บริษัทนี้ก่อตั้งโดยพันเอกอีไล ลิลลี่นักเคมีเภสัชกรรมและ ทหารผ่านศึก กองทัพสหภาพในสงครามกลางเมืองอเมริกา [ ^{8 ] ลิลลี่}ดำรงตำแหน่งประธานบริษัทจนกระทั่งเสียชีวิตในปี 1898 ^{[ 12 ]}

ในปี พ.ศ. 2412 หลังจากทำงานให้กับร้านขายยาในรัฐอินเดียนา ลิลลี่ได้เป็นหุ้นส่วนกับเจมส์ ดับเบิลยู บินฟอร์ด ในร้านขายยาแห่ง หนึ่ง ในเมืองปารีส รัฐอิลลินอยส์^{[ 13 ]}สี่ปีต่อมา ในปี พ.ศ. 2416 ลิลลี่ได้แยกตัวออกจากหุ้นส่วนกับบินฟอร์ด และกลับไปยังอินเดียนาโพลิส ในปี พ.ศ. 2417 ลิลลี่ได้เป็นหุ้นส่วนกับจอห์น เอฟ จอห์นสตัน และเปิดโรงงานผลิตยาชื่อจอห์นสตันแอนด์ลิลลี่^{[ 14 ]}

ในปี พ.ศ. 2419 ลิลลี่ได้ยุบเลิกหุ้นส่วน และใช้ส่วนแบ่งสินทรัพย์ของเขาเพื่อเปิดธุรกิจผลิตยาของตนเองชื่อ Eli Lilly and Company ในเมืองอินเดียนาโพลิส^{[ 15 ] [ 16 ]}ป้ายด้านนอกเหนือประตูร้านเขียนว่า "Eli Lilly, Chemist" ^{[ 12 ] [ 17 ]}

สมาคมประวัติศาสตร์อินเดียนาได้สร้างแบบจำลองห้องปฏิบัติการแห่งแรกของลิลลี่บนถนนเพิร์ลสตรีทขึ้นใหม่สำหรับนิทรรศการ "You Are There: Eli Lilly at the Beginning " ที่ศูนย์ประวัติศาสตร์ยูจีนและมาริลีน กลิคแห่งอินเดียนาโพลิส นิทรรศการชั่วคราว (1 ตุลาคม 2016 ถึง 20 มกราคม 2018) ยังรวมถึงผู้แสดงที่แต่งกายเป็นพันเอกลิลลี่และบุคคลอื่นๆ ด้วย^{[ 18 ]}

ในปี พ.ศ. 2429 เออร์เนสต์ จี. เอเบอร์ฮาร์ดท์ นักเคมี ได้เข้าร่วมบริษัทในฐานะนักวิทยาศาสตร์วิจัยเต็มเวลาคนแรก^{[ 19 ]}

ลิลลี่เริ่มต้นกิจการผลิตยาโดยมีพนักงานสามคน รวมทั้งลูกชายของเขาโจไซอาห์ (เจเค) ^{[ 20 ] [ 21 ]}หนึ่งในยาตัวแรกที่ลิลลี่ผลิตคือควินินซึ่งเป็นยาที่ใช้รักษา โรค มาลาเรียซึ่ง เป็นโรค ที่เกิดจากยุง^{[ 22 ]}เมื่อสิ้นปี พ.ศ. 2319 ยอดขายสูงถึง 4,470 ดอลลาร์สหรัฐ^{[ 22 ]}

ประมาณปี 1890 พันเอกลิลลี่ได้มอบกิจการของครอบครัวให้แก่โจไซอาห์ บุตรชายของเขา ซึ่งบริหารบริษัทต่อมาอีกหลายทศวรรษ พันเอกลิลลี่ยังคงมีส่วนร่วมในกิจการพลเมืองและให้ความช่วยเหลือองค์กรท้องถิ่นหลายแห่ง รวมถึง Commercial Club of Indianapolis ซึ่งต่อมากลายเป็น Indianapolis Chamber of Commerce ^{[ 23 ]}และCharity Organization Societyซึ่งเป็นองค์กรต้นแบบของ Family Services Association of Central Indiana ซึ่งเป็นองค์กรที่ได้รับการสนับสนุนจากUnited Way of America [ ^{24 ] อี}ไลและโจ บุตรชายของโจไซอาห์ ก็เป็นผู้ใจบุญที่ให้การสนับสนุนองค์กรทางวัฒนธรรมและการศึกษามากมาย^{[ 25 ]}

ในปี พ.ศ. 2421 ลิลลี่ได้จ้างเจมส์ น้องชายของเขาเป็นพนักงานขายเต็มเวลาคนแรก และทีมขายในเวลาต่อมาได้ทำการตลาดผลิตภัณฑ์ยาของบริษัทไปทั่วประเทศ^{[ 26 ]}ภายในปี พ.ศ. 2422 บริษัทมียอดขายเพิ่มขึ้นเป็น 48,000 ดอลลาร์สหรัฐ^{[ 22 ]}

