สำนักงานข่าวกรองกลาง

ตราสัญลักษณ์ของสำนักงานข่าวกรองกลาง
ธงของสำนักงานข่าวกรองกลาง
ศูนย์ข่าวกรองจอร์จ บุชในเมืองแลงลีย์ รัฐเวอร์จิเนีย
ภาพรวมของหน่วยงาน
ก่อตั้ง	วันที่ 18 กันยายน พ.ศ. 2490 (1947-09-18)
หน่วยงานก่อนหน้า	สำนักงานผู้ประสานงานข้อมูล[ 2 ] สำนักงานบริการเชิงกลยุทธ์ หน่วยบริการเชิงกลยุทธ์ กลุ่มข่าวกรองกลาง
พิมพ์	อิสระ (ส่วนประกอบของหน่วยงานข่าวกรอง )
สำนักงานใหญ่	ศูนย์ข่าวกรองจอร์จ บุชแลงลีย์ รัฐเวอร์จิเนีย สหรัฐอเมริกา38°57′07″N 77°08′46″W / 38.95194°N 77.14611°W / 38.95194; -77.14611
ภาษิต	(ทางการ): งานของชาติ ศูนย์กลางข่าวกรอง(ไม่เป็นทางการ):และท่านทั้งหลายจะรู้จักความจริง และความจริงจะทำให้ท่านเป็นอิสระ[ 1 ]
พนักงาน	21,575 (ประมาณการ) [ 3 ]
งบประมาณประจำปี	15 พันล้านดอลลาร์ (ณ ปี 2013) [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]
ผู้บริหารหน่วยงาน	จอห์น แรตคลิฟฟ์[ 6 ]ผู้อำนวยการ ไมเคิล เอลลิสรองผู้อำนวยการ ตำแหน่งว่าง , ที่ปรึกษาทั่วไป
แผนกผู้ปกครอง	สำนักงานประธานาธิบดีแห่งสหรัฐอเมริกา
หน่วยงานแม่	สำนักงานผู้อำนวยการข่าวกรองแห่งชาติ
หน่วยงานเด็ก	กองอำนวยการปฏิบัติการ กรมวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี สาขาสนับสนุนการปฏิบัติงาน
เว็บไซต์	cia.gov​ ciadotgov4sjwlzihbbgxnqg3xiyrg7so2r2o3lt5wz5ypk4sxyjstad.onion [ 7 ]

สำนักงานข่าวกรองกลาง ( CIA ) /ˌsiː.aɪˈeɪ/เป็นหน่วยงานข่าวกรองต่างประเทศพลเรือนของรัฐบาลกลางสหรัฐอเมริกามีหน้าที่ส่งเสริมความมั่นคงของชาติโดยการ รวบรวม และวิเคราะห์ข่าวกรองจากทั่วโลก และดำเนินการปฏิบัติการลับสำนักงานใหญ่ของหน่วยงานตั้งอยู่ที่ศูนย์ข่าวกรองจอร์จ บุชในเมืองแลงลีย์ รัฐเวอร์จิเนียและบางครั้งก็ เรียก กันว่า " แลงลีย์ " CIA เป็นสมาชิกสำคัญของชุมชนข่าวกรองสหรัฐฯ (IC) และขึ้นตรงต่อผู้อำนวยการข่าวกรองแห่งชาติมาตั้งแต่ปี 2004 โดยมุ่งเน้นการให้ข้อมูลข่าวกรองแก่ประธานาธิบดีและคณะรัฐมนตรีแม้ว่าจะให้ข้อมูลข่าวกรองแก่หน่วยงานอื่นๆ อีกหลายแห่ง รวมถึงกองทัพสหรัฐฯและพันธมิตรต่างประเทศด้วย

CIA มีผู้อำนวย การเป็นหัวหน้า และแบ่งออกเป็นหลายหน่วยงาน รวมถึงหน่วยงานวิเคราะห์และหน่วยงานปฏิบัติการแตกต่างจากสำนักงานสอบสวนกลาง (FBI) CIA ไม่มีหน้าที่บังคับใช้กฎหมายและมุ่งเน้นการรวบรวมข่าวกรองในต่างประเทศ โดยมีการรวบรวมข่าวกรองภายในประเทศอย่างจำกัด[ ^{8 ] CIA}มีหน้าที่รับผิดชอบในการประสานงาน กิจกรรม ข่าวกรองมนุษย์ (HUMINT) ทั้งหมดใน IC มีบทบาทสำคัญในการจัดตั้งหน่วยงานข่าวกรองในหลายประเทศ และให้การสนับสนุนองค์กรต่างประเทศหลายแห่ง CIA ใช้อิทธิพลทางการเมืองในต่างประเทศผ่านหน่วยปฏิบัติการกึ่งทหาร รวมถึงศูนย์กิจกรรมพิเศษนอกจากนี้ยังให้การสนับสนุนกลุ่มการเมืองและรัฐบาลต่างประเทศหลายแห่ง รวมถึงการวางแผน ประสานงาน ฝึกอบรม และดำเนินการทรมาน ตลอดจนการสนับสนุนทางเทคนิค มีส่วนเกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงระบอบการปกครอง หลายครั้ง และดำเนินการลอบสังหารผู้นำต่างประเทศตามแผน และการโจมตีของผู้ก่อการร้ายต่อพลเรือน

ในช่วงสงครามโลกครั้งที่สองหน่วยงานข่าวกรองและปฏิบัติการลับของสหรัฐฯ ดำเนินการโดยสำนักงานบริการยุทธศาสตร์ (OSS) หน่วยงานนี้ถูกยุบในปี 1945 โดยประธานาธิบดีแฮร์รี เอส. ทรูแมนซึ่งได้ก่อตั้งกลุ่มข่าวกรองกลาง (CIA) ในปี 1946 ท่ามกลางสงครามเย็น ที่ทวีความรุนแรงขึ้น พระราชบัญญัติความมั่นคงแห่งชาติปี 1947ได้จัดตั้ง CIA ขึ้น โดยมีผู้อำนวยการข่าวกรองกลาง (DCI) เป็นหัวหน้า พระราชบัญญัติสำนักงานข่าวกรองกลางปี ​​1949 ได้ยกเว้นหน่วยงานนี้จากการกำกับดูแลของรัฐสภาส่วนใหญ่ และในช่วงทศวรรษ 1950 CIA ได้กลายเป็นเครื่องมือสำคัญของนโยบายต่างประเทศของสหรัฐฯ CIA ใช้ปฏิบัติการทางจิตวิทยาต่อต้านระบอบคอมมิวนิสต์ และสนับสนุนการรัฐประหารเพื่อผลประโยชน์ของอเมริกาปฏิบัติการสำคัญที่ได้รับการสนับสนุนจาก CIA ได้แก่การรัฐประหารในอิหร่านปี 1953 การรัฐประหารในกัวเตมาลา ปี1954 การรุกราน อ่าวหมูในคิวบาปี 1961 และการรัฐประหารในชิลีปี 1973 ในปี 1975 คณะกรรมการเชิร์ชแห่งวุฒิสภาสหรัฐฯเปิดเผยปฏิบัติการที่ผิดกฎหมาย เช่นโครงการ MKUltraและCHAOSซึ่งหลังจากนั้นจึงมีการบังคับใช้การกำกับดูแลที่เข้มงวดมากขึ้น ในช่วงทศวรรษ 1980 ซีไอเอให้การสนับสนุนกลุ่มมูจาฮิดีนในอัฟกานิสถานผ่านทางหน่วยข่าวกรอง ISI ของปากีสถานและกลุ่มกบฏคอนทรา ในนิการากัว และหลังจากเหตุการณ์โจมตี 11 กันยายน 2001 ซี ไอเอก็มีบทบาทในสงครามต่อต้านการก่อการร้ายทั่วโลก

หน่วย งานนี้ตกเป็นเป้าของข้อโต้แย้งมากมายรวมถึงการใช้การลอบสังหารทางการเมืองการทรมาน การดักฟัง โทรศัพท์ภายในประเทศการโฆษณาชวนเชื่อเทคนิคการควบคุมจิตใจและการค้ายาเสพติด เป็นต้น

เมื่อมีการเสนอให้จัดตั้ง CIA จุดประสงค์คือเพื่อสร้างศูนย์กลางในการรวบรวม วิเคราะห์ ประเมิน เผยแพร่ข่าวกรองต่างประเทศ และดำเนินการปฏิบัติการลับ^{[ 9 ]}

ณ ปี 2013 CIA มีลำดับความสำคัญห้าประการ: ^{[ 3 ]}

• การต่อต้านการก่อการร้าย
• การไม่แพร่กระจายอาวุธทำลายล้างสูง
• ข้อบ่งชี้และคำเตือนสำหรับผู้กำหนดนโยบายระดับสูง
• หน่วยข่าวกรองต่อต้าน
• ข่าวกรองไซเบอร์

CIA ประกอบด้วยสำนักงานบริหารและหน่วยงานหลัก 5 หน่วยงาน:

• สำนักนวัตกรรมดิจิทัล
• สำนักวิเคราะห์
• กองอำนวยการปฏิบัติการ
• สำนักสนับสนุน
• กรมวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี

ผู้อำนวยการสำนักงานข่าวกรองกลาง (D/CIA) ได้รับการแต่งตั้งโดยประธานาธิบดีโดยได้รับการยืนยันจากวุฒิสภาและรายงานโดยตรงต่อผู้อำนวยการข่าวกรองแห่งชาติ (DNI) ในทางปฏิบัติ ผู้อำนวยการ CIA จะประสานงานกับ DNI รัฐสภาและทำเนียบขาวในขณะที่รองผู้อำนวยการ (DD/CIA)เป็นผู้บริหารภายในของ CIA และหัวหน้าเจ้าหน้าที่ฝ่ายปฏิบัติการ (COO/CIA) ซึ่งรู้จักกันในชื่อผู้อำนวยการบริหารจนถึงปี 2017 เป็นผู้นำงานประจำวัน^{[ 11 ]}ในฐานะตำแหน่งสูงสุดอันดับสามของ CIA ^{[ 12 ]}รองผู้อำนวยการได้รับการแต่งตั้งอย่างเป็นทางการโดยผู้อำนวยการโดยไม่ต้องได้รับการยืนยัน จาก วุฒิสภา^{[ 12 ] [ 13 ]}แต่เนื่องจากความคิดเห็นของประธานาธิบดีมีบทบาทสำคัญในการตัดสินใจ^{[ 13 ]}รองผู้อำนวยการจึงมักถูกพิจารณาว่าเป็นตำแหน่งทางการเมือง ทำให้หัวหน้าเจ้าหน้าที่ฝ่ายปฏิบัติการเป็นตำแหน่งอาวุโสสูงสุดที่ไม่เกี่ยวข้องกับการเมืองสำหรับเจ้าหน้าที่อาชีพของ CIA ^{[ 14 ]}

สำนักงานบริหารยังให้การสนับสนุนกองทัพสหรัฐฯรวมถึงกองบัญชาการข่าวกรองและความมั่นคงของกองทัพบกสหรัฐฯโดยการให้ข้อมูลที่รวบรวมได้ รับข้อมูลจาก องค์กร ข่าวกรองทางทหารและร่วมมือกับกิจกรรมภาคสนาม รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหารของซีไอเอมีหน้าที่รับผิดชอบการดำเนินงานประจำวันของหน่วยงาน แต่ละสาขาของหน่วยงานมีผู้อำนวยการของตนเอง^{[ 11 ]}สำนักงานกิจการทหาร (OMA) ซึ่งอยู่ภายใต้รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหาร ทำหน้าที่จัดการความสัมพันธ์ระหว่างซีไอเอและกองบัญชาการรบร่วมซึ่งผลิตและส่งมอบข่าวกรองระดับภูมิภาคและปฏิบัติการ และใช้ข่าวกรองระดับชาติที่ผลิตโดยซีไอเอ^{[ 15 ]}

กองอำนวยการวิเคราะห์ซึ่งในประวัติศาสตร์ส่วนใหญ่รู้จักกันในชื่อกองอำนวยการข่าวกรอง (DI) มีหน้าที่ช่วยเหลือ “ประธานาธิบดีและผู้กำหนดนโยบายคนอื่นๆ ในการตัดสินใจอย่างรอบรู้เกี่ยวกับความมั่นคงแห่งชาติของประเทศ” โดยการพิจารณา “ข้อมูลที่มีอยู่ทั้งหมดเกี่ยวกับประเด็นหนึ่งๆ และจัดระเบียบข้อมูลเหล่านั้นให้กับผู้กำหนดนโยบาย” ^{[ 16 ]} กองอำนวยการ นี้มีกลุ่มวิเคราะห์ระดับภูมิภาค 4 กลุ่ม กลุ่มสำหรับประเด็นข้ามชาติ 6 กลุ่ม และกลุ่มที่เน้นด้านนโยบาย การรวบรวม และการสนับสนุนบุคลากรอีก 3 กลุ่ม^{[ 17 ]}มีสำนักงานวิเคราะห์ระดับภูมิภาคที่ครอบคลุมตะวันออกใกล้และเอเชียใต้รัสเซียและยุโรป และเอเชีย แปซิฟิกละตินอเมริกาและแอฟริกา

DI ได้ก่อตั้งสำนักงานวิจัยเชิงกลยุทธ์ขึ้นในปี 1967 เจ้าหน้าที่ CIA จอห์น เพสลีย์ดำรงตำแหน่งรองหัวหน้าสำนักงาน^{[ 18 ]}สำนักงานนี้ให้การสนับสนุนการฝึกวิเคราะห์เชิงแข่งขันของทีม Bซึ่งเจาะลึกถึงภัยคุกคามจากสหภาพโซเวียต ข้อมูลที่จัดหาโดยสายลับสองหน้า "วีรบุรุษ" โอเลก เพนคอฟสกีถูกนำมาใช้โดยหน่วยงานในช่วงต้นทศวรรษ 1970 สำนักงานนี้ดำเนินการวิเคราะห์ทางทหาร เช่น อิรักมีศักยภาพที่จะเอาชนะคูเวตได้หรือไม่^{[ 19 ]}ในปี 1981 มีการกล่าวอ้างว่าสำนักงานนี้ถูกยุบเนื่องจากการปรับโครงสร้าง

กองอำนวยการปฏิบัติการมีหน้าที่รับผิดชอบในการรวบรวมข่าวกรองต่างประเทศ (ส่วนใหญ่มาจากแหล่งข่าวกรองมนุษย์ลับ) และปฏิบัติการลับ ชื่อนี้สะท้อนถึงบทบาทในการประสานงานกิจกรรมข่าวกรองมนุษย์ระหว่างหน่วยงานอื่นๆ ในชุมชนข่าวกรองของสหรัฐฯ ที่มีการดำเนินงานข่าวกรองมนุษย์ กองอำนวยการนี้ถูกสร้างขึ้นเพื่อยุติการแข่งขันกันมานานหลายปีในเรื่องอิทธิพล ปรัชญา และงบประมาณระหว่างกระทรวงกลาโหมสหรัฐฯ (DOD) และซีไอเอ แม้จะเป็นเช่นนั้น กระทรวงกลาโหมก็ประกาศในปี 2012 ถึงความตั้งใจที่จะจัดตั้งหน่วยข่าวกรองลับระดับโลกของตนเอง คือหน่วยข่าวกรองลับกลาโหม (DCS) ^{[ 20 ]}ภายใต้หน่วยงานข่าวกรองกลาโหม (DIA) ตรงกันข้ามกับความเข้าใจผิดของสาธารณชนและสื่อ บางส่วน DCS ไม่ใช่หน่วยงานข่าวกรอง "ใหม่" แต่เป็นการรวม การขยาย และการปรับแนวใหม่ของ กิจกรรมข่าวกรอง มนุษย์ ของกลาโหมที่มีอยู่ ซึ่งดำเนินการโดย DIA มานานหลายทศวรรษภายใต้ชื่อต่างๆ โดยล่าสุดคือหน่วยข่าวกรองมนุษย์กลาโหม^{[ 21 ]}

เป็นที่ทราบกันว่าหน่วยงานนี้จัดตั้งขึ้นตามภูมิภาคและประเด็นต่างๆ แต่โครงสร้างองค์กรที่แน่นอนนั้นเป็นความลับ^{[ 22 ]}

สำนักวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีจัดตั้งขึ้นเพื่อวิจัย สร้าง และบริหารจัดการด้านเทคโนโลยีและอุปกรณ์การรวบรวมข้อมูล นวัตกรรมหลายอย่างของสำนักนี้ถูกถ่ายทอดไปยังหน่วยงานข่าวกรองอื่นๆ หรือเมื่อมีความชัดเจนมากขึ้น ก็ถูกถ่ายทอดไปยังหน่วยงานทางทหาร

ตัวอย่างเช่น การพัฒนาเครื่องบินลาดตระเวนระดับสูงU-2 ดำเนินการโดยความร่วมมือกับ กองทัพอากาศสหรัฐฯภารกิจดั้งเดิมของ U-2 คือการรวบรวมข้อมูลข่าวกรองภาพ ลับ เหนือพื้นที่ต้องห้าม เช่นสหภาพโซเวียต^{[ 23 ]}

สำนักสนับสนุนมีหน้าที่ด้านการจัดองค์กรและการบริหารแก่หน่วยงานสำคัญต่างๆ รวมถึง:

• สำนักงานรักษาความปลอดภัย
• สำนักงานประชาสัมพันธ์
• สำนักงานเทคโนโลยีสารสนเทศ

สำนักนวัตกรรมดิจิทัล (DDI) มุ่งเน้นการเร่งนวัตกรรมในกิจกรรมภารกิจต่างๆ ของหน่วยงาน เป็นสำนักใหม่ล่าสุด ของหน่วยงาน สำนักงานที่ตั้งอยู่ใน แลงลีย์ รัฐเวอร์จิเนียมีภารกิจในการปรับปรุงและบูรณาการความสามารถด้านดิจิทัลและความปลอดภัยทางไซเบอร์เข้ากับการจารกรรม การต่อต้านข่าวกรอง การวิเคราะห์ทุกแหล่งข้อมูล การรวบรวมข่าวกรองจากแหล่งข้อมูลเปิด และปฏิบัติการลับของ CIA ^{[ 24 ]}โดยจัดหาเครื่องมือและเทคนิคให้กับบุคลากรปฏิบัติการเพื่อใช้ในการปฏิบัติการทางไซเบอร์ ทำงานร่วมกับ โครงสร้างพื้นฐานด้าน เทคโนโลยีสารสนเทศและฝึกฝนทักษะ ทาง ไซเบอร์^{[ 25 ]}ซึ่งหมายถึงการปรับปรุง CIA ให้พร้อมสำหรับสงครามไซเบอร์เจ้าหน้าที่ DDI ช่วยเร่งการบูรณาการวิธีการและเครื่องมือที่เป็นนวัตกรรมใหม่เพื่อเพิ่มขีดความสามารถทางไซเบอร์และดิจิทัลของ CIA ในระดับโลก และท้ายที่สุดช่วยปกป้องสหรัฐอเมริกา พวกเขายังใช้ความเชี่ยวชาญทางเทคนิคเพื่อใช้ประโยชน์จากข้อมูลลับและข้อมูลที่เปิดเผยต่อสาธารณะ (หรือที่เรียกว่าข้อมูลเปิด ) โดยใช้วิธีการเฉพาะและเครื่องมือดิจิทัลในการวางแผน เริ่มต้น และสนับสนุนการปฏิบัติการทางเทคนิคและมนุษย์ของ CIA ^{[ 26 ]}ก่อนการจัดตั้งหน่วยงานดิจิทัลใหม่ ศูนย์ปฏิบัติการข้อมูลของ CIA เป็นผู้ดำเนินการปฏิบัติการไซเบอร์เชิงรุก^{[ 27 ]}มีข้อมูลน้อยมากเกี่ยวกับวิธีการทำงานของสำนักงานนี้โดยเฉพาะ หรือว่าสำนักงานนี้ได้ใช้ขีดความสามารถในการโจมตีทางไซเบอร์หรือไม่^{[ 24 ]}

หน่วยงานดังกล่าวได้ดำเนินการอย่างลับๆ มาตั้งแต่ประมาณเดือนมีนาคม พ.ศ. 2558 แต่ได้เริ่มดำเนินการอย่างเป็นทางการในวันที่ 1 ตุลาคม พ.ศ. 2558 ^{[ 28 ]}ตามเอกสารงบประมาณที่เป็นความลับ งบประมาณสำหรับการปฏิบัติการเครือข่ายคอมพิวเตอร์ของ CIA สำหรับปีงบประมาณ พ.ศ. 2556 อยู่ที่ 685.4 ล้านดอลลาร์สหรัฐ งบประมาณของ NSA อยู่ที่ประมาณ 1 พันล้านดอลลาร์สหรัฐในขณะนั้น^{[ 29 ]}

ส.ส. อดัม ชิฟฟ์สมาชิกพรรคเดโมแครตจากแคลิฟอร์เนีย ซึ่งดำรงตำแหน่งสมาชิกอาวุโสของคณะกรรมการข่าวกรองสภาผู้แทนราษฎรได้รับรองการปรับโครงสร้างองค์กรใหม่ “ผู้อำนวยการได้ท้าทายบุคลากรของเขา ชุมชนข่าวกรองที่เหลือ และประเทศชาติ ให้พิจารณาว่าเราจะดำเนินธุรกิจข่าวกรองในโลกที่แตกต่างไปจากปี 1947 อย่างสิ้นเชิง ซึ่งเป็นปีที่ซีไอเอได้รับการก่อตั้งขึ้น” ชิฟฟ์กล่าว^{[ 30 ]}

สำนักงานกิจการรัฐสภา ( OCA ) ทำหน้าที่เป็นผู้ประสานงานระหว่าง CIA และรัฐสภาสหรัฐฯ OCA ระบุว่ามีเป้าหมายเพื่อให้แน่ใจว่ารัฐสภาได้รับทราบข้อมูลเกี่ยวกับกิจกรรมข่าวกรองอย่างครบถ้วนและทันสมัย^{​​[ 31 ]}

สำนักงานนี้เป็นช่องทางหลักของ CIA ในการติดต่อกับ คณะกรรมการ กำกับดูแลรัฐสภาผู้นำ และสมาชิก มีหน้าที่รับผิดชอบในทุกเรื่องที่เกี่ยวข้องกับการมีปฏิสัมพันธ์และการกำกับดูแลกิจกรรมข่าวกรองของสหรัฐฯ โดยอ้างว่ามีเป้าหมายเพื่อ^{[ 32 ]}

