของกลุ่มกบฏได้สำเร็จในวันที่ 12  ธันวาคม ค.ศ. 1864 แต่การก่อกบฏก็ยังคงลุกลามไปยังทางตอนเหนือของมณฑล ( จุงกาเรีย ) ซึ่งชาวคาซัคต่างยินดีที่จะแก้แค้นชาวคาลมิกที่เคยปกครองพื้นที่นี้ในอดีต

เนื่องในเทศกาลตรุษจีนปี 1865 ผู้นำชาวฮุยแห่ง เมือง ทาเฉิง (ชูกูชัก) ได้เชิญเจ้าหน้าที่ราชวงศ์ชิงและขุนนางชาวคาลมิกมารวมตัวกันที่มัสยิดของชาวฮุย เพื่อสาบานตนว่าจะรักษาสันติภาพร่วมกัน อย่างไรก็ตาม เมื่อชาวแมนจูและชาวคาลมิกเข้าไปอยู่ในมัสยิดแล้ว กลุ่มกบฏชาวฮุยก็เข้ายึดคลังอาวุธของเมืองและเริ่มสังหารชาวแมนจู หลังจากต่อสู้กันสองวัน ชาวมุสลิมก็ยึดครองเมืองได้ ในขณะที่ชาวแมนจูถูกปิดล้อมอยู่ในป้อมปราการ ถึงกระนั้น ด้วยความช่วยเหลือจากชาวคาลมิก ชาวแมนจูก็สามารถยึดพื้นที่ทาเฉิงคืนได้ในฤดูใบไม้ร่วงปี 1865 คราวนี้เป็นกลุ่มกบฏชาวฮุยที่ถูกขังอยู่ในมัสยิด การต่อสู้ส่งผลให้เมืองทาเฉิงถูกทำลาย และชาวเมืองที่รอดชีวิตก็หนีออกจากเมืองไป

ทั้งรัฐบาลชิงในปักกิ่งและเจ้าหน้าที่คุลยาที่กำลังตกอยู่ในสถานการณ์ลำบากต่างขอความช่วยเหลือจากรัสเซียในการต่อต้านกลุ่มกบฏผ่านทางทูตรัสเซียประจำปักกิ่งอเล็กซานเดอร์ วลังกาลีและผู้บัญชาการรัสเซียในเซมิเรชเยพลเอก เกราซิม โคลปาคอฟสกีตามลำดับ อย่างไรก็ตาม รัสเซียกลับแสดงท่าทีที่ไม่ชัดเจนทางการทูต ในด้านหนึ่ง ดังที่วลังกาลีเขียนถึงเซนต์ปีเตอร์สเบิร์กการ "ปฏิเสธอย่างสิ้นเชิง" จะส่งผลเสียต่อความสัมพันธ์ของรัสเซียกับปักกิ่ง ในอีกด้านหนึ่ง นายพลรัสเซียในเอเชียกลางโดยทั่วไปรู้สึกว่าการให้ความช่วยเหลืออย่างจริงจังแก่จีนในการต่อต้านชาวมุสลิมในซินเจียงจะไม่ช่วยแก้ปัญหาของรัสเซียกับพลเมืองมุสลิมกลุ่มใหม่ของตนเอง หากการก่อกบฏประสบความสำเร็จและนำไปสู่การก่อตั้งรัฐฮุยถาวร การที่รัสเซียอยู่ฝ่ายชิงในความขัดแย้งครั้งก่อนจะไม่เป็นประโยชน์ใดๆ ต่อความสัมพันธ์กับประเทศเพื่อนบ้านใหม่นี้ ด้วยเหตุนี้ ในปี 1865 จึงมีการตัดสินใจที่เซนต์ปีเตอร์สเบิร์กที่จะหลีกเลี่ยงการให้ความช่วยเหลืออย่างจริงจังแก่ราชวงศ์ชิง นอกเหนือจากการตกลงที่จะฝึกทหารจีนในไซบีเรีย—หากพวกเขาส่งมา—และขายธัญพืชบางส่วนให้แก่ผู้ปกป้องเมืองคุลจาแบบให้เครดิต ลำดับความสำคัญหลักของรัฐบาลรัสเซียยังคงอยู่ที่การรักษาความปลอดภัยชายแดนกับจีนและป้องกันความเป็นไปได้ที่การก่อกบฏจะลุกลามเข้ามาในดินแดนของรัสเซียเอง

เมื่อพิจารณาว่าการรุกเป็นรูปแบบการป้องกันที่ดีที่สุด โคลปาคอฟสกีจึงเสนอต่อผู้บังคับบัญชาของเขาในเดือนกุมภาพันธ์ ค.ศ. 1865 ว่ารัสเซียควรจะก้าวไปไกลกว่าการป้องกันพรมแดนของตนเอง และเคลื่อนกำลังเข้าไปในพื้นที่ชายแดนของซินเจียง จากนั้นยึดครองพื้นที่ชูกูชัคคุลด์จาและคัชการ์เพื่อที่จะตั้งถิ่นฐานชาวรัสเซียในพื้นที่เหล่านั้น ทั้งหมดนี้เพื่อปกป้อง ดินแดนอื่นๆ ของจักรวรรดิ โรมานอฟ ให้ดียิ่งขึ้น อย่างไรก็ตาม เวลานั้นยังไม่เหมาะสมสำหรับการผจญภัยเช่นนั้น ดังที่รัฐมนตรีต่างประเทศกอร์ชาคอฟกล่าวไว้ การละเมิดความเป็นกลางเช่นนี้จะไม่ใช่เรื่องดี หากจีนสามารถยึดคืนจังหวัดที่ก่อกบฏได้ในที่สุด

ในขณะเดียวกัน กองกำลังชิงในหุบเขาอีลี่ก็ประสบชะตากรรมที่ไม่ดีนัก ในเดือนเมษายน ค.ศ. 1865 ป้อมปราการหุยหนิง (惠宁) (ปัจจุบันคือบายันไต้ตั้งอยู่ระหว่างอีหนิงและหุยหยวน) ตกอยู่ภายใต้การยึดครองของฝ่ายกบฏหลังจากการปิดล้อมนานสามเดือน ทหารแมนจู ซีเบ และโซลอน 8,000 นายที่ป้องกันป้อมถูกสังหารหมู่ และผู้รอดชีวิตสองคนที่ถูกตัดหูและจมูกถูกส่งไปยังหุยหยวน ซึ่งเป็นฐานที่มั่นสุดท้ายของชิงในหุบเขา เพื่อรายงานชะตากรรมของหุยหนิงให้ผู้ว่าการทราบ