บริษัทได้ย้ายสำนักงานใหญ่ในอินเดียนาโพลิสจากถนนเพิร์ลไปยังอาคารที่ใหญ่กว่าที่ 36 ถนนเซาท์เมอริเดียนในปี พ.ศ. 2324 บริษัทได้ย้ายไปยังสำนักงานใหญ่ปัจจุบันในเขตอุตสาหกรรมทางใต้ของอินเดียนาโพลิส และต่อมาบริษัทได้ซื้อสิ่งอำนวยความสะดวกเพิ่มเติมสำหรับการวิจัยและการผลิต ในปีเดียวกันนั้น ลิลลี่ได้จดทะเบียนบริษัทในชื่อ Eli Lilly and Company เลือกคณะกรรมการบริหาร และออกหุ้นให้กับสมาชิกในครอบครัวและผู้ร่วมงานใกล้ชิด^{[ 26 ]}

ผลิตภัณฑ์นวัตกรรมแรกของลิลลี่คือ การเคลือบ เจลาตินสำหรับยาเม็ดและแคปซูล นวัตกรรมในช่วงแรกอื่นๆ ของบริษัท ได้แก่ การแต่งกลิ่นรสผลไม้และยาเม็ดเคลือบน้ำตาล ซึ่งทำให้ยากลืนง่ายขึ้น^{[ 20 ]}

ในปี พ.ศ. 2425 โจไซอาห์ เค. ลิลลี่ ซีเนียร์ (เจเค) บุตรชายคนเดียวของพันเอกลิลลี่ ซึ่งเป็นนักเคมีเภสัชกรรม สำเร็จการศึกษาจากวิทยาลัยเภสัชศาสตร์ฟิลาเดลเฟียใน ฟิลาเดล เฟียและกลับไปยังอินเดียนาโพลิสเพื่อเข้าร่วมธุรกิจของครอบครัวในตำแหน่งหัวหน้าห้องปฏิบัติการ^{[ 27 ] [ 13 ] [ 28 ]}

ในปี พ.ศ. 2426 บริษัทได้ทำสัญญาเพื่อผสมและจำหน่าย Succus Alteran ซึ่งเป็นผลิตภัณฑ์แรกที่ประสบความสำเร็จอย่างกว้างขวางและเป็นหนึ่งในสินค้าขายดีที่สุด ผลิตภัณฑ์นี้วางจำหน่ายในฐานะ "ยาฟอกเลือด" และใช้รักษาโรคซิฟิลิสโรคไขข้อบางชนิดและโรคผิวหนัง เช่นกลากและโรคสะเก็ดเงิน^{[ 29 ]}

ในช่วงปลายทศวรรษ 1880 พันเอกลิลลี่เป็นหนึ่งในนักธุรกิจชั้นนำของพื้นที่อินเดียนาโพลิส และบริษัทมีพนักงานมากกว่า 100 คนและมียอดขายต่อปี 200,000 ดอลลาร์^{[ 13 ]}

ในปี พ.ศ. 2433 พันเอกลิลลี่ได้มอบหมายการบริหารจัดการธุรกิจประจำวันทั้งหมดให้กับเจเค ซึ่งบริหารบริษัทเป็นเวลา 34 ปี ทศวรรษ พ.ศ. 2433 เป็นทศวรรษที่เศรษฐกิจผันผวน แต่บริษัทกลับเจริญรุ่งเรือง^{[ 13 ] [ 30 ]}ในปี พ.ศ. 2437 ลิลลี่ได้ซื้อโรงงานผลิตเพื่อใช้ในการผลิตแคปซูลโดยเฉพาะ บริษัทยังได้พัฒนาเทคโนโลยีหลายอย่างในกระบวนการผลิต รวมถึงการทำให้การผลิตแคปซูลเป็นแบบอัตโนมัติ ในช่วงไม่กี่ปีต่อมา บริษัทได้ผลิตแคปซูลและยาเม็ดหลายสิบล้านเม็ดต่อปี^{[ 31 ]}

ในปี ค.ศ. 1898 เจ.เค. ลิลลี่ บุตรชายของลิลลี่ ได้รับมรดกบริษัทและดำรงตำแหน่งประธานบริษัทต่อจากพันเอกลิลลี่ เมื่อถึงเวลาที่พันเอกลิลลี่เสียชีวิต บริษัทมีผลิตภัณฑ์ 2,005 รายการ และมียอดขายต่อปีมากกว่า 300,000 ดอลลาร์สหรัฐ^{[ 32 ]}พันเอกลิลลี่เป็นผู้บุกเบิกในอุตสาหกรรมยาแผนปัจจุบัน โดยนวัตกรรมในช่วงแรกๆ ของเขาหลายอย่างได้กลายเป็นมาตรฐานในเวลาต่อมา การปฏิรูปจริยธรรมของเขาในอุตสาหกรรมที่เต็มไปด้วยการกล่าวอ้างยาที่มหัศจรรย์เกินจริง ได้เริ่มต้นยุคแห่งความก้าวหน้าอย่างรวดเร็วในการพัฒนายา^{[ 33 ]}เจ.เค. ลิลลี่ ยังคงสนับสนุนการควบคุมยาโดยรัฐบาลกลางต่อไป^{[ 34 ]}

เมื่อบริษัท Lilly เติบโตขึ้น ธุรกิจอื่นๆ ก็ได้เข้ามาตั้งโรงงานใกล้กับโรงงานทางด้านทิศใต้ของเมืองอินเดียนาโพลิส พื้นที่ดังกล่าวพัฒนาจนกลายเป็นศูนย์กลางธุรกิจและอุตสาหกรรมที่สำคัญแห่งหนึ่งของเมือง การผลิต การผลิต การวิจัย และการดำเนินงานด้านบริหารของ Lilly ในอินเดียนาโพลิสในที่สุดก็ครอบครองอาคารมากกว่าสองโหล ซึ่งครอบคลุมพื้นที่ 15 บล็อก นอกเหนือจากโรงงานผลิตตามแนวถนนเคนตักกี้^{[ 35 ]}