• เพื่อให้มั่นใจว่ารัฐสภาได้รับทราบข้อมูลเกี่ยวกับประเด็นและกิจกรรมด้านข่าวกรองอย่างทันท่วงที โดยการให้ข้อมูลสรุปและการแจ้งเตือนต่างๆ
• อำนวยความสะดวกในการตอบสนองต่อคำขอข้อมูลและข้อซักถามของรัฐสภาอย่างรวดเร็วและครบถ้วน
• จัดทำบันทึกการปฏิสัมพันธ์ของหน่วยงานกับรัฐสภา
• ติดตามกฎหมายที่อาจส่งผลกระทบต่อหน่วยงาน
• ให้ความรู้แก่บุคลากรของหน่วยงานเกี่ยวกับความรับผิดชอบของพวกเขาในการแจ้งข้อมูลให้รัฐสภาทราบอย่างครบถ้วนและทันสมัยอยู่เสมอ

CIA ได้จัดตั้งศูนย์ฝึกอบรมแห่งแรกขึ้นในปี พ.ศ. 2493 ซึ่งก็คือสำนักงานฝึกอบรมและการศึกษา หลังจากการสิ้นสุดของสงครามเย็นงบประมาณการฝึกอบรมของ CIA ก็ถูกตัดลดลง ซึ่งส่งผลเสียต่อการรักษาพนักงานไว้^{[ 33 ] [ 34 ]}

เพื่อเป็นการตอบสนอง ผู้อำนวยการหน่วยข่าวกรองกลางจอร์จ เทเน็ตจึงได้ก่อตั้งมหาวิทยาลัยซีไอเอ ขึ้น ในปี 2545 ^{[ 33 ] [ 16 ]}มหาวิทยาลัยซีไอเอจัดหลักสูตรระหว่าง 200 ถึง 300 หลักสูตรในแต่ละปี เพื่อฝึกอบรมทั้งผู้ที่ได้รับการว่าจ้างใหม่และเจ้าหน้าที่ข่าวกรองที่มีประสบการณ์ รวมถึงเจ้าหน้าที่สนับสนุนของซีไอเอ^{[ 33 ] [ 34 ]}สถานที่แห่งนี้ทำงานร่วมกับมหาวิทยาลัยข่าวกรองแห่งชาติและรวมถึงโรงเรียนเชอร์แมน เคนท์ สำหรับการวิเคราะห์ข่าวกรองซึ่งเป็นส่วนประกอบของสำนักวิเคราะห์ของมหาวิทยาลัย^{[ 16 ] [ 35 ] [ 36 ]}

สำหรับการฝึกอบรมขั้นหลังของเจ้าหน้าที่ปฏิบัติการนักเรียน มีพื้นที่ฝึกอบรมลับอย่างน้อยหนึ่งแห่งที่แคมป์เพียรีใกล้กับวิลเลียมส์เบิร์ก รัฐเวอร์จิเนียนักเรียนจะได้รับการคัดเลือก และความก้าวหน้าของพวกเขาจะได้รับการประเมินในรูปแบบที่ได้มาจาก OSS ซึ่งตีพิมพ์เป็นหนังสือ Assessment of Men, Selection of Personnel for the Office of Strategic Services ^{[ 37 ]}การฝึกอบรมภารกิจเพิ่มเติมจะดำเนินการที่ฮาร์วีย์พอยต์รัฐนอร์ทแคโรไลนา^{[ 38 ]}

ศูนย์ฝึกอบรมหลักของสำนักงานการสื่อสารคือศูนย์ฝึกอบรมวอร์เรนตันซึ่งตั้งอยู่ใกล้กับเมืองวอร์เรนตัน รัฐเวอร์จิเนียศูนย์แห่งนี้ก่อตั้งขึ้นในปี 1951 และซีไอเอได้ใช้มาตั้งแต่ปี 1955 เป็นอย่างน้อย^{[ 39 ] [ 40 ]}

รายละเอียดของงบประมาณข่าวกรองโดยรวมของสหรัฐอเมริกาถือเป็นข้อมูลลับ^{[ 3 ]}ภายใต้พระราชบัญญัติสำนักงานข่าวกรองกลางปี ​​1949 ผู้อำนวยการสำนักงานข่าวกรองกลางเป็นพนักงานรัฐบาลกลางเพียงคนเดียวที่สามารถใช้เงินของรัฐบาลที่ "ไม่มีใบสำคัญ" ได้ [ ^{41 ] รัฐบาล}ได้แสดงงบประมาณปี 1997 ไว้ที่ 26.6 พันล้านดอลลาร์สำหรับปีงบประมาณ^{[ 42 ]}รัฐบาลได้เปิดเผยตัวเลขรวมของการใช้จ่ายด้านข่าวกรองที่ไม่ใช่ทางทหารทั้งหมดตั้งแต่ปี 2007 โดยตัวเลขของปีงบประมาณ 2013 อยู่ที่ 52.6 พันล้านดอลลาร์ จากการเปิดเผยข้อมูลการเฝ้าระวังจำนวนมากในปี 2013งบประมาณของ CIA ในปีงบประมาณ 2013 อยู่ที่ 14.7 พันล้านดอลลาร์ คิดเป็น 28% ของทั้งหมด และมากกว่างบประมาณของสำนักงานความมั่นคงแห่งชาติเกือบ 50% งบประมาณHUMINT ของ CIA อยู่ที่ 2.3 พันล้านดอลลาร์ งบประมาณ SIGINTอยู่ที่ 1.7 พันล้านดอลลาร์ และการใช้จ่ายด้านความปลอดภัยและโลจิสติกส์ของภารกิจ CIA อยู่ที่ 2.5 พันล้านดอลลาร์ “โครงการปฏิบัติการลับ” ซึ่งรวมถึงกิจกรรมต่างๆ เช่น กอง โดรน ของ CIA และกิจกรรมต่อต้านโครงการนิวเคลียร์ของอิหร่านคิดเป็นมูลค่า 2.6 พันล้านดอลลาร์^{[ 3 ]}

ก่อนหน้านี้มีความพยายามหลายครั้งในการรวบรวมข้อมูลทั่วไปเกี่ยวกับงบประมาณ^{[ 43 ]}ส่งผลให้รายงานเปิดเผยว่างบประมาณประจำปีของ CIA ในปีงบประมาณ 1963 อยู่ที่ 550 ล้านดอลลาร์สหรัฐ (เทียบเท่ากับ 5.8  พันล้านดอลลาร์สหรัฐใน ปี 2025) ^{[ 44 ]}และงบประมาณด้านข่าวกรองโดยรวมในปีงบประมาณ 1997 อยู่ที่ 26.6 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ (เทียบเท่ากับ 53.3  พันล้านดอลลาร์สหรัฐใน ปี 2025) ^{[ 45 ]}มีการเปิดเผยข้อมูลโดยไม่ได้ตั้งใจ ตัวอย่างเช่นแมรี มาร์กาเร็ต เกรแฮมอดีตเจ้าหน้าที่ CIA และรองผู้อำนวยการหน่วยข่าวกรองแห่งชาติฝ่ายรวบรวมข้อมูลในปี 2005 กล่าวว่างบประมาณด้านข่าวกรองประจำปีอยู่ที่ 44 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ^{[ 46 ]}และในปี 1994 รัฐสภาได้เผยแพร่งบประมาณโดยไม่ได้ตั้งใจจำนวน 43.4 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ (ในสกเงินดอลลาร์ปี 2012) สำหรับโครงการข่าวกรองแห่งชาติที่ไม่ใช่ทางการทหาร ซึ่งรวมถึง 4.8 พันล้านดอลลาร์สหรัฐสำหรับ CIA ^{[ 3 ]}

หลังจากที่แผนมาร์แชลล์ได้รับการอนุมัติ โดยจัดสรรเงิน 13.7 พันล้านดอลลาร์ในระยะเวลาห้าปี ร้อยละ 5 ของเงินทุนเหล่านั้น หรือ 685 ล้านดอลลาร์ ได้ถูกจัดสรรให้กับซีไอเออย่างลับๆ ส่วนหนึ่งของกองทุน M ขนาดใหญ่ ซึ่งรัฐบาลสหรัฐฯ จัดตั้งขึ้นในช่วงหลังสงครามเพื่อการฟื้นฟูญี่ปุ่น ได้ถูกส่งต่อให้กับซีไอเออย่างลับๆ^{[ 47 ]}

บทบาทและหน้าที่ของซีไอเอเทียบได้กับหน่วยข่าวกรอง ของ เยอรมนี (BND) , MI6ในสหราชอาณาจักร , หน่วยข่าวกรองลับของออสเตรเลีย (ASIS) , กองอำนวยการความมั่นคงภายนอก ของ ฝรั่งเศส (DGSE) , หน่วยข่าวกรองต่างประเทศของรัสเซีย , กระทรวงความมั่นคงแห่งรัฐ ของ จีน (MSS) , หน่วยวิจัยและวิเคราะห์ ของ อินเดีย (R&AW) , หน่วยข่าวกรองระหว่างกองทัพ ของ ปากีสถาน (ISI) , หน่วยข่าวกรองทั่วไปของอียิปต์ , มอสสาดของอิสราเอลและหน่วยข่าวกรองแห่งชาติ ของ เกาหลีใต้ (NIS )

CIA มีบทบาทสำคัญในการจัดตั้งหน่วยงานข่าวกรองในประเทศพันธมิตรของสหรัฐฯ หลายประเทศ รวมถึง BND ของเยอรมนีและEYP ของกรีซ (ซึ่งในขณะนั้นรู้จักกันในชื่อ KYP) ^{[ 48 ]}

ความเชื่อมโยงที่ใกล้ชิดที่สุดของหน่วยข่าวกรองสหรัฐฯ กับหน่วยข่าวกรองต่างประเทศอื่นๆ คือประเทศที่ใช้ภาษาอังกฤษ ได้แก่ ออสเตรเลีย แคนาดา นิวซีแลนด์ และสหราชอาณาจักร สัญญาณการสื่อสารพิเศษบ่งชี้ว่าข้อความที่เกี่ยวข้องกับข่าวกรองสามารถแบ่งปันกับประเทศทั้งสี่นี้ได้^{[ 49 ]}ตัวบ่งชี้ความร่วมมือในการปฏิบัติงานอย่างใกล้ชิดของสหรัฐฯ คือการสร้างป้ายกำกับการกระจายข้อความใหม่ภายในเครือข่ายการสื่อสารทางทหารหลักของสหรัฐฯ ก่อนหน้านี้ การทำเครื่องหมาย NOFORN (เช่น ห้ามชาวต่างชาติ) กำหนดให้ผู้ส่งต้องระบุว่าประเทศที่ไม่ใช่สหรัฐฯ ประเทศใดบ้างที่สามารถรับข้อมูลได้ ข้อควรระวังในการจัดการใหม่ USA/AUS/CAN/GBR/NZL Five Eyesซึ่งใช้เป็นหลักกับข้อความข่าวกรอง บ่งชี้ว่าเนื้อหาสามารถแบ่งปันกับออสเตรเลีย แคนาดา สหราชอาณาจักร และนิวซีแลนด์ได้

หน้าที่ของหน่วยงานที่เรียกว่า " Verbindungsstelle 61 " ของ Bundesnachrichtendienstของเยอรมนีคือการติดต่อประสานงานกับสำนักงาน CIA ในเมืองวิสบาเดน^{[ 50 ]}

ในช่วงสงครามโลกครั้งที่สองหน่วยข่าวกรองและปฏิบัติการลับของสหรัฐฯ ดำเนินการโดยสำนักงานบริการยุทธศาสตร์ (OSS) ^{[ 51 ]}เจ้าหน้าที่ CIA ในอนาคตหลายคน รวมถึงผู้อำนวยการหน่วยข่าวกรองกลางสี่คน เคยรับราชการใน OSS ^{[ 52 ]}เมื่อวันที่ 20 กันยายน พ.ศ. 2488 ไม่นานหลังจากสิ้นสุดสงครามโลกครั้งที่สอง ทรูแมนได้ลงนามในคำสั่งบริหารเพื่อยุบ OSS ^{[ 53 ]}ภายในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2488 หน้าที่ของ OSS ได้ถูกแบ่งไปยังกระทรวงการต่างประเทศและกระทรวงกลาโหมการแบ่งแยกนี้คงอยู่เพียงไม่กี่เดือน

การกล่าวถึง "สำนักงานข่าวกรองกลาง" ครั้งแรกในที่สาธารณะปรากฏในข้อเสนอการปรับโครงสร้างการบังคับบัญชาที่เสนอโดยจิม ฟอร์เรสตัลและอาร์เธอร์ แรดฟอร์ดต่อ คณะกรรมการกิจการทหาร ของวุฒิสภาสหรัฐฯในช่วงปลายปี 1945 ^{[ 54 ]}พันเอกซิดนีย์ แมชเบียร์ เจ้าหน้าที่ข่าวกรองกองทัพบก และผู้บัญชาการเอลลิส ซาคาเรียส ทำงานร่วมกันเป็นเวลาสี่เดือนภายใต้การกำกับดูแลของพลเรือเอกโจเซฟ เออร์เนสต์ คิงและเตรียมร่างแรกและคำสั่งดำเนินการสำหรับการจัดตั้งสิ่งที่จะกลายเป็นสำนักงานข่าวกรองกลาง^{[ 55 ] [ 56 ] [ 57 ]}แม้จะมีการต่อต้านจากหน่วยงานทางทหารกระทรวงการต่างประเทศและสำนักงานสอบสวนกลาง (FBI) ^{[ 58 ]}ทรูแมนได้จัดตั้งหน่วยงานข่าวกรองแห่งชาติ^{[ 59 ]}ในเดือนมกราคม 1946 ส่วนขยายการดำเนินงานของหน่วยงานนี้เป็นที่รู้จักในชื่อกลุ่มข่าวกรองกลาง (CIG) ^{[ 60 ]}ซึ่งเป็นหน่วยงานก่อนหน้าโดยตรงของ CIA ^{[ 61 ]}

สำนักงานข่าวกรองกลาง (CIA) ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 26 กรกฎาคม พ.ศ. 2490 เมื่อประธานาธิบดีทรูแมนลงนาม ใน พระราชบัญญัติความมั่นคงแห่งชาติแรงผลักดันสำคัญในการก่อตั้งหน่วยงานนี้คือความตึงเครียดที่เพิ่มขึ้นกับสหภาพโซเวียตหลังสิ้นสุดสงครามโลกครั้งที่สอง^{[ 62 ]}

ลอว์เรนซ์ ฮูสตัน หัวหน้าฝ่ายกฎหมายของSSU , CIG และต่อมาคือ CIA เป็นผู้ร่างหลักของ^{พระราชบัญญัติ}ความมั่นคงแห่งชาติปี 1947 [ ^{63 ] [ 64 ] [ 65 ]}ซึ่งยุบ NIA และ CIG และจัดตั้งทั้งสภาความมั่นคงแห่งชาติและสำนักงานข่าวกรองกลาง^{[ 60 ] [ 66 ]}ในปี 1949 ฮูสตันได้ช่วยร่างพระราชบัญญัติสำนักงานข่าวกรองกลาง ( Pub. L. 81–110 ) ซึ่งอนุญาตให้หน่วยงานใช้ขั้นตอนทางการเงินและการบริหารที่เป็นความลับ และยกเว้นจากข้อจำกัดส่วนใหญ่ในการใช้เงินทุนของรัฐบาลกลาง พระราชบัญญัตินี้ยังยกเว้น CIA จากการต้องเปิดเผย "องค์กร หน้าที่ เจ้าหน้าที่ ตำแหน่ง เงินเดือน หรือจำนวนบุคลากรที่จ้าง" และสร้างโปรแกรม "PL-110" เพื่อจัดการกับผู้แปรพักตร์และ "ชาวต่างชาติที่จำเป็น" อื่น ๆ ที่อยู่นอกเหนือขั้นตอนการตรวจคนเข้าเมืองปกติ^{[ 67 ] [ 68 ]} 

ในช่วงเริ่มต้นของสงครามเกาหลี CIA ยังคงมีพนักงานเพียงไม่กี่พันคน โดยประมาณหนึ่งพันคนทำงานด้านการวิเคราะห์ ข้อมูลข่าวกรองส่วนใหญ่มาจากสำนักงานรายงานและการประเมิน ซึ่งรวบรวมรายงานจากโทรเลขของกระทรวงการต่างประเทศ คำสั่งทางทหาร และเอกสารสาธารณะอื่นๆ ในแต่ละวัน CIA ยังขาดความสามารถในการรวบรวมข้อมูลข่าวกรอง^{[ 69 ]}ในวันที่ 21 สิงหาคม พ.ศ. 2493 ไม่นานหลังจากนั้น ทรูแมนได้ประกาศแต่งตั้งวอลเตอร์ เบเดลล์ สมิธเป็นผู้อำนวยการ CIA คนใหม่ การเปลี่ยนแปลงผู้นำเกิดขึ้นไม่นานหลังจากเริ่มสงครามเกาหลีในเกาหลีใต้เนื่องจากการขาดคำเตือนที่ชัดเจนต่อประธานาธิบดีและสภาความมั่นคงแห่งชาติเกี่ยวกับการรุกรานของเกาหลีเหนือที่กำลังจะเกิดขึ้นนั้นถูกมองว่าเป็นความล้มเหลวอย่างร้ายแรงของหน่วยข่าวกรอง^{[ 69 ]}

CIA ได้รับข้อเรียกร้องที่แตกต่างกันจากหน่วยงานต่างๆ ที่กำกับดูแล ทรูแมนต้องการกลุ่มส่วนกลางเพื่อจัดระเบียบข้อมูลที่ส่งมาถึงเขา^{[ 70 ] [ 71 ]}กระทรวงกลาโหมต้องการข่าวกรองทางทหารและการปฏิบัติการลับ และกระทรวงการต่างประเทศต้องการสร้างการเปลี่ยนแปลงทางการเมืองระดับโลกที่เป็นประโยชน์ต่อสหรัฐอเมริกา ดังนั้น ขอบเขตความรับผิดชอบสองด้านของ CIA จึงคือการปฏิบัติการลับและข่าวกรองลับ หนึ่งในเป้าหมายหลักของการรวบรวมข่าวกรองคือสหภาพโซเวียตซึ่งเป็นเป้าหมายสำคัญของหน่วยงานก่อนหน้าของ CIA เช่นกัน^{[ 70 ] [ 71 ] [ 72 ]}

พลอากาศเอก ฮอยต์ แวนเดนเบิร์ก แห่ง กองทัพอากาศสหรัฐฯผู้อำนวยการคนที่สองของ CIG ได้ก่อตั้งสำนักงานปฏิบัติการพิเศษ (OSO) และสำนักงานรายงานและการประเมิน (ORE) ^{[ 71 ]}ในตอนแรก OSO ได้รับมอบหมายให้สอดแนมและบ่อนทำลายในต่างประเทศด้วยงบประมาณ 15 ล้านดอลลาร์ (เทียบเท่า 201 ล้านดอลลาร์ในปี 2025) ^{[ 73 ]}ซึ่งเป็นเงินบริจาคจากผู้สนับสนุนจำนวนน้อยในรัฐสภา เป้าหมายของแวนเดนเบิร์กคล้ายคลึงกับเป้าหมายที่ผู้ดำรงตำแหน่งก่อนหน้ากำหนดไว้ คือ การค้นหา "ทุกสิ่งทุกอย่างเกี่ยวกับกองกำลังโซเวียตในยุโรปตะวันออกและยุโรปกลาง – การเคลื่อนไหว ความสามารถ และเจตนาของพวกเขา" ^{[ 74 ]}

เมื่อวันที่ 18 มิถุนายน พ.ศ. 2491 สภาความมั่นคงแห่งชาติได้ออกคำสั่ง 10/2 ^{[ 75 ]}เรียกร้องให้ดำเนินการลับต่อ^{สหภาพ}โซเวียต [ ^{76 ]}และมอบอำนาจให้ดำเนินการปฏิบัติการลับต่อ "รัฐหรือกลุ่มต่างชาติที่เป็นศัตรู" ซึ่งรัฐบาลสหรัฐฯ สามารถปฏิเสธได้หากจำเป็น ด้วยเหตุนี้ สำนักงานประสานงานนโยบาย (OPC) จึงถูกสร้างขึ้นภายใน CIA ^{[ 77 ]} OPC มีลักษณะเฉพาะแฟรงค์ วิสเนอร์หัวหน้า OPC ไม่ได้ขึ้นตรงกับผู้อำนวยการ CIAแต่ขึ้นตรงกับรัฐมนตรีว่าการกระทรวงกลาโหม กระทรวงการต่างประเทศ และ NSC การกระทำของ OPC เป็นความลับแม้กระทั่งจากหัวหน้า CIA สถานี CIA ส่วนใหญ่มีหัวหน้าสถานีสองคน คนหนึ่งทำงานให้กับ OSO และอีกคนหนึ่งทำงานให้กับ OPC ^{[ 78 ]}

หน่วยงานไม่สามารถให้ข้อมูลข่าวกรองที่เพียงพอเกี่ยวกับการเข้ายึดครองโรมาเนียและเชโกสโลวาเกีย ของโซเวียต การปิดล้อมเบอร์ลินของโซเวียตหรือโครงการระเบิดปรมาณูของโซเวียตโดยเฉพาะอย่างยิ่ง หน่วยงานไม่สามารถคาดการณ์การเข้าร่วมสงครามเกาหลีของจีนด้วยกองกำลัง 300,000 นายได้^{[ 79 ] [ 80 ]}คิม ฟิลบีสายลับสองหน้าชื่อดังเป็นผู้ประสานงานของอังกฤษกับหน่วยข่าวกรองกลางของอเมริกา^{[ 81 ]}ผ่านทางเขา ซีไอเอได้ประสานงานการส่งทางอากาศหลายร้อยครั้งภายในม่านเหล็กซึ่งทั้งหมดถูกเปิดเผยโดยฟิลบี อาร์ลิงตันฮอลล์ศูนย์กลางประสาทของการวิเคราะห์รหัสลับ ของซีไอเอ ถูกเปิดเผยโดยบิล ไวส์แบนด์นักแปลชาวรัสเซียและสายลับโซเวียต^{[ 82 ]}

