หลังจากความล้มเหลวของการลุกฮือของชาวตาตาร์บูนารีสหภาพโซเวียตได้ส่งเสริมเขตปกครองตนเองมอลโดวา ที่เพิ่งก่อตั้งขึ้นใหม่ ภายใน สาธารณรัฐสังคมนิยม โซเวียตยูเครนบนดินแดนบางส่วนระหว่าง แม่น้ำ ดนีสเตอร์และแม่น้ำบูก ให้เป็น สาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตปกครองตนเองมอลโดวา (Moldavian ASSR) เมื่อวันที่ 12 ตุลาคม พ.ศ. 2467 โดยมีจุดประสงค์หลักเพื่อสนับสนุนความพยายามในการโฆษณาชวนเชื่อของโซเวียตในเบสซาราเบีย แต่ยังเพื่อกดดันบูคาเรสต์ในการเจรจาเกี่ยวกับเบสซาราเบีย และแม้กระทั่งเพื่อช่วยให้เกิดการปฏิวัติคอมมิวนิสต์ที่อาจเกิดขึ้นในโรมาเนีย^{[ 3 ]}

เมื่อวันที่ 24 สิงหาคม พ.ศ. 2482 สหภาพโซเวียตและนาซีเยอรมนีได้ลงนามในสนธิสัญญาไม่รุกรานกันเป็นเวลา 10 ปี ซึ่งรู้จักกันอย่างเป็นทางการในชื่อสนธิสัญญาโมโลตอฟ-ริบเบนทรอป อย่างไรก็ตาม สนธิสัญญานี้มีพิธีสารลับ ซึ่งเปิดเผยหลังจากเยอรมนีพ่ายแพ้ในปี พ.ศ. 2488 เท่านั้น โดยระบุว่ารัฐต่างๆ ใน ยุโรป เหนือและยุโรปตะวันออก ถูกแบ่งออกเป็น เขตอิทธิพลของเยอรมนีและสหภาพโซเวียตพิธีสารลับนี้กำหนดให้จังหวัดเบสซาราเบีย ซึ่งในขณะนั้นอยู่ภายใต้การควบคุมของโรมาเนีย อยู่ใน "เขตอิทธิพล" ของสหภาพโซเวียต^{[ 4 ]}หลังจากนั้น ทั้งสหภาพโซเวียตและเยอรมนีได้รุกรานดินแดนส่วนของตนในโปแลนด์^{[ 5 ]}ในขณะที่สหภาพโซเวียตเข้ายึดครองและผนวกดินแดนลิทัวเนียเอสโตเนียและลัตเวียในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2483 พร้อมกับทำสงครามกับฟินแลนด์^{[ 6 ]}

เมื่อวันที่ 26 มิถุนายน พ.ศ. 2483 สี่วันหลังจากสิ้นสุดยุทธการฝรั่งเศสสหภาพโซเวียตได้ออกคำขาดต่อราชอาณาจักรโรมาเนียโดยเรียกร้องให้โรมาเนียยกดินแดนเบสซาราเบียและบูโควินาให้^{[ 7 ]}หลังจากที่โซเวียตตกลงกับเยอรมนีว่าจะจำกัดการอ้างสิทธิ์ในบูโควินา ซึ่งอยู่นอกเหนือ พิธีสารลับของ สนธิสัญญาโมโลตอฟ-ริบเบนทรอปไว้เฉพาะบูโควินาตอนเหนือ เยอรมนีจึงเร่งเร้าให้โรมาเนียยอมรับคำขาด ซึ่งโรมาเนียก็ยอมรับในอีกสองวันต่อมา^{[ 8 ]}เมื่อวันที่ 28 มิถุนายน กองทัพโซเวียตได้เข้าสู่พื้นที่ และเมื่อวันที่ 9 กรกฎาคม สาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตมอลโดวาได้ก่อตั้งขึ้นและยื่นคำร้องต่อสภาสูงสุดเพื่อผนวกเข้ากับสหภาพโซเวียตอย่างเป็นทางการ^{[ 9 ]}