เมืองฮุยหยวน (เมืองของชาวแมนจู) ส่วนใหญ่ตกอยู่ภายใต้การยึดครองของกลุ่มกบฏเมื่อวันที่ 8 มกราคม พ.ศ. 2409 ผู้อยู่อาศัยและทหารรักษาการณ์ส่วนใหญ่เสียชีวิตไปพร้อมกับกลุ่มกบฏประมาณ 700 คน หมิงซุ่ยซึ่งยังคงต่อสู้อยู่ในป้อมฮุยหยวนพร้อมกับกองกำลังที่เหลืออยู่ แต่เสบียงอาหารหมด จึงส่งคณะผู้แทนไปยังกลุ่มกบฏพร้อมของขวัญเป็นเงิน 40 ซีซี^{[ 92 ]} และ ชาเขียวสี่กล่องและเสนอที่จะยอมจำนน โดยมีเงื่อนไขว่ากลุ่มกบฏต้องรับประกันชีวิตของพวกเขาและยอมให้พวกเขายังคงจงรักภักดีต่อรัฐบาลชิง เจ้าหน้าที่ชาวแมนจู 12 คนพร้อมครอบครัวได้ออกจากป้อมปราการพร้อมกับคณะผู้แทน ชาวฮุยและชาวทารันชีได้ให้การต้อนรับพวกเขาและอนุญาตให้ผู้ลี้ภัยจากฮุยหยวนไปตั้งถิ่นฐานในยี่หนิง ("เมืองเก่า") อย่างไรก็ตาม กลุ่มกบฏไม่ยอมรับเงื่อนไขของหมิงซุ่ย แต่เรียกร้องให้เขายอมจำนนทันทีและยอมรับอำนาจของกลุ่มกบฏ เนื่องจากหมิงซุ่ยปฏิเสธข้อเสนอของพวกกบฏ พวกกบฏจึงบุกโจมตีป้อมปราการทันที ในวัน ที่ 3 มีนาคม หลังจากที่พวกกบฏบุกเข้าไปในป้อมปราการได้สำเร็จ หมิงซุ่ยได้รวบรวมครอบครัวและข้าราชบริพารไว้ในคฤหาสน์ของเขา แล้วระเบิดคฤหาสน์ทิ้ง ก่อนจะเสียชีวิตอยู่ใต้ซากปรักหักพัง นี่เป็นการสิ้นสุดการปกครองของราชวงศ์ชิงในหุบเขาอีลี่เป็นการชั่วคราว

ตามที่แหล่งข้อมูลของชาวมุสลิมระบุไว้ ทางการของราชวงศ์ชิงในคัชการ์ตั้งใจที่จะกำจัดชาวดุงกันในท้องถิ่นมาโดยตลอด และได้ดำเนินการสังหารหมู่แบบชิงลงมือในฤดูร้อนปี 1864 การที่กองกำลังชาวดุงกันในท้องถิ่นอ่อนแอลงนั้น อาจเป็นสาเหตุที่ทำให้การก่อกบฏครั้งแรกในพื้นที่นี้ไม่ประสบความสำเร็จเท่ากับในส่วนอื่นๆ ของจังหวัด แม้ว่ากลุ่มกบฏชาวดุงกันจะสามารถยึดเมืองยางิฮิสซาร์ได้ แต่ทั้งพวกเขาและชาวคีร์กีซของซิดดิก เบก ก็ไม่ สามารถบุกเข้าไปในป้อมปราการของชาวแมนจูที่อยู่นอกเมืองยางิฮิสซาร์และคัชการ์ หรือเข้าไปในเมืองคัชการ์ซึ่งเป็นเมืองมุสลิมที่มีกำแพงล้อมรอบ ซึ่งอยู่ภายใต้ การปกครองของกุ ตลุก เบกผู้ได้รับการแต่งตั้งจากราชวงศ์ชิงให้เป็นชาวมุสลิมในท้องถิ่น

เนื่องจากไม่สามารถควบคุมภูมิภาคได้ด้วยตนเอง ชาวดุงกันและชาวคีร์กีซจึงหันไปขอความช่วยเหลือจากอาลิม กูลีผู้ปกครองแห่งโคกันด์ความช่วยเหลือมาถึงในช่วงต้นปี 1865 ทั้งในรูปแบบทางจิตวิญญาณและวัตถุ ความช่วยเหลือทางจิตวิญญาณมาในรูปของบูซูร์ก โคจา (หรือที่รู้จักกันในชื่อบูซูร์ก ข่าน ) สมาชิกของตระกูลอาฟาคิส ผู้ทรงอิทธิพล ซึ่งอำนาจทางศาสนาของเขาคาดว่าจะปลุกเร้าจิตวิญญาณแห่งการต่อต้านของประชาชน เขาเป็นทายาทของประเพณีการก่อกวนในคัชกาเรียมายาวนาน โดยเป็นบุตรชายของจาฮันกีร์ โคจาและน้องชายของวาลี ข่าน โคจาความช่วยเหลือทางวัตถุ—รวมถึงช่องทางที่คาดว่าจะนำพาอิทธิพลของโคกันด์ไปยังคัชกาเรีย—ประกอบด้วยยาคูบ เบกผู้บัญชาการทหารโคกันด์หนุ่มแต่เป็นที่รู้จักกันดีอยู่แล้ว พร้อมด้วยทหารโคกันด์อีกหลายสิบคน ซึ่งต่อมาเป็นที่รู้จักในคัชกาเรียในชื่ออันดิจานิส

แม้ว่ากองทัพคีร์กีซของซิดดิก เบก จะยึดเมืองคัชการ์ซึ่งเป็นเมืองของชาวมุสลิมได้แล้วก่อนที่บูซูร์ก โคจาและยาคูบ เบกจะเดินทางมาถึง แต่เขาก็ต้องยอมให้โคจาที่เป็นที่นิยมเหล่านี้ไปตั้งรกรากอยู่ในบ้านพักของผู้ว่าการคนก่อน ( อูร์ดา ) ความพยายามของซิดดิกที่จะแสดงอำนาจเหนือกว่าถูกกองกำลังของยาคูบ เบกและบูซูร์กปราบปรามลงได้ ในที่สุดชาวคีร์กีซก็ต้องยอมรับอำนาจของยาคูบ

ด้วยกองทัพขนาดเล็กแต่ได้รับการฝึกฝนและมีระเบียบวินัยค่อนข้างดี ซึ่งประกอบด้วยชาวดุงกันและชาวเติร์กแห่งคัชการ์ (ชาวอุยกูร์ในปัจจุบัน) พันธมิตรชาวคีร์กีซ ชาวโคกันเดียนของยาคูบเอง รวมถึงทหารอีกประมาณ 200 นายที่ส่งมาจากผู้ปกครองแห่งบาดักชานยาคูบ เบกจึงสามารถยึดป้อมปราการแมนจูและเมืองคัชการ์ของชาวฮั่นได้ในปี 1865 (ผู้บัญชาการแมนจูในคัชการ์ระเบิดตัวเองตายตามปกติ) และยังสามารถเอาชนะกองกำลังที่ใหญ่กว่ามากซึ่งส่งมาจากราชีดินแห่งคูชา ผู้ซึ่งต้องการครอบครองภูมิภาคแอ่งทาริมได้อีกด้วย