อย่างไรก็ตาม CIA ประสบความสำเร็จในการมีอิทธิพลต่อการเลือกตั้งของอิตาลีในปี 1948เพื่อสนับสนุนพรรคคริสเตียนเดโมแครต^{[ 83 ]}กองทุนรักษาเสถียรภาพอัตราแลกเปลี่ยนมูลค่า 200 ล้านดอลลาร์สหรัฐ(เทียบเท่ากับ 2.7 พันล้านดอลลาร์สหรัฐในปี 2025) ^{[ 73 ]}ซึ่งจัดสรรไว้สำหรับการฟื้นฟูยุโรป ถูกนำไปใช้จ่ายให้กับชาวอเมริกันผู้มั่งคั่งเชื้อสายอิตาลี จากนั้นเงินสดก็ถูกแจกจ่ายให้กับCatholic Action ซึ่งเป็นหน่วยงานทางการเมือง ของวาติกันและโดยตรงไปยังนักการเมืองชาวอิตาลี กลยุทธ์การใช้เงินทุนจำนวนมากเพื่อซื้อเสียงเลือกตั้งนี้ถูกนำมาใช้ซ้ำบ่อยครั้งในหลายปีต่อมา^{[ 84 ]}

ในช่วงเริ่มต้นของสงครามเกาหลีฮันส์ ทอฟเต เจ้าหน้าที่ซีไอเอ อ้างว่าได้เปลี่ยน ชาว เกาหลีเหนือ ที่ลี้ภัยกว่าพันคน ให้เป็นกองกำลังกองโจรที่ได้รับมอบหมายให้แทรกซึม ทำสงครามกองโจร และช่วยเหลือนักบิน^{[ 85 ]}ในปี 1952 ซีไอเอได้ส่งสายลับที่ลี้ภัยอีก 1,500 คนไปทางเหนือ อัลเบิร์ต ฮานีย์ หัวหน้าสถานี โซลได้เฉลิมฉลองความสามารถของสายลับเหล่านั้นและข้อมูลที่พวกเขาส่งมาอย่างเปิดเผย^{[ 85 ]}ในเดือนกันยายนปี 1952 ฮานีย์ถูกแทนที่โดยจอห์น ลิมอนด์ ฮาร์ต อดีตทหารผ่านศึกในยุโรปที่มีความทรงจำที่ชัดเจนเกี่ยวกับประสบการณ์อันขมขื่นของข้อมูลที่ผิดพลาด [ ^{85 ] ฮา}ร์ตสงสัยในความสำเร็จมากมายที่ทอฟเตและฮานีย์รายงาน และได้เริ่มการสอบสวนซึ่งสรุปว่าข้อมูลทั้งหมดที่ได้รับจากแหล่งข่าวเกาหลีนั้นเป็นเท็จหรือทำให้เข้าใจผิด^{[ 86 ]}หลังสงคราม การตรวจสอบภายในของซีไอเอได้ยืนยันข้อค้นพบของฮาร์ต สถานีซีไอเอในกรุงโซลมีเจ้าหน้าที่ 200 นาย แต่ไม่มีใครพูดภาษาเกาหลีได้เลย[ 86 ^{]ฮาร์}ตรายงานไปยังวอชิงตันว่าสถานีในกรุงโซลไม่สามารถกอบกู้ได้ ลอฟตัส เบ็คเกอร์ รองผู้อำนวยการหน่วยข่าวกรอง ถูกส่งไปบอกฮาร์ตเป็นการส่วนตัวว่าซีไอเอต้องเปิดสถานีต่อไปเพื่อรักษาหน้าตา เบ็คเกอร์กลับไปวอชิงตัน ดี.ซี. โดยประกาศว่าสถานการณ์นั้น "สิ้นหวัง" ^{[ 86 ]}จากนั้นเขาก็ลาออก พันเอกเจมส์ คัลลิส แห่งกองทัพอากาศระบุว่าอัลเลน ดัลเลส ผู้อำนวยการซีไอเอ ยังคงยกย่องกองกำลังซีไอเอในเกาหลี แม้จะรู้ว่าพวกเขาอยู่ภายใต้การควบคุมของศัตรู^{[ 87 ]}เมื่อจีนเข้าร่วมสงครามในปี 1950 ซีไอเอพยายามดำเนินการก่อวินาศกรรมหลายครั้งในประเทศ ซึ่งทั้งหมดล้มเหลวเนื่องจากการมีอยู่ของสายลับสองหน้า มีการใช้เงินหลายล้านดอลลาร์ในความพยายามเหล่านี้^{[ 88 ]}ซึ่งรวมถึงทีมเจ้าหน้าที่ CIA รุ่นเยาว์ที่ถูกส่งทางอากาศไปยังประเทศจีนซึ่งถูกซุ่มโจมตี และเงินทุนของ CIA ที่ถูกนำไปใช้ในการจัดตั้งอาณาจักรเฮโรอีนระดับโลกในสามเหลี่ยมทองคำ ของพม่า หลังจากการทรยศของสายลับสองหน้าอีกคน^{[ 88 ]}

ในปี พ.ศ. 2494 โมฮัมหมัด มอสซาเดห์สมาชิกของแนวร่วมแห่งชาติได้รับเลือกเป็นนายกรัฐมนตรีอิหร่าน^{[ 89 ]}ในฐานะนายกรัฐมนตรี เขาได้ทำการแปรรูปบริษัทน้ำมันแองโกล-เปอร์เซียซึ่งผู้ดำรงตำแหน่งก่อนหน้าเขาสนับสนุน การแปรรูปอุตสาหกรรมน้ำมันของอิหร่านที่ได้รับทุนจากอังกฤษ ซึ่งรวมถึงโรงกลั่นน้ำมันที่ใหญ่ที่สุดในโลก เป็นหายนะสำหรับมอสซาเดห์ การคว่ำบาตรทางทะเลของอังกฤษทำให้โรงงานน้ำมันของอังกฤษต้องปิดตัวลง ซึ่งอิหร่านไม่มีแรงงานที่มีทักษะในการดำเนินงาน ในปี พ.ศ. 2495 มอสซาเดห์ต่อต้านการที่กษัตริย์ปฏิเสธที่จะอนุมัติรัฐมนตรีว่าการกระทรวงสงครามของเขา และลาออกเพื่อประท้วง แนวร่วมแห่งชาติจึงออกมาประท้วงบนท้องถนน ด้วยความกลัวว่าจะสูญเสียการควบคุม กองทัพจึงถอนกำลังทหารกลับไปในอีกห้าวันต่อมา และชาห์โมฮัมหมัด เรซา ปาห์ลาวีก็ยอมทำตามข้อเรียกร้องของมอสซาเดห์ มอสซาเดห์ได้เปลี่ยนผู้นำทางทหารที่ภักดีต่อชาห์อย่างรวดเร็วด้วยผู้ที่ภักดีต่อเขา ทำให้เขามีอำนาจควบคุมกองทัพด้วยตนเอง เมื่อได้รับอำนาจฉุกเฉินเป็นเวลาหกเดือน มอสซาเดห์ได้ออกกฎหมายแต่เพียงฝ่ายเดียว เมื่อครบหกเดือน อำนาจของเขาก็ถูกขยายออกไปอีกหนึ่งปี ในปี 1953 มอสซาเดห์ได้ยุบสภาและเข้ายึดอำนาจเผด็จการ การยึดอำนาจครั้งนี้กระตุ้นให้ชาห์ใช้สิทธิตามรัฐธรรมนูญในการปลดมอสซาเดห์ มอสซาเดห์จึงก่อรัฐประหารและชาห์ก็หนีออกนอกประเทศ

ภายใต้การนำของผู้อำนวยการซีไอเอ อัลเลน ดัลเลสปฏิบัติการเอแจ็กซ์ได้เริ่มต้นขึ้น เป้าหมายคือการโค่นล้มมอสซาเดห์ด้วยการสนับสนุนทางทหารจากนายพลฟาซลอลลาห์ ซาเฮดีและสถาปนาระบอบการปกครองที่เป็นมิตรกับตะวันตกซึ่งนำโดยชาห์แห่งอิหร่าน เคอร์มิต รูสเวลต์ จูเนียร์ ดูแลปฏิบัติการในอิหร่าน^{[ 90 ]}ในวันที่ 16 สิงหาคม กลุ่มคนร้ายที่ได้รับค่าจ้างจากซีไอเอ นำโดยอยาตอลลาห์ รูฮอลลาห์ โคมัย นี ได้จุดชนวนสิ่งที่เจ้าหน้าที่สถานทูตสหรัฐฯ เรียกว่า "การปฏิวัติที่เกิดขึ้นเองโดยธรรมชาติ" ^{[ 91 ]}แต่มอสซาเดห์ได้รับการคุ้มครองโดยกลุ่มทหารภายในกลุ่มใหม่ของเขา และซีไอเอไม่สามารถมีอิทธิพลภายในกองทัพอิหร่านได้ ชายที่พวกเขาเลือก อดีตนายพลฟาซลอลลาห์ ซาเฮดี ไม่มีกองกำลังให้เรียกใช้^{[ 92 ]}หลังจากความล้มเหลวของการรัฐประหารครั้งแรก รูสเวลต์ได้จ่ายเงินให้ผู้ประท้วงปลอมตัวเป็นคอมมิวนิสต์และทำลายสัญลักษณ์สาธารณะที่เกี่ยวข้องกับชาห์ เหตุการณ์เมื่อวันที่ 19 สิงหาคมนี้ช่วยส่งเสริมการสนับสนุนจากประชาชนต่อชาห์และนำกลุ่มประชาชนก่อความรุนแรงเพื่อทำลายมอสซาเดห์^{[ 93 ]}การโจมตีบ้านของเขาทำให้มอสซาเดห์ต้องหนี เขายอมจำนนในวันรุ่งขึ้น และการรัฐประหารของเขาก็สิ้นสุดลง^{[ 94 ]}

การกลับมามีอำนาจของชาห์ และความประทับใจที่ว่าซีไอเอที่มีประสิทธิภาพสามารถนำพาประเทศนั้นไปสู่ความสัมพันธ์ที่เป็นมิตรและมั่นคงกับตะวันตกได้ กระตุ้นให้เกิดการวางแผนปฏิบัติการ PBSuccess ซึ่งเป็นแผนการโค่นล้มประธานาธิบดีจาโคโบ อาร์เบนซ์แห่งกัวเตมาลา^{[ 95 ]}แผนการดังกล่าวถูกเปิดเผยในหนังสือพิมพ์สำคัญๆ ก่อนที่จะเกิดขึ้นจริง หลังจากที่เจ้าหน้าที่ซีไอเอทิ้งแผนการรัฐประหารไว้ในห้องพักโรงแรม ของเขาใน เมืองกัวเตมาลาซิตี้^{[ 96 ]}

การปฏิวัติกัวเตมาลา ในปี 1944–54 โค่นล้มเผด็จการ Jorge Ubicoที่ได้รับการสนับสนุนจากสหรัฐฯและนำรัฐบาลที่มาจากการเลือกตั้งตามระบอบประชาธิปไตยขึ้นสู่อำนาจ รัฐบาลได้เริ่ม โครงการ ปฏิรูปที่ดินที่ ทะเยอทะยาน ซึ่งมุ่งหวังที่จะมอบที่ดินให้กับชาวนาไร้ที่ดินนับล้านคน โครงการนี้คุกคามการถือครองที่ดินของบริษัท United Fruit Companyซึ่งได้ล็อบบี้ให้เกิดการรัฐประหารโดยการพรรณนาการปฏิรูปเหล่านี้ว่าเป็นลัทธิคอมมิวนิสต์^{[ 97 ] [ 98 ] [ 99 ] [ 100 ]}

เมื่อวันที่ 18 มิถุนายน พ.ศ. 2497 คาร์ลอส คาสติโย อาร์มาส นำทหารที่ได้รับการฝึกฝนจากซีไอเอ 480 นาย ข้ามพรมแดนจากฮอนดูรัสเข้าสู่กัวเตมาลา อาวุธเหล่านั้นก็มาจากซีไอเอเช่นกัน^{[ 101 ]}ซีไอเอได้ดำเนินแคมเปญทางจิตวิทยาเพื่อโน้มน้าวให้ประชาชนและรัฐบาลกัวเตมาลาเชื่อว่าชัยชนะของอาร์มาสเป็นสิ่งที่เกิดขึ้นแล้วอย่างแน่นอนส่วนที่สำคัญที่สุดคือการออกอากาศทางวิทยุชื่อ "เสียงแห่งการปลดปล่อย" ซึ่งประกาศว่าผู้ลี้ภัยชาวกัวเตมาลาที่นำโดยคาสติโย อาร์มาส กำลังจะปลดปล่อยประเทศในไม่ช้า^{[ 101 ]}เมื่อวันที่ 25 มิถุนายน เครื่องบินของซีไอเอได้ทิ้งระเบิดเมืองกัวเตมาลาซิตี ทำลายแหล่งสำรองน้ำมันหลักของรัฐบาล อาร์เบนซ์สั่งให้กองทัพแจกจ่ายอาวุธให้กับชาวนาและคนงานในท้องถิ่น^{[ 102 ]}กองทัพปฏิเสธ ทำให้จาโคโบ อาร์เบนซ์ต้องลาออกเมื่อวันที่ 27 มิถุนายน พ.ศ. 2497 อาร์เบนซ์มอบอำนาจให้แก่พันเอกคาร์ลอส เอนริเก ดิอาซ^{[ 102 ]}จากนั้น CIA ได้วางแผนการถ่ายโอนอำนาจหลายครั้ง ซึ่งจบลงด้วยการยืนยันให้ Castillo Armas เป็นประธานาธิบดีในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2497 ^{[ 102 ]} Armas เป็นเผด็จการทหารคนแรกในบรรดาเผด็จการทหารหลายคนที่ปกครองประเทศ ซึ่งนำไปสู่สงครามกลางเมืองกัวเตมาลา อันโหดร้าย ตั้งแต่ปี พ.ศ. 2503 ถึง พ.ศ. 2539 ซึ่งมีผู้เสียชีวิตประมาณ 200,000 คน ส่วนใหญ่เกิดจากกองทัพที่ได้รับการสนับสนุนจากสหรัฐฯ^{[ 107 ]}

ในปี พ.ศ. 2492 พันเอกAdib Shishakliขึ้นสู่อำนาจในซีเรียด้วยการรัฐประหารที่ได้รับการสนับสนุนจาก CIA สี่ปีต่อมา เขาถูกโค่นล้มโดยกองทัพพรรคบาธและคอมมิวนิสต์ CIA และ MI6 เริ่มให้เงินทุนแก่สมาชิกฝ่ายขวาของกองทัพ แต่ประสบความล้มเหลวครั้งใหญ่ภายหลังวิกฤตการณ์คลองสุเอซเจ้าหน้าที่ CIA Rocky Stone ซึ่งมีบทบาทเล็กน้อยในการรัฐประหารอิหร่านในปี พ.ศ. 2496ทำงานอยู่ที่ สถานทูต ดามัสกัสในฐานะนักการทูต แต่เป็นหัวหน้าสถานี เจ้าหน้าที่ซีเรียที่ได้รับเงินจาก CIA ปรากฏตัวทางโทรทัศน์อย่างรวดเร็วโดยระบุว่าพวกเขาได้รับเงินจาก "ชาวอเมริกันที่ทุจริตและชั่วร้าย" "เพื่อพยายามโค่นล้มรัฐบาลที่ถูกต้องตามกฎหมายของซีเรีย" ^{[ 108 ]}กองกำลังซีเรียล้อมสถานทูตและขับไล่เจ้าหน้าที่ Stone ซึ่งสารภาพและต่อมาได้สร้างประวัติศาสตร์ในฐานะนักการทูตอเมริกันคนแรกที่ถูกขับออกจากประเทศอาหรับ สิ่งนี้เสริมสร้างความสัมพันธ์ระหว่างซีเรียและอียิปต์ ช่วยก่อตั้งสาธารณรัฐอาหรับสหรัฐและทำให้สถานการณ์ของสหรัฐฯ เลวร้ายลงไปอีกในอนาคตอันใกล้^{[ 108 ]}

สหรัฐอเมริกาสงสัยในตัวซูการ์โนประธานาธิบดีของอินโดนีเซีย เนื่องจากเขาประกาศความเป็นกลางในช่วง สงครามเย็น [ ^{109 ]}หลังจากที่ซูการ์โนเป็นเจ้าภาพการประชุมบันดุงซึ่งส่งเสริมขบวนการไม่ฝักใฝ่ฝ่ายใดทำเนียบขาวของไอเซนฮาวร์จึงตอบโต้ ด้วย NSC 5518 ซึ่งอนุญาตให้ใช้ "วิธีการลับที่เป็นไปได้ทั้งหมด" เพื่อนำอินโดนีเซีย ^เข้าสู่อิทธิพลของชาติตะวันตก^{[ 110 ]}

สหรัฐฯ ไม่มีนโยบายที่ชัดเจนเกี่ยวกับอินโดนีเซีย ไอเซนฮาวร์ส่งผู้ช่วยพิเศษด้านปฏิบัติการความมั่นคง FM Dearborn Jr. ไปยังจาการ์ตา รายงานของเขาระบุว่ามีความไม่มั่นคงสูง และสหรัฐฯ ขาดพันธมิตรที่มั่นคง ซึ่งเป็นการตอกย้ำทฤษฎีโดมิโนอินโดนีเซียประสบกับสิ่งที่เขาอธิบายว่าเป็น "การบ่อนทำลายโดยประชาธิปไตย" ^{[ 111 ]}ซีไอเอตัดสินใจที่จะพยายามก่อรัฐประหารอีกครั้งในอินโดนีเซีย ซึ่งกองทัพอินโดนีเซียได้รับการฝึกฝนจากสหรัฐฯ มีความสัมพันธ์ทางวิชาชีพที่แข็งแกร่งกับกองทัพสหรัฐฯมีนายทหารที่สนับสนุนรัฐบาลอย่างแข็งขัน และมีความเชื่อมั่นอย่างแรงกล้าในการควบคุมกองทัพโดยพลเรือน ซึ่งส่วนหนึ่งเกิดจากการมีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับกองทัพสหรัฐฯ^{[ 112 ]}

เมื่อวันที่ 25 กันยายน พ.ศ. 2490 ไอเซนฮาวร์สั่งให้ซีไอเอเริ่มการปฏิวัติในอินโดนีเซียโดยมีเป้าหมายเพื่อเปลี่ยนแปลงระบอบการปกครองสามวันต่อมาBlitzซึ่งเป็นหนังสือพิมพ์รายสัปดาห์ที่อยู่ภายใต้การควบคุมของโซเวียตในอินเดีย^{[ 113 ]}รายงานว่าสหรัฐฯ กำลังวางแผนที่จะโค่นล้มซูการ์โน เรื่องนี้ถูกนำไปเผยแพร่ต่อในสื่อต่างๆ ในอินโดนีเซีย หนึ่งในส่วนแรกของการปฏิบัติการคือเรือของ กองทัพเรือสหรัฐฯ ขนาด 11,500 ตัน ขึ้นฝั่งที่สุมาตราเพื่อส่งมอบอาวุธให้กับผู้ก่อการปฏิวัติที่มีศักยภาพมากถึง 8,000 คน^{[ 114 ]}

เพื่อสนับสนุนรัฐบาลปฏิวัติแห่งสาธารณรัฐอินโดนีเซีย - ขบวนการเปอร์เมสตา ซึ่งก่อตั้งโดยผู้บัญชาการทหารที่ไม่เห็นด้วยในสุมาตรากลางและสุลาเวซีเหนือ โดยมีเป้าหมายเพื่อโค่นล้มระบอบซูการ์โน เครื่องบิน B-26ที่ขับโดยอัลเลน ลอว์เรนซ์ โป๊ป เจ้าหน้าที่ซีไอเอ ได้โจมตีเป้าหมายทางทหารของอินโดนีเซียในเดือนเมษายนและพฤษภาคม พ.ศ. 2491 ^{[ 115 ]}ซีไอเออธิบายการโจมตีทางอากาศต่อประธานาธิบดีว่าเป็นการโจมตีโดย "เครื่องบินของผู้ไม่เห็นด้วย" เครื่องบิน B-26 ของโป๊ปถูกยิงตกเหนือเมืองอัมบอน ประเทศอินโดนีเซีย เมื่อวันที่ 18 พฤษภาคม พ.ศ. 2491 และเขาดีดตัวออกมา เมื่อเขาถูกจับกุม กองทัพอินโดนีเซียพบประวัติส่วนตัวรายงานหลังปฏิบัติการและบัตรสมาชิกสโมสรนายทหารที่สนามบินคลาร์กฟิลด์ ของเขา เมื่อวันที่ 9 มีนาคมจอห์น ฟอสเตอร์ ดัลเลส รัฐมนตรีว่าการกระทรวงต่างประเทศและน้องชายของดีซีไออัลเลน ดัลเลสได้ออกแถลงการณ์ต่อสาธารณะเรียกร้องให้มีการก่อกบฏต่อต้านเผด็จการคอมมิวนิสต์ภายใต้ซูการ์โน สามวันต่อมา CIA รายงานต่อทำเนียบขาวว่าการกระทำของกองทัพอินโดนีเซียต่อการปฏิวัติที่ได้รับการสนับสนุนจาก CIA เป็นการปราบปรามลัทธิคอมมิวนิสต์^{[ 116 ]}

หลังจากเหตุการณ์ในอินโดนีเซีย ไอเซนฮาวร์แสดงความไม่ไว้วางใจทั้งซีไอเอและผู้อำนวยการ อัลเลน ดัลเลส ดัลเลสเองก็แสดงความไม่ไว้วางใจซีไอเอเช่นกัน แอบบอต สมิธ นักวิเคราะห์ของซีไอเอซึ่งต่อมาได้เป็นหัวหน้าสำนักงานประเมินแห่งชาติกล่าวว่า "เราได้สร้างภาพของสหภาพโซเวียตขึ้นมาสำหรับตัวเราเอง และไม่ว่าจะเกิดอะไรขึ้นก็ต้องทำให้เข้ากับภาพนี้ นักประเมินข่าวกรองแทบจะไม่สามารถก่อบาปที่น่ารังเกียจยิ่งกว่านี้ได้" ในวันที่ 16 ธันวาคม ไอเซนฮาวร์ได้รับรายงานจากคณะที่ปรึกษาข่าวกรองของเขาซึ่งระบุว่าหน่วยงาน "ไม่สามารถประเมินข้อมูลข่าวกรองของตนเองและปฏิบัติการของตนเองได้อย่างเป็นกลาง" ^{[ 117 ]}