เมื่อวันที่ 2 สิงหาคม พ.ศ. 2483 สภาโซเวียตสูงสุดได้อนุมัติการยุบ ASSR ของมอลโดวาเดิมอย่างเป็นเอกฉันท์ พร้อมทั้งจัดตั้ง SSR ของมอลโดวาขึ้นใหม่ SSR ใหม่นี้ประกอบด้วย 6 เขตปกครองเต็ม และส่วนเล็ก ๆ ของอีก 3 เขตปกครองของ มอลโดวาใน เบสซาราเบีย (ประมาณ 65 เปอร์เซ็นต์ของดินแดนทั้งหมด) รวมกับ 6 เขต ทางตะวันตกสุด ของ ASSR มอลโดวา (ประมาณ 40 เปอร์เซ็นต์ของดินแดนทั้งหมด) ^{[ 10 ] [ 11 ]}เมื่อพิจารณาว่า 90 เปอร์เซ็นต์ของดินแดนของ MSSR ตั้งอยู่ทางตะวันตกของแม่น้ำดนีสเตอร์ซึ่งเคยเป็นพรมแดนระหว่างสหภาพโซเวียตและโรมาเนียก่อนปี พ.ศ. 2483 และ 10 เปอร์เซ็นต์อยู่ทางตะวันออก ส่วนทางเหนือและทางใต้ของดินแดนที่สหภาพโซเวียตยึดครองในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2483 (ปัจจุบันคือแคว้นเชอร์นิฟซีและบุดยัค ) ซึ่งมีความหลากหลายทางชาติพันธุ์มากกว่า ถูกโอนไปยัง SSR ยูเครน แม้ว่าประชากรในดินแดนเหล่านั้นจะรวมถึงชาวมอลโดวา 337,000 คนก็ตาม^{[ 10 ]}ด้วยเหตุนี้ ชายฝั่งทะเลดำและแนวชายฝั่งแม่น้ำดานูบซึ่งมีความสำคัญทางยุทธศาสตร์จึงตกเป็นของสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตยูเครน ซึ่งถือว่ามีความน่าเชื่อถือมากกว่าสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตมอลโดวา ซึ่งโรมาเนียอาจอ้างสิทธิ์ได้^{[ 12 ]}ในฤดูร้อนปี 1941 โรมาเนียเข้าร่วมกับฝ่ายอักษะของฮิตเลอร์ในการรุกรานสหภาพโซเวียตยึดเบสซาราเบียและบูโควินาเหนือคืนมา และยังยึดครองดินแดนทางตะวันออกของแม่น้ำดนีสเตอร์ ซึ่งถูกเรียกว่า "ทรานส์นิสเตรีย " กองกำลังพลพรรคฝ่ายสนับสนุนโซเวียตยังคงเคลื่อนไหวอยู่ในทั้งสองภูมิภาค เมื่อสิ้นสุดสงครามโลกครั้งที่สองสหภาพโซเวียตได้ยึดดินแดนที่สูญเสียไปทั้งหมดคืนมา และฟื้นฟูอำนาจของโซเวียตในที่นั้น

เมื่อระบอบการปกครองของนิกิตา ครุสชอฟเข้ามาแทนที่ระบอบของโจเซฟ สตาลินผู้รอดชีวิตจาก ค่าย กูลากและผู้ถูกเนรเทศก็ค่อยๆ ได้รับอนุญาตให้กลับไปยังสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตมอลโดวา การผ่อนคลายทางการเมืองยุติอำนาจที่ไร้การควบคุมของNKVDและMGBและระบบเศรษฐกิจแบบวางแผนจากส่วนกลางได้ก่อให้เกิดการพัฒนาในด้านต่างๆ เช่น การศึกษา เทคโนโลยีและวิทยาศาสตร์ การดูแลสุขภาพ และอุตสาหกรรม

ระหว่างปี 1969 ถึง 1971 กลุ่มปัญญาชนหนุ่มหลายคนในคีชีเนา นำโดยมิไฮล์ มุนเตียนู ได้ก่อตั้ง แนวร่วมรักชาติแห่งชาติ ขึ้นอย่างลับๆ โดยให้คำมั่นว่าจะต่อสู้เพื่อการแยกตัวของมอลโดวาออกจากสหภาพโซเวียตและรวมกับโรมาเนีย

ในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2514 หลังจากบันทึกข้อมูลจาก Ion Stănescu ประธานสภาความมั่นคงแห่งรัฐของสาธารณรัฐสังคมนิยมโรมาเนียถึงYuri Andropovหัวหน้า KGB ผู้นำสามคนของแนวร่วมรักชาติแห่งชาติได้แก่Alexandru Usatiuc-Bulgăr , Gheorghe GhimpuและValeriu Graurรวมทั้งบุคคลที่สี่Alexandru Șoltoianuผู้นำของขบวนการลับที่คล้ายกันในบูโควิ นาเหนือ ถูกจับกุมและต่อมาถูกตัดสินจำคุกเป็นเวลานาน^{[ 18 ]}

