เรือกลไฟล้อข้างPamlicoถูกสร้างขึ้นในปี 1856 ในนครนิวยอร์กและมีฐานอยู่ที่บริเวณนิวออร์ลีนส์ รัฐลุยเซียนา^{[ 1 ]}ในช่วงต้นเดือนกรกฎาคม ปี 1861 มีการโฆษณาว่าเรือลำนี้ให้บริการขนส่งผู้โดยสารระหว่างเมืองMandeville , Lewisburg , MadisonvilleและCovington ในรัฐลุยเซียนา กับ สถานีรถไฟ Lake Pontchartrainของ ทาง รถไฟPontchartrain ^{[ 2 ]} ในช่วงเริ่มต้นของสงครามกลางเมืองอเมริกาในปี 1861 สมาพันธรัฐอเมริกา ที่แยกตัวออกมานั้น เสียเปรียบทางด้านกองทัพเรืออย่างมากเมื่อเทียบกับสหรัฐอเมริกาในขณะที่สหรัฐอเมริกามีกองทัพเรือที่ใช้งานได้ สมาพันธรัฐต้องสร้างกองทัพเรือขึ้นมาใหม่ทั้งหมดด้วยโครงสร้างพื้นฐานและความสามารถในการผลิตที่จำกัด^{[ 3 ]} สมาพันธรัฐเริ่มตรวจสอบเรือเพื่อพิจารณาว่าเรือลำใดเหมาะสมที่จะซื้อและดัดแปลงเป็นเรือปืน [ ^{4 ]}และPamlicoถูกซื้อเมื่อวันที่ 10 กรกฎาคม ปี 1861 เพื่อจุดประสงค์^{นั้น[ 5 ] [ 6 ]} นอกจากเรือ Pamlico แล้ว เรือโดยสาร ArrowและAG Brownในทะเลสาบ Pontchartrain ก็ถูกยึดเช่นกัน ทำให้ชาวบ้านในพื้นที่ริมทะเลสาบร้องเรียนว่ารัฐบาลฝ่ายสัมพันธมิตรได้ยึดวิธีการขนส่งและการสื่อสารของพวกเขาไป^{[ 7 ]} เรือPamlico เป็นเรือขนาดเล็ก มีระวางบรรทุก218 ตัน ( 221 ตัน) ^{[ 8 ]}ขนาดอื่นๆ ของเรือไม่เป็นที่ทราบ^{[ 9 ]} เรือลำนี้ ได้รับการขึ้นระวางประจำการเมื่อวันที่ 2 กันยายน^{[ 5 ]}และอยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของร้อยโท William G. Dozier ^{[ 10 ]} เมื่อวันที่ 21 พฤศจิกายน 1861 และ 27 กุมภาพันธ์ 1862 มีรายงานว่าเรือลำนี้ติดตั้งปืนใหญ่สองกระบอก^{[ 11 ]} แต่ก็มีรายงานว่าเรือลำนี้ติดตั้งปืนใหญ่ลำกล้อง เรียบขนาด 8 นิ้ว (20 ซม.)สามกระบอก และปืนไรเฟิล Brooke ขนาด 6.4 นิ้ว (16 ซม.) อีก ด้วย^{[ 10 ]}   ตามที่ W. Craig Gaines นักประวัติศาสตร์กองทัพเรือกล่าวไว้ นี่อาจหมายถึงการเพิ่มปืนใหญ่อีกสองกระบอกมากกว่าความไม่สอดคล้องกันระหว่างแหล่งข้อมูล^{[ 1 ]}

แพมลิโกเข้าประจำการทันทีหลังจากขึ้นประจำการ โดยลาดตระเวนในอ่าวมิสซิสซิปปีไปทางตะวันออกไกลถึงเกาะฮอร์น [ ^{12 ] ร่วม} กับเรือปืนCSS Florida แพ มลิโกมีส่วนร่วมในความพยายามที่จะขึ้นเรือกลไฟUSS Montgomeryซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการปิดล้อมของฝ่ายสหภาพในวันที่ 4 ธันวาคม แผนการคือการทำให้Montgomery ใช้การไม่ได้ ด้วยการยิงระยะไกลจากปืนใหญ่ลำกล้อง เดี่ยว ที่เรือแต่ละลำบรรทุก แล้วจึงขึ้นเรือ^{[ 13 ]}แพมลิโกบรรทุกทหารประมาณ 400 นาย^{[ 14 ]}สำหรับการขึ้นเรือ ผู้บัญชาการเรือของฝ่ายสหภาพคาดเดาเจตนาของฝ่ายสัมพันธมิตรได้อย่างถูกต้อง และMontgomeryก็หนีออกไปสู่มหาสมุทรเปิด^{[ 13 ]} สามวันต่อมา ในการเดินทางไปทางตะวันตกจากเกาะฮอร์นแพมลิโกพบเรือปืนปิดล้อมUSS New LondonและUSS De Sotoใกล้กับเมืองมิสซิสซิปปี รัฐมิสซิสซิปปี เรือปืนCSS Oregonซึ่งกำลังขนส่ง อุปกรณ์ โรงสีดินปืนอยู่ที่เมืองมิสซิสซิปปี และเรือทั้งสองลำภายใต้การบังคับบัญชาโดยรวมของโดซิเออร์ ได้เผชิญหน้ากับเรือของฝ่ายสหภาพ ฝ่ายสัมพันธมิตรยิงจากระยะไกลด้วยปืนไรเฟิลสองกระบอกของพวกเขา ขณะที่ยังคงอยู่ในน้ำตื้นที่เรือปิดล้อมไม่สามารถเข้าถึงได้ ต่อมาเรือนิวลอนดอนและเดอโซโต ได้ถอน ตัวออกไปหลังจากที่ฝ่ายสัมพันธมิตรเพิกเฉยต่อการท้าทายให้เข้าปะทะใน ระยะประชิด ^{[ 15 ]} พจนานุกรมเรือรบของกองทัพเรืออเมริกันอธิบายว่า การมีส่วนร่วม ของแพมลิโกในการปะทะสองครั้งในเดือนธันวาคมนั้นไร้ผล^{[ 5 ]} หลังจากการปะทะกันในวันที่ 7 ธันวาคมแพมลิโกได้คุ้มกันโอเรกอนไปยังทะเลสาบบอร์กเนในวันที่ 20 ธันวาคม เรือปืนทั้งสองลำเป็นส่วนหนึ่งของความพยายามที่จะคุ้มกันเรือฝ่าการปิดล้อมผ่านการปิดล้อมของฝ่ายสหภาพ ซึ่งล้มเหลวเมื่อพวกเขาพบกับเรือปิดล้อมของฝ่ายสหภาพใกล้เกาะชิป^{[ 16 ]}