คองโกได้รับเอกราชจากเบลเยียมในปี 1960 ^{[ 118 ]}สหรัฐอเมริกากลัวว่านายกรัฐมนตรีคนใหม่ของตนปาทริซ ลูมัมบาจะอ่อนไหวต่ออิทธิพลของโซเวียต ดังนั้นซีไอเอจึงสนับสนุนโจเซฟ โมบูตูในการจัดตั้งรัฐประหารโค่นล้มลูมัมบาเมื่อวันที่ 14 กันยายน 1960 ^{[ 119 ]}ลูมัมบาถูกลอบสังหารโดยศัตรูชาวคองโกและเบลเยียมในปี 1961 โดยซีไอเอยินยอม^{[ 120 ]}ซีไอเอยังคงให้การสนับสนุนระบอบโมบูตูตลอดช่วงสงครามเย็น แม้ว่าจะมีการทุจริต การบริหารจัดการที่ผิดพลาด และการละเมิดสิทธิมนุษยชนก็ตาม^{[ 121 ]}

หลังจากช่องว่างด้านเครื่องบินทิ้งระเบิดก็มาถึงช่องว่างด้านขีปนาวุธไอเซนฮาวร์ต้องการใช้เครื่องบินU-2เพื่อพิสูจน์ว่าช่องว่างด้านขีปนาวุธนั้นไม่มีอยู่จริง แต่เขาได้สั่งห้ามเครื่องบิน U-2 บินผ่านน่านฟ้าสหภาพโซเวียตหลังจากพบกับรัฐมนตรีต่างประเทศครุชเชฟที่แคมป์เดวิดอีกเหตุผลหนึ่งที่ประธานาธิบดีคัดค้านการใช้เครื่องบิน U-2 ก็คือ ในยุคนิวเคลียร์ข้อมูลข่าวกรองที่เขาต้องการมากที่สุดคือเจตนาของฝ่ายตรงข้าม ซึ่งหากปราศจากข้อมูลนี้ สหรัฐฯ จะเผชิญกับภาวะอัมพาตทางด้านข่าวกรอง เขากังวลเป็นพิเศษว่าการบินของเครื่องบิน U-2 อาจถูกมองว่าเป็นการเตรียมการโจมตีแบบชิงลงมือก่อน เขามีความหวังสูงสำหรับการประชุมที่จะถึงนี้กับครุชเชฟในปารีส ในที่สุดไอเซนฮาวร์ก็ยอมจำนนต่อแรงกดดันจากซีไอเอ อนุญาตให้มีการบินเป็นเวลา 16 วัน ซึ่งขยายออกไปอีก 6 วันเนื่องจากสภาพอากาศเลวร้าย ในวันที่ 1 พฤษภาคม 1960 กองทัพอากาศโซเวียตยิงเครื่องบิน U-2 ที่บินอยู่เหนือน่านฟ้าโซเวียตตก สำหรับไอเซนฮาวร์ การปกปิดที่เกิดขึ้นทำลายความซื่อสัตย์สุจริตที่เขามีอยู่ และความหวังของเขาที่จะสร้างมรดกแห่งการฟื้นฟูความสัมพันธ์กับครุชเชฟ ต่อมาไอเซนฮาวร์กล่าวว่าการปกปิดเรื่อง U-2 เป็นสิ่งที่เขาเสียใจมากที่สุดในสมัยดำรงตำแหน่งประธานาธิบดี^{[ 122 ] : 160}

ซีไอเอให้การต้อนรับฟิเดล คาสโตรในการเยือนวอชิงตัน ดี.ซี.และให้ข้อมูลสรุปแบบตัวต่อตัวแก่เขา ซีไอเอหวังว่าคาสโตรจะนำมาซึ่งรัฐบาลประชาธิปไตยที่เป็นมิตร และวางแผนที่จะสนับสนุนรัฐบาลของเขาด้วยเงินและอาวุธ อย่างไรก็ตาม ในวันที่ 11 ธันวาคม พ.ศ. 2492 บันทึกข้อความฉบับหนึ่งมาถึงโต๊ะทำงานของผู้อำนวยการซีไอเอ โดยแนะนำให้ "กำจัด" คาสโตร ดัลเลสเปลี่ยนคำว่า "กำจัด" เป็น "เคลื่อนย้าย" และเริ่มดำเนินการตามแผน ในช่วงกลางเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2503 ดิ๊ก บิสเซลล์ พยายามจ้าง มาเฟียให้ลอบสังหารคาสโตรโดยได้รับการสนับสนุนอย่างเต็มที่จากซีไอเอ^{[ 124 ]}

การบุก อ่าวหมูเป็นการรุกรานทางทหารที่ล้มเหลวของคิวบา โดยกลุ่มติดอาวุธ Brigade 2506ซึ่งได้รับการสนับสนุนจาก CIA เมื่อวันที่ 17 เมษายน 1961 Brigade 2506 เป็น กอง กำลังต่อต้านการปฏิวัติที่ได้รับการฝึกฝนและให้ทุนโดย CIA ทำหน้าที่เป็นแนวหน้าของกองกำลังติดอาวุธของแนวร่วมปฏิวัติประชาธิปไตย (DRF) และมีเป้าหมายที่จะโค่นล้มรัฐบาลคอมมิวนิสต์ของคาสโตรที่กำลังทวีความรุนแรงขึ้น กองกำลังที่ บุกเข้ามาจากกัวเตมาลา ถูก กองกำลังปฏิวัติคิวบา ภายใต้การบัญชาการโดยตรงของคาสโตร เอาชนะได้ภายในสามวัน ประธานาธิบดี ดไวต์ ดี. ไอเซนฮาวร์ของสหรัฐฯกังวลเกี่ยวกับทิศทางที่รัฐบาลของคาสโตรกำลังดำเนินไป และในเดือนมีนาคม 1960 ไอเซนฮาวร์ได้จัดสรรเงิน 13.1 ล้านดอลลาร์ให้กับ CIA เพื่อวางแผนโค่นล้มเขา ซีไอเอได้ดำเนินการจัดเตรียมปฏิบัติการโดยได้รับความช่วยเหลือจากกองกำลังต่อต้านการปฏิวัติของคิวบาหลายกลุ่ม โดยฝึกกองพลน้อยที่ 2506 ในกัวเตมาลา กองกำลังกึ่งทหารกว่า 1,400 นายออกเดินทางไปยังคิวบาทางเรือในวันที่ 13 เมษายน เพื่อทำการบุกโจมตีทางทะเลสองวันต่อมา ในวันที่ 15 เมษายน เครื่องบินทิ้งระเบิด B-26 จำนวน 8 ลำที่ซีไอเอจัดหาให้ ได้โจมตีสนามบินของคิวบา ในคืนวันที่ 16 เมษายน การบุกโจมตีทางบกเริ่มต้นขึ้นที่อ่าวหมูแต่ในที่สุดวันที่ 20 เมษายน ผู้บุกรุกก็ยอมจำนน การบุกรุกที่ล้มเหลวนี้ทำให้ตำแหน่งผู้นำของคาสโตรแข็งแกร่งขึ้น รวมถึงความสัมพันธ์ของเขากับสหภาพโซเวียต ซึ่งนำไปสู่เหตุการณ์วิกฤตการณ์ขีปนาวุธคิวบาในปี 1962 ในที่สุด การบุกรุกครั้งนี้เป็นความอับอายครั้งใหญ่สำหรับนโยบายต่างประเทศของสหรัฐฯ

คณะกรรมการเทย์เลอร์ได้รับมอบหมายให้ตรวจสอบว่าอะไรผิดพลาดในคิวบา คณะกรรมการได้ข้อสรุปเช่นเดียวกับที่คณะกรรมการที่ปรึกษาของประธานาธิบดีด้านกิจกรรมข่าวกรองต่างประเทศเมื่อเดือนมกราคม ค.ศ. 1961 ได้สรุปไว้ และการตรวจสอบอื่นๆ อีกมากมายก่อนหน้านั้นและที่จะตามมา คือ การปฏิบัติการลับต้องแยกออกจากข่าวกรองและการวิเคราะห์อย่าง สิ้นเชิง ผู้ตรวจการทั่วไปของซีไอเอได้ตรวจสอบเหตุการณ์อ่าวหมู เขาได้สรุปว่ามีความจำเป็นต้องปรับปรุงองค์กรและการบริหารจัดการของซีไอเออย่างมาก

หลังจากความล้มเหลวของการพยายามบุกโจมตีอ่าวหมู ซีไอเอได้เสนอปฏิบัติการมังกูส ซึ่งเป็นโครงการก่อวินาศกรรมและการโจมตีของผู้ก่อการร้ายต่อเป้าหมายพลเรือนและทหารในคิวบา โดยมีเจตนาที่จะโค่นล้มรัฐบาลคิวบาและจัดตั้งรัฐบาลใหม่^{[ 125 ]}นอกจากนี้ยังพยายามบังคับให้รัฐบาลคิวบาใช้มาตรการพลเรือนที่เข้มงวดและจัดสรรทรัพยากรเพื่อปกป้องพลเมืองจากการโจมตี^{[ 126 ]} ปฏิบัติการ นี้ได้รับอนุมัติจากประธานาธิบดีเคนเนดีในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2504 ^{[ 127 ] [ 128 ] [ 129 ] [ 130 ]}ปฏิบัติการนี้ทำให้ซีไอเอดำเนินแคมเปญโจมตีของผู้ก่อการร้ายอย่างกว้างขวางต่อพลเรือนและเป้าหมายทางเศรษฐกิจ สังหารพลเรือนจำนวนมาก และดำเนินการปฏิบัติการลับต่อรัฐบาลคิวบา^{[ 128 ] [ 131 ] [ 132 ] [ 133 ]}

CIA ได้จัดตั้งฐานปฏิบัติการขึ้น โดยใช้ชื่อรหัสว่าJMWAVEที่ฐานทัพเรือร้าง แห่งหนึ่ง ใน วิทยาเขตของ มหาวิทยาลัยไมอามี ปฏิบัติการนี้มีขนาดใหญ่มากจนมีเจ้าหน้าที่ CIA จำนวนมากที่สุดอยู่นอกเมืองแลงลีย์ โดยในที่สุดมีจำนวนถึงประมาณสี่ร้อยคน นับเป็นนายจ้างรายใหญ่ในฟลอริดา โดยมีเจ้าหน้าที่หลายพันคนได้รับเงินเดือนลับจากหน่วยงาน^{[ 134 ] [ 135 ]}กิจกรรมก่อการร้ายที่ดำเนินการโดยเจ้าหน้าที่ที่ติดอาวุธ จัดตั้ง และได้รับเงินทุนจาก CIA เป็นแหล่งที่มาของความตึงเครียดระหว่างรัฐบาลสหรัฐฯ และคิวบามากขึ้น พวกเขาเป็นปัจจัยสำคัญที่ทำให้สหภาพโซเวียตตัดสินใจติดตั้งขีปนาวุธในคิวบา ซึ่งนำไปสู่วิกฤตการณ์ขีปนาวุธคิวบา^{[ 136 ] [ 137 ]}

การโจมตียังคงดำเนินต่อไปตลอดปี 1965 ^{[ 137 ]}แม้ว่าระดับกิจกรรมก่อการร้ายที่สั่งการโดย CIA จะลดลงในช่วงครึ่งหลังของทศวรรษ 1960 แต่ในปี 1969 CIA ได้รับคำสั่งให้เพิ่มปฏิบัติการต่อต้านคิวบา^{[ 138 ]}ผู้ก่อการร้ายที่ลี้ภัยยังคงทำงานให้กับ CIA ในช่วงกลางทศวรรษ 1970 รวมถึงLuis Posada Carriles [ ^{139 ] [ 140 ] [ 141 ] เขา}ยังคงได้รับเงินเดือนจาก CIA จนถึงกลางปี ​​1976 ^{[ 139 ] [ 141 ]}และเป็นที่เชื่อกันอย่างกว้างขวางว่าเป็นผู้รับผิดชอบต่อเหตุการณ์วางระเบิดเที่ยวบิน Cubana 455 ในเดือนตุลาคม 1976 ซึ่งทำให้มีผู้เสียชีวิต 73 คน นับเป็นเหตุการณ์ก่อการร้ายทางอากาศที่ร้ายแรงที่สุดในซีกโลกตะวันตกก่อนการโจมตีในเดือนกันยายน 2001ที่นิวยอร์ก^{[ 139 ] [ 140 ] [ 141 ]}

แม้จะเกิดความเสียหายและมีพลเรือนเสียชีวิตจากการโจมตีของผู้ก่อการร้ายของ CIA แต่เมื่อพิจารณาตามวัตถุประสงค์ที่ระบุไว้ โครงการนี้ถือว่าล้มเหลวโดยสิ้นเชิง^{[ 131 ] [ 132 ]}

ซีไอเอและรัฐบาลสหรัฐอเมริกามีส่วนเกี่ยวข้องกับการรัฐประหารในบราซิลปี 1964การรัฐประหารเกิดขึ้นระหว่างวันที่ 31 มีนาคมถึง 1 เมษายน ซึ่งส่งผลให้กองทัพบราซิลโค่นล้มประธานาธิบดีโจเอา กูลาตสหรัฐอเมริกามองว่ากูลาตเป็นภัยคุกคามฝ่ายซ้ายในละตินอเมริกา โทรเลขลับที่เขียนโดยเอกอัครราชทูตสหรัฐฯ ประจำบราซิลลินคอล์น กอร์ดอนยืนยันว่าซีไอเอมีส่วนเกี่ยวข้องกับการปฏิบัติการลับในบราซิล ตัวอย่างเช่น ซีไอเอสนับสนุน "การชุมนุมบนท้องถนนเพื่อประชาธิปไตย" ในบราซิล เพื่อสร้างความไม่พอใจต่อกูลาต^{[ 142 ]}

โครงการทิเบตของซีไอเอประกอบด้วยแผนการทางการเมืองการเผยแพร่โฆษณาชวนเชื่อ ปฏิบัติการ กึ่งทหารและการรวบรวมข่าวกรองตามพันธสัญญาที่สหรัฐฯ ทำไว้กับดาไลลามะในปี พ.ศ. 2494 และ พ.ศ. 2499 ^{[ 143 ]}

ทั้ง CIA และR&AWมีบทบาทสำคัญในการจัดตั้งหน่วยปฏิบัติการพิเศษชายแดน (SFF) ซึ่งเป็นหน่วยปฏิบัติการพิเศษชั้นยอดของอินเดียที่อยู่ภายใต้อำนาจของสำนักเลขาธิการคณะรัฐมนตรีบุคลากรใน SFF โดยทั่วไปแล้วจะได้รับการคัดเลือกจากผู้ลี้ภัยชาวทิเบตที่อาศัยอยู่ในอินเดียเป็นหลัก รวมถึงจาก ชุมชน กอร์คาด้วย หน่วยนี้ถูกสร้างขึ้นเพื่อดำเนินการปฏิบัติการพิเศษในพื้นที่สูงและภูมิประเทศที่เป็นภูเขา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในบริบทของความกังวลเชิงยุทธศาสตร์ของอินเดียเกี่ยวกับกองทัพปลดปล่อยประชาชนจีนเมื่อเวลาผ่านไป SFF ได้พัฒนาเป็นหน่วยที่มีการฝึกฝนมาอย่างดีและมีความสามารถสูง และถือเป็นเครื่องมือยับยั้งเชิงยุทธศาสตร์ที่สำคัญและเป็นองค์ประกอบสำคัญของท่าทีการป้องกันของอินเดียตามแนวชายแดนหิมาลัย^{[ 144 ]}

ภารกิจ OSS Patti เดินทางมาถึงเวียดนามในช่วงปลายสงครามโลกครั้งที่สองและมีปฏิสัมพันธ์ที่สำคัญกับผู้นำของกลุ่มต่างๆ ในเวียดนามหลายกลุ่ม รวมถึงโฮจิมินห์ด้วย^{[ 145 ]}

ในช่วงที่สหรัฐฯ มีส่วนร่วมในการสู้รบในสงครามเวียดนามมีการโต้เถียงกันอย่างมากเกี่ยวกับความคืบหน้าระหว่างกระทรวงกลาโหมภายใต้ การนำของ โรเบิร์ต แม็คนามารา ซีไอเอ และในระดับหนึ่ง เจ้าหน้าที่ข่าวกรองของกองบัญชาการช่วยเหลือทางทหารเวียดนาม^{[ 146 ]}

ในช่วงระหว่างปี 1959 ถึง 1961 CIA ได้เริ่มโครงการเสือ ซึ่งเป็นโครงการส่งสายลับเวียดนามใต้ เข้าไปใน เวียดนามเหนือเพื่อรวบรวมข้อมูลข่าวกรอง โครงการนี้ล้มเหลว รองหัวหน้าโครงการเสือ ร้อยเอกโด วัน เทียน ยอมรับว่าเขาเป็นสายลับของฮานอย^{[ 147 ]}

เมื่อโครงการไทเกอร์ล้มเหลว เพนตากอนต้องการให้กองกำลังกึ่งทหารของซีไอเอเข้าร่วมในแผนปฏิบัติการ 64A ซึ่งส่งผลให้กองกำลังกึ่งทหารต่างประเทศของซีไอเออยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของกระทรวงกลาโหม ซึ่งถือเป็นก้าวที่อันตรายภายในซีไอเอ เป็นการลื่นไถลจากปฏิบัติการลับไปสู่การใช้กำลังทหาร^{[ 148 ]}

ขบวนการต่อต้านสงครามขยายตัวอย่างรวดเร็วทั่วสหรัฐอเมริกาในช่วงที่จอห์นสันดำรงตำแหน่งประธานาธิบดีจอห์นสันต้องการให้ริชาร์ด เฮล์มส์ ผู้อำนวยการซีไอเอ พิสูจน์ข้อสันนิษฐานของจอห์นสันที่ว่ามอสโกและปักกิ่งกำลังให้เงินทุนและมีอิทธิพลต่อขบวนการต่อต้านสงครามของอเมริกา^{[ 149 ]}ดังนั้น ในฤดูใบไม้ร่วงปี 1967 ซีไอเอจึงเปิดตัวโครงการสอดแนมภายในประเทศที่มีชื่อรหัสว่าChaosซึ่งจะดำเนินต่อไปเป็นเวลาทั้งหมดเจ็ดปี หน่วยงานตำรวจทั่วประเทศร่วมมือกับหน่วยงาน โดยรวบรวม "ดัชนีคอมพิวเตอร์ของชื่อบุคคลและองค์กรชาวอเมริกัน 300,000 รายการ และไฟล์ข้อมูลจำนวนมากเกี่ยวกับพลเมือง 7,200 คน" เฮล์มส์ได้จัดตั้ง "กลุ่มปฏิบัติการพิเศษ" ซึ่งมีเจ้าหน้าที่ซีไอเอ "[สิบเอ็ด] คนไว้ผมยาว เรียนรู้ศัพท์เฉพาะของฝ่ายซ้ายใหม่และออกไปแทรกซึมกลุ่มสันติภาพในสหรัฐอเมริกาและยุโรป" ^{[ 150 ]}การประเมินของนักวิเคราะห์ซีไอเอเกี่ยวกับเวียดนามคือ สหรัฐฯ "กำลังแยกตัวออกจากความเป็นจริงมากขึ้นเรื่อยๆ... [และ] ดำเนินการด้วยความกล้าหาญมากกว่าสติปัญญา" ^{[ 151 ]}

ระหว่างปี พ.ศ. 2511 ถึง พ.ศ. 2515 โครงการฟีนิกซ์ของซีไอเอเกี่ยวข้องกับการสังหารพลเรือนชาวเวียดนามใต้จำนวนระหว่าง 20,000 ถึง 40,000 คน ซึ่งซีไอเอเชื่อว่าเป็นสมาชิกของสิ่งที่พวกเขาเรียกว่า "โครงสร้างพื้นฐาน" ซึ่งก็คือส่วนประกอบด้านการบริหารและการเมืองที่ไม่ใช่ทางทหารของโครงสร้างองค์กรของคอมมิวนิสต์ หลายพันคนถูกทรมานก่อนถูกสังหารด้วยวิธีการต่างๆ เช่น การช็อตไฟฟ้า ซ้ำๆ ที่สมอง และการเจาะแท่งผ่านรูหูเข้าไปในสมองจนกระทั่งเสียชีวิต^{[ 152 ]}

สถานการณ์เลวร้ายลงในช่วงกลางทศวรรษ 1970 ซึ่งเป็นช่วงเวลาใกล้เคียงกับเหตุการณ์วอเตอร์เกตลักษณะเด่นของชีวิตทางการเมืองในช่วงเวลานั้นคือความพยายามของรัฐสภาในการควบคุมดูแลประธานาธิบดีสหรัฐฯ และฝ่ายบริหารของรัฐบาลสหรัฐฯ การเปิดเผยเกี่ยวกับกิจกรรมของซีไอเอในอดีต เช่น การลอบสังหารและการพยายามลอบสังหารผู้นำต่างชาติ (โดยเฉพาะอย่างยิ่งฟิเดล คาสโตรและราฟาเอล ทรูจิลโล) และการสอดแนมภายในประเทศอย่างผิดกฎหมายต่อพลเมืองสหรัฐฯ เปิดโอกาสให้รัฐสภาเพิ่มการกำกับดูแลปฏิบัติการข่าวกรองของสหรัฐฯ^{[ 153 ]}

ในปี พ.ศ. 2514 NSA และ CIA มีส่วนร่วมในการสอดแนมภายในประเทศ กระทรวงกลาโหมดักฟังเฮนรี คิสซิงเจอร์ทำเนียบขาวและแคมป์เดวิดถูกติดตั้งเครื่องดักฟังเสียง นิกสันและคิสซิงเจอร์ดักฟังผู้ช่วยของพวกเขารวมถึงนักข่าวด้วย เป็นที่รู้กันว่ากลุ่ม Plumbers ของนิกสัน มีอดีตเจ้าหน้าที่ CIA หลายคนรวมอยู่ด้วย เช่นฮาวาร์ดฮั นต์ จิม แมคคอร์ดและยูจีนิโอ มาร์ติเนซเมื่อวันที่ 7 กรกฎาคม พ.ศ. 2514 จอห์น เออร์ลิช แมน หัวหน้าฝ่ายนโยบายภายในประเทศของนิกสัน บอกกับ DCI Cushman ซึ่ง เป็นมือสังหารของนิกสันใน CIA ให้แจ้ง Cushman ว่า "ฮันต์กำลังทำบางสิ่งเพื่อประธานาธิบดี... คุณควรพิจารณาว่าเขามีอำนาจ เต็มที่ " ^{[ 154 ]}