นอกจากพันเอกลิลลี่ น้องชายของเขา เจมส์ และลูกชาย โจไซอาห์ (เจเค) แล้ว บริษัทยังจ้างสมาชิกครอบครัวลิลลี่คนอื่นๆ อีกด้วย อีแวน ลิลลี่ ลูกพี่ลูกน้องของพันเอกลิลลี่ ได้รับการว่าจ้างเป็นพนักงานบัญชี^{[ 30 ]}อีไลและโจไซอาห์ จูเนียร์ (โจ) หลานชายของลิลลี่เข้าร่วมบริษัทตั้งแต่อายุยังน้อย^{[ 30 ]}ภายใต้การนำของเจเค บริษัทได้นำแนวคิดการจัดการเชิงวิทยาศาสตร์มาใช้ จัดตั้งแผนกวิจัยของบริษัท เพิ่มกำลังคนฝ่ายขาย และเริ่มกระจายสินค้าไปต่างประเทศ ในช่วงปลายศตวรรษที่ 19 ลิลลี่ดำเนินกิจการในอินเดียนาโพลิสและพื้นที่โดยรอบเช่นเดียวกับธุรกิจยาอื่นๆ อีกมากมาย โดยผลิตและจำหน่าย "ยาเม็ดเคลือบน้ำตาล สารสกัดเหลว ยาอายุวัฒนะ และน้ำเชื่อม" ^{[ 29 ]}บริษัทใช้พืชเป็นวัตถุดิบและผลิตสินค้าด้วยมือ นักประวัติศาสตร์คนหนึ่งตั้งข้อสังเกตว่า "แม้ว่าบริษัทอินเดียนาโพลิสจะระมัดระวังในการผลิตและส่งเสริมยามากกว่าผู้ผลิตยาสามัญประจำถิ่นในยุคนั้น แต่บริษัทก็ยังคงลังเลใจเกี่ยวกับการวิจัยทางวิทยาศาสตร์" ^{[ 29 ]}

ในปี ค.ศ. 1905 เจ.เค. ลิลลี่ ได้ดูแลการขยายตัวครั้งใหญ่ของบริษัท ส่งผลให้ยอดขายต่อปีสูงถึง 1 ล้านดอลลาร์สหรัฐ

หลังเหตุการณ์แผ่นดินไหวที่ซานฟรานซิสโกในปี พ.ศ. 2449บริษัทได้ส่งยาที่จำเป็นมากไปสนับสนุนความพยายามในการฟื้นฟู^{[ 36 ]}

ก่อนและหลังสงครามโลกครั้งที่ 1บริษัทประสบกับการเติบโตอย่างรวดเร็ว^{[ 29 ]}รวมถึงการขยายโรงงานผลิตที่โรงงาน McCarty Street ซึ่งช่วยเพิ่มกำลังการผลิตด้วยอาคารวิทยาศาสตร์แห่งใหม่ (อาคาร 14) ที่เปิดในปี 1911 และโรงงานผลิตแคปซูลแห่งใหม่ (อาคาร 15) ในปี 1913 ^{[ 37 ]}ในปี 1913 บริษัทได้เริ่มก่อสร้างห้องปฏิบัติการชีววิทยาของลิลลี่ซึ่งเป็นโรงงานวิจัยและผลิตบนพื้นที่ 150 เอเคอร์ใกล้กับ เมืองกรีนฟิลด์ รัฐอินเดียนา^{[ 38 ] [ 39 ]}

หลังสงครามโลกครั้งที่ 1โรงงานผลิตที่ขยายตัวและการนำวิธีการบริหารจัดการใหม่มาใช้ของบริษัทได้วางรากฐานสำหรับขั้นตอนสำคัญถัดไปของลิลลี่ นั่น คือ "การเข้าสู่การวิจัยและพัฒนาทางวิทยาศาสตร์อย่างจริงจัง" ^{[ 17 ]}ก้าวสำคัญแรกเกิดขึ้นในปี 1919 เมื่อโจไซอาห์ ลิลลี่ จ้างนักชีวเคมีจอร์จ เฮนรี อเล็กซานเดอร์ โคลว์สเป็นผู้อำนวยการฝ่ายวิจัยชีวเคมี^{[ 40 ]}โคลว์สมีความเชี่ยวชาญด้านการวิจัยทางการแพทย์อย่างกว้างขวางและมีเครือข่ายเชื่อมโยงกับชุมชนวิจัยทางวิทยาศาสตร์ ซึ่งนำไปสู่ความร่วมมือของบริษัทกับนักวิจัยในสหรัฐอเมริกาและที่อื่นๆ^{[ 41 ]}ความร่วมมือครั้งสำคัญครั้งแรกของโคลว์สกับนักวิจัยที่พัฒนาอินซูลินที่มหาวิทยาลัยโตรอนโตส่งผลกระทบอย่างมากต่ออนาคตของบริษัท^{[ 41 ]}ความสำเร็จของลิลลี่ในการผลิตอินซูลินทำให้บริษัทมีตำแหน่งที่มั่นคงในฐานะผู้ผลิตยาที่เน้นการวิจัยชั้นนำ ซึ่งช่วยให้บริษัทสามารถดึงดูดและจ้างนักวิทยาศาสตร์ด้านการวิจัยมากขึ้น และร่วมมือกับมหาวิทยาลัยอื่นๆ ในการวิจัยทางการแพทย์เพิ่มเติม^{[ 42 ]}