เมื่อวันที่ 25 มีนาคม พ.ศ. 2405 เรือแพมลิโกได้คุ้มกันเรือโอเรกอนไปยัง บริเวณ พาสส์คริสเตียนหลังจากส่งเสบียงแล้วเรือโอเรกอนก็แล่นต่อไปทางตะวันออกเพื่อสำรวจพื้นที่เกาะชิป และได้พบกับเรือนิ วลอนดอนเรือโอเรกอนจึงกลับไปยังเรือแพมลิโกและเรือทั้งสองลำก็แล่นไปยังนิวลอนดอนทั้งสองฝ่ายยิงใส่กันจากระยะ2,000 หลา (1,800 เมตร)กระสุนที่ยิงจากปืนขนาด 8 นิ้วกระบอกหนึ่งของ เรือ แพมลิโกเกิดระเบิดก่อนกำหนด ทำให้โดซิเออร์ไม่ไว้วางใจกระสุนที่เขามีสำหรับปืนเหล่านั้นอีกต่อไป หลังจากที่ปืนไรเฟิลบรูคบนเรือแพมลิโก ติดขัดจนใช้งานไม่ได้ เรือฝ่ายสัมพันธมิตรจึงถอนตัว โดยเรือแพมลิโกมุ่งหน้าไปยังป้อมแมคคอมบ์เพื่อซ่อมแซมดาดฟ้าปืนและห้องบังคับการ^{[ 17 ]} การต่อสู้กินเวลาประมาณสองชั่วโมง^{[ 18 ]} ในวันที่ 3 เมษายน เรือของฝ่ายสหภาพ 3 ลำได้แก่ เรือ นิวลอนดอนเรือกลไฟยูเอสเอสจอห์น พี. แจ็กสันและ เรือ ขนส่งทหารยูเอส เอส เฮนรี ลูอิสได้ทำการโจมตีพาสส์ คริสเตียน^{[ 19 ]}เรือแพมลิโกเรือโอเรกอนและเรือปืนซีเอสเอสคารอนเด เลต์ ได้ตอบโต้ เรือ เฮนรี ลูอิสถูกบังคับให้ถอนตัวชั่วคราวเมื่อถูกกระสุนปืนใหญ่ของฝ่ายสัมพันธมิตรยิง แต่หลังจากต่อสู้กันหนึ่งชั่วโมง ฝ่ายสัมพันธมิตรก็ถอนตัว เรือ โอเรกอนและคารอนเดเลต์ได้รับความเสียหายเล็กน้อย^{[ 20 ]} หลังจากการถอนตัวของฝ่ายสัมพันธมิตร กองทหารสหภาพบนเรือเฮนรี ลูอิสสามารถขึ้นฝั่งและควบคุมพาสส์ คริสเตียนได้^{[ 21 ]}รวมถึงการทำลายค่ายของฝ่ายสัมพันธมิตรในพื้นที่^{[ 22 ]} เรือของฝ่ายสัมพันธมิตร 3 ลำ ได้เข้าประจำตำแหน่งบนทะเลสาบปอนต์ชาร์เทรน ซึ่งพวกเขารักษาการณ์ช่องเขาเชฟ เมนเทอร์และริโกเลต [ ^{21 ]} ลูกเรือ บางส่วนของ^เรือแพมลิโกถูก จับตัวไปในวันที่ 21 เมษายน เพื่อช่วยประจำการ บนเรือรบหุ้มเกราะซีเอสเอส ลุยเซียนา^{[ 23 ]}   

On April 24, Union ships passed the Confederate defenses at Fort Jackson and Fort St. Philip. They then passed further defenses at Chalmette the next day, rendering New Orleans essentially indefensible.^[24]Oregon was sunk as a blockship, but the wreck later prevented Pamlico, Arrow, Carondelet, and the gunboat CSS Bienville from escaping. The four Confederate vessels ferried Confederate troops from New Orleans across Lake Pontchartrain to Covington. Their cannons were removed and were sent to the defenses at Vicksburg, Mississippi.^[25]Pamlico was burned by her crew on Lake Pontchartrain to prevent capture,^[1] on April 25.^[25]