การที่อดีตเจ้าหน้าที่ซีไอเอบุกเข้าไปในสำนักงานใหญ่ของพรรคเดโมแครตที่วอเตอร์เกตและพยายามใช้ซีไอเอเพื่อขัดขวางการสืบสวนของเอฟบีไอเกี่ยวกับการบุกรุกดังกล่าว ทำให้ซีไอเอตกต่ำ ลงอย่างรวดเร็ว ในบันทึกเสียงที่เป็นหลักฐาน สำคัญที่นำไปสู่การลาออกของประธานาธิบดีนิ กสัน นิกสันสั่งให้หัวหน้าคณะทำงานของเขาHR Haldemanบอกกับซีไอเอว่าการสืบสวนวอเตอร์เกตต่อไปจะ "เปิดโปงเรื่องราวทั้งหมดเกี่ยวกับอ่าวหมู" ^{[ 155 ] [ 156 ]}ด้วยวิธีนี้ นิกสันและฮัลเดแมนจึงมั่นใจได้ว่าเจ้าหน้าที่อันดับ 1 และ 2 ของซีไอเอ คือริชาร์ด เฮล์มส์และเวอร์นอน วอลเตอร์สจะสื่อสารกับผู้อำนวยการเอฟบีไอ แอล. แพทริก เกรย์ว่าเอฟบีไอไม่ควรติดตามเส้นทางการเงินจากผู้บุกรุกไปยังคณะกรรมการเพื่อการเลือกตั้งประธานาธิบดีใหม่เนื่องจากจะเปิดเผยสายลับของซีไอเอในเม็กซิโก ในตอนแรก FBI ตกลงตามข้อตกลงนี้เนื่องจากข้อตกลงที่มีมายาวนานระหว่าง FBI และ CIA ที่จะไม่เปิดเผยแหล่งข้อมูลของกันและกัน แม้ว่าภายในสองสามสัปดาห์ FBI ก็กลับมาทำการสืบสวนอีกครั้งก็ตาม อย่างไรก็ตาม เมื่อเทปหลักฐานชิ้นสำคัญถูกเปิดเผยต่อสาธารณะ ความเสียหายต่อภาพลักษณ์ของเจ้าหน้าที่ระดับสูงของ CIA และต่อ CIA โดยรวมจึงไม่อาจหลีกเลี่ยงได้^{[ 157 ]}

เมื่อวันที่ 13 พฤศจิกายน พ.ศ. 2515 หลังจากนิกสันได้รับเลือกตั้งใหม่ด้วยคะแนนเสียงถล่มทลาย นิกสันบอกกับคิสซิงเจอร์ว่า "[ผมตั้งใจ] จะทำลายกระทรวงการต่างประเทศ ผมหมายถึงทำลายมัน – กระทรวงการต่างประเทศแบบเก่า – และสร้างกระทรวงการต่างประเทศใหม่" เขามีแผนการที่คล้ายกันสำหรับซีไอเอและตั้งใจที่จะแทนที่เฮล์มส์ด้วยเจมส์ ชเลซิงเกอร์^{[ 158 ]}นิกสันสัญญาว่าเฮล์มส์จะสามารถอยู่ต่อได้จนถึงวันเกิดครบรอบ 60 ปี ซึ่งเป็นอายุเกษียณภาคบังคับ เมื่อวันที่ 2 กุมภาพันธ์ นิกสันได้ละเมิดสัญญาดังกล่าว โดยดำเนินการตามความตั้งใจที่จะ "กำจัดคนไร้ประโยชน์" ออกจากซีไอเอ "กำจัดตัวตลก" คือคำสั่งของเขาต่อผู้อำนวยการซีไอเอคนใหม่ คิสซิงเกอร์บริหารซีไอเอมาตั้งแต่ต้นสมัยประธานาธิบดีของนิกสัน แต่นิกสันเน้นย้ำกับชเลซิงเกอร์ว่าเขาต้องแสดงให้รัฐสภาเห็นว่าเขาเป็นผู้รับผิดชอบ เพื่อหลีกเลี่ยงความสงสัยของพวกเขาเกี่ยวกับการมีส่วนร่วมของคิสซิงเกอร์^{[ 159 ]}นิกสันยังหวังว่าชเลซิงเกอร์จะสามารถผลักดันการเปลี่ยนแปลงในวงกว้างในหน่วยงานข่าวกรองที่เขาพยายามมาหลายปีแล้ว เช่น การแต่งตั้งผู้อำนวยการข่าวกรองแห่งชาติและการแยกส่วนปฏิบัติการลับของซีไอเอออกเป็นหน่วยงานอิสระ ก่อนที่เฮล์มส์จะออกจากตำแหน่ง เขาจะทำลายเทปบันทึกการประชุมที่เขาแอบบันทึกไว้ในสำนักงานทั้งหมด และเอกสารจำนวนมากเกี่ยวกับโครงการ MKUltraในช่วง 17 สัปดาห์ที่ชเลซิงเกอร์ดำรงตำแหน่ง เขาได้ยืนยันกับประธานาธิบดีนิกสันว่า “จำเป็นอย่างยิ่งที่จะต้องลด ‘ความสำคัญของการปฏิบัติการของซีไอเอ’ ทั่วโลก” และได้ไล่พนักงานออกมากกว่า 1,500 คน^{[ 160 ]}เมื่อวอเตอร์เกตทำให้ซีไอเอตกอยู่ภายใต้แสงสปอตไลท์ ชเลซิงเกอร์ซึ่งไม่ได้รับรู้เกี่ยวกับการมีส่วนร่วมของซีไอเอ จึงตัดสินใจว่าเขาจำเป็นต้องรู้ว่ามีอะไรซ่อนอยู่บ้าง

เอกสาร นี้กลายเป็นสมบัติล้ำค่าของครอบครัว (Family Jewels ) ซึ่งรวมถึงข้อมูลที่เชื่อมโยง CIA กับการลอบสังหารผู้นำต่างชาติ การสอดแนมอย่างผิดกฎหมายต่อพลเมืองสหรัฐฯ ประมาณ 7,000 คนที่เกี่ยวข้องกับขบวนการต่อต้านสงคราม ( ปฏิบัติการ CHAOS ) การทดลองกับพลเมืองสหรัฐฯ และแคนาดาโดยที่พวกเขาไม่รู้ตัวและการแอบให้LSD แก่พวกเขา (รวมถึงสิ่งอื่นๆ) และสังเกตผลลัพธ์^{[ 153 ]}สิ่งนี้กระตุ้นให้รัฐสภาจัดตั้งคณะกรรมการเชิร์ชในวุฒิสภา และคณะกรรมการไพค์ในสภาผู้แทนราษฎร ประธานาธิบดีเจอรัลด์ ฟอร์ดได้จัดตั้งคณะกรรมการร็อกกีเฟลเลอร์ [ ^{153 ] และ}ออกคำสั่งบริหารห้ามการลอบสังหารผู้นำต่างชาติ DCI โคลบี ได้รั่วไหลเอกสารไปยังสื่อมวลชน ต่อมาเขากล่าวว่าเขาเชื่อว่าการให้ข้อมูลนี้แก่รัฐสภาเป็นสิ่งที่ถูกต้อง และท้ายที่สุดก็เพื่อผลประโยชน์ของ CIA ^{[ 161 ]}

ในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2517 หนังสือพิมพ์นิวยอร์กไทมส์รายงานว่าซีไอเอได้รวบรวมไฟล์ข่าวกรองเกี่ยวกับชาวอเมริกันอย่างน้อย 10,000 คน และมีส่วนร่วมในกิจกรรมที่ผิดกฎหมายอื่นๆ อีกหลายสิบรายการตั้งแต่ช่วงทศวรรษ พ.ศ. 2493 รวมถึงการบุกรุก การดักฟังโทรศัพท์ และการตรวจสอบจดหมาย ซึ่งเป็นการละเมิดกฎบัตรปี พ.ศ. 2490 ที่ห้ามไม่ให้ซีไอเอดำเนินการใดๆ บนแผ่นดินอเมริกาและต่อพลเมืองสหรัฐฯ^{[ 162 ]}

รักษาการอัยการสูงสุดลอเรนซ์ ซิลเบอร์แมนทราบถึงการมีอยู่ของ Family Jewels และออกหมายเรียก ทำให้เกิดการสอบสวนของรัฐสภา 8 ครั้งเกี่ยวกับกิจกรรมการสอดแนมภายในประเทศของ CIA วาระการดำรงตำแหน่งสั้นๆ ของบิล โคลบี ในฐานะผู้อำนวยการ CIA จะสิ้นสุดลงด้วย เหตุการณ์สังหารหมู่ในวันฮาโลวีนผู้สืบทอดตำแหน่งของเขาคือจอร์จ เอช ดับเบิลยู บุชในขณะนั้น กระทรวงกลาโหมควบคุมงบประมาณด้านข่าวกรองถึง 80% ^{[ 163 ]}การสื่อสารและการประสานงานระหว่าง CIA และกระทรวงกลาโหมจะได้รับผลกระทบอย่างมากภายใต้รัฐมนตรีว่าการกระทรวงกลาโหม โดนัลด์ รัมส์เฟลด์ งบประมาณของ CIA สำหรับการจ้างเจ้าหน้าที่ลับถูกบีบออกไปโดยปฏิบัติการทางทหารในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ และความนิยมที่ตกต่ำของรัฐบาลยิ่งทำให้การจ้างงานตึงเครียดมากขึ้น ส่งผลให้หน่วยงานมีผู้บริหารระดับกลางมากเกินไป และขาดแคลนเจ้าหน้าที่รุ่นใหม่ ด้วยการฝึกอบรมพนักงานที่ใช้เวลาถึง 5 ปี ความหวังเดียวของหน่วยงานจึงอยู่ที่เจ้าหน้าที่ใหม่ที่จะทยอยเข้ามาในอนาคต CIA จะประสบกับความล้มเหลวอีกครั้งเมื่อคอมมิวนิสต์เข้ายึดครองแองโกลาวิลเลียม เจ. เคซีย์สมาชิกคณะที่ปรึกษาด้านข่าวกรองของฟอร์ด ได้รับการอนุมัติจากบุชให้ทีมงานจากภายนอกซีไอเอจัดทำรายงานประเมินกำลังทหารของโซเวียตในฐานะ "ทีมบี" ทีม "บี" ประกอบด้วยผู้ที่สนับสนุนการขยายอำนาจทางทหารของโซเวียต รายงานประเมินของพวกเขาสูงที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ และพวกเขาวาดภาพกองทัพโซเวียตที่กำลังเติบโตขึ้น ในขณะที่ความจริงแล้วกองทัพโซเวียตกำลังหดตัวลง รายงานหลายฉบับของพวกเขาถูกเผยแพร่ในสื่อต่างๆ

ลิเบียซึ่งเป็นประเทศเพื่อนบ้านของชาดเป็นแหล่งอาวุธสำคัญของกองกำลังกบฏคอมมิวนิสต์ ซีไอเอฉวยโอกาสนี้ในการจัดหาอาวุธและเงินทุนให้แก่นายกรัฐมนตรีของชาดฮิสแซน ฮาเบรหลังจากที่เขาก่อตั้งรัฐบาลแยกตัวในซูดานตะวันตก^{[ 164 ]}

ในอัฟกานิสถาน CIA ได้ส่งอาวุธมูลค่าหลายพันล้านดอลลาร์ [ ^{165 ]}รวมถึงขีปนาวุธพื้นสู่อากาศFIM-92 Stinger [ ^{166 ]}ให้กับหน่วยข่าวกรองระหว่างกองทัพของปากีสถาน (ISI) ซึ่งส่งต่อ ^{อาวุธ เหล่านั้นให้กับนักรบมูจาฮิดี น}ชาวอัฟกานิสถานหลายหมื่นคนเพื่อต่อสู้กับโซเวียตและกองทัพของสาธารณรัฐประชาธิปไตยอัฟกานิสถานในช่วงสงครามโซเวียต-อัฟกานิสถาน^{[ 167} ] ^{[ 168 ] [ 169 ]}โดยรวมแล้ว CIA ได้ส่ง Stinger ประมาณ 2,300 ลูกไปยังอัฟกานิสถาน ทำให้เกิดตลาดมืด ขนาดใหญ่สำหรับอาวุธเหล่า ^นี้ทั่วตะวันออกกลาง เอเชียกลาง และแม้แต่บางส่วนของแอฟริกา ซึ่งยังคงมีอยู่จนถึงช่วงทศวรรษ 1990 อิหร่านอาจได้รับ Stinger ประมาณ 100 ลูก ต่อมา CIA ได้ดำเนินโครงการเพื่อเรียกคืน Stinger ผ่านการซื้อคืนด้วยเงินสด^{[ 170 ]}

ภายใต้ประธานาธิบดีจิมมี คาร์เตอร์ซีไอเอได้ให้การสนับสนุนกลุ่มคอนทรา อย่างลับๆ ในสงครามต่อต้านกลุ่มซานดินิส ตาส ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2524 เรแกนกล่าวต่อสภาคองเกรสว่าซีไอเอจะปกป้องเอลซัลวาดอร์โดยการป้องกันไม่ให้กลุ่มซานดินิสตาสส่งอาวุธให้กับกลุ่มกบฏคอมมิวนิสต์ในเอลซัลวาดอร์ ซีไอเอยังเริ่มติดอาวุธและฝึกฝนกลุ่มคอนทราในฮอนดูรัสโดยหวังว่าพวกเขาจะสามารถโค่นล้มกลุ่มซานดินิสตาสในนิการากัวได้^{[ 171 ]}ซีไอเอมีส่วนเกี่ยวข้องกับ เรื่องอื้อฉาวการลักลอบค้าอาวุธในคดี อิหร่าน-คอนทราผลกระทบจากเรื่องอื้อฉาวนี้รวมถึงการสร้างพระราชบัญญัติการอนุญาตข่าวกรองในปี พ.ศ. 2534 ซึ่งกำหนดปฏิบัติการลับว่าเป็นภารกิจลับในพื้นที่ทางภูมิศาสตร์การเมืองที่สหรัฐฯ ไม่ได้มีส่วนร่วมอย่างเปิดเผยหรือเห็นได้ชัด นอกจากนี้ยังต้องมีลำดับชั้นการบังคับบัญชาในการอนุมัติ รวมถึง รายงาน การค้นพบอย่างเป็นทางการของประธานาธิบดีและการแจ้งให้คณะกรรมการข่าวกรองของสภาผู้แทนราษฎรและวุฒิสภาทราบ ซึ่งในกรณีฉุกเฉินจะต้องมีการ "แจ้งให้ทราบทันท่วงที" เท่านั้น นักวิจารณ์กล่าวหาว่า CIA มีส่วนเกี่ยวข้องกับการค้าโคเคนของกลุ่มคอนทราด้วย^{[ 172 ] [ 173 ]}

แหล่งข่าวหลักของ CIA ในเลบานอนคือบาชีร์ เกมาเยลสมาชิกของ นิกาย คริสเตียนมารอนิต การลุกฮือต่อต้านชนกลุ่มน้อยมารอนิตทำให้ CIA ตกอยู่ในสถานการณ์ที่คาดไม่ถึงอิสราเอลบุกเลบานอนและร่วมกับ CIA สนับสนุนเกมาเยล^{[ 174 ]}สิ่งนี้ทำให้เกมาเยลมั่นใจว่าชาวอเมริกันจะได้รับการคุ้มครองในเลบานอน สิบสามวันต่อมา เขาถูกลอบสังหารอิมัด มุคนิยาห์ มือสังหาร ของฮิซบอล ลาห์ ตั้งเป้าหมายโจมตีชาวอเมริกันเพื่อแก้แค้นการรุกรานของอิสราเอล การสังหารหมู่ที่ซาบราและชาติลาและนาวิกโยธินสหรัฐฯของกองกำลังนานาชาติที่มีบทบาทในการต่อต้านPLOในเลบานอน เมื่อวันที่ 18 เมษายน 1983 เกิดเหตุระเบิดรถยนต์หนัก 2,000 ปอนด์ในล็อบบี้ของสถานทูตอเมริกันในเบรุตทำให้มีผู้เสียชีวิต 63 คน รวมถึงชาวอเมริกัน 17 คน และเจ้าหน้าที่ซีไอเอ 7 คน ซึ่งรวมถึงโรเบิร์ต เอมส์หนึ่งในผู้เชี่ยวชาญด้านตะวันออกกลางของซีไอเอ สถานการณ์ของอเมริกาในเลบานอนย่ำแย่ลงไปอีก เนื่องจากมาตรการตอบโต้ที่ผิดพลาดของอเมริกาต่อเหตุการณ์วางระเบิดนั้น ถูกตีความโดยหลายคนว่าเป็นการสนับสนุนชนกลุ่มน้อยมารอนิต เมื่อวันที่ 23 ตุลาคม 1983 เกิดเหตุระเบิดสองครั้งในเบรุต ( เหตุการณ์วางระเบิดเบรุตปี 1983 ) รวมถึงระเบิดหนัก 10 ตันที่ค่ายทหารสหรัฐฯ ทำให้มีผู้เสียชีวิต 242 คน

การวางระเบิดสถานทูตทำให้เคน ฮาส หัวหน้าสถานีซีไอเอในเบรุต เสียชีวิต บิล บักลีย์ถูกส่งเข้าไปแทนที่เขา สิบแปดวันหลังจากนาวิกโยธินสหรัฐฯ ออกจากเลบานอน บักลีย์ก็ถูกลักพาตัวไป เมื่อวันที่ 7 มีนาคม พ.ศ. 2527 เจเรมี เลวินหัวหน้า สำนักงาน ซีเอ็นเอ็นในเบรุตก็ถูกลักพาตัวไปเช่นกัน ชาวอเมริกันอีก 12 คนถูกจับตัวไปในเบรุตในช่วงที่เรแกนเป็นประธานาธิบดีมานูเชอร์ กอร์บานิฟาร์อดีต สายลับ ซาวัก เป็นผู้ขายข้อมูล และถูกเปิดโปงเรื่องการเผยแพร่ข้อมูลเท็จ เขาติดต่อหน่วยงานโดยเสนอช่องทางลับไปยังอิหร่าน โดยแนะนำการแลกเปลี่ยนขีปนาวุธที่จะสร้างผลกำไรให้กับคนกลาง^{[ 175 ]}

นักเขียนอย่างอาห์เหม็ด ราชิด ได้กล่าวอ้าง ว่า CIA และISIกำลังทำสงครามลับๆ อยู่

เมื่อวันที่ 11 พฤษภาคม พ.ศ. 2541 จอร์จ เทเน็ต ผู้อำนวยการซีไอเอและหน่วยงานของเขาต่างตกใจกับการทดสอบนิวเคลียร์ครั้งที่สอง ของอินเดีย การทดสอบดังกล่าวทำให้ ปากีสถานซึ่งเป็นคู่ปรับที่มีศักยภาพด้านนิวเคลียร์เกิดความกังวลและ "เปลี่ยนแปลงดุลยภาพของอำนาจในโลก" การทดสอบนิวเคลียร์ครั้งนี้เป็นการ ตอบโต้ที่คำนวณไว้ของ นิวเดลีต่อการที่ปากีสถานทดสอบขีปนาวุธใหม่ในคลังอาวุธที่กำลังขยายตัวก่อนหน้านี้ เหตุการณ์ชุดนี้ต่อมาได้เปิดเผยให้เห็นถึง "ความล้มเหลวในการจารกรรม ความล้มเหลวในการอ่านภาพถ่าย ความล้มเหลวในการทำความเข้าใจรายงาน ความล้มเหลวในการคิด และความล้มเหลวในการมองเห็น" ของซีไอเอ^{[ 176 ]}

ต่างจากรัฐบาลคาร์เตอร์รัฐบาลเรแกนสนับสนุน ขบวนการ โซลิแดริตีในโปแลนด์และ—โดยอาศัยข่าวกรองของซีไอเอ—ดำเนินแคมเปญประชาสัมพันธ์เพื่อยับยั้งสิ่งที่รัฐบาลคาร์เตอร์รู้สึกว่าเป็น "การเคลื่อนไหวที่ใกล้จะเกิดขึ้นของกองกำลังทหารโซเวียตขนาดใหญ่เข้าสู่โปแลนด์" พันเอกริชาร์ด คุคลินสกี นายทหารอาวุโสในกองบัญชาการทหารสูงสุดของโปแลนด์ ได้ส่งรายงานลับไปยังซีไอเอ^{[ 177 ]}

CIA โอนเงินสดประมาณ 2 ล้านดอลลาร์สหรัฐต่อปีให้กับ Solidarity ซึ่งแสดงให้เห็นว่ายอดรวม 10 ล้านดอลลาร์สหรัฐเป็นประมาณการที่สมเหตุสมผลสำหรับยอดรวมห้าปี ไม่มีการเชื่อมโยงโดยตรงระหว่าง CIA และSolidarnośćและเงินทั้งหมดถูกส่งผ่านบุคคลที่สาม^{[ 178 ]}เจ้าหน้าที่ CIA ถูกห้ามไม่ให้พบกับผู้นำของ Solidarity และการติดต่อของ CIA กับ นักเคลื่อนไหว ของ Solidarnośćนั้นอ่อนแอกว่าของAFL–CIOซึ่งระดมทุนได้ 300,000 ดอลลาร์สหรัฐจากสมาชิก ซึ่งใช้ในการจัดหาวัสดุและเงินสดโดยตรงให้กับ Solidarity โดยไม่มีการควบคุมการใช้จ่ายเงินของ Solidarity รัฐสภาสหรัฐฯ อนุญาตให้National Endowment for Democracyส่งเสริมประชาธิปไตย และ NED จัดสรรเงิน 10 ล้านดอลลาร์สหรัฐให้กับ Solidarity ^{[ 179 ]}