นอกจากการพัฒนายาใหม่แล้ว บริษัทยังประสบความสำเร็จในการพัฒนาเทคโนโลยีหลายประการ รวมถึงการทำให้โรงงานผลิตเป็นระบบอัตโนมัติ ลิลลี่เป็นผู้ริเริ่มในการผลิตแคปซูลยาด้วย โดยเป็นหนึ่งในผู้ผลิตรายแรกๆ ที่บรรจุยาลงในแคปซูลเจลาตินเปล่า ซึ่งทำให้ได้ขนาดยาที่แม่นยำยิ่งขึ้น^{[ 12 ]}ลิลลี่ผลิตแคปซูลเพื่อใช้เองและขายส่วนเกินให้กับผู้อื่น^{[ 43 ]}

ในปี พ.ศ. 2460 Scientific Americanได้บรรยายถึง Lilly ว่าเป็น "โรงงานผลิตแคปซูลที่ใหญ่ที่สุดในโลก" และรายงานว่าบริษัท "สามารถผลิตแคปซูลได้ 2.5 ล้านแคปซูลต่อวัน" ^{[ 43 ]}หนึ่งในนวัตกรรมในช่วงแรกของ Lilly คือการปรุงแต่งรสผลไม้ให้กับยาและยาเม็ดเคลือบน้ำตาลเพื่อให้กลืนยาได้ง่ายขึ้น^{[ 20 ]}ในช่วงไม่กี่ปีต่อมา บริษัทได้ผลิตแคปซูลและยาเม็ดหลายสิบล้านเม็ดต่อปี^{[ 31 ]}

ความก้าวหน้าอื่นๆ ช่วยปรับปรุงประสิทธิภาพของโรงงานและขจัดข้อผิดพลาดในการผลิต ในปี พ.ศ. 2452 Eli Lillyหลานชายของผู้ก่อตั้งบริษัท ได้นำวิธีการพิมพ์เขียวสำหรับใบสั่งผลิตมาใช้^{[ 44 ]}ซึ่งสร้างสำเนาสูตรยาหลายชุดและช่วยขจัดข้อผิดพลาดในการผลิตและการคัดลอก^{[ 43 ]}

ในปี ค.ศ. 1919 โจไซอาห์ได้ว่าจ้างจอร์จ เฮนรี อเล็กซานเดอร์ โคลว์ส นักชีวเคมี ให้ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการฝ่ายวิจัยชีวเคมี

ในช่วงทศวรรษ 1920 อีไลได้นำแนวคิดใหม่ของการผลิตแบบเส้นตรงมาใช้ในอุตสาหกรรมยา โดยวัตถุดิบจะเข้ามาทางด้านหนึ่งของโรงงาน และผลิตภัณฑ์สำเร็จรูปจะออกมาทางอีกด้านหนึ่งในกระบวนการผลิตของบริษัท^{[ 45 ]}กระบวนการใหม่นี้ส่งผลให้ผลผลิตและกำไรของบริษัทเพิ่มขึ้น^{[ 45 ]}ภายใต้การดูแลของอีไล การออกแบบอาคาร 22 ซึ่งเป็นโรงงานใหม่ 5 ชั้นที่เปิดในอินเดียนาโพลิสในปี 1926 ได้นำแนวคิดการผลิตแบบเส้นตรงมาใช้เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพการผลิตและลดต้นทุนการผลิต^{[ 46 ] [ 47 ]}นักประวัติศาสตร์คนหนึ่งกล่าวว่า "น่าจะเป็นระบบการผลิตที่ซับซ้อนที่สุดในอุตสาหกรรมยาของอเมริกา" ^{[ 47 ]}กระบวนการผลิตที่มีประสิทธิภาพมากขึ้นนี้ยังช่วยให้บริษัทสามารถจ้างพนักงานประจำได้ แทนที่จะเรียกคนงานกลับมาในช่วงเวลาที่มีความต้องการสูงและเลิกจ้างเมื่อความต้องการการผลิตลดลง พนักงานประจำของลิลลี่สามารถผลิตยาที่มีต้นทุนต่ำกว่าในช่วงเวลาที่ไม่ใช่ช่วงที่มีความต้องการสูง โดยใช้โรงงานผลิตเดียวกัน^{[ 47 ]}

