อ่าน 3 นาที
เซโดลิซิน
ตระกูลเซโดลิซิน ( MEROPS S53) ของเปปติเดสเป็นตระกูลของเซรินโปรตีเอสที่มีโครงสร้างเกี่ยวข้องกับ ตระกูล ซับทิลิซิน (S8) สมาชิกที่รู้จักกันดีในตระกูลนี้ ได้แก่ เซโดลิซิน...
เซโดลิซิน
| โดเมน S8/S53 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||
| ตัวระบุ | |||||||
| เครื่องหมาย | เปปติเดส_เอส8 | ||||||
| พีแฟม | PF00082 | ||||||
| อินเตอร์โปร | IPR000209 | ||||||
| โปรไซต์ | PDOC00125 | ||||||
| แคท | 1GA6 | ||||||
| สโคป2 | 1GA6 / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| ซีดีดี | ซีดี07477 | ||||||
| |||||||
ตระกูลเซโดลิซิน ( MEROPS S53) ของเปปติเดสเป็นตระกูลของเซรินโปรตีเอสที่มีโครงสร้างเกี่ยวข้องกับ ตระกูล ซับทิลิซิน (S8) สมาชิกที่รู้จักกันดีในตระกูลนี้ ได้แก่ เซโดลิซิน ("ซูโดโมนาลิซิน") ที่พบใน แบคทีเรีย ซูโดโมนาส แซนโทโมนาลิซิน ("เซโดลิซิน-บี") ฟิซาโรลิซิน รวมถึง ไตร เปปติลเปปติเดส I ของสัตว์ นอกจากนี้ยังรู้จักกันในชื่อเซโดลิซินหรือเซรินคาร์บอก ซิลเปปติเด ส กลุ่มเอนไซม์นี้มีรูปแบบที่แตกต่างกันในไตรแอดเร่งปฏิกิริยา : ต่างจาก S8 ที่ใช้ Ser-His-Asp กลุ่มนี้ใช้ Ser-Glu-Asp โดยมีกรดแอสปาร์ติกเพิ่มเติมคือ Asp ในช่องออกซิแอนไอออน[ 1 ]
ค่า pH ที่เหมาะสมของพวกมันอยู่ที่ประมาณ 3 สมาชิกส่วนใหญ่ในกลุ่มนี้ผลิตเป็นโปรตีนตั้งต้นที่มีเปปไทด์ที่ปลาย N ( InterPro : IPR015366 ) และบางครั้งก็มีเปปไทด์ที่ปลาย C ที่ต้องตัดออก[ 2 ]
สมาชิกในครอบครัว
เซโดลิซิน
เซโดลิซิน ( P42790 , ซูโดโมแนปซิน , เซโดไลซิน ) เป็นเซรินโปรตีเอส มันถูกหลั่งโดยPseudomonas sp. 101 มันทำการไฮโดรไลซิสของโซ่ B ของอินซูลินที่ -Glu 13 -Ala-, -Leu 15 -Tyr- และ -Phe 25 -Tyr- และแองจิโอเทนซิน Iที่ -Tyr 4 -Ile- สารตั้งต้นสังเคราะห์ที่ดีคือ Lys-Pro-Ile-Glu-Phe-Phe(NO )-Arg-Leu [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
แซนโทโมนาลิซิน
| แซนโทโมนาลิซิน | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||||
| หมายเลข EC | 3.4.21.101 | ||||||||
| หมายเลข CAS | 113356-29-9 | ||||||||
| ฐานข้อมูล | |||||||||
| อินท์เอ็นซ์ | มุมมองของ IntEnz | ||||||||
| เบรนด้า | เบรนด้าเข้าร่วม | ||||||||
| เอ็กซ์แพซี่ | มุมมองของ NiceZyme | ||||||||
| เคกก์ | รายการ KEGG | ||||||||
| เมตาไซค์ | วิถีการเผาผลาญ | ||||||||
| ไพรแอม | ประวัติโดยย่อ | ||||||||
| โครงสร้างPDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Xanthomonalisin ( Q60106 ) พบใน แบคทีเรีย Xanthomonasทำหน้าที่สลายซีซินและทำให้เกิดการจับตัวเป็นก้อนของนม[ 7 ] [ 8 ]
ฟิซาโรลิซิน
| ฟิซาโรลิซิน | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||||
| หมายเลข EC | 3.4.21.103 | ||||||||
| หมายเลข CAS | 94949-28-7 | ||||||||
| ฐานข้อมูล | |||||||||
| อินท์เอ็นซ์ | มุมมองของ IntEnz | ||||||||
| เบรนด้า | เบรนด้าเข้าร่วม | ||||||||
| เอ็กซ์แพซี่ | มุมมองของ NiceZyme | ||||||||
| เคกก์ | รายการ KEGG | ||||||||
| เมตาไซค์ | วิถีการเผาผลาญ | ||||||||
| ไพรแอม | ประวัติโดยย่อ | ||||||||
| โครงสร้างPDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
ฟิซาโรลิซิน ( Q8MZS4 , ฟิซาโรเปปซิน ) เป็นเอนไซม์ที่ทำให้เกิดการจับตัวเป็นก้อนของนม โดยแสดงการตัด Gly 8 -Ser ในโซ่ B ของอินซูลินอย่างรวดเร็วที่สุด ตามด้วย Leu 11 !Val, Cys(SO H) 19 -Gly และ Phe 24 -Phe [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]
มีความพิเศษตรงที่ปรับตัวเข้ากับความเย็นได้ มันถูกค้นพบในราเมือกPhysarum flavicomumโปรตีนที่คล้ายกัน ( InterPro : IPR017001 ) ยังพบในอาร์เคียอีกด้วย[ 14 ]
เอกสารอ้างอิง
- ^ "ตระกูล S53: สรุป" . MEROPS - ฐานข้อมูลเปปติเดส .