เมื่อรัฐบาลโปแลนด์เริ่มปราบปรามในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2524 โซลิดาริตีไม่ได้รับการแจ้งเตือน คำอธิบายสำหรับเรื่องนี้แตกต่างกันไป บางคนเชื่อว่าซีไอเอถูกจับได้โดยไม่ทันตั้งตัว ในขณะที่บางคนเสนอว่าผู้กำหนดนโยบายของอเมริกาเห็นว่าการปราบปรามภายในประเทศดีกว่า "การแทรกแซงของโซเวียตที่หลีกเลี่ยงไม่ได้" ^{[ 180 ]}

การสนับสนุนของ CIA ต่อ Solidarity รวมถึงเงิน อุปกรณ์ และการฝึกอบรม ซึ่งได้รับการประสานงานโดยหน่วยปฏิบัติการพิเศษของ CIA ^{[ 181 ]}เฮนรี ไฮด์สมาชิก คณะกรรมการข่าวกรอง ของสภาผู้แทนราษฎรสหรัฐฯกล่าวว่า สหรัฐฯ จัดหา "เสบียงและความช่วยเหลือทางเทคนิคในแง่ของหนังสือพิมพ์ลับ การออกอากาศ การโฆษณาชวนเชื่อ เงิน ความช่วยเหลือด้านองค์กร และคำแนะนำ" ^{[ 182 ]} ไมเคิล ไรส์แมน จากโรงเรียนกฎหมายเยล ระบุว่าปฏิบัติการในโปแลนด์เป็นหนึ่งใน ปฏิบัติการลับของ CIA ในช่วงสงครามเย็น^{[ 183 ]}

เงินทุนเริ่มต้นสำหรับการปฏิบัติการลับของ CIA คือ 2 ล้านดอลลาร์ แต่ในไม่ช้าก็ได้รับการอนุมัติเพิ่มขึ้น และภายในปี 1985 CIA ก็สามารถแทรกซึมเข้าไปในโปแลนด์ได้สำเร็จ^{[ 184 ]}ไรเนอร์ ทีล ในหนังสือ Nested Games of External Democracy Promotion: The United States and the Polish Liberalization 1980–1989กล่าวถึงวิธีการปฏิบัติการลับของ CIA และเกมสายลับ ซึ่งทำให้สหรัฐฯ สามารถดำเนินการเปลี่ยนแปลงระบอบการปกครองได้สำเร็จ^{[ 185 ]}

ในช่วงสงครามเย็น CIA และNATOมีส่วนร่วมในปฏิบัติการ Gladio [ ^{186 ] [ 187 ] ใน}ฐานะส่วนหนึ่งของปฏิบัติการ Gladio CIA สนับสนุนรัฐบาลอิตาลี และถูกกล่าวหาว่าสนับสนุนองค์กรนีโอฟาสซิสต์^{[ 188 ] [ 189 ] [ 190 ]}เช่น National Vanguard, New Order และNuclei Armati Rivoluzionariในช่วงYears of Lead ในอิตาลี

ในตุรกี Gladio ถูกเรียกว่าหน่วยต่อต้านกองโจรความพยายามของ CIA เสริมสร้างความแข็งแกร่งให้กับ ขบวนการ แพนเติร์กิสต์ผ่านสมาชิกผู้ก่อตั้งหน่วยต่อต้านกองโจร คือAlparslan Türkeş [ ^{191 ] บุคคล}ฝ่ายขวาจัดอื่นๆที่ CIA จ้างเป็นส่วนหนึ่งของหน่วยต่อต้านกองโจร ได้แก่Ruzi Nazarอดีต เจ้าหน้าที่ SSและผู้สนับสนุนแพนเติร์กิสต์^{[ 192 ]}

ในช่วงสงครามอิรัก-อิหร่านซีไอเอให้การสนับสนุนทั้งสองฝ่าย ซีไอเอมีเครือข่ายสายลับในอิหร่าน แต่ในปี 1989 ความผิดพลาดของซีไอเอทำให้สายลับทุกคนในอิหร่านตกอยู่ในอันตราย และซีไอเอก็ไม่มีสายลับในอิรักอีกต่อไป ในช่วงหลายสัปดาห์ก่อนที่อิรักจะบุกคูเวตซีไอเอได้ลดความสำคัญของการเสริมกำลังทางทหารลง ในระหว่างสงคราม การประเมินความสามารถและความตั้งใจของอิรักโดยซีไอเอเปลี่ยนแปลงไปมาและไม่ค่อยแม่นยำ ในกรณีหนึ่ง กระทรวงกลาโหมได้ขอให้ซีไอเอระบุเป้าหมายทางทหารที่จะทิ้งระเบิด เป้าหมายหนึ่งที่ซีไอเอระบุคือที่หลบภัยใต้ดิน ซีไอเอไม่รู้ว่ามันเป็นที่หลบภัยระเบิดของพลเรือน ในกรณีที่เกิดขึ้นไม่บ่อยนัก ซีไอเอระบุได้อย่างถูกต้องว่าความพยายามของกองกำลังพันธมิตรในการทำลายขีปนาวุธสกั๊ดนั้นล้มเหลว รัฐสภาได้ถอดถอนบทบาทของซีไอเอในการตีความภาพถ่ายจากดาวเทียมสอดแนม ทำให้ปฏิบัติการข่าวกรองดาวเทียมของซีไอเออยู่ภายใต้การดูแลของกองทัพ CIA ได้จัดตั้งสำนักงานกิจการทหารขึ้น ซึ่งทำหน้าที่เป็น "หน่วยสนับสนุนระดับที่สองสำหรับเพนตากอน...ตอบคำถามจากทหาร [เช่น] 'ถนนเส้นนี้กว้างเท่าไหร่? ' " ^{[ 193 ]}

การประกาศของ มิคาอิล กอร์บาชอฟเกี่ยวกับการลดกำลังทหารโซเวียตฝ่ายเดียวจำนวน 500,000 นาย ทำให้ซีไอเอตกใจ ยิ่งไปกว่านั้น ดัก แมคอีชิน หัวหน้าฝ่ายวิเคราะห์โซเวียตของซีไอเอ กล่าวว่า แม้ว่าซีไอเอจะแจ้งประธานาธิบดี สภาความมั่นคงแห่งชาติ และรัฐสภาเกี่ยวกับการลดกำลังทหารล่วงหน้าแล้วก็ตาม ก็คงถูกเพิกเฉยอยู่ดี “เราคงไม่สามารถเผยแพร่เรื่องนี้ได้” ^{[ 194 ]}ตัวเลขทั้งหมดของซีไอเอเกี่ยวกับเศรษฐกิจของสหภาพโซเวียตนั้นผิดพลาด บ่อยครั้งที่ซีไอเอพึ่งพาบุคคลที่ไม่มีประสบการณ์ซึ่งถูกมองว่าเป็นผู้เชี่ยวชาญ บ็อบ เกตส์ เคยดำรงตำแหน่งหัวหน้าฝ่ายวิเคราะห์โซเวียตมาก่อนดัก แมคอีชิน และเขาไม่เคยไปเยือนสหภาพโซเวียตมาก่อน เจ้าหน้าที่เพียงไม่กี่คน แม้แต่ผู้ที่ประจำการอยู่ในประเทศ ก็พูดภาษาของผู้คนที่พวกเขาสอดแนมได้ และซีไอเอไม่สามารถส่งสายลับไปตอบสนองต่อสถานการณ์ที่กำลังพัฒนาได้ การวิเคราะห์รัสเซียของซีไอเอในช่วงสงครามเย็นนั้นถูกขับเคลื่อนด้วยอุดมการณ์หรือการเมืองวิลเลียม เจ. โครว์ประธานคณะเสนาธิการร่วม กล่าวว่า CIA "พูดถึงสหภาพโซเวียตราวกับว่าพวกเขาไม่ได้อ่านหนังสือพิมพ์เลย ยิ่งไม่ต้องพูดถึงการพัฒนาหน่วยข่าวกรองลับ" ^{[ 195 ]}

เมื่อวันที่ 25 มกราคม พ.ศ. 2536 Mir Qazi ได้เปิดฉากยิงใส่สำนักงานใหญ่ CIAในเมือง Langley รัฐเวอร์จิเนีย ทำให้เจ้าหน้าที่เสียชีวิต 2 นาย และบาดเจ็บอีก 3 นาย^{[ 196 ]}เมื่อวันที่ 26 กุมภาพันธ์ ผู้ก่อการร้าย อัล-เคดานำโดยRamzi Yousef ได้วางระเบิดโรงจอดรถใต้ตึกนอร์ททาวเวอร์ของเวิลด์เทรดเซ็นเตอร์ในนครนิวยอร์กทำให้มีผู้เสียชีวิต 6 คน และบาดเจ็บอีก 1,402 คน

ระหว่างสงครามบอสเนียซีไอเอเพิกเฉยต่อสัญญาณทั้งภายในและภายนอกเกี่ยวกับการสังหารหมู่ที่สเรเบรนิกาเมื่อวันที่ 13 กรกฎาคม 1995 เมื่อรายงานข่าวเกี่ยวกับการสังหารหมู่เผยแพร่ออกมา ซีไอเอได้รับภาพจากดาวเทียมสอดแนมของนักโทษที่ถูกเฝ้าโดยชายติดอาวุธในสเรเบรนิกา^{[ 197 ]}ซีไอเอไม่มีเจ้าหน้าที่ภาคพื้นดินเพื่อตรวจสอบรายงานดังกล่าว สองสัปดาห์หลังจากรายงานข่าวเกี่ยวกับการสังหารหมู่ ซีไอเอได้ส่งเครื่องบินU-2ไปถ่ายภาพ หนึ่งสัปดาห์ต่อมา ซีไอเอได้สรุปรายงานเกี่ยวกับเรื่องนี้ รายงานฉบับสุดท้ายมาถึงทำเนียบขาวเมื่อวันที่ 4 สิงหาคม 1995 กล่าวโดยสรุปคือ หน่วยงานใช้เวลาสามสัปดาห์ในการยืนยันว่าการสังหารหมู่ครั้งใหญ่ที่สุดครั้งหนึ่งในยุโรปนับตั้งแต่สงครามโลกครั้งที่สองได้เกิดขึ้น^{[ 197 ]}ความผิดพลาดอีกประการหนึ่งของซีไอเอที่เกิดขึ้นในคาบสมุทรบอลข่านในสมัยประธานาธิบดีคลินตันคือ การทิ้งระเบิดเซอร์เบี ยของนาโตเพื่อบังคับให้สโลโบดัน มิโลเซวิชถอนทหารออกจากโคโซโว ซีไอเอได้รับเชิญให้จัดหาเป้าหมายทางทหารสำหรับการทิ้งระเบิด โดยที่นักวิเคราะห์ของหน่วยงานใช้แผนที่ท่องเที่ยวเพื่อกำหนดตำแหน่ง^{[ 198 ]}อย่างไรก็ตาม หน่วยงานได้ให้พิกัดของสถานทูตจีนเป็นเป้าหมายอย่างไม่ถูกต้อง ส่งผลให้มีการทิ้งระเบิดสถานทูตจีน ซีไอเออ่านเป้าหมายผิดเป็นคลังเก็บอาวุธของสโลโบดัน มิโลเซวิช^{[ 199 ]}

ในกัวเตมาลาซีไอเอได้จัดทำบันทึกเมอร์ฟี โดยอิงจากบันทึกเสียงที่ได้จากอุปกรณ์ดักฟังลับที่หน่วยข่าวกรองกัวเตมาลาติดตั้งไว้ในห้องนอนของเอกอัครราชทูตแมริลีน แมคอาฟี ในบันทึกเสียงนั้น เอกอัครราชทูตแมคอาฟีได้วิงวอนเรียก "เมอร์ฟี" ซีไอเอได้เผยแพร่บันทึกดังกล่าวในแวดวงระดับสูงของวอชิงตัน โดยกล่าวหาเอกอัครราชทูตแมคอาฟีว่ามีความสัมพันธ์นอกสมรสแบบเลสเบี้ยนกับเลขานุการของเธอ แคโรล เมอร์ฟี แต่ความจริงแล้วไม่มีความสัมพันธ์ดังกล่าว เอกอัครราชทูตแมคอาฟีเรียกเมอร์ฟี สุนัขพุดเดิลของ เธอต่างหาก ^{[ 200 ]}

แฮโรลด์ เจมส์ นิโคลสันจะ ทำให้เจ้าหน้าที่ที่ปฏิบัติหน้าที่หลายคนและผู้ฝึกอบรมสามปี ต้องเดือดร้อนก่อนที่เขาจะถูกจับได้ว่าสอดแนมให้รัสเซีย ในปี 1997 สภาผู้แทนราษฎรได้เขียนรายงานอีกฉบับหนึ่งซึ่งระบุว่าเจ้าหน้าที่ซีไอเอรู้เพียงเล็กน้อยเกี่ยวกับภาษาหรือการเมืองของผู้คนที่พวกเขาสอดแนม ข้อสรุปคือซีไอเอขาด "ความลึก ความกว้าง และความเชี่ยวชาญในการติดตามพัฒนาการทางการเมือง การทหาร และเศรษฐกิจทั่วโลก" ^{[ 201 ]}รัสส์ ทราเวอร์ส กล่าวในวารสารภายในของซีไอเอว่า ในอีกห้าปีข้างหน้า "ความล้มเหลวทางด้านข่าวกรองเป็นสิ่งที่หลีกเลี่ยงไม่ได้" ^{[ 202 ]}ในปี 1997 จอร์จ เทเน็ต ผู้อำนวยการคนใหม่ของซีไอเอ ได้ให้คำมั่นสัญญาว่าจะสร้างหน่วยงานทำงานใหม่ภายในปี 2002 ความประหลาดใจของซีไอเอต่อการทดลองระเบิดปรมาณูของอินเดียเป็นความล้มเหลวในเกือบทุกระดับ หลังจากการวางระเบิดสถานทูตในปี 1998โดยอัล-เคดาซีไอเอเสนอเป้าหมายสองแห่งที่จะถูกโจมตีเพื่อตอบโต้ หนึ่งในนั้นคือโรงงานผลิตยาอัล-ชิฟาซึ่งตรวจพบร่องรอยของสารตั้งต้นอาวุธเคมี ภายหลังเหตุการณ์ดังกล่าว สรุปได้ว่า "การตัดสินใจโจมตีอัล-ชิฟาเป็นการสานต่อประเพณีการดำเนินงานโดยอาศัยข้อมูลข่าวกรองที่ไม่เพียงพอเกี่ยวกับซูดาน" ซึ่งกระตุ้นให้ซีไอเอทำการ "เปลี่ยนแปลงครั้งใหญ่และครอบคลุม" เพื่อป้องกัน "ความล้มเหลวของระบบข่าวกรองที่ร้ายแรง" ^{[ 203 ]}

ระหว่างปี 1985 ถึง 1986 ซีไอเอสูญเสียสายลับทั้งหมดในยุโรปตะวันออก รายละเอียดของการสอบสวนสาเหตุนั้นถูกปกปิดจากผู้อำนวยการคนใหม่ และการสอบสวนก็ประสบความสำเร็จเพียงเล็กน้อยและถูกวิพากษ์วิจารณ์อย่างกว้างขวาง เมื่อวันที่ 21 กุมภาพันธ์ 1994 เจ้าหน้าที่เอฟบีไอได้ดึงตัวอัลดริช เอมส์ออกจากรถจากัวร์ของเขา^{[ 204 ]}ในการสอบสวนที่ตามมา ซีไอเอค้นพบว่าแหล่งข้อมูลจำนวนมากสำหรับการวิเคราะห์ที่สำคัญที่สุดเกี่ยวกับสหภาพโซเวียตนั้นมาจากข้อมูลเท็จของโซเวียตที่ส่งให้ซีไอเอโดยสายลับที่ถูกควบคุม ยิ่งไปกว่านั้น ยังพบว่าในบางกรณี ซีไอเอสงสัยในขณะนั้นว่าแหล่งข้อมูลนั้นถูกแทรกแซง แต่ข้อมูลนั้นถูกส่งต่อขึ้นไปตามลำดับชั้นว่าเป็นข้อมูลจริง^{[ 205 ] [ 206 ]}

เอกสารของหน่วยงานแสดงให้เห็นว่าเชื่อกันว่าโอซามา บิน ลาเดนให้เงินสนับสนุนกลุ่มกบฏอัฟกานิสถานต่อต้านสหภาพโซเวียตในช่วงทศวรรษ 1980 ^{[ 207 ]}ในปี 1991 บิน ลาเดน กลับไปยังซาอุดีอาระเบีย บ้านเกิดของเขา เพื่อประท้วงการมีอยู่ของกองกำลังและปฏิบัติการพายุทะเลทรายเขาถูกขับไล่ออกจากประเทศ ในปี 1996 ซีไอเอได้จัดตั้งทีมเพื่อตามล่าบิน ลาเดน พวกเขาแลกเปลี่ยนข้อมูลกับซูดาน จนกระทั่งตามคำกล่าวอ้างของแหล่งข่าวที่ต่อมาพบว่าเป็นผู้สร้างเรื่อง ซีไอเอจึงปิดสถานีซูดานในปลายปีนั้น ในปี 1998 บิน ลาเดน ประกาศสงครามกับอเมริกา และในวันที่ 7 สิงหาคมได้โจมตีแทนซาเนียและไนโรบี ใน วันที่ 12 ตุลาคม 2000 อัล-เคดาได้วางระเบิดเรือ USS Coleในช่วงแรกของการดำรงตำแหน่งประธานาธิบดีของจอร์จ ดับเบิลยู. บุช ภัยคุกคามจากอัล-เคดาปรากฏอยู่ทั่วไปในการบรรยายสรุปประจำวันของซีไอเอต่อประธานาธิบดี แต่เรื่องนี้อาจกลายเป็นการเตือนภัยที่ผิดพลาดก็ได้ การคาดการณ์ของหน่วยงานนั้นร้ายแรงแต่มีน้ำหนักน้อย และประธานาธิบดีและคณะทำงานด้านกลาโหมของเขามุ่งความสนใจไปที่เรื่องอื่น ซีไอเอได้จัดให้มีการจับกุมสมาชิกอัล-เคดาที่ต้องสงสัยผ่านความร่วมมือกับหน่วยงานต่างประเทศ แต่ซีไอเอไม่สามารถระบุได้อย่างแน่ชัดว่าการจับกุมเหล่านี้มีผลอย่างไร และไม่สามารถได้รับข้อมูลข่าวกรองที่แน่ชัดจากผู้ที่ถูกจับกุมได้ ประธานาธิบดีได้ถามซีไอเอว่าอัล-เคดาสามารถวางแผนโจมตีในสหรัฐฯ ได้หรือไม่ ในวันที่ 6 สิงหาคม บุชได้รับการบรรยายสรุปประจำวันที่มีหัวข้อข่าว ซึ่งไม่ได้อิงจากข้อมูลข่าวกรองที่แน่ชัดในขณะนั้น ว่า "อัล-เคดาตั้งใจที่จะโจมตีภายในสหรัฐฯ" สหรัฐฯ ได้ออกตามล่าบิน ลาเดนมาตั้งแต่ปี 1996 และมีโอกาสหลายครั้ง แต่ทั้งคลินตันและบุชต่างก็ไม่ต้องการเสี่ยงที่จะเข้าไปมีบทบาทในแผนการลอบสังหารที่คลุมเครือ และโอกาสที่สมบูรณ์แบบก็ไม่เคยเกิดขึ้นสำหรับผู้อำนวยการ CIA ที่จะให้ความมั่นใจที่เขาต้องการเพื่อที่จะลงมือทำ ในวันนั้นริชาร์ด เอ. คลาร์กได้ส่งที่ปรึกษาด้านความมั่นคงแห่งชาติคอนโดลีซซา ไรซ์ไปเตือนถึงความเสี่ยง และประณามการไม่ดำเนินการของ CIA ^{[ 208 ]}

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2539 ซีไอเอได้สร้าง "สถานีเสมือนจริง" ทดลองขึ้นมา ซึ่งก็คือสถานีประเด็นบินลาเดนภายใต้ศูนย์ต่อต้านการก่อการร้าย เพื่อติดตามกิจกรรมที่กำลังพัฒนาของบินลาเดนจามาล อัล-ฟาดล์ผู้แปรพักตร์ไปอยู่กับซีไอเอในฤดูใบไม้ผลิ พ.ศ. 2539 เริ่มให้ข้อมูลใหม่เกี่ยวกับผู้นำอัล-เคดาแก่สถานีแห่งนี้ นั่นคือ เขาไม่เพียงแต่เป็นผู้ให้เงินสนับสนุนการก่อการร้าย แต่ยังเป็นผู้จัดตั้งการก่อการร้ายด้วย เจ้าหน้าที่พิเศษของเอฟบีไอ แดน โคลแมน (ซึ่งร่วมกับคู่หูของเขา แจ็ค โคลูนัน ได้รับ "มอบหมาย" ให้ไปประจำที่สถานีบินลาเดน) เรียกเขาว่า " ศิลาโรเซตตา " ของอัล-เคดา ^{[ 209 ]}

ในปี 1999 จอร์จ เทเน็ต หัวหน้าซีไอเอ ได้ริเริ่มแผนการรับมือกับอัล-เคดา ศูนย์ต่อต้านการก่อการร้ายโคเฟอร์ แบล็ก หัวหน้าคนใหม่ และ หน่วยบิน ลาเดนของศูนย์เป็นผู้พัฒนาและดำเนินการตามแผน เมื่อเตรียมการเสร็จ เทเน็ตได้มอบหมายให้ชาร์ลส์ อี. อัลเลน หัวหน้าหน่วยข่าวกรองของซีไอเอ จัดตั้ง "หน่วยอัล-เคดา" เพื่อดูแลการดำเนินการทางยุทธวิธี^{[ 210 ]}ในปี 2000 ซีไอเอและกองทัพอากาศสหรัฐฯได้ร่วมกันทำการบินสำรวจเหนืออัฟกานิสถานหลายครั้งโดยใช้โดรนลาดตระเวนควบคุมระยะไกลขนาดเล็กPredatorพวกเขาได้ภาพถ่ายที่น่าจะเป็นของบิน ลาเดน โคเฟอร์ แบล็ก และคนอื่นๆ กลายเป็นผู้สนับสนุนการติดขีปนาวุธให้กับ Predator เพื่อพยายามลอบสังหารบิน ลาเดน และผู้นำอัล-เคดาคนอื่นๆ