ในช่วงทศวรรษ 1920 การเปิดตัวผลิตภัณฑ์ใหม่นำมาซึ่งความสำเร็จทางการเงินแก่บริษัท^{[ 29 ]}ในปี 1921 นักวิทยาศาสตร์จากมหาวิทยาลัยโตรอนโต 3 คน ได้แก่ John Macleod , Frederick BantingและCharles Bestกำลังทำงานเกี่ยวกับการพัฒนาอินซูลินเพื่อรักษาโรคเบาหวาน^{[ 48 ]} Clowes เสนอความร่วมมือกับนักวิจัยในเดือนธันวาคม 1921 และอีกครั้งในเดือนมีนาคมและพฤษภาคม 1922 นักวิจัยลังเลที่จะทำงานกับบริษัทยาเชิงพาณิชย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งเนื่องจากพวกเขามี สิ่งอำนวยความสะดวกที่ไม่ใช่เชิงพาณิชย์ของ ห้องปฏิบัติการ Connaughtอยู่แล้ว แต่เมื่อถึงขีดจำกัดของขนาดที่ Connaught สามารถผลิตอินซูลินได้ Clowes และ Eli Lilly ได้พบกับนักวิจัยในปี 1922 เพื่อเจรจาข้อตกลงกับนักวิทยาศาสตร์จากมหาวิทยาลัยโตรอนโตเพื่อผลิตอินซูลินในปริมาณมาก^{[ 49 ] [ 50 ] [ 51 ]}ความร่วมมือนี้ช่วยเร่งการผลิตสารสกัดในปริมาณมากอย่างมาก^{[ 52 ]}

ในปี พ.ศ. 2466 บริษัทเริ่มจำหน่าย Iletin ซึ่งเป็นชื่อทางการค้าของบริษัทสำหรับผลิตภัณฑ์อินซูลินตัวแรกที่วางจำหน่ายในเชิงพาณิชย์ในสหรัฐอเมริกาสำหรับการรักษาโรคเบาหวาน^{[ 53 ]}คณะกรรมการอินซูลินของมหาวิทยาลัยโทรอนโตได้ยื่นคัดค้านการใช้คำว่า "Iletin" ของ Lilly หลายครั้ง แม้ว่าการผลิตจะยังคงดำเนินต่อไปภายใต้ชื่อนี้ และต่อมาการคัดค้านก็ถูกยกเลิก "เพื่อเป็นการประนีประนอม" ^{[ 54 ] [ 55 ]}

นอกจากนี้ ในปี 1923 แบนติงและแมคลีโอได้รับรางวัลโนเบลจากการวิจัยของพวกเขา ซึ่งต่อมาพวกเขาได้แบ่งปันรางวัลนี้กับผู้ร่วมค้นพบชาร์ลส์ เบสต์และเจมส์ คอลลิป [ ^{56 ] [ 57 ] อินซูลิน}ซึ่งเป็น "ยาที่สำคัญที่สุด" ในประวัติศาสตร์ของบริษัท ได้ "ทำมากกว่ายาอื่นใด" เพื่อทำให้ลิลลี่กลายเป็น "หนึ่งในผู้ผลิตยาที่สำคัญของโลก" ^{[ 48 ]}บริษัทอีไลลิลลี่แอนด์คอมพานีได้ผูกขาดการขายอินซูลินในสหรัฐอเมริกาเป็นเวลาเกือบสองปี จนกระทั่งผู้ได้รับใบอนุญาตรายใหม่ชาวอเมริกันรายแรกคือ เฟรเดอริค สเติร์นส์ แอนด์ โค เข้าสู่ตลาดในเดือนมิถุนายน 1924 ^{[ 58 ]}

ความสำเร็จของอินซูลินทำให้บริษัทสามารถดึงดูดนักวิทยาศาสตร์และด้วยเหตุนี้จึงทำให้เกิดความก้าวหน้าทางการแพทย์มากขึ้น เมื่อถึงวันครบรอบ 50 ปีของบริษัทในปี 1926 ยอดขายของบริษัทก็สูงถึง 9 ล้านดอลลาร์ และบริษัทก็ผลิตสินค้ามากกว่า 2,800 รายการ^{[ 59 ]}

ในปี พ.ศ. 2461 ลิลลี่ได้นำสารสกัดจากตับหมายเลข 343 มาใช้รักษาโรคโลหิตจางชนิดร้ายแรงซึ่งเป็นโรคเลือดชนิดหนึ่ง โดยร่วมมือกับนักวิทยาศาสตร์จากมหาวิทยาลัยฮาร์วาร์ด สองคน คือ จอร์จ มิโนต์และวิลเลียม พี. เมอร์ฟีในปี พ.ศ. 2473 ลิลลี่ได้นำสารสกัดจากตับหมายเลข 55 มาใช้โดยร่วมมือกับจอร์จ วิปเปิลนักวิทยาศาสตร์จากมหาวิทยาลัยโรเชสเตอร์^{[ 60 ]}สี่ปีต่อมา ในปี พ.ศ. 2477 มิโนต์ เมอร์ฟี และวิปเปิล ได้รับรางวัลโนเบลสาขาสรีรวิทยาหรือการแพทย์จากการวิจัยของพวกเขา^{[ 61 ]}