- ^ Oda K (มกราคม 2012). "ตระกูลใหม่ของคาร์บอกซิลเปปติเดส: เซรีน-คาร์บอกซิลเปปติเดสและกลูตามิกเปปติเดส"วารสารชีวเคมี 151 ( 1): 13– 25. doi : 10.1093/jb/mvr129 . PMID 22016395 .
- ^ Oda K, Sugitani M, Fukuhara K, Murao S (มีนาคม 1987). "การทำให้บริสุทธิ์และคุณสมบัติของคาร์บอกซิลโปรตีเอสที่ไม่ไวต่อเปปสแตตินจากแบคทีเรียแกรมลบ" Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects . 923 (3): 463– 469. doi : 10.1016/0304-4165(87)90055-9 . PMID 3548827 .
- ^ Oda K, Nakatani H, Dunn BM (เมษายน 1992). "ความจำเพาะของสารตั้งต้นและคุณสมบัติจลนศาสตร์ของคาร์บอกซิลโปรตีเอสที่ไม่ไวต่อเปปสแตตินจาก Pseudomonas sp. หมายเลข 101" Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - โครงสร้างโปรตีนและเอนไซม์วิทยาโมเลกุล 1120 ( 2): 208– 214. doi : 10.1016/0167-4838(92)90272-f . PMID 1562589 .
- ^ Wlodawer A, Li M, Dauter Z, Gustchina A, Uchida K, Oyama H และคณะ (พฤษภาคม 2544). "คาร์บอกซิลโปรตีเอสจาก Pseudomonas กำหนดตระกูลใหม่ของเอนไซม์คล้ายซับทิลิซิน" Nature Structural Biology . 8 (5): 442– 446. doi : 10.1038/87610 . PMID 11323721 . S2CID 16793101 .
- ^ Wlodawer A, Li M, Gustchina A, Oyama H, Dunn BM, Oda K (2003). "คุณสมบัติเชิงโครงสร้างและเอนไซม์ของตระกูลเซโดลิซินของเซริน-คาร์บอกซิลเปปติเดส" Acta Biochimica Polonica 50 ( 1): 81– 102. doi : 10.18388/abp.2003_3716 . PMID 12673349 .
- ^ Oda K, Nakazima T, Terashita T, Suzuki KI, Murao S (1987). "การทำให้บริสุทธิ์และคุณสมบัติของโปรตีนคาร์บอกซิลโปรตีเอสที่ไม่ไวต่อS -PI (pepstatin Ac) จากแบคทีเรีย Xanthomonas sp." . Agric. Biol. Chem . 51 (11): 3073– 3080. doi : 10.1271/bbb1961.51.3073 .
- ^ Wlodawer A, Li M, Gustchina A, Oyama H, Dunn BM, Oda K (2003). "คุณสมบัติเชิงโครงสร้างและเอนไซม์ของตระกูลเซโดลิซินของเซริน-คาร์บอกซิลเปปติเดส" Acta Biochimica Polonica 50 ( 1): 81– 102. doi : 10.18388/abp.2003_3716 . PMID 12673349 .
- ^ Henney HR, Tavana G (1982). "การทำให้บริสุทธิ์และคุณสมบัติบางประการของโปรตีเอสกรด (คาร์บอกซิล) ภายในเซลล์จากเซลล์แฮพลอยด์ที่กำลังแยกตัวของPhysarum flavicomum " Exp. Mycol . 6 (2): 161– 170. doi : 10.1016/0147-5975(82) 90090-1
- ^ Murakami-Murofushi K, Hiratsuka A, Ohta J (1984). "โปรตีเอสกรดชนิดใหม่จากอะมีบาแฮพลอยด์ของPhysarum polycephalumและการเปลี่ยนแปลงระหว่างการผสมพันธุ์และการแยกตัวเป็นพลาสโมเดียดิพลอยด์ในภายหลัง" . Cell Struct. Funct . 9 (3): 311– 315. doi : 10.1247/csf.9.311 .