ในช่วงทศวรรษ 1970 และ 1980 มอลโดวาได้รับการลงทุนอย่างมากจากงบประมาณของสหภาพโซเวียตเพื่อพัฒนาโรงงานอุตสาหกรรม สถานวิทยาศาสตร์ รวมถึงที่อยู่อาศัย ในปี 1971 คณะรัฐมนตรีโซเวียตได้มีมติ "เกี่ยวกับมาตรการเพื่อการพัฒนา เมือง คิชิเนฟ ต่อไป " ซึ่งรับประกันการลงทุนมากกว่าหนึ่งพันล้านรูเบิลจากงบประมาณของสหภาพโซเวียต

การตัดสินใจในเวลาต่อมาได้นำพาความมั่งคั่งมหาศาลและผู้เชี่ยวชาญที่มีคุณสมบัติสูงจากทั่วสหภาพโซเวียตมาพัฒนาสาธารณรัฐโซเวียต การจัดสรรสินทรัพย์ของสหภาพโซเวียตเช่นนี้ได้รับอิทธิพลส่วนหนึ่งจากข้อเท็จจริงที่ว่าเลโอนิด เบรจเนฟผู้ปกครองสหภาพโซเวียตโดยพฤตินัยตั้งแต่ปี 1964 ถึง 1982 เคยดำรงตำแหน่งเลขาธิการพรรคคอมมิวนิสต์แห่งมอลโดวาตั้งแต่ปี 1950 ถึง 1952 การจัดสรรเหล่านี้ยุติลงในปี 1991 ด้วยข้อตกลงเบลาเวซาเมื่อประเทศได้รับเอกราช

แม้ว่าเบรจเนฟและเลขาธิการพรรคคอมมิวนิสต์มอลโดวาคนอื่นๆ จะประสบความสำเร็จในการปราบปรามลัทธิชาตินิยมมอลโดวา เป็นส่วนใหญ่ แต่ รัฐบาลของ มิคาอิล กอร์บาชอฟกลับส่งเสริมการฟื้นตัวของขบวนการนี้ในภูมิภาค นโยบายกลาสนอสต์และเปเรสตรอยกา ของเขา ได้สร้างเงื่อนไขที่ทำให้ความรู้สึกชาตินิยมสามารถแสดงออกได้อย่างเปิดเผย และทำให้สาธารณรัฐโซเวียตสามารถพิจารณาการปฏิรูปได้อย่างอิสระจากรัฐบาลกลาง

การผลักดันให้สาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตมอลโดวาแยกตัวเป็นอิสระจากสหภาพโซเวียตนั้น เต็มไปด้วยความขัดแย้งภายในประเทศ เนื่องจากนักเคลื่อนไหวฝ่ายอนุรักษ์นิยมในภาคตะวันออก โดยเฉพาะในเมืองติรัสปอล รวมถึงนักเคลื่อนไหวพรรคคอมมิวนิสต์ในเมืองคีชีเนา ต่างพยายามรักษาให้สาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตมอลโดวาอยู่ภายใต้การปกครองของสหภาพโซเวียตต่อไป ความสำเร็จที่สำคัญที่สุดของขบวนการชาตินิยมระหว่างปี 1988 ถึง 1989 คือ การรับรองภาษามอลโดวา อย่างเป็นทางการ เมื่อวันที่ 31 สิงหาคม 1989 โดยสภาสูงสุดแห่งมอลโดวาการประกาศความเป็นเอกภาพทางภาษาของมอลโดวาและโรมาเนียในคำนำของคำประกาศอิสรภาพ และการกลับมาใช้ ตัวอักษรละตินแบบก่อนยุคโซเวียตในปี 1990 เมื่อเป็นที่ชัดเจนว่ามอลโดวาจะแยกตัวออกไปในที่สุด กลุ่มนักเคลื่อนไหวชาตินิยมที่สนับสนุนโซเวียตในกาเกาเซียและทรานส์นิสเตรียได้ประกาศตนแยกตัวออกจากสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตมอลโดวา เพื่อที่จะยังคงอยู่ภายใต้การปกครองของสหภาพโซเวียต ต่อไป ในที่สุด สาธารณรัฐกาเกาซ์ก็ถูกผนวกเข้ากับมอลโดวาอย่างสันติในฐานะหน่วยปกครองตนเองแห่งกาเกาเซียแต่ความสัมพันธ์กับทรานส์นิสเตรียกลับแย่ลง มีการประกาศอำนาจอธิปไตยเหนือดินแดนของตนเมื่อวันที่ 23 มิถุนายน 1990