เมื่อวันที่11 กันยายน 2544สมาชิกกลุ่มอัล-เคด้า 19 คนได้จี้เครื่องบินโดยสาร 4 ลำในภาคตะวันออกเฉียงเหนือของสหรัฐอเมริกาในการโจมตีของผู้ก่อการร้ายที่ประสานงานกัน เครื่องบินสองลำพุ่งชนตึกแฝดเวิลด์เทรดเซ็นเตอร์ในนครนิวยอร์กลำที่สามพุ่งชนอาคาร เพนตากอน ในอาร์ลิงตันเคาน์ตี้ รัฐเวอร์จิเนียและลำที่สี่ตกในทุ่งนาใกล้เมืองแชงค์สวิลล์ รัฐเพนซิลเวเนียการโจมตีครั้งนี้คร่าชีวิตผู้คน 2,996 คน (รวมถึงผู้ก่อการร้าย 19 คน)ทำลายตึกแฝดและสร้างความเสียหายให้กับด้านตะวันตกของอาคารเพนตากอน ไม่นานหลังจากเหตุการณ์ 9/11 หนังสือพิมพ์นิวยอร์กไทมส์ได้ตีพิมพ์เรื่องราวที่ระบุว่าสำนักงานภาคสนามของซีไอเอในนิวยอร์กถูกทำลายหลังจากการโจมตี ตามแหล่งข่าวที่ไม่เปิดเผยชื่อของซีไอเอ ในขณะที่เจ้าหน้าที่กู้ภัยเจ้าหน้าที่ทหาร และอาสาสมัครกำลังดำเนินการช่วยเหลือที่บริเวณเวิลด์เทรดเซ็นเตอร์ทีมพิเศษของซีไอเอได้ค้นหาซากปรักหักพังเพื่อหาสำเนาเอกสารลับทั้งในรูปแบบดิจิทัลและกระดาษ การดำเนินการนี้เป็นไปตามขั้นตอนการกู้คืนเอกสารที่ได้เตรียมการไว้อย่างดี ซึ่งถูกนำมาใช้หลังจากอิหร่านเข้ายึดสถานทูตสหรัฐอเมริกาในกรุงเตหะรานเมื่อปี 1979

แม้ว่า CIA จะยืนยันว่าผู้ที่ทำการโจมตีในวันที่ 11 กันยายนไม่ทราบว่าหน่วยงานดังกล่าวปฏิบัติการอยู่ที่ 7 เวิลด์เทรดเซ็นเตอร์ภายใต้หน้ากากของหน่วยงานรัฐบาลกลางอื่น (ที่ไม่ระบุชื่อ) แต่ศูนย์แห่งนี้เป็นสำนักงานใหญ่สำหรับการสืบสวนคดีก่อการร้ายทางอาญาที่สำคัญหลายคดี แม้ว่าความรับผิดชอบหลักของสำนักงานภาคสนามในนิวยอร์กคือการติดตามและสรรหาเจ้าหน้าที่ต่างชาติที่ประจำอยู่ที่สหประชาชาติ แต่สำนักงานภาคสนามยังจัดการสืบสวนคดีระเบิดสถานทูตสหรัฐฯ ในแอฟริกาตะวันออกในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2541และคดีระเบิดเรือ USS Cole ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2543 อีกด้วย ^{[ 211 ]}แม้ว่าการโจมตีในวันที่ 11 กันยายนอาจสร้างความเสียหายให้กับสาขานิวยอร์กของ CIA และพวกเขาต้องยืมพื้นที่สำนักงานจากคณะผู้แทนสหรัฐฯ ประจำสหประชาชาติและหน่วยงานรัฐบาลกลางอื่นๆ แต่ก็มีข้อดีสำหรับ CIA ^{[ 211 ]}ในช่วงหลายเดือนหลังจากเหตุการณ์ 11 กันยายน มีจำนวนผู้สมัครงานในตำแหน่งของ CIA เพิ่มขึ้นอย่างมาก ตามที่ตัวแทนของ CIA ที่ให้สัมภาษณ์กับThe New York Timesระบุว่า ก่อนเหตุการณ์ 9/11 หน่วยงานได้รับใบสมัครประมาณ 500 ถึง 600 ใบต่อสัปดาห์ ในช่วงหลายเดือนหลังเหตุการณ์ 9/11 หน่วยงานได้รับใบสมัครจำนวนดังกล่าวทุกวัน^{[ 212 ]}

หน่วยงานข่าวกรองโดยรวม และโดยเฉพาะอย่างยิ่ง CIA มีส่วนร่วมในการวางแผนของประธานาธิบดีทันทีหลังจากการโจมตี 9/11 ในสุนทรพจน์ที่ประธานาธิบดีกล่าวต่อประชาชนเวลา 20:30 น. ของวันที่ 11 กันยายน พ.ศ. 2544 จอร์จ ดับเบิลยู บุช ได้กล่าวถึงหน่วยงานข่าวกรองว่า "การค้นหาผู้ที่อยู่เบื้องหลังการกระทำอันชั่วร้ายเหล่านี้กำลังดำเนินอยู่ ผมได้สั่งการให้ หน่วย งานข่าวกรองและหน่วยงานบังคับใช้กฎหมายของเราใช้ทรัพยากรทั้งหมดเพื่อค้นหาผู้รับผิดชอบและนำพวกเขาเข้าสู่กระบวนการยุติธรรม" ^{[ 213 ]}

การมีส่วนร่วมของ CIA ใน " สงครามต่อต้านการก่อการร้าย " ที่เพิ่งกำหนดขึ้นใหม่นั้นเพิ่มมากขึ้นในวันที่ 15 กันยายน พ.ศ. 2544 ระหว่างการประชุมที่แคมป์เดวิด จอร์จ ดับเบิลยู. บุช ตกลงที่จะนำแผนที่เสนอโดยจอร์จ เทเน็ต ผู้อำนวยการ CIA มาใช้ แผนนี้ประกอบด้วยการทำสงครามลับซึ่งเจ้าหน้าที่หน่วยกึ่งทหารของ CIA จะร่วมมือกับกองกำลังต่อต้านตาลีบันภายในอัฟกานิสถาน ต่อมาจะมี ทีม หน่วยปฏิบัติการพิเศษ ขนาดเล็กเข้าร่วม ซึ่งจะเรียกการโจมตีทางอากาศอย่างแม่นยำต่อกลุ่มตาลีบันและนักรบอัล-เคดา แผนนี้ได้รับการกำหนดเป็นลายลักษณ์อักษรในวันที่ 16 กันยายน พ.ศ. 2544 โดยบุชได้ลงนามในบันทึกการแจ้งเตือนอย่างเป็นทางการซึ่งอนุญาตให้แผนดำเนินการต่อไปได้^{[ 214 ]}

ในวันที่ 25–27 พฤศจิกายน พ.ศ. 2544 นักโทษตาลีบันก่อการจลาจลที่เรือนจำกาลา-อิ-จังกีทางตะวันตกของมาซาร์-อี-ชารีฟ แม้ว่าจะมีการต่อสู้กันหลายวันระหว่างนักโทษตาลีบันและ สมาชิก พันธมิตรเหนือที่อยู่ในที่นั้น แต่นักโทษก็เป็นฝ่ายได้เปรียบและได้อาวุธของพันธมิตรเหนือมา ในช่วงเวลาหนึ่งจอห์นนี่ "ไมค์" สแปนน์เจ้าหน้าที่ซีไอเอที่ถูกส่งไปสอบสวนนักโทษ ถูกทุบตีจนเสียชีวิต เขาจึงกลายเป็นชาวอเมริกันคนแรกที่เสียชีวิตในการสู้รบในสงครามในอัฟกานิสถาน^{[ 214 ]}

หลังเหตุการณ์ 9/11 ซีไอเอถูกวิพากษ์วิจารณ์ว่าไม่ได้ทำอะไรมากพอที่จะป้องกันการโจมตี เทเน็ตปฏิเสธคำวิจารณ์ โดยอ้างถึงความพยายามในการวางแผนของหน่วยงาน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในช่วงสองปีที่ผ่านมา เขายังพิจารณาว่าความพยายามของซีไอเอทำให้หน่วยงานสามารถตอบสนองต่อการโจมตีได้อย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพ ทั้งใน "เขตปลอดภัยในอัฟกานิสถาน" และใน "เก้าสิบสองประเทศทั่วโลก" ^{[ 215 ] [ 216 ]}กลยุทธ์ใหม่นี้เรียกว่า "เมทริกซ์การโจมตีทั่วโลก" ^{[ 217 ]}

อันวาร์ อัล-อัฟลาคีพลเมืองอเมริกันเชื้อสายเยเมนและสมาชิกอัล-เคดา ถูกสังหารเมื่อวันที่ 30 กันยายน 2011 โดยการโจมตีด้วยโดรนของซีไอเอในเยเมน^{[ 218 ] [ 219 ]}ลูกชายวัย 16 ปีของอัล-อัฟลาคี ซึ่งเป็นพลเรือนและพลเมืองอเมริกัน ก็ถูกสังหารในการโจมตีอีกครั้งหนึ่ง^{[ 219 ]}แม้ว่ากระทรวงยุติธรรม จะอนุมัติ แต่การโจมตีดังกล่าวได้จุดประกายให้เกิดการถกเถียงเกี่ยวกับความชอบด้วยกฎหมายของการสังหารพลเมืองอเมริกันโดยไม่ผ่านการพิจารณาคดี^{[ 218 ]}

ข้อวิจารณ์สำคัญประการหนึ่งคือความล้มเหลวในการป้องกันเหตุการณ์โจมตีเมื่อวันที่ 11 กันยายนรายงานของคณะกรรมการสอบสวนเหตุการณ์ 9/11ระบุถึงความล้มเหลวในหน่วยข่าวกรองโดยรวม ตัวอย่างเช่น ปัญหาหนึ่งคือ FBI ล้มเหลวในการ "เชื่อมโยงข้อมูล" โดยการแบ่งปันข้อมูลระหว่างสำนักงานภาคสนามที่กระจายอยู่ทั่วพื้นที่

รายงานสรุปว่าอดีตผู้อำนวยการหน่วยข่าวกรองกลาง (DCI) จอร์จ เทเน็ตล้มเหลวในการเตรียมความพร้อมของหน่วยงานให้รับมือกับอันตรายที่เกิดจากอัล-เคดา อย่างเพียงพอ ก่อนการโจมตีเมื่อวันที่ 11 กันยายน 2544 ^{[ 220 ]}รายงานฉบับนี้เสร็จสมบูรณ์ในเดือนมิถุนายน 2548 และเผยแพร่สู่สาธารณะบางส่วนตามข้อตกลงกับรัฐสภา แม้จะมีเสียงคัดค้านจากผู้อำนวยการหน่วยข่าวกรองกลางคนปัจจุบัน พลเอกไมเคิล เฮย์เดนเฮย์เดนกล่าวว่าการเผยแพร่รายงานฉบับนี้จะ "เสียเวลาและความสนใจไปกับการทบทวนเรื่องที่เคยทำมาแล้ว" ^{[ 221 ]}เทเน็ตไม่เห็นด้วยกับข้อสรุปของรายงาน โดยอ้างถึงความพยายามในการวางแผนของเขาเกี่ยวกับอัล-เคดา โดยเฉพาะอย่างยิ่งตั้งแต่ปี 2542 ^{[ 222 ]}ผู้ช่วยรัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศฝ่ายข่าวกรองคาร์ล ดับเบิลยู ฟอร์ด จูเนียร์กล่าวว่า "ตราบใดที่เรายังให้ความสำคัญกับปริมาณข่าวกรองมากกว่าคุณภาพ เราก็จะยังคงผลิตข่าวกรองไร้ค่ามูลค่า 40 พันล้านดอลลาร์อย่างที่เรามีชื่อเสียงต่อไป" เขากล่าวเพิ่มเติมว่า “ซีไอเอพังแล้ว พังจนไม่มีใครอยากเชื่อ” ^{[ 223 ]}

ในปี 1989 ยูโกสลาเวียได้แตกออกเป็น 6 สาธารณรัฐอย่างเป็นทางการ โดยมีพรมแดนแบ่งตามเชื้อชาติและประวัติศาสตร์ ได้แก่บอสเนียและเฮอร์เซโกวีนาโครเอเชียมาซิโดเนียมอนเตเนโกร เซอร์เบียและสโลวีเนียเหตุการณ์นี้ก่อให้เกิดความตึงเครียดทางเชื้อชาติระหว่างชาวเซิร์บและชนชาติอื่นๆในบอลข่าน อย่างรวดเร็ว ในปี 1991 ซีไอเอคาดการณ์ว่าความตึงเครียดในภูมิภาคนี้จะพัฒนาไปสู่สงครามกลางเมืองเต็มรูปแบบ^{[ 224 ]}ในปี 1992 สหรัฐฯ ได้สั่งห้ามการค้าอาวุธเข้าบอสเนียและเซอร์เบีย เพื่อไม่ให้สงครามยืดเยื้อและทำลายชุมชนที่ได้รับผลกระทบ ในเดือนพฤษภาคม 1994 ซีไอเอรายงานว่าประเทศต่างๆ เช่น มาเลเซียและอิหร่าน ได้เพิกเฉยต่อคำสั่งห้ามดังกล่าว และได้เคลื่อนย้ายอาวุธเข้าไปในบอสเนีย^{[ 225 ]}

เจ็ดสิบสองวันหลังจากการโจมตี 9/11 ประธานาธิบดีบุชได้บอกกับรัฐมนตรีว่าการกระทรวงกลาโหมรัมส์เฟลด์ให้ปรับปรุงแผนการบุกอิรักของสหรัฐฯแต่ห้ามบอกใคร รัมส์เฟลด์ถามบุชว่าเขาสามารถแจ้ง DCI Tenet ให้ทราบได้หรือไม่ ซึ่งบุชก็ตกลง^{[ 226 ]}

ซีไอเอได้ส่งเจ้าหน้าที่ที่ดีที่สุดแปดคนไปประจำการในดินแดนเคิร์ดทางตอนเหนือของอิรัก ภายในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2545 ซีไอเอมีเครือข่ายที่ใช้งานได้เกือบสิบสองเครือข่ายในอิรัก^{[ 226 ] : 242} และจะแทรกซึมเข้าไปในSSO ของอิรัก ดักฟังการสื่อสารที่เข้ารหัสของรองนายกรัฐมนตรี และเกณฑ์บอดี้การ์ดของบุตรชายของฮุสเซนเป็นสายลับ เมื่อเวลาผ่านไป ซีไอเอจะยิ่งวิตกกังวลมากขึ้นเกี่ยวกับความเป็นไปได้ที่เครือข่ายของพวกเขาจะถูกบุกรุก สำหรับซีไอเอ การบุกรุกจะต้องเกิดขึ้นก่อนสิ้นเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2546 หากแหล่งข่าวของพวกเขาภายในรัฐบาลของฮุสเซนจะรอดชีวิต การจับกุมเกิดขึ้นตามที่คาดการณ์ไว้ แหล่งข่าวของซีไอเอ 37 รายถูกระบุตัวตนโดยโทรศัพท์ดาวเทียม Thuraya ที่ซีไอเอจัดหาให้^{[ 226 ] : 337}

กรณีที่โคลิน พาวเวลล์นำเสนอต่อสหประชาชาติ (ซึ่งอ้างว่าพิสูจน์โครงการอาวุธทำลายล้างสูงของอิรัก ) นั้นไม่ถูกต้อง ดีดีซีไอเอจอห์น อี . แมคลาฟลิน เป็นส่วนหนึ่งของการอภิปรายยาวนานในซีไอเอเกี่ยวกับความกำกวม แมคลาฟลิน ผู้ซึ่งจะทำการนำเสนอที่ "ชัดเจน" ต่อประธานาธิบดี "รู้สึกว่าพวกเขาต้องกล้าที่จะผิดพลาดเพื่อให้การตัดสินใจของพวกเขาชัดเจนยิ่งขึ้น" ^{[ 226 ] : 197} ตัวอย่างเช่น การเชื่อมโยงกับอัล-เคดา มาจากแหล่งข่าวเดียวที่ได้มาจากการทรมาน และต่อมาถูกปฏิเสธ แหล่งข่าวเดียวสำหรับข้อกล่าวหาเกี่ยวกับห้องปฏิบัติการอาวุธเคลื่อนที่ของอิรักซึ่งมีรหัสว่าเคิร์ฟบอลเป็นคนโกหกที่รู้จักกันดี^{[ 228 ]}การวิเคราะห์ความล้มเหลวของหน่วยข่าวกรองในช่วงก่อนเกิดสงครามอิรัก ซึ่งนำโดยอดีตรองหัวหน้าหน่วยข่าวกรอง Richard Kerr สรุปได้ว่า CIA ตกเป็นเหยื่อของสงครามเย็น ถูกทำลายล้างในลักษณะที่ "คล้ายคลึงกับผลกระทบของการพุ่งชนของอุกกาบาตต่อไดโนเสาร์ " ^{[ 229 ]}

ช่วงเริ่มต้นของการรุกรานอิรักนั้นมีทั้งความสำเร็จและความพ่ายแพ้สำหรับซีไอเอ เครือข่ายในอิรักของซีไอเอถูกบุกรุก และข้อมูลเชิงกลยุทธ์และยุทธวิธีก็ตื้นเขินและมักผิดพลาด ทำให้ด้านข่าวกรองของการรุกรานครั้งนี้กลายเป็นจุดด่างพร้อยสำหรับหน่วยงาน ซีไอเอประสบความสำเร็จบ้างกับทีมกึ่งทหาร "สกอร์ปิออน" ซึ่งประกอบด้วย เจ้าหน้าที่กึ่งทหารจาก หน่วยปฏิบัติการพิเศษ ของซีไอเอ ร่วมกับกองกำลังต่อต้าน อิรักที่เป็นมิตร เจ้าหน้าที่ซีไอเอ SAD ยังให้ความช่วยเหลือแก่ กองกำลังพิเศษที่ 10ของสหรัฐฯ อีกด้วย[ ^{226 ] [ 230 ] [ 231 ] การ}ยึดครองอิรักถือเป็นจุดตกต่ำในประวัติศาสตร์ของซีไอเอ ที่สถานีซีไอเอที่ใหญ่ที่สุดในโลก เจ้าหน้าที่จะหมุนเวียนกันปฏิบัติหน้าที่เป็นเวลา 1-3 เดือน ในอิรัก เจ้าหน้าที่ชั่วคราวเกือบ 500 นายติดอยู่ในเขตกรีนโซนขณะที่หัวหน้าสถานีในอิรักจะหมุนเวียนกันบ่อยน้อยกว่าเล็กน้อย^{[ 232 ]}

พระราชบัญญัติการปฏิรูปข่าวกรองและการป้องกันการก่อการร้าย พ.ศ. 2547ได้จัดตั้งสำนักงานผู้อำนวยการข่าวกรองแห่งชาติ (DNI) ซึ่งรับหน้าที่บางส่วนของรัฐบาลและหน่วยงานข่าวกรอง (IC) ที่ก่อนหน้านี้เป็นของ CIA ^{[ 233 ]} DNI บริหารจัดการหน่วยงานข่าวกรองของสหรัฐอเมริกา และในการทำเช่นนั้นก็บริหารจัดการวงจรข่าวกรองหน้าที่ที่โอนไปยัง DNI ได้แก่ การจัดทำประมาณการที่สะท้อนความคิดเห็นโดยรวมของหน่วยงาน IC ทั้ง 16 แห่ง และการจัดเตรียมการบรรยายสรุปสำหรับประธานาธิบดี เมื่อวันที่ 30 กรกฎาคม พ.ศ. 2551 ประธานาธิบดีบุชได้ออกคำสั่งบริหารที่ 13470 ^{[ 234 ]}แก้ไขคำสั่งบริหารที่ 12333เพื่อเสริมสร้างบทบาทของ DNI ^{[ 235 ]}

ก่อนหน้านี้ ผู้อำนวยการสำนักงานข่าวกรองกลาง (DCI) มีหน้าที่กำกับดูแลหน่วยงานข่าวกรองทั้งหมด ทำหน้าที่เป็นที่ปรึกษาด้านข่าวกรองหลักของประธานาธิบดี และดำรงตำแหน่งหัวหน้าสำนักงานข่าวกรองกลาง (CIA) ด้วย ปัจจุบัน ตำแหน่งของ DCI คือ "ผู้อำนวยการสำนักงานข่าวกรองกลาง" (D/CIA) โดยยังคงดำรงตำแหน่งหัวหน้าสำนักงานข่าวกรองกลาง (CIA) อยู่

ปัจจุบัน CIA ขึ้นตรงต่อผู้อำนวยการข่าวกรองแห่งชาติ ก่อนการจัดตั้ง DNI นั้น CIA เคยขึ้นตรงต่อประธานาธิบดี โดยมีการบรรยายสรุปข้อมูลต่อคณะกรรมการของรัฐสภาที่ปรึกษาด้านความมั่นคงแห่งชาติเป็นสมาชิกถาวรของสภาความมั่นคงแห่งชาติมีหน้าที่บรรยายสรุปข้อมูลที่เกี่ยวข้องซึ่งรวบรวมโดยหน่วยงานข่าวกรองทั้งหมดของสหรัฐฯ รวมถึงสำนักงานความมั่นคงแห่งชาติสำนักงานปราบปรามยาเสพติดฯลฯ ให้แก่ ประธานาธิบดี หน่วยงาน ข่าวกรอง ทั้ง 16 แห่ง อยู่ภายใต้การกำกับดูแลของผู้อำนวยการข่าวกรองแห่งชาติ

เมื่อวันที่ 1 พฤษภาคม 2554 ประธานาธิบดีบารัค โอบามา ประกาศว่าโอซามา บิน ลาเดนถูกสังหารในวันนั้นโดย "ทีมเล็กๆ ของชาวอเมริกัน" ที่ปฏิบัติการในเมืองแอ็บบอตตาบัดประเทศปากีสถาน ระหว่างปฏิบัติการของซีไอเอ^{[ 236 ] [ 237 ]} การโจมตีครั้งนี้ดำเนินการจากฐานปฏิบัติการของซีไอเอในอัฟกานิสถาน โดยหน่วย ปฏิบัติการพิเศษทางทะเลของกองทัพเรือสหรัฐฯและหน่วยปฏิบัติการกึ่งทหารของซีไอเอ^{[ 238 ]}