ในช่วงทศวรรษ 1930 บริษัทยังคงขยายกิจการไปต่างประเทศอย่างต่อเนื่อง^{[ 62 ]}ในปี 1934 บริษัท Eli Lilly and Company Limited ซึ่งเป็นบริษัทสาขาต่างประเทศแห่งแรกของบริษัท ได้ก่อตั้งขึ้นในลอนดอนและโรงงานผลิตก็เปิดทำการในเบซิงสโตก [ ^{62 ] ใน}ปี 1932 แม้จะเผชิญกับความท้าทายทางเศรษฐกิจจากภาวะเศรษฐกิจตกต่ำครั้งใหญ่ยอดขายของลิลลี่ก็เพิ่มขึ้นเป็น 13 ล้านดอลลาร์ ในปีเดียวกันนั้น อีไล ลิลลี่ หลานชายคนโตของพันเอกลิลลี่ ซึ่งเข้าร่วมบริษัทในปี 1909 ได้รับการแต่งตั้งให้เป็นประธานบริษัท สืบทอดตำแหน่งต่อจากบิดาของเขา ซึ่งดำรงตำแหน่งประธานกรรมการจนถึงปี 1948 ในช่วงแรกๆ ที่ทำงานในบริษัท อีไลให้ความสนใจเป็นพิเศษในการปรับปรุงประสิทธิภาพการผลิต และได้นำอุปกรณ์ประหยัดแรงงานหลายอย่างมาใช้ เขายังได้นำหลักการจัดการเชิงวิทยาศาสตร์มาใช้ ดำเนินมาตรการประหยัดต้นทุนที่ทำให้บริษัททันสมัยขึ้น^{[ 63 ]}และขยายความพยายามในการวิจัยของบริษัทและความร่วมมือกับนักวิจัยจากมหาวิทยาลัย^{[ 64 ]}

บริษัท Lilly เปิดตัวในปี 1930 และได้พัฒนาสารกันบูดวัคซีนไทโอเมอร์ซอล (เรียกอีกอย่างว่าเมอร์ไธโอเลตและไทเมอโรซอล) เมอร์ไธโอเลตเป็นสารฆ่าเชื้อและสารฆ่าเชื้อโรคที่มีส่วนประกอบของปรอท ซึ่ง "ได้รับการคิดค้นสูตรขึ้นที่มหาวิทยาลัยแมริแลนด์โดยได้รับการสนับสนุนจากทุนวิจัยของ Lilly" ^{[ 65 ]}ในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2545 ^{[ 66 ]}พรรครีพับลิกันในรัฐสภาได้แทรกบทบัญญัติในร่างกฎหมายความมั่นคงภายในประเทศที่ประธานาธิบดีจอร์จ ดับเบิลยู. บุชลงนามบังคับใช้ ซึ่งคุ้มครองบริษัท Eli Lilly จากการฟ้องร้องทั้งหมดในศาลรัฐบาลกลาง โดยกล่าวหาว่าไทโอเมอร์ซอลทำให้เกิดออทิสติกและโรคทางระบบประสาทอื่นๆ ในเด็ก เพื่อให้เรื่องดังกล่าวทั้งหมดได้รับการพิจารณาโดยผู้เชี่ยวชาญพิเศษที่ได้รับการแต่งตั้งเพื่อจุดประสงค์นี้ แทนที่จะเป็นศาลรัฐบาลกลางทั่วไป พิษวิทยาของมันคือมันจะถูกเผาผลาญเป็นเอทิลเมอร์คิวรี (C2H5Hg+) และไทโอซาลิไซเลตในร่างกาย อย่างไรก็ตาม ตั้งแต่กลางทศวรรษ 2543 เป็นต้นมา การใช้งานส่วนใหญ่ก็ลดลง

ในปี พ.ศ. 2477 บริษัทได้เปิดสถานที่ใหม่ 2 แห่งในอินเดียนาโพลิส บนอาคาร McCarty Street ซึ่งเป็นแบบจำลองของห้องปฏิบัติการของ Lilly ในปี พ.ศ. 2419 และห้องปฏิบัติการวิจัย Lilly แห่งใหม่ ซึ่งเป็น "หนึ่งในสถานที่ที่มีอุปกรณ์ครบครันที่สุดในโลก" ^{[ 67 ] [ 48 ]}ในฐานะส่วนหนึ่งของกระบวนการวิจัยและพัฒนาผลิตภัณฑ์ Lilly ยังได้ดำเนินการศึกษาทางคลินิกที่โรงพยาบาลเมืองอินเดียนา โพลิ ส ด้วย

เซโคบาร์บิทัล ( Secobarbital)เป็นอนุพันธ์ของ บาร์บิทูเรต ( Barbiturate)ที่ได้รับการจดสิทธิบัตรโดยบริษัทลิลลี่ (Lilly) ในปี 1934 มีคุณสมบัติในการระงับ ความรู้สึก ต้านอาการชักทำให้สงบและทำให้ หลับ บริษัทลิลลี่ทำการตลาดเซโคบาร์บิทัลภายใต้ชื่อแบรนด์ Seconal เซโคบาร์บิทัลมีข้อบ่งใช้ในการรักษาโรค ลมชัก อาการนอนไม่ หลับ ชั่วคราวและใช้เป็นยาเตรียมก่อนผ่าตัดเพื่อระงับความรู้สึกและลดความวิตกกังวลในขั้นตอนการผ่าตัด การวินิจฉัย หรือการรักษาที่ไม่เจ็บปวดมากนัก เนื่องจากมีการพัฒนาวิธีการรักษาใหม่ๆ สำหรับภาวะเหล่านี้ เซโคบาร์บิทัลจึงถูกนำมาใช้น้อยลง และบริษัทลิลลี่ได้หยุดการผลิตในปี 1999 เซโคบาร์บิทัลได้รับความสนใจอย่างมากในช่วงทศวรรษ 1970 เมื่อมันได้รับความนิยมอย่างแพร่หลายในการใช้เป็นยาเสพติดเพื่อความบันเทิงในเดือนกันยายนปี 1970 จิมิ เฮนดริกซ์ (Jimi Hendrix)ตำนานมือกีตาร์เพลงร็อคเสียชีวิตจากการใช้เซโคบาร์บิทัลเกินขนาด ในเดือนมิถุนายน ปี 1969 การใช้ยาเซโคบาร์บิทัลเกินขนาดเป็นสาเหตุการเสียชีวิตของนักแสดงหญิงจูดี้ การ์แลนด์ยาชนิดนี้เป็นส่วนสำคัญของเนื้อเรื่องในนวนิยายยอดนิยมเรื่องValley of the Dolls (1966) โดยแจ็กเกอลีน ซูซานซึ่ง เล่าเรื่องราวของหญิงสาว ฮอลลีวูด ที่ประสบความสำเร็จสามคน ที่ต่างตกเป็นเหยื่อของยาชนิดนี้ในรูปแบบต่างๆ นวนิยายเรื่องนี้ถูกนำมาสร้างเป็นภาพยนตร์ในชื่อเดียวกันในภายหลัง