- ^ North MJ, Whyte A (1984). "การทำให้บริสุทธิ์และลักษณะเฉพาะของโปรตีเอสกรดสองชนิดจากDictyostelium discoideum " . J. Gen. Microbiol . 130 : 123– 134. doi : 10.1099/00221287-130-1-123 .
- ^ Wlodawer A, Li M, Gustchina A, Oyama H, Dunn BM, Oda K (2003). "คุณสมบัติเชิงโครงสร้างและเอนไซม์ของตระกูลเซโดลิซินของเซริน-คาร์บอกซิลเปปติเดส" Acta Biochimica Polonica 50 ( 1): 81– 102. doi : 10.18388/abp.2003_3716 . PMID 12673349 .
- ↑นิชิอิ ดับเบิลยู, อูเอกิ ที, มิยาชิตะ อาร์, โคจิมะ เอ็ม, คิม วายที, ซาซากิ เอ็น, และคณะ (กุมภาพันธ์ 2546). "ลักษณะทางโครงสร้างและเอนไซม์ของไฟซาโรลิซิน (เดิมชื่อไฟซาโรเปปซิน) พิสูจน์ได้ว่าเป็นซีรีน-คาร์บอกซิลโปรตีเอสที่มีเอกลักษณ์เฉพาะตัว" การสื่อสารการวิจัยทางชีวเคมีและชีวฟิสิกส์301 (4): 1023– 1029. Bibcode : 2003BBRC..301.1023N . ดอย : 10.1016/s0006-291x(03) 00083-4 PMID 12589815 .
- ^ Nishii W, Kuriyama H, Takahashi K (กรกฎาคม 2546). "ยีน php ของ Physarum polycephalum เข้ารหัสเอนไซม์ serine-carboxyl peptidase ที่ปรับตัวเข้ากับความเย็นได้เฉพาะตัว คือ physarolisin II" FEBS Letters . 546 ( 2– 3): 340– 344. Bibcode : 2003FEBSL.546..340N . doi : 10.1016/S0014-5793(03)00621-5 . PMID 12832065 . S2CID 19197020 .
ลิงก์ภายนอก
- เซโดลิซิน ในฐานข้อมูล Medical Subject Headings (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
- Physarolisin ในฐานข้อมูล Medical Subject Headings (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
- Xanthomonalisinที่ US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เซโดลิซิน
ตระกูลเซโดลิซิน ( MEROPS S53) ของเปปติเดสเป็นตระกูลของเซรินโปรตีเอสที่มีโครงสร้างเกี่ยวข้องกับ ตระกูล ซับทิลิซิน (S8) สมาชิกที่รู้จักกันดีในตระกูลนี้ ได้แก่ เซโดลิซิน...
เซโดลิซิน
เซโดลิซินตัวระบุหมายเลข EC3.4.21.100หมายเลข CAS848318-58-1ฐานข้อมูลอินท์เอ็นซ์มุมมองของ IntEnzเบรนด้าเบรนด้าเข้าร่วมเอ็กซ์แพซี่มุมมองของ NiceZymeเคกก์รายการ KEGGเมตาไซค์วิถีการเผาผลาญไพรแอมประวัติโดยย่อโครงสร้างPDBRCSB PDB PDBe...
แซนโทโมนาลิซิน
แซนโทโมนาลิซินตัวระบุหมายเลข EC3.4.21.101หมายเลข CAS113356-29-9ฐานข้อมูลอินท์เอ็นซ์มุมมองของ IntEnzเบรนด้าเบรนด้าเข้าร่วมเอ็กซ์แพซี่มุมมองของ NiceZymeเคกก์รายการ KEGGเมตาไซค์วิถีการเผาผลาญไพรแอมประวัติโดยย่อโครงสร้างPDBRCSB PDB PDBe...
ฟิซาโรลิซิน
ฟิซาโรลิซินตัวระบุหมายเลข EC3.4.21.103หมายเลข CAS94949-28-7ฐานข้อมูลอินท์เอ็นซ์มุมมองของ IntEnzเบรนด้าเบรนด้าเข้าร่วมเอ็กซ์แพซี่มุมมองของ NiceZymeเคกก์รายการ KEGGเมตาไซค์วิถีการเผาผลาญไพรแอมประวัติโดยย่อโครงสร้างPDBRCSB PDB PDBe...