ในขณะที่ยาคูบ เบก อ้างอำนาจเหนือคัชกาเรีย สถานการณ์ที่บ้านเกิดในโคกันด์ก็เปลี่ยนแปลงไปอย่างมาก ในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2408 อาลีม กูลี เสียชีวิตขณะปกป้องทาชเคนต์จากรัสเซีย ทหารของเขาจำนวนมาก (ส่วนใหญ่เป็นชาวคีร์กีซและคิปชัค ) เห็นว่าควรหนีไปยังคัชกาเรียซึ่งมีความปลอดภัยกว่า พวกเขาปรากฏตัวที่ชายแดนของอาณาเขตของยาคูบ เบก ในต้นเดือนกันยายน พ.ศ. 2408 นักรบชาวอัฟกันก็ให้ความช่วยเหลือยาคูบ เบก ด้วยเช่นกัน^{[ 93 ]} การปกครองของยาคูบ เบก ไม่เป็นที่นิยมในหมู่ชาวพื้นเมือง โดยชาวคัชกาเรียคนหนึ่งซึ่งเป็นนักรบและบุตรชายของหัวหน้าเผ่าได้แสดงความคิดเห็นว่า "ในสมัยที่จีนปกครองนั้นมีทุกอย่าง แต่ตอนนี้ไม่มีอะไรเลย" นอกจากนี้การค้าขายก็ลดลงด้วย^{[ 94 ]}

ชาวอุยกูร์ในท้องถิ่นของ Altishahr มาดู Yaqub Beg ในฐานะชาวต่างชาติของ Kokandi และเพื่อนร่วมงาน Kokandi ของเขาประพฤติตนอย่างไร้ความปราณีต่อชาวอุยกูร์ในท้องถิ่น บทกวีต่อต้าน Yaqub Beg เขียนโดย Uyghur: ^{[ 95 ]}

ชาวจีนมาจากปักกิ่ง ดุจดวงดาวบนท้องฟ้า พวกอันดิยานีลุกขึ้นหนีไป เหมือนหมูป่า พวกเขามาอย่างเปล่าประโยชน์และจากไปอย่างเปล่าประโยชน์ พวกอันดิยานี! พวกเขาจากไปอย่างหวาดกลัวและอ่อนแรง พวกอันดิยานี! ทุกวันพวกเขาลักพาตัวหญิงสาวบริสุทธิ์ และ พวกเขาออกล่าหาหญิงงาม พวกเขาเล่นกับเด็กชายนักเต้นซึ่ง กฎศักดิ์สิทธิ์ได้ห้ามไว้

ชาวมุสลิม เติร์กทารันชีในซินเจียงในตอนแรกให้ความร่วมมือกับชาวดุงกัน (ชาวฮุย) เมื่อพวกเขาก่อการกบฏ แต่ต่อมาได้ละทิ้งพวกเขาหลังจากที่ชาวฮุยพยายามจะยึดครองทั้งภูมิภาค ชาวทารันชีได้สังหารหมู่ชาวดุงกันที่คุลจาและขับไล่ที่เหลือผ่านช่องเขาทอล์กไปยังหุบเขาอิลี^{[ 96 ]} ชาวฮุยในซินเจียงไม่ได้รับความไว้วางใจจากทั้งทางการชิงและชาวมุสลิมเติร์กสถาน^{[ 97 ]}

กองกำลัง Kokandi Andijani Uzbek ของ Yaqub Beg ประกาศสงครามศักดิ์สิทธิ์ (ญิฮาด) ต่อต้านกบฏ Dungan ภายใต้การนำของ T'o Ming (Tuo Ming หรือ Daud Khalifa) การต่อสู้ปะทุขึ้นระหว่าง Dungan และกบฏ Kokandi Uzbek ในซินเจียง Yaqub Beg เกณฑ์ทหารฮั่นภายใต้การนำของXu Xuegongมาต่อสู้กับกองทัพ Dungan ภายใต้การนำของ T'o Ming กองกำลัง Dungan ของ T'o Ming พ่ายแพ้ในยุทธการที่อุรุมฉี (1870)ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของแผนการของ Yaqub Beg ในการพิชิตDzungariaและยึดครองดินแดน Dungan ทั้งหมด^{[ 98 ] [ 65 ]} มีการเขียนบทกวีเกี่ยวกับชัยชนะของกองกำลังของ Yaqub Beg เหนือชาวฮั่นและ Dungan ^{[ 99 ]} Yaqub Beg ยึดAksuจากกองกำลัง Dungan และบังคับให้พวกเขาไปทางเหนือของเทือกเขาTian Shanพร้อมทั้งสังหารหมู่ชาว Dungan (Tunganis) ^{[ 100 ]} กองกำลังติดอาวุธชาวฮั่นอิสระที่ไม่เกี่ยวข้องกับรัฐบาลชิงได้เข้าร่วมกับทั้งกองกำลังเติร์กภายใต้การนำของยาคูบ เบก และกลุ่มกบฏตุนกัน ในปี พ.ศ. 2413 ยาคูบ เบกได้นำทหารชาวฮั่น 1,500 นายร่วมกับกองกำลังเติร์กของเขาโจมตีชาวตุนกันในเมืองอูรุมฉี ปีต่อมา กองกำลังติดอาวุธชาวฮั่นได้เข้าร่วมกับชาวตุนกันในการต่อสู้กับกองกำลังเติร์ก^{[ 101 ]}

รัสเซียและอังกฤษได้ลงนามในสนธิสัญญาหลายฉบับกับระบอบการปกครองของยาคูบ เบก ในเมืองคัชการ์ โดยยาคูบพยายามที่จะได้รับการช่วยเหลือจากอังกฤษและรัสเซียสำหรับรัฐบาลของเขา

ความสัมพันธ์ระหว่างยาคูบ เบก กับจักรวรรดิรัสเซียสลับไปมาระหว่างการสู้รบและการแลกเปลี่ยนทางการทูตอย่างสันติ

ชาวรัสเซียเกลียดชังประชากรพื้นเมืองของคัชการ์เนื่องจากชนชั้นสูงของพวกเขามีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับข่านโคกันด์ซึ่งเพิ่งถูกขับไล่ออกไปในระหว่างการพิชิตเตอร์กิสถานของรัสเซีย ความเป็นปรปักษ์นี้คงจะทำลายยาคูบ เบก หากเขาแสวงหาความช่วยเหลืออย่างกว้างขวางจากพวกเขาตามที่เขาตั้งใจไว้แต่แรก^{[ 102 ]}

ทั้ง จักรวรรดิออตโตมันและจักรวรรดิอังกฤษต่างยอมรับรัฐของยาคูบ เบก และจัดหาปืนให้เขาหลายพันกระบอก นักการทูตอังกฤษโรเบิร์ต บาร์คลีย์ ชอว์และโทมัส ดักลาส ฟอร์ไซธ์ที่เดินทางไปยังคัชการ์ในปี พ.ศ. 2411 และ พ.ศ. 2413 ตามลำดับ ได้ปลุกความสนใจของอังกฤษต่อระบอบการปกครองของยาคูบ และอังกฤษได้ทำสนธิสัญญาการค้ากับเอมีร์ในปี พ.ศ. 2417 ^{[ 103 ]}

ราชวงศ์ชิงตัดสินใจยึดซินเจียงคืนในช่วงปลายทศวรรษ 1870 จั่วจงถังซึ่งก่อนหน้านี้เป็นนายพลในกองทัพเซียง เป็นผู้บัญชาการทหารสูงสุดของกองทัพชิงทั้งหมดที่เข้าร่วมในการปราบปรามกบฏครั้งนี้ ผู้ใต้บังคับบัญชาของเขาคือนายพล หลิวจินถังชาวฮั่นและนายพลจินซุนชาวแมนจู^{[ 104 ]}ขณะที่จั่วจงถังเคลื่อนพลเข้าสู่ซินเจียงเพื่อปราบปรามกบฏมุสลิมภายใต้การนำของยาคูบ เบก เขาได้รับการสนับสนุนจากนายพลหม่า อันเหลียง ชาว ตุนกัน ( ฮุย ) และนายพลตงฟู่เซียง กอง กำลังชิง เข้าสู่อูรุมฉีโดยไม่มีการต่อต้าน ผู้ใต้บังคับบัญชาของยาคูบแปรพักตร์ไปอยู่กับราชวงศ์ชิงหรือหนีไปเมื่อกองกำลังของเขาเริ่มแตกสลาย^{[ 105 ]}และโอเอซิสก็ตกอยู่ภายใต้การควบคุมของกองทัพชิงอย่างง่ายดาย^{[ 106 ]} การถอยทัพครั้งใหญ่ของกองทัพกบฏทำให้ขอบเขตการควบคุมของพวกเขาลดลงเรื่อยๆ ยาคูบ เบก สูญเสียทหารไปมากกว่า 20,000 นาย ทั้งจากการหนีทัพหรือถูกศัตรูสังหาร ในเดือนตุลาคม ค.ศ. 1877 หลังจากการเสียชีวิตของยาคูบ เบก จิน ชุน ก็เริ่มเคลื่อนทัพต่อไปและไม่พบการต่อต้านที่สำคัญใดๆ นายพลจั่วปรากฏตัวขึ้นหน้ากำแพงเมืองอักซูป้อมปราการทางตะวันออกของคัชกาเรีย และผู้บัญชาการเมืองก็ละทิ้งตำแหน่งตั้งแต่การโจมตีครั้งแรก กองทัพชิงจึงรุกคืบไปยังอุกตูร์ปันซึ่งก็ยอมจำนนโดยไม่ถูกโจมตีแม้แต่ครั้งเดียว ต้นเดือนธันวาคม กองทัพชิงทั้งหมดเริ่มการโจมตีครั้งสุดท้ายต่อเมืองหลวงของระบอบคัชกาเรีย กองกำลังกบฏพ่ายแพ้ และกองกำลังที่เหลือเริ่มถอนตัวไปยังยาร์กันต์ จากนั้นก็หนีไปยังดินแดนรัสเซีย การล่มสลายของคัชกาเรียทำให้การยึดคืนซินเจียงของชิงเสร็จสมบูรณ์ ไม่มีการก่อกบฏเกิดขึ้นอีก และทางการชิงที่จัดตั้งขึ้นใหม่ได้เริ่มดำเนินการฟื้นฟูและจัดระเบียบใหม่^{[ 107 ]}ซึ่งรวมถึงการจัดตั้งมณฑลซินเจียงในปี พ.ศ. 2427

หยางเจิ้งซินได้บันทึกการใช้ชาวมุสลิมในกองทัพชิงเพื่อต่อต้านการกบฏไว้^{[ 108 ]}

เหตุผลที่สามคือ ในช่วงต้นรัชสมัยของจักรพรรดิกวางซู ขณะที่ชาวมุสลิมเชื้อสายเติร์กกำลังก่อกบฏ กองทหารชั้นยอดทั้งห้าที่ข้าหลวงหลิวจินถังนำออกมาจากช่องเขาล้วนเป็นทหารตุนกัน [Hui dui回队] ในเวลานั้น แม่ทัพตุนกันอย่างเช่น ชุยเว่ย และฮวาต้าไฉ เป็นทหารที่ยอมจำนนและถูกโยกย้ายไปประจำการที่อื่น นี่เป็นตัวอย่างของหมากตัวเล็กๆ ที่ต่อมาได้สร้างคุณงามความดีอย่างมาก เมื่อจักรพรรดิเชินซู่หยิงทรงบัญชาการทหารในยูนนาน กองทหารและแม่ทัพมุสลิมที่พระองค์ใช้ประกอบด้วยกบฏจำนวนมาก และเป็นเพราะพวกเขานี่เองที่ทำให้การก่อกบฏของชาวมุสลิมในยูนนานสงบลง นี่เป็นตัวอย่างที่แสดงให้เห็นว่ากองทหารมุสลิมสามารถนำมาใช้ได้อย่างมีประสิทธิภาพแม้ในขณะที่การก่อกบฏของชาวมุสลิมยังคงดำเนินอยู่ ยิ่งไปกว่านั้น นับตั้งแต่การก่อตั้งสาธารณรัฐ ตุนกันก็ไม่แสดงพฤติกรรมที่ผิดพลาดแม้แต่น้อยที่จะบ่งชี้ว่าพวกเขาอาจไม่น่าเชื่อถือ