ปฏิบัติการนี้เป็นผลมาจากการทำงานด้านข่าวกรองหลายปี ซึ่งรวมถึงการจับกุมและ สอบสวนKhalid Sheik MohammadโดยCIA ซึ่งนำไปสู่การระบุตัวตนของผู้ส่งสารของบิน ลาเดน^{[ 239 ] [ 240 ] [ 241 ]}การติดตามผู้ส่งสารไปยังสถานที่โดย เจ้าหน้าที่ หน่วยปฏิบัติการพิเศษและการจัดตั้งบ้านพักปลอดภัยของ CIA เพื่อให้ข้อมูลข่าวกรองทางยุทธวิธีที่สำคัญสำหรับปฏิบัติการ^{[ 242 ] [ 243 ] [ 244 ]}

CIA ได้จัดตั้งคลินิกฉีดวัคซีนปลอมขึ้นเพื่อพยายามค้นหาโอซามา บิน ลาเดนซึ่งอาจส่งผลเสียต่อการรณรงค์ต่อต้านโรคโปลิโอในปากีสถานและอัฟกานิสถาน ในบางพื้นที่ชนบท เจ้าหน้าที่ฉีดวัคซีนถูกกลุ่มตาลีบันห้ามเข้าหรือถูกชาวบ้านไล่ล่า^{[ 245 ] [ 246 ]}มีการโจมตีที่ร้ายแรงหลายครั้งโดยกลุ่มติดอาวุธต่อเจ้าหน้าที่ฉีดวัคซีนในปากีสถาน^{[ 247 ]}นอกจากนี้ ความพยายามในการกำจัดโรคโปลิโอยังถูกขัดขวางโดย การโจมตีด้วยโดร นของอเมริกา^{[ 245 ]}

ภายใต้ปฏิบัติการTimber Sycamoreและกิจกรรมลับอื่นๆเจ้าหน้าที่ CIAและกองกำลังปฏิบัติการพิเศษของสหรัฐฯได้ฝึกฝนและติดอาวุธให้กับนักรบกบฏเกือบ 10,000 คน ด้วยงบประมาณ 1 พันล้านดอลลาร์ต่อปี^{[ 248 ]} CIA ได้ส่งอาวุธให้กับกลุ่มกบฏต่อต้านรัฐบาลในซีเรียมาตั้งแต่ปี 2012 เป็นอย่างน้อย^{[ 249 ]}มีรายงานว่าอาวุธเหล่านี้ตกไปอยู่ในมือของกลุ่มหัวรุนแรง เช่นกลุ่มอัล-นูสราและกลุ่มไอเอส [ ^{250 ] [ 251 ] [ 252 ] ประมาณ}เดือนกุมภาพันธ์ 2017 CIA ได้รับคำสั่งให้ระงับความช่วยเหลือทางทหารแก่กลุ่มกบฏซีเรีย (กองทัพซีเรียเสรี หรือ FSA) ซึ่งรวมถึงการฝึกอบรม กระสุน ขีปนาวุธนำวิถี และเงินเดือน แหล่งข่าวเชื่อว่าการระงับความช่วยเหลือดังกล่าวเกี่ยวข้องกับความกังวลว่าอาวุธและเงินทุนจะตกไปอยู่ในมือของกลุ่มไอเอส เมื่อวันที่ 6 เมษายน 2560 อัลจาซีรารายงานว่าเงินทุนสำหรับ FSA ได้รับการฟื้นฟูบางส่วนแล้ว โดยอ้างอิงจากข้อมูลที่ได้รับจากแหล่งข่าว FSA สองแหล่ง ห้องปฏิบัติการทางทหารแห่งใหม่จะได้รับเงินทุนจากกลุ่มพันธมิตร "มิตรแห่งซีเรีย" กลุ่มพันธมิตรนี้ประกอบด้วยสมาชิกจากสหรัฐอเมริกาตุรกียุโรปตะวันตกและรัฐในอ่าวเปอร์เซีย ซึ่งก่อนหน้านี้เคยสนับสนุนปฏิบัติการทางทหารที่รู้จักกันในชื่อ MOM ^{[ 253 ]}

มีรายงานในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2560 ว่าประธานาธิบดีโดนัลด์ ทรัมป์ได้สั่งให้ "ยุติ" การสนับสนุนของ CIA ต่อกลุ่มกบฏ ต่อต้าน อัสซาด^{[ 254 ]}

เมื่อวันที่ 6 มีนาคม 2558 สำนักงาน D/CIA ได้ออกแถลงการณ์ฉบับที่ไม่เป็นความลับโดยผู้อำนวยการ ในหัวข้อ "พิมพ์เขียวสำหรับอนาคตของหน่วยงานของเรา" ในรูปแบบข่าวประชาสัมพันธ์สำหรับสาธารณชน ข่าวประชาสัมพันธ์ดังกล่าวประกาศแผนการที่ครอบคลุมสำหรับการปรับโครงสร้างและปฏิรูป CIA ซึ่งผู้อำนวยการเชื่อว่าจะทำให้ CIA สอดคล้องกับหลักการของหน่วยงานที่เรียกว่า "ทิศทางเชิงกลยุทธ์" มากขึ้น การเปลี่ยนแปลงหลักที่เปิดเผย ได้แก่ การจัดตั้งหน่วยงานใหม่ คือ หน่วยงานนวัตกรรมดิจิทัล การเปลี่ยนแปลงอื่นๆ ที่ประกาศ ได้แก่ การจัดตั้งศูนย์ความเป็นเลิศด้านการพัฒนาบุคลากร การยกระดับและขยายมหาวิทยาลัยCIAและการสร้างสำนักงานอธิการบดีเพื่อเป็นหัวหน้ามหาวิทยาลัย CIA เพื่อรวมและประสานความพยายามในการสรรหาและฝึกอบรม หน่วยงานปฏิบัติการลับแห่งชาติ (NCS) จะกลับไปใช้ชื่อหน่วยงานเดิม คือหน่วยงานปฏิบัติการหน่วยงานข่าวกรองก็ได้รับการเปลี่ยนชื่อเช่นกัน โดยจะเปลี่ยนเป็นหน่วยงานวิเคราะห์^{[ 255 ]}

นโยบายใหม่ที่ประธานาธิบดีบารัค โอบามา นำมาใช้ได้ ยกเลิกอำนาจของซีไอเอในการโจมตีด้วยโดรน และอนุญาตให้การโจมตีเหล่านี้เกิดขึ้นได้เฉพาะภายใต้ คำสั่ง ของกระทรวงกลาโหม เท่านั้น การเปลี่ยนแปลงนี้ถูกยกเลิกโดยประธานาธิบดีโดนัลด์ ทรัมป์ ซึ่งอนุญาตให้ซีไอเอโจมตีด้วยโดรนใส่ผู้ก่อการร้ายที่ต้องสงสัย^{[ 256 ]}

เป็นเวลาหลายทศวรรษจนถึงปี 2018 CIA เป็นเจ้าของCrypto AG อย่างลับๆ ซึ่งเป็นบริษัทสวิสขนาดเล็กที่ผลิตอุปกรณ์เข้ารหัส โดยร่วมมือกับหน่วยข่าวกรองของเยอรมนีตะวันตกบริษัทดังกล่าวขายอุปกรณ์เข้ารหัสที่ถูกบุกรุกให้กับกว่า 120 ประเทศ ทำให้หน่วยข่าวกรองตะวันตกสามารถดักฟังการสื่อสารที่ผู้ใช้เชื่อว่าปลอดภัยได้^{[ 257 ] [ 258 ]}

จนกระทั่งการปรับโครงสร้างองค์กรข่าวกรองในปี 2547 หนึ่งใน "บริการที่เกี่ยวข้องร่วมกัน" ที่ CIA ให้บริการคือข่าวกรองแบบเปิดจากForeign Broadcast Information Service (FBIS) ^{[ 259 ]} FBIS ซึ่งได้รวมเอา Joint Publication Research Service ซึ่งเป็นองค์กรทางทหารที่แปลเอกสาร^{[ 260 ]}เข้ามาอยู่ภายใต้National Open Source Enterpriseภายใต้ผู้อำนวยการข่าวกรองแห่งชาติ

ในระหว่างการบริหารงานของเรแกนไมเคิล เซโครา (ซึ่งได้รับมอบหมายให้ประจำการที่DIA ) ได้ทำงานร่วมกับหน่วยงานต่างๆ ทั่วชุมชนข่าวกรอง รวมถึง CIA เพื่อพัฒนาและใช้งานระบบกลยุทธ์การแข่งขันที่ใช้เทคโนโลยีเป็นฐาน ซึ่งเรียกว่าProject Socrates Project Socrates ได้รับการออกแบบมาเพื่อใช้การรวบรวมข่าวกรองจากแหล่งข้อมูลเปิดเกือบทั้งหมด ระบบ Socrates ที่เน้นเทคโนโลยีนี้สนับสนุนโครงการต่างๆ เช่นStrategic Defense Initiativeรวมถึงโครงการของภาคเอกชนด้วย^{[ 261 ] [ 262 ]}

CIA เป็นผู้บริโภคข้อมูลข่าวกรองจากสื่อสังคมออนไลน์รายใหญ่ขึ้นเรื่อยๆ^{[ 263 ]} CIA เปิดบัญชีTwitterในเดือนมิถุนายน 2014 ^{[ 264 ]} นอกจากนี้ CIA ยังเปิดเว็บไซต์ .onionของตนเองเพื่อรวบรวมความคิดเห็นแบบไม่ระบุชื่อ^{[ 265 ]}

หน้าที่และภารกิจหลายอย่างของหน่วยงานข่าวกรองไม่ใช่เฉพาะซีไอเอเท่านั้น กำลังถูกว่าจ้างภายนอกและแปรรูปเป็น เอกชน ไมค์ แมคคอนเนลล์อดีตผู้อำนวยการหน่วยข่าวกรองแห่งชาติ กำลังจะเปิดเผยรายงานการสอบสวนเกี่ยวกับการว่าจ้างภายนอกของหน่วยงานข่าวกรองสหรัฐฯ ตามที่รัฐสภากำหนด^{[ 266 ]}อย่างไรก็ตาม รายงานฉบับนี้ถูกจัดเป็นเอกสารลับ^{[ 267 ] [ 268 ]}ฮิลล์เฮาส์คาดการณ์ว่ารายงานฉบับนี้รวมถึงข้อกำหนดให้ซีไอเอต้องรายงานด้วย: ^{[ 267 ] [ 269 ]}

• มีมาตรฐานที่แตกต่างกันสำหรับพนักงานของรัฐและผู้รับเหมา
• ผู้รับเหมาที่ให้บริการในลักษณะเดียวกันแก่เจ้าหน้าที่ของรัฐ
• การวิเคราะห์ต้นทุนระหว่างผู้รับเหมากับพนักงานประจำ
• การประเมินความเหมาะสมของกิจกรรมที่ว่าจ้างจากภายนอก;
• การประเมินจำนวนสัญญาและผู้รับเหมา
• การเปรียบเทียบค่าตอบแทนระหว่างผู้รับเหมาและพนักงานของรัฐ
• การวิเคราะห์อัตราการลาออกของพนักงานภาครัฐ
• คำอธิบายตำแหน่งงานที่จะต้องแปลงกลับไปใช้รูปแบบพนักงานประจำ
• การประเมินกลไกการตรวจสอบความรับผิดชอบ;
• การประเมินขั้นตอนสำหรับ "การกำกับดูแลผู้รับเหมาเพื่อให้แน่ใจว่ามีการระบุและดำเนินคดีกับการกระทำผิดทางอาญา การใช้จ่ายเงินอย่างสิ้นเปลือง การฉ้อโกง หรือการกระทำผิดอื่น ๆ ที่กระทำโดยผู้รับเหมาหรือบุคลากรตามสัญญา" และ
• "การระบุแนวทางปฏิบัติที่ดีที่สุดของกลไกการตรวจสอบความรับผิดชอบภายในสัญญาบริการ"

ตามรายงานของทิม ชอร์ร็อก นักข่าวสืบสวนสอบสวน :

...สิ่งที่เรามีในปัจจุบันเกี่ยวกับธุรกิจข่าวกรองนั้นเป็นสิ่งที่เป็นระบบมากกว่านั้นมาก: เจ้าหน้าที่ระดับสูงลาออกจากงานด้านความมั่นคงแห่งชาติและการต่อต้านการก่อการร้ายเพื่อไปรับตำแหน่งที่โดยพื้นฐานแล้วทำหน้าที่เดียวกันกับที่เคยทำใน CIA, NSA และหน่วยงานอื่นๆ – แต่ได้รับเงินเดือนและผลกำไรเป็นสองหรือสามเท่า มันเป็นการแปรรูปเป็นเอกชนในระดับสูงสุด ซึ่งความทรงจำและประสบการณ์ร่วมกันของเราในด้านข่าวกรอง – อัญมณีล้ำค่าแห่งการสอดแนมของเราว่างั้นเถอะ – ตกเป็นของบริษัทอเมริกัน โดยพื้นฐานแล้วไม่มีการกำกับดูแลจากรัฐบาลในภาคเอกชนนี้ซึ่งเป็นหัวใจสำคัญของอาณาจักรข่าวกรองของเรา และเส้นแบ่งระหว่างภาครัฐและเอกชนก็พร่าเลือนจนแทบไม่มีอยู่จริง^{[ 270 ] [ 271 ]}

รัฐสภาได้กำหนดให้มีรายงานการจ้างเหมาภายนอกภายในวันที่ 30 มีนาคม พ.ศ. 2551: ^{[ 269 ]}

ผู้อำนวยการหน่วยข่าวกรองแห่งชาติได้รับมอบอำนาจให้เพิ่มจำนวนตำแหน่ง (FTE) ในหน่วยงานข่าวกรองได้มากถึง 10% หากมีการพิจารณาว่ากิจกรรมที่ดำเนินการโดยผู้รับเหมาควรดำเนินการโดยพนักงานของรัฐบาลสหรัฐฯ” ^{[ 269 ]}

ส่วนหนึ่งของปัญหา ตามที่ผู้เขียนTim Weiner กล่าว ไว้ คือ ผู้ได้รับการแต่งตั้งทางการเมืองที่ได้รับการแต่งตั้งจากฝ่ายบริหารของประธานาธิบดีในช่วงที่ผ่านมา บางครั้งอาจไม่มีคุณสมบัติเพียงพอหรือมีความกระตือรือร้นทางการเมืองมากเกินไป มีการกวาดล้างครั้งใหญ่เกิดขึ้นในระดับสูงของ CIA และเมื่อบุคคลที่มีความสามารถเหล่านั้นถูกผลักดันออกไป พวกเขามักจะไปก่อตั้งบริษัทข่าวกรองอิสระแห่งใหม่ ซึ่งสามารถดึงดูดบุคลากรที่มีความสามารถของ CIA ไปได้^{[ 122 ]}อีกส่วนหนึ่งของปัญหาการทำสัญญามาจากการจำกัดจำนวนพนักงานภายในหน่วยข่าวกรองโดยรัฐสภา ตามที่ Hillhouse กล่าวไว้ ส่งผลให้ 70% ของกำลังคนโดยพฤตินัยของหน่วยงานปฏิบัติการลับแห่งชาติของ CIA ประกอบด้วยผู้รับเหมา “หลังจากหลายปีที่สนับสนุนการพึ่งพาผู้รับเหมาเพิ่มมากขึ้น ขณะนี้รัฐสภากำลังจัดทำกรอบการทำงานสำหรับการเปลี่ยนผู้รับเหมาให้เป็นพนักงานของรัฐบาลกลาง – ไม่มากก็น้อย” ^{[ 269 ]}จำนวนผู้รับเหมาอิสระที่รัฐบาลกลางว่าจ้างทั่วทั้งหน่วยข่าวกรองเพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็ว ดังนั้น ไม่เพียงแต่ CIA จะมีปัญหาในการจ้างงานเท่านั้น แต่พนักงานที่ได้รับการจ้างงานมักจะลาออกจากงานประจำเพื่อไปทำงานสัญญาจ้างระยะสั้นซึ่งมีค่าตอบแทนสูงกว่ามากและเปิดโอกาสให้ก้าวหน้าในสายอาชีพได้มากขึ้น^{[ 122 ]}

เช่นเดียวกับหน่วยงานรัฐบาลส่วนใหญ่ การสร้างอุปกรณ์มักจะทำสัญญาสำนักงานข่าวกรองแห่งชาติ (NRO) ซึ่งรับผิดชอบการพัฒนาและการดำเนินงานของเซ็นเซอร์ทางอากาศและอวกาศ เคยเป็นการดำเนินงานร่วมกันของ CIA และกระทรวงกลาโหมของสหรัฐอเมริกา NRO ซึ่งอยู่ภายใต้การกำกับดูแลของ DCI ได้ทำสัญญาเพิ่มเติมสำหรับการออกแบบที่เป็นประเพณีของพวกเขา และให้กับผู้รับเหมาที่ไม่มีประสบการณ์ด้านการลาดตระเวนมากนักอย่างโบอิ้ง โครงการ สถาปัตยกรรมภาพแห่งอนาคตของดาวเทียมรุ่นต่อไป"สวรรค์มีหน้าตาอย่างไร" ซึ่งพลาดเป้าหมายหลังจากค่าใช้จ่ายเกินงบประมาณไป 4 พันล้านดอลลาร์ เป็นผลมาจากสัญญานี้^{[ 272 ] [ 273 ]}

ปัญหาต้นทุนบางส่วนที่เกี่ยวข้องกับข่าวกรองมาจากหน่วยงานหนึ่ง หรือแม้แต่กลุ่มภายในหน่วยงานหนึ่ง ที่ไม่ยอมรับแนวปฏิบัติด้านความปลอดภัยแบบแยกส่วนสำหรับแต่ละโครงการ ซึ่งต้องอาศัยการทำซ้ำที่มีค่าใช้จ่ายสูง^{[ 274 ]}

CIA ตกเป็นเป้าของการโต้แย้งมากมาย หน่วยงานนี้ดำเนินปฏิบัติการที่มีชื่อรหัสว่า " CHAOS " ซึ่งดำเนินการตั้งแต่ปี 1967 ถึง 1974 โดยทำการสอดแนมชาวอเมริกันที่เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มสันติภาพต่างๆ ที่ประท้วงสงครามเวียดนาม เป็นประจำ ปฏิบัติการนี้ได้รับอนุญาตตามคำสั่งของประธานาธิบดีลินดอน บี. จอห์นสันในเดือนตุลาคม 1967 โดย CIA ได้รวบรวมข้อมูลของชาวอเมริกันและองค์กรต่างๆ จำนวน 300,000 ราย และแฟ้มข้อมูลจำนวนมากเกี่ยวกับพลเมือง 7,200 คน โครงการนี้ถูกเปิดเผยโดยคณะกรรมการเชิร์ชในปี 1975 ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการสอบสวนคดีวอเตอร์เกต^{[ 223 ] [ 275 ]}

นอกจากนี้ CIA ยังดำเนินโครงการลับที่เรียกว่าMKUltraซึ่งดำเนินการตั้งแต่ต้นทศวรรษ 1950 ถึงทศวรรษ 1970 และเกี่ยวข้องกับการทดลองกับมนุษย์ อย่างผิดกฎหมาย เพื่อพัฒนาเทคนิคการควบคุมจิตใจ ผู้ถูกทดลองมักไม่รู้ตัวว่าตนเองเป็นส่วนหนึ่งของการทดลอง ซึ่งรวมถึงการให้ยาออกฤทธิ์ต่อจิตประสาท เช่นLSDและวิธีการควบคุมจิตใจ อื่นๆ ^{[ 276 ] [ 277 ]} โครงการนี้ถูกเปิดโปงในทศวรรษ 1970 ทำให้เกิดความไม่พอใจอย่างกว้างขวางใน หมู่ประชาชนและเรียกร้องให้มีการกำกับดูแลหน่วยงานข่าวกรองมากขึ้น^{[ 278 ]}

นอกจากนี้ CIA ยังมีส่วนเกี่ยวข้องกับคดีอิหร่าน-คอนทราโดยมีการขายขีปนาวุธให้กับรัฐบาลอิหร่านเพื่อแลกกับการปล่อยตัวประกัน และกำไรที่หน่วยงานได้รับจากการขายอาวุธในราคาสูงเกินจริงถูกนำไปช่วยเหลือกลุ่มกบฏคอนทราในนิการากัว

แหล่งที่มาของข้อโต้แย้งอีกประการหนึ่งคือบทบาทของ CIA ในปฏิบัติการคอนดอร์ซึ่งเป็นการรณรงค์ปราบปรามและการก่อการร้ายโดยรัฐที่ได้รับการสนับสนุนจากสหรัฐอเมริกา ซึ่งเกี่ยวข้องกับปฏิบัติการข่าวกรอง การรัฐประหารที่ได้รับการสนับสนุนจาก CIA และการลอบสังหารผู้นำในอเมริกาใต้ตั้งแต่ปี 1968 ถึง 1989 เมื่อสิ้นสุดปฏิบัติการในปี 1989 มีผู้เสียชีวิตมากถึง 80,000 คน^{[ 279 ]}ในทำนองเดียวกัน CIA ก็มีส่วนร่วมในการกระทำของ^{หน่วย}สังหารในเอลซัลวาดอร์และฮอนดูรัส^{[ 280} ] ^{[ 281 ]}

ข้อโต้แย้งเพิ่มเติมเกิดขึ้นจากคำกล่าวอ้างของรัฐบาลบุช ที่ว่า อิรักมี "อาวุธทำลายล้างสูง"ในปี 2545 และอีกครั้งในปี 2546 เพื่อใช้เป็นเหตุผลในการรุกรานประเทศในตะวันออกกลาง ซีไอเอเห็นด้วยกับคำกล่าวอ้างนี้ แม้ว่าจะขัดแย้งกับคำให้การของประธานาธิบดีต่อคณะกรรมการข่าวกรองวุฒิสภาในปี 2545 พวกเขาได้จัดทำรายงานการประเมินข่าวกรองระดับชาติที่อ้างว่า หากรัฐบาลอิรักสามารถจัดหา "วัสดุฟิสไซล์ที่เพียงพอจากต่างประเทศได้ ก็จะสามารถผลิตอาวุธนิวเคลียร์ได้ภายในหนึ่งปี" ^{[ 282 ]}

• Official website CIA
• Central Intelligence Collection at the Internet Archive