เมื่อวันที่ 17 มีนาคม 1991 ประเทศมอลโดวากลุ่มประเทศบอลติกสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตอาร์เมเนียและสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตจอร์เจียได้คว่ำบาตรการลงประชามติเกี่ยวกับสหภาพโซเวียตในปี 1991ซึ่งมีผู้เห็นด้วยถึง 98.72% โดยไม่มีการรับรองอย่างเป็นทางการใดๆ เมื่อวันที่ 23 พฤษภาคม 1991 รัฐสภามอลโดวาได้เปลี่ยนชื่อสาธารณรัฐเป็นสาธารณรัฐมอลโดวา ชาวกาเกาซ์ได้ประกาศจัดตั้งสาธารณรัฐกาเกาซ์เมื่อวันที่ 19 สิงหาคม 1990 ก่อนหน้านี้พวกเขาได้ประกาศจัดตั้งสาธารณรัฐปกครองตนเองกาเกาซ์ (Gagauz ASSR) ภายในมอลโดวาเมื่อวันที่ 12 พฤศจิกายน 1989

หลังจากการได้รับเอกราชไม่นานก็เกิดสงครามกลางเมืองในทรานส์นิสเตรียซึ่งรัฐบาลกลางในคีชีเนาต่อสู้กับกลุ่มแบ่งแยกดินแดนที่ได้รับการสนับสนุนจากกองกำลังฝ่ายโซเวียต และต่อมาได้รับการสนับสนุนจากกองกำลังต่างๆ จากรัสเซียความขัดแย้ง นี้ ทำให้ระบอบการปกครองที่แยกตัวออกมา ( สาธารณรัฐมอลโดวาพรีดเนสโตรเวีย ) เข้าควบคุมทรานส์นิสเตรีย ซึ่งสถานการณ์นี้ยังคงดำเนินมาจนถึงปัจจุบันสหภาพโซเวียตล่มสลายในวันที่ 26 ธันวาคม 1991 และมอลโดวาได้รับการยอมรับอย่างเป็นทางการว่าเป็นรัฐเอกราช

ตั้งแต่ช่วงต้นทศวรรษ 1950 รัฐบาลได้ค่อยๆ ละทิ้งมาตรฐานภาษาที่อิงตามภาษาเบสซาราเบียนกลาง ซึ่งได้รับการกำหนดให้เป็นภาษาทางการในสมัยสาธารณรัฐสังคมนิยม ปกครองตนเองมอลโดวา และหัน มาใช้มาตรฐานภาษาโรมาเนียแทน ด้วยเหตุนี้มิไฮ เอมิเนสคูและวาซิเล อเล็กซานดรี จึง ได้รับอนุญาตให้กลับมาดำรงตำแหน่งอีกครั้ง และภาษาเขียนมาตรฐานจึงกลายเป็นภาษาเดียวกับภาษาโรมาเนีย ยกเว้นว่าเขียนด้วยอักษรซีริลลิก

การเข้าถึงผลงานของนักเขียนชาวโรมาเนียที่เกิดนอกอาณาจักรโมลดาเวีย ในยุคกลาง นั้นถูกจำกัด เช่นเดียวกับผลงานของนักเขียนอย่าง Eminescu, Mihail Kogălniceanu , Bogdan Petriceicu HasdeuและConstantin Stereที่ส่งเสริมความรู้สึกชาตินิยมโรมาเนีย อย่างไรก็ตาม การติดต่อกับโรมาเนียไม่ได้ถูกตัดขาด และหลังจากปี 1956 ผู้คนก็ค่อยๆ ได้รับอนุญาตให้ไปเยี่ยมหรือรับญาติในโรมาเนียได้ สื่อสิ่งพิมพ์ของโรมาเนียก็เข้าถึงได้ง่ายขึ้น และสามารถรับชมรายการโทรทัศน์และวิทยุของโรมาเนียข้ามพรมแดนได้อย่างสะดวก ถึงกระนั้น พรมแดนโซเวียต-โรมาเนียตามแนว แม่น้ำ ปรุตซึ่งแบ่งเบสซาราเบียออกจากโรมาเนีย ก็ยังคงปิดไม่ให้ประชาชนทั่วไปเข้าออก

ลัทธิชาตินิยมเล็กน้อยที่มีอยู่ในชนชั้นสูงของมอลโดวาปรากฏให้เห็นในบทกวีและบทความในวารสารวรรณกรรม ก่อนที่ผู้เขียนจะถูกกำจัดในการรณรงค์ต่อต้าน "ความรู้สึกต่อต้านโซเวียต" และ "ลัทธิชาตินิยมท้องถิ่น" ที่จัดโดยโบดิอูลและกรอสซู^{[ 32 ]}

จุดยืนอย่างเป็นทางการของรัฐบาลโซเวียตคือวัฒนธรรมมอลโดวาแตกต่างจากวัฒนธรรมโรมาเนียแต่พวกเขามีนโยบายที่สอดคล้องกันมากกว่านโยบายก่อนหน้านี้ของสาธารณรัฐปกครองตนเองมอลโดวา^{[ 33 ]}ไม่มีการพยายามสร้างภาษามอลโดวาที่แตกต่างจากภาษาโรมาเนียอีกต่อไป ภาษาโรมาเนียเชิงวรรณกรรมที่เขียนด้วยอักษรซีริลลิกได้รับการยอมรับว่าเป็นมาตรฐานทางภาษาสำหรับมอลโดวา ความแตกต่างเพียงอย่างเดียวคือคำศัพท์ทางเทคนิคบางคำที่ยืมมาจากภาษารัสเซีย^{[ 34 ]}

ชาวมอลโดวาได้รับการสนับสนุนให้เรียนภาษารัสเซียซึ่งเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับตำแหน่งผู้นำทุกตำแหน่ง (ภาษารัสเซียมีจุดประสงค์เพื่อให้เป็นภาษากลางในการสื่อสารระหว่างกลุ่มชาติพันธุ์ในสหภาพโซเวียต) ในช่วงแรก ตำแหน่งทางการเมืองและวิชาการมักมอบให้กับสมาชิกจากกลุ่มชาติพันธุ์ที่ไม่ใช่ชาวมอลโดวา (ในปี 1946 มีเพียง 14% ของผู้นำทางการเมืองของสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตมอลโดวาที่เป็นชาวมอลโดวา) แม้ว่าสถานการณ์นี้จะค่อยๆ เปลี่ยนแปลงไปเมื่อเวลาผ่านไป

หลังสงครามโลกครั้งที่สอง ชาวรัสเซียและยูเครนจำนวนมาก รวมถึงกลุ่มชาติพันธุ์อื่นๆ อีกจำนวนหนึ่ง ได้อพยพจากส่วนอื่นๆ ของสหภาพโซเวียตไปยังมอลโดวา เพื่อช่วยฟื้นฟูเศรษฐกิจที่เสียหายอย่างหนักจากสงคราม พวกเขาส่วนใหญ่เป็นคนงานโรงงานและคนงานก่อสร้างที่ตั้งรกรากอยู่ในเขตเมืองใหญ่ๆ รวมถึงบุคลากรทางทหารที่ประจำการอยู่ในภูมิภาคนี้ จากมุมมองทางสังคมและเศรษฐกิจ กลุ่มนี้มีความหลากหลายมาก นอกเหนือจากคนงานอุตสาหกรรมและคนงานก่อสร้างแล้ว ยังรวมถึงนายทหารและทหารเกษียณอายุของกองทัพโซเวียต วิศวกร ช่างเทคนิค นักวิทยาศาสตร์จำนวนหนึ่ง แต่ส่วนใหญ่เป็นแรงงานที่ไม่มีคุณวุฒิ

การเข้าถึงตำแหน่งในฝ่ายบริหารและเศรษฐกิจของชาวเบสซาราเบียพื้นเมืองนั้นมีจำกัด เนื่องจากพวกเขาถูกมองว่าไม่น่าไว้วางใจ ชาวพื้นเมืองคนแรกที่ได้เป็นรัฐมนตรีในสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตมอลโดวาคือรัฐมนตรีว่าการกระทรวงสาธารณสุขในช่วงทศวรรษ 1960 ความขัดแย้งระหว่าง "ชาวพื้นเมือง" และ "ผู้มาใหม่" ยังคงมีอยู่จนกระทั่งสหภาพโซเวียตล่มสลาย และเห็นได้ชัดเจนในช่วงเหตุการณ์ต่อต้านโซเวียตและต่อต้านคอมมิวนิสต์ตั้งแต่ปี 1988 ถึง 1992 ^{[ 35 ] [ 36 ]}การอพยพส่วนใหญ่ส่งผลกระทบต่อเมืองต่างๆ ในเบสซาราเบีย บูโควินาเหนือ รวมถึงชนบทของบุดยัคซึ่งชาวเยอรมันเบสซาราเบียเคยอาศัยอยู่ แต่ยังรวมถึงเมืองต่างๆ ในทรานส์นิสเตรียด้วย ทั้งหมดนี้ทำให้สัดส่วนของชาวมอลโดวาค่อยๆ ลดลงตลอดช่วงการปกครองของโซเวียต