หลังจากที่จั่วจงถังยึดซินเจียงคืนมาได้ ทหารฮั่นและทหารชายชาวจีนฮั่นคนอื่นๆ รวมถึงชาวต่างชาติที่เดินทางมาจากต่างแดน ซื้อตัวหญิงสาวชาวมุสลิมเติร์ก (อุยกูร์) จากพ่อแม่ของพวกเธอมาเป็นภรรยา และชาวฮั่นกับชาวอุยกูร์มักอาศัยคนกลางชาวหุยในการแปลและจัดการเรื่องการแต่งงาน ชายชาวจีนฮั่นนามสกุลหลี่คนหนึ่งซื้อตัวหญิงสาวชาวอุยกูร์คนหนึ่งจากชายชาวอุยกูร์สองคนที่ลักพาตัวเธอไปในปี 1880 พวกเขาทั้งสองทำงานให้กับผู้พิพากษาของเมืองพีฉาน เด็กหญิงชาวอุยกูร์จากเมืองตูร์ปันชื่อรัวจางเล่อ อายุ 12 ปี ถูกขายในราคา 30 ตำลึงในปี 1889 ที่เมืองฉีไท่ ให้กับชายหนุ่มชาวจีนฮั่นจากมณฑลชานซีชื่อหลิวหยุน เธอตั้งครรภ์ลูกของเขาในปี 1892 ชายชาวจีนฮั่นมองว่าเงินที่จ่ายเป็นเหรียญเงินให้กับเจ้าสาวชาวอุยกูร์นั้นเป็นสินสอด^{[ 109 ] [ 110 ]}หญิงมุสลิมอุยกูร์แต่งงานกับชายชาวจีนฮั่นในซินเจียงในช่วงปลายศตวรรษที่ 19 และต้นศตวรรษที่ 20 ^{[ 111 ]} ชายชาวจีนฮั่น ชายชาวฮินดู ชายชาวอาร์เมเนีย ชายชาวยิว และชายชาวรัสเซียแต่งงานกับหญิงมุสลิมอุยกูร์ที่ไม่สามารถหาสามีได้^{[ 112 ]}พ่อค้าอุยกูร์จะรังแกนายทุนชาวฮินดูโดยการตะโกนถามพวกเขาว่ากินเนื้อวัวหรือไม่ หรือแขวนหนังวัวไว้ในที่พักของพวกเขา ชายอุยกูร์ยังก่อจลาจลและโจมตีชาวฮินดูที่แต่งงานกับหญิงอุยกูร์ในปี 1907 ใน Poskam และ Yarkand เช่น Ditta Ram เรียกร้องให้ตัดหัวและขว้างหินใส่พวกเขาขณะที่พวกเขามีส่วนร่วมในความรุนแรงต่อต้านชาวฮินดู^{[ 113 ]} นายทุนชาวอินเดียฮินดูที่เข้าร่วมในขบวนแห่ทางศาสนาทำให้เกิดความรุนแรงต่อพวกเขาโดยชาวมุสลิมอุยกูร์^{[ 114 ]}

เมื่อกองทัพชิงภายใต้การนำของจั่วจงถังปราบปรามการกบฏตุนกัน บุตรชายของผู้นำกบฏ ชาวมุสลิม ฮุยและซาลา เช่น หม่าเปิ่นหยวน (马本源) และหม่ากุ้ยหยวน (马桂源) ในหนิงเซี่ยกานซูและชิงไห่ถูกกรมราชสำนัก ชิงตอน เมื่ออายุครบ 11 ปี และถูกส่งไปทำงานเป็นขันทีทาสในกองทหารชิงในซินเจียง และภรรยาของผู้นำกบฏก็ถูกจับเป็นทาสเช่นกัน^{[ 116 ] [ 117 ] [ 118 ] [ 119 ]}ในบรรดาเด็กชายมุสลิม ได้แก่ หม่าซานเหอ (马三和), หม่าฉีซีซี (马七十子), หม่าซาเฉียง (马沙枪), หม่าซัว (马锁), หม่าโหยวจง (马由宗), หม่าเฟยเฟย (马飞飞), หม่า อูชิจิ่ว (马五十九), หม่า อู๋ชีหลิว (马五十六) ^{[ 120 ] [ 121 ]} Ma Jincheng ลูกชายของ Hui Naqshbandi ผู้นำMa Hualongก็ตอนเช่นกัน^{[ 122 ] [ 123 ]}กรมราชสำนักได้ทำการตอนบุตรชายทั้ง 9 คนของหม่ากุ้ยหยวนทันที เนื่องจากพวกเขามีอายุครบ 12 ปีแล้ว และถูกจับเป็นขันทีรับใช้ทหารชิงในซินเจียง หม่าเจิ้นหยวน (马侦源), หม่าเปิ่นหยวน (马本源) และภรรยาของหม่ากุ้ยหยวน (马桂源) ต่างก็ถูกจับเป็นทาสรับใช้ทหารและข้าราชการในค่ายทหารประจำจังหวัดหลังจากที่สามีถูกประหารชีวิต^{[ 124 ] [ 125 ]}หม่าหยูหลง (马玉龙) เป็นบิดาของเด็กชายหม่าซานเหอ (马三和) และหม่าจี้ปัง (继邦) หม่าติงปัง (马定邦) เป็นบิดาของหม่า ฉีซี (马七十), หม่าชาบา (马沙把), หม่าซัว (马锁) และหม่าโหย่วจง (马由宗) หม่าเฉิงหลง (马成龙) เป็นบิดาของหม่า เฟยเฟย (马飞) ลูกชายของพวกเขาทั้งหมดถูกตัดสินให้ตอน^{[ 126 ] [ 127 ] [ 128 ] [ 129 ] [ 130 ] [ 131 ]}กลุ่มกบฏมุสลิมเองก็ถูกประหารชีวิตด้วยลิ้นจี่(การหั่นอย่างช้าๆ) ในขณะที่ลูกชายของพวกเขาถูกตอน และญาติผู้หญิงของพวกเขาถูกจับเป็นทาสให้กับทหารและเจ้าหน้าที่ในค่ายทหารประจำจังหวัด^{[ 132 ]}เด็กๆ ของกบฏมุสลิมที่อายุต่ำกว่า 10 ปี ได้แก่ กาหลิว (尕六) อายุ 6 ปี กากวน (尕全) อายุ 8 ปี และหม่าเซียร์ (马希儿) ซึ่งถูกคุมขังจนกระทั่งอายุ 11 ปี แล้วถูกตอนโดยกรมราชสำนัก^{[ 133 ]}

ศพของยาคูบ เบก และอิชานา บุตรชายของเขา ถูก "เผาเป็นเถ้าถ่าน" ต่อหน้าสาธารณชน เหตุการณ์นี้สร้างความโกรธแค้นให้กับประชาชนในเมืองคัชการ์ แต่กองทัพชิงได้ปราบปรามแผนการก่อกบฏของฮาคิม ข่าน^{[ 134 ]}สมาชิกในครอบครัวของยาคูบ เบก ที่รอดชีวิต ได้แก่ บุตรชาย 4 คน หลาน 4 คน (หลานชาย 2 คน และหลานสาว 2 คน) และภรรยา 4 คน พวกเขาเสียชีวิตในคุกที่หลานโจวมณฑลกานซู หรือถูกรัฐบาลชิงสังหาร บุตรชายของเขา ยิมา คูลี, คาติ คูลี, ไมติ คูลี และหลานชาย ไอซาน อาฮุง เป็นผู้รอดชีวิตเพียงกลุ่มเดียวที่ยังมีชีวิตอยู่ในปี พ.ศ. 2422 พวกเขาทั้งหมดเป็นเด็กที่ยังไม่บรรลุนิติภาวะในเวลานั้น พวกเขาถูกนำตัวขึ้นศาลและถูกตัดสินประหารชีวิตอย่างทรมานหากพบว่าพวกเขามีส่วนร่วมในการก่อกบฏของบิดา หากพวกเขาบริสุทธิ์ พวกเขาจะถูกตัดสินให้ตอนและเป็น ทาส ขันทีให้กับกองทัพชิง ต่อมา เมื่อพวกเขามีอายุครบ 11 ปี พวกเขาจะถูกส่งตัวไปยังราชสำนักเพื่อประหารชีวิตหรือตอน^{[ 135 ] [ 136 ] [ 137 ]}ในปี พ.ศ. 2422 ได้มีการยืนยันว่าคำพิพากษาตอนได้ถูกดำเนินการแล้ว บุตรชายและหลานชายของยาคูบ เบก ถูกราชสำนักจีนตอนในปี พ.ศ. 2422 และถูกฝึกให้เป็นขันทีเพื่อทำงานในพระราชวัง^{[ 138 ]}บุตรชายและหลานชายของยาคูบ เบก ที่ถูกจับตัวไปนั้นมีอายุต่ำกว่า 10 ปี ได้แก่ ไอซิน อาหงจู (爱散阿洪俱), คาดีฮูลี (卡底胡里) และอิมาฮูลี (依玛胡里) ซึ่งมีอายุ 10 ปี ^{[ 139 ]}

เมื่อวันที่ 25 มกราคม พ.ศ. 2434 หลิว จินถังได้สร้างวัดขึ้น เขาเป็นหนึ่งในนายพลที่เข้าร่วมในการปราบปรามการกบฏของตุนกัน และในขณะนั้นเขาดำรงตำแหน่งผู้ว่าการมณฑลกานซู วัดแห่งนี้สร้างขึ้นในเมืองหลวงของมณฑลกานซูเพื่อเป็นอนุสรณ์แก่ผู้เสียชีวิตจากการกบฏของตุนกันในคัชกาเรียและจุงกาเรีย ผู้เสียชีวิตมีจำนวน 24,838 คน ซึ่งรวมถึงข้าราชการ ชาวนา และสมาชิกจากทุกชนชั้นทางสังคมและกลุ่มชาติพันธุ์ วัดนี้ได้รับการตั้งชื่อว่า ชุนอี้ฉี นอกจากนี้ยังมีการสร้างวัดอีกแห่งหนึ่งเพื่อเป็นเกียรติแก่ ทหาร กองทัพเซียงที่ต่อสู้ในระหว่างการกบฏ^{[ 140 ]}

ความล้มเหลวของการก่อกบฏนำไปสู่การอพยพของชาวฮุยบางส่วนเข้าสู่จักรวรรดิรัสเซีย ตามที่ Rimsky-Korsakoff (1992) กล่าวไว้ ชาวฮุยสามกลุ่มแยกกันอพยพหนีไปยังจักรวรรดิรัสเซียข้ามเทือกเขาเทียนซานในช่วงฤดูหนาวที่รุนแรงเป็นพิเศษของปี 1877/78:

• กลุ่มแรกของผู้คนประมาณ 1,000 คน มีพื้นเพมาจากเมืองทูร์ปันในซินเจียง และนำโดยหม่า ดาเรน (马大人) หรือที่รู้จักในชื่อหม่า ต้า-ลาว-เย (马大老爷) ไปถึงออชทางตอนใต้ของคีร์กีซสถาน
• กลุ่มที่สองจำนวน 1,130 คน เดิมทีมาจากเมืองตีเต๋าโจว (狄道州) ในมณฑลกานซู นำโดยอาหงอา เยลาโอเรน (阿爷老人) ได้เข้ามาตั้งถิ่นฐานในฤดูใบไม้ผลิปี 1878 ในหมู่บ้านยาร์ดิก ซึ่งอยู่ห่างจากเมืองคารา คอลประมาณ 15 กิโลเมตร (9.3 ไมล์) ทางตะวันออกของประเทศคีร์กีซสถาน
• กลุ่มที่สาม เดิมทีมาจากมณฑลฉานซีนำโดยไป่เหยียนหู (白彦虎; หรือสะกดว่า Bo Yanhu; 1829( ? )-1882) หนึ่งในผู้นำการก่อกบฏ ได้ตั้งถิ่นฐานในหมู่บ้านคาราคูนุซ (ปัจจุบันคือมาซานชี) ในจังหวัดจัมบิลของคาซัคสถาน มาซานชีตั้งอยู่ทางฝั่งเหนือ (คาซัค) ของแม่น้ำชู ห่าง จากเมืองทอกมัคในคีร์กีซสถานตะวันตกเฉียงเหนือไปทางเหนือ 8 กิโลเมตร (5.0 ไมล์) กลุ่มนี้มีจำนวน 3314 คนเมื่อเดินทางมาถึง

การอพยพครั้งใหม่เกิดขึ้นในช่วงต้นทศวรรษ 1880 ตามเงื่อนไขของสนธิสัญญาเซนต์ปีเตอร์สเบิร์กที่ลงนามในเดือนกุมภาพันธ์ 1881 ซึ่งกำหนดให้กองทัพรัสเซียถอนตัวออกจาก ลุ่มน้ำ อิลี ตอนบน ( พื้นที่ คุลยา ) ชาวฮุยและ ชาว ทารันชี (อุยกูร์) ในภูมิภาคนี้ได้รับอนุญาตให้เลือกย้ายไปยังฝั่งรัสเซียของชายแดน คนส่วนใหญ่เลือกตัวเลือกนั้น และตามสถิติของรัสเซีย ชาวฮุย 4,682 คนย้ายไปยังจักรวรรดิรัสเซียภายใต้สนธิสัญญา พวกเขาอพยพเป็นกลุ่มเล็กๆ หลายกลุ่มระหว่างปี 1881 ถึง 1883 ตั้งถิ่นฐานในหมู่บ้านโซกูลุก ซึ่งอยู่ห่าง จากบิชเคกไปทางตะวันตกประมาณ 30 กิโลเมตร (19 ไมล์) รวมถึงจุดต่างๆ ระหว่างชายแดนจีนและโซกูลุก ในคาซัคสถานตะวันออกเฉียงใต้และคีร์กีสถานตอนเหนือ

ลูกหลานของกลุ่มกบฏและผู้ลี้ภัยเหล่านี้ยังคงอาศัยอยู่ในคีร์กีสถานและบางส่วนของประเทศใกล้เคียง ได้แก่ รัสเซีย คาซัคสถาน ทาจิกิสถาน และอุซเบกิสถาน พวกเขายังคงเรียกตัวเองว่าชาวฮุย ( Huizu ) แต่สำหรับคนภายนอก พวกเขาเป็นที่รู้จักในชื่อตุนกัน ซึ่งหมายถึง "กานซูตะวันออก" ในภาษาจีน

หลังจากความแตกแยกระหว่างจีนและโซเวียตนักเขียนโฆษณาชวนเชื่อของโซเวียต เช่น ไรส์ อับดุลคาโควิช ตุซมูคาเมดอฟ เรียกการกบฏของชาวดุงกัน (พ.ศ. 2405–2420) ว่าเป็น "ขบวนการปลดปล่อยชาติ" เพื่อจุดประสงค์ทางการเมืองของพวกเขา^{[ 141 ]}

การก่อกบฏทำให้เหล่าขุนพลและทหารของฮุยในจักรวรรดิชิงมีอำนาจมากขึ้น ขุนพลฮุยหลายคนที่เข้าร่วมในการรบได้รับการเลื่อนตำแหน่งจากจักรพรรดิ รวมถึงหม่าอันเหลียงและตงฟู่เซียงซึ่งทำให้กองทัพฮุยต้องต่อสู้อีกครั้งในการกบฏตุนกัน (ค.ศ. 1895-1896)กับพวกกบฏ และในการกบฏบ็อกเซอร์กับกองทัพตะวันตก นักรบมุสลิมแห่งกานซูและพวกบ็อกเซอร์ได้โจมตีและสังหารชาวคริสต์จีนเพื่อแก้แค้นที่ต่างชาติโจมตีชาวจีน^{[ 142 ]}และเป็นผู้โจมตีที่ดุร้ายที่สุดในช่วงการปิดล้อมสถานทูตตั้งแต่วันที่ 20 มิถุนายนถึง 14 สิงหาคม ค.ศ. 1900 ^{[ 143 ]}

เป็นที่รู้กันว่ากบฏตุนกันมักหลีกเลี่ยงการโจมตีคริสเตียน และผู้คนต่างพากันไปหลบภัยในโบสถ์คริสเตียน ดังนั้น บางคนจึงเชื่อว่าการเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญของชาวคาทอลิกและโปรเตสแตนต์ตามฝั่งตะวันตกของแม่น้ำเหลืองในมณฑลกานซูและซานซี เป็นผลมาจากการที่ผู้คนเหล่านั้นไปหลบภัยในโบสถ์^{[ 144 ]}

หม่าฟู่เซียงหม่าฉีและหม่าปู้ฟางเป็นทายาทของทหารชาวหุยจากยุคนั้น และพวกเขากลายเป็นนายพลสำคัญที่มีตำแหน่งสูงในกองทัพปฏิวัติแห่งชาติของสาธารณรัฐ จีน

ขุนศึกฮุยที่สนับสนุนราชวงศ์ชิงเหล่านี้ขึ้นสู่อำนาจโดยการต่อสู้กับกบฏมุสลิม^{[ 54 ]}บุตรชายของขุนศึกมุสลิมที่แปรพักตร์จากการกบฏตุนกัน (พ.ศ. 2405–2420) ได้ช่วยราชวงศ์ชิงปราบปรามกบฏมุสลิมใน การกบฏตุนกัน ( พ.ศ. 2438–2439) ^{[ 54 ]}

หลังจากที่นายพลจั่วจงถังและกองทัพเซียงของเขาปราบปรามพวกกบฏ พวกเขาเรียกร้องให้รัสเซียคืนเมืองคุลจาในซินเจียงซึ่งพวกเขายึดครองไว้ จั่วจงถังได้แสดงจุดยืนอย่างชัดเจนในการเรียกร้องให้ทำสงครามกับรัสเซียและหวังที่จะยุติเรื่องนี้โดยการโจมตีกองกำลังรัสเซียในซินเจียง ในปี พ.ศ. 2421 ความตึงเครียดในพื้นที่เพิ่มสูงขึ้น จั่วจงถังได้ระดมกำลังทหารชิงไปยังคุลจาที่รัสเซียยึดครอง กองกำลังจีนยังได้ยิงใส่กองกำลังสำรวจของรัสเซียที่มาจากยาร์ตเวอร์นาอิก ขับไล่พวกเขาออกไป ซึ่งส่งผลให้รัสเซียต้องถอยทัพ^{[ 145 ]}

รัสเซียอยู่ในสถานะทางการทูตและการทหารที่ย่ำแย่มากเมื่อเทียบกับจีน รัสเซียเกรงกลัวภัยคุกคามจากความขัดแย้งทางทหาร ซึ่งบังคับให้พวกเขาต้องหันมาเจรจาทางการทูตแทน^{[ 146 ]}

หวันหยานชงโหวถูกส่งไปรัสเซียเพื่อเจรจาสนธิสัญญา แต่ถึงแม้จีนจะอยู่ในตำแหน่งการเจรจาที่แข็งแกร่งกว่าสนธิสัญญาลิวาเดีย ที่ได้กลับ ไม่เป็นผลดีต่อจีนอย่างมาก โดยให้รัสเซียได้ส่วนหนึ่งของอิลิ สิทธิพิเศษนอกอาณาเขต สถานกงสุล การควบคุมการค้า และค่าชดเชย หลังจากนั้นก็เกิดความวุ่นวายครั้งใหญ่ในหมู่นักปราชญ์จีน และพวกเขาเรียกร้องให้รัฐบาลระดมกำลังทหารต่อต้านรัสเซีย รัฐบาลจึงดำเนินการหลังจากนั้น โดยมอบตำแหน่งสำคัญให้กับเจ้าหน้าที่จากกองทัพเซียง ชาร์ลส์ กอร์ดอนกลายเป็นที่ปรึกษาของจีน^{[ 147 ]}

รัสเซียปฏิเสธที่จะเจรจาใหม่เว้นแต่จะไว้ชีวิตชงโฮ่ว จีนไม่ต้องการยอมรับสนธิสัญญาลิวาเดียและไม่สนใจที่จะต่อสู้กันอีกครั้ง จึงไม่มีทางเลือกอื่นนอกจากต้องปฏิบัติ ตาม เจิ้งจี้เจ๋อจึงกลายเป็นผู้เจรจาคนใหม่ และถึงแม้จะมีความไม่พอใจอย่างมากต่อเงื่อนไขเดิม แต่สนธิสัญญาเซนต์ปีเตอร์สเบิร์ก ที่ได้ออกมา ก็แตกต่างกันเพียงเล็กน้อย คือ จีนยังคงควบคุมอิหลี่เกือบทั้งหมด แต่ค่าชดเชยสูงขึ้น^{[ 148 ]}

เนย์ เอเลียสเดินทางผ่านพื้นที่ที่มีการก่อกบฏ^{[ 149 ] [ 150 ]}

ในช่วงการกบฏตุนกัน ชาวมุสลิมฮุยในเมืองซีอาน (มณฑลฉานซี) ไม่ได้ก่อกบฏต่อราชวงศ์ชิงและปฏิเสธที่จะเข้าร่วมกับกลุ่มกบฏ ในขณะที่ชาวมุสลิมฮุยในมณฑลกานซูภายใต้การนำของแม่ทัพหม่าจ้านอ้าวได้ก่อกบฏ และหม่าอันเหลียงบุตรชายของเขาก็ได้ก่อกบฏก่อนที่จะแปรพักตร์และยอมจำนนต่อราชวงศ์ชิง

ชุมชนมุสลิมฮุยแตกแยกกันในการสนับสนุนการปฏิวัติซินไห่ ในปี 1911 มุสลิมฮุยในซีอาน มณฑลฉานซี สนับสนุนฝ่ายปฏิวัติ ในขณะที่มุสลิมฮุยในมณฑลกานซู สนับสนุนราชวงศ์ชิง มุสลิมฮุยพื้นเมือง (ชาวมุสลิม) ในซีอาน (มณฑลฉานซี) เข้าร่วมกับฝ่ายปฏิวัติชาวจีนฮั่นในการสังหารหมู่ชาวแมนจูทั้งหมด 20,000 คนในเมืองซีอาน^{[ 151 ] [ 152 ] [ 153 ]}มุสลิมฮุยพื้นเมืองในมณฑลกานซู นำโดยนายพลหม่าอันเหลียง เข้าข้างราชวงศ์ชิงและเตรียมโจมตีฝ่ายปฏิวัติที่ต่อต้านราชวงศ์ชิงในเมืองซีอาน มีเพียงชาวแมนจูผู้มั่งคั่งบางส่วนที่ได้รับการไถ่ตัวและสตรีชาวแมนจูเท่านั้นที่รอดชีวิต ชาวจีนฮั่นผู้มั่งคั่งจับตัวหญิงสาวชาวแมนจูไปเป็นทาส^{[ 154 ]}และทหารชาวจีนฮั่นผู้ยากจนจับตัวหญิงสาวชาวแมนจูไปเป็นภรรยา^{[ 155 ]}เด็กสาวชาวแมนจูหน้าตาดีก็ถูกชาวมุสลิมฮุยแห่งซีอานจับตัวไปในระหว่างการสังหารหมู่และเลี้ยงดูในฐานะชาวมุสลิม^{[ 156 ]}

• การก่อจลาจลของดังก์แกน (ค.ศ. 1895–1896)
• ศาสนาอิสลามในสมัยราชวงศ์ชิง
• รายชื่อการกบฏในประเทศจีน
• กบฏไท่ผิง
• กบฏเนียน
• การกบฏของชาวเหมียว (ค.ศ. 1854–1873)
• การกบฏปันธาย
• สงครามระหว่างเผ่าปุนติและฮักกา
• สงครามเนปาล-ทิเบต

ทั่วไป

• คิม โฮดง , "สงครามศักดิ์สิทธิ์ในจีน: การปฏิวัติมุสลิมและรัฐในเอเชียกลางของจีน ค.ศ. 1864–1877"สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยสแตนฟอร์ด (มีนาคม 2547) ISBN 0-8047-4884-5(สามารถค้นหาข้อความได้บน Amazon.com)
• บรูซ เอลเลแมน, "สงครามจีนสมัยใหม่ (สงครามและประวัติศาสตร์)". 2001, ISBN 0-415-21474-2(หน้า 65- ส่วนที่กล่าวถึง "การกบฏของชาวตุนกัน ค.ศ. 1862–73")

ภูมิหลัง และสงครามในมณฑลฉานซี-กานซู

• Jonathan N. Lipman, "คนแปลกหน้าที่คุ้นเคย: ประวัติศาสตร์ของชาวมุสลิมในภาคตะวันตกเฉียงเหนือของจีน (การศึกษาเกี่ยวกับกลุ่มชาติพันธุ์ในประเทศจีน)", สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยวอชิงตัน (กุมภาพันธ์ 1998), ISBN 0-295-97644-6(สามารถค้นหาข้อความได้บน Amazon.com)

สงครามในซินเจียงและการมีส่วนร่วมของรัสเซีย

• บูลเจอร์, เดเมทริอุส ชาร์ลส์ เดอ คาวานาห์ (1878). ชีวิตของยาคูบ เบก: อะธาลิก กาซี และบาดาอูเลต์; อามีร์แห่งคัชการ์ . ลอนดอน: WH Allen & Co. สืบค้นเมื่อ 18 มกราคม 2012 .
• "คู่แข่งทางจักรวรรดิ: จีน รัสเซีย และพรมแดนที่พิพาทกัน" โดย ซาราห์ ซี.เอ็ม. เพน (1996) ISBN 1-56324-723-2
• "วิกฤตการณ์อีลี: การศึกษาการทูตจีน-รัสเซีย ค.ศ. 1871-1881" โดย อิมมานูเอล ชุง-เย่ว์ ซู (1966)
• VA Moiseev, "การประท้วงของชาวมุสลิมในซินเจียงและนโยบายของรัสเซีย (ค.ศ. 1864–1871)" , ใน "Россия и Китай в центральной Азии (вторая половина XIX в. – 1917 гг.)" (รัสเซียและจีนในเอเชียกลาง (ครึ่งหลังของ 19 ประมาณคริสตศักราช 1917) บาร์นาอูล สำนักพิมพ์อัซบู คา 2003 5-93957-025-9

การอพยพของชาวดันแกน

• Svetlana Rimsky-Korsakoff Dyer. Karakunuz: การตั้งถิ่นฐานยุคแรกของชาวมุสลิมจีนในรัสเซียพร้อมด้วยคำแปลภาษาอังกฤษของงานของ V. Tsibuzgin และ A. Shmakov. "Asian Folklore Studies", Vol. 51 (1992), หน้า 243–279.
• หมู่บ้านฉานซีในคาซัคสถาน (Chinabroadcast.cn)

• สื่อที่เกี่ยวข้องกับการปฏิวัติ Dunganที่วิกิมีเดียคอมมอนส์