บริษัทได้ให้ความช่วยเหลือหลังเหตุการณ์น้ำท่วมเมืองจอห์นสทาวน์ใน ปี 1936

ในช่วงสงครามโลกครั้งที่สองบริษัทได้ขยายการผลิตไปสู่ระดับใหม่ โดยผลิตเมอร์ไธโอเลต ซึ่งเป็น สารประกอบออร์ กาโนเมอร์คิวรีและเพนิซิลลินซึ่งเป็นยาปฏิชีวนะกลุ่มเบตา-แลคแทมลิลลี่ยังร่วมมือกับสภากาชาดอเมริกันในการแปรรูปพลาสมาในเลือดเมื่อสิ้นสุดสงครามโลกครั้งที่สอง บริษัทได้ทำให้เลือดแห้งไปกว่าสองล้านไพนต์ ซึ่งคิดเป็น "ประมาณ 20 เปอร์เซ็นต์ของปริมาณเลือดทั้งหมดของสหรัฐอเมริกา" ^{[ 68 ]}เมอร์ไธโอเลต ซึ่งเปิดตัวครั้งแรกในปี 1930 เป็น "ยาฆ่าเชื้อและยาฆ่าเชื้อโรค" ซึ่งกลายเป็น ยามาตรฐานของ กองทัพสหรัฐฯในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง^{[ 69 ] [ 65 ] [ 70 ]}ในช่วงสงครามโลกครั้งที่สองลิลลี่ผลิตผลิตภัณฑ์สำหรับใช้ในกองทัพ รวมถึงชุดอุปกรณ์เอาชีวิตรอดสำหรับนักบินและยาแก้เมาเรือสำหรับการบุกโจมตีในวันดีเดย์ ตลอดจนเพนิซิลลิน^{[ 71 ]}ในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง ลิลลี่ผลิตเพนิซิลลินและยาปฏิชีวนะ อื่นๆ "ยาต้านมาลาเรีย" พลาสมาในเลือด วัคซีนไข้สมองอักเสบ วัคซีนไข้ไทฟัสและไข้หวัดใหญ่ ยา แก้พิษ โรคเนื้อเน่าจากแก๊สเมอร์ไธโอเลต และไอเลทิน (อินซูลินของลิลลี่) ^{[ 72 ]}บริษัทเป็นพันธมิตรกับรัฐบาลสหรัฐฯ ในการผลิตเพนิซิลลินในปริมาณมาก^{[ 73 ]}

การดำเนินงานระหว่างประเทศขยายตัวมากยิ่งขึ้นในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง^{[ 62 ]} ในปี พ.ศ. 2486 บริษัท Eli Lilly International Corp. ก่อตั้งขึ้นเป็นบริษัทในเครือเพื่อส่งเสริมการค้าต่างประเทศ ภายใน ปีพ.ศ. 2491 พนักงานของ Lilly ทำงานใน 35 ประเทศ โดยส่วนใหญ่เป็นตัวแทนขายใน^{ละติน}อเมริกาเอเชียและแอฟริกา^{[ 62} ]

หลังจากที่ตระกูลลิลลี่บริหารงานมาสามรุ่นภายใต้การนำของพันเอกอีไล ลิลลี่ ผู้ก่อตั้งบริษัท ลูกชายของเขา โจไซอาห์ เค. ลิลลี่ ซีเนียร์ และหลานชายสองคนคือ อีไล ลิลลี่ จูเนียร์ และโจไซอาห์ เค. ลิลลี่ จูเนียร์ บริษัทได้ประกาศการปรับโครงสร้างองค์กรในปี พ.ศ. 2487 ซึ่งเป็นการเตรียมการสำหรับการขยายตัวในอนาคตและการแยกการบริหารจัดการบริษัทออกจากความเป็นเจ้าของในที่สุด^{[ 74 ]}

ในปี พ.ศ. 2488 ลิลลี่ได้เริ่มขยายกิจการครั้งใหญ่ ซึ่งรวมถึงโรงงานผลิตสองแห่งในอินเดียนาโพลิส บริษัทได้ซื้อโรงงานผลิตใบพัดขนาดใหญ่ของเคอร์ติส-ไรท์บนถนนเคนทักกี ซึ่งอยู่ทางตะวันตกของโรงงานบนถนนแมคคาร์ตีของบริษัท เมื่อการปรับปรุงเสร็จสมบูรณ์ในช่วงกลางปี ​​พ.ศ. 2490 สถานที่ตั้งบนถนนเคนทักกีได้ผลิตยาปฏิชีวนะและแคปซูล และเป็นที่ตั้งของแผนกจัดส่งของบริษัท^{[ 75 ]}ในปี พ.ศ. 2491 ลิลลี่มีพนักงานเกือบ 7,000 คน^{[ 17 ]}

ในปี พ.ศ. 2490 ลิลลี่กลายเป็นผู้จัดจำหน่ายเมทาโดน รายแรก ในสหรัฐอเมริกา ซึ่งเป็นยาแก้ปวดที่ใช้บ่อยในการรักษาการติดเฮโรอีน ฝิ่น และ ยาเสพติดประเภทโอปิออยด์และ ยา เสพติดอื่นๆ^{[ 76 ]}วางจำหน่ายภายใต้ชื่อทางการค้า "โดโลฟีน" ^{[ 77 ] [ 78 ]}อีไล ลิลลี่สามารถซื้อสิทธิ์ในการผลิตยาในเชิงพาณิชย์ได้ในราคาเพียง 1 ดอลลาร์ เนื่องจากสิทธิบัตรของผู้ถือสิทธิบัตรเดิมIG FarbenและFarbwerke Hoechstไม่ได้รับการคุ้มครองหลังจากฝ่ายสัมพันธมิตรในสงครามโลกครั้งที่สองยึดสิทธิบัตร บันทึกการวิจัย และชื่อทางการค้าของเยอรมนีทั้งหมด

ในปี พ.ศ. 2491 อีไล ลิลลี่ ผู้ดำรงตำแหน่งประธานบริษัทมาตั้งแต่ปี พ.ศ. 2475 ได้เกษียณจากการบริหารงาน และดำรงตำแหน่งประธานกรรมการบริหาร พร้อมทั้งมอบตำแหน่งประธานบริษัทให้แก่โจไซอาห์ เค. ลิลลี่ จูเนียร์ (โจ) น้องชายของเขา ^{[ 79 ]}ในช่วง 16 ปีที่อีไลดำรงตำแหน่งประธานบริษัท ยอดขายเพิ่มขึ้นจาก 13 ล้านดอลลาร์ในปี พ.ศ. 2475 เป็น 117 ล้านดอลลาร์ในปี พ.ศ. 2491 โจเข้าร่วมบริษัทในปี พ.ศ. 2457 และมุ่งเน้นไปที่บุคลากรและการตลาดของบริษัท^{[ 32 ]}เขาดำรงตำแหน่งประธานบริษัทตั้งแต่ปี พ.ศ. 2491 ถึง พ.ศ. 2496 จากนั้นจึงดำรงตำแหน่งประธานกรรมการบริหาร และดำรงตำแหน่งนั้นจนกระทั่งเสียชีวิตในปี พ.ศ. 2509 ^{[ 80 ]}

ตลอดศตวรรษที่ 20 ลิลลี่ได้ขยายโรงงานผลิตออกไปนอกเมืองอินเดียนาโพลิสอย่างต่อเนื่องในปี พ.ศ. 2493 ลิลลี่ได้เปิดห้องปฏิบัติการทิปเปคาโนในเมืองลาฟาเยต รัฐอินเดียนา^{[ 81 ]}และเพิ่ม การผลิต ยาปฏิชีวนะด้วยสิทธิบัตรอิริโทรไมซิน^{[ 82 ]}

ในปี 1949 บริษัท Eli Lilly ได้ร่วมเป็นพันธมิตรกับกองทัพสำรองสหรัฐฯโดยจัดตั้งหน่วยวิจัยและวิเคราะห์ข่าวกรองเชิงกลยุทธ์ (SIRA) ในท้องถิ่น เพื่อให้พนักงานสามารถวิจัยข้อมูลของบริษัทสำหรับสาขาวิทยาศาสตร์โลจิสติกส์และยูเรเซียได้

ในช่วงทศวรรษ 1950 ลิลลี่ได้แนะนำยาปฏิชีวนะใหม่ 2 ชนิด ได้แก่แวนโคไมซินซึ่งเป็นยาปฏิชีวนะกลุ่มไกลโคเปปไทด์และอิริโทรไมซินซึ่งเป็นยาปฏิชีวนะกลุ่มมาโครไลด์^{[ 83 ]}ในช่วงทศวรรษ 1950 และ 1960 เมื่อยาสามัญเริ่มเข้ามาในตลาดอย่างมากมายหลังจากสิทธิบัตรหมดอายุ ลิลลี่จึงขยายธุรกิจไปยังด้านอื่นๆ รวมถึงสารเคมีทางการเกษตรผลิตภัณฑ์ยาสัตว์เครื่องสำอางและเครื่องมือแพทย์

ในปี พ.ศ. 2495 บริษัทได้เสนอขายหุ้นต่อสาธารณะเป็นครั้งแรก ซึ่งมีการซื้อขายในตลาดหลักทรัพย์นิวยอร์ก^{[ 84 ]}

ในปี พ.ศ. 2496 Eugene N. Beesley ได้รับการแต่งตั้งให้เป็นประธานบริษัทคนแรกที่ไม่ใช่สมาชิกในครอบครัว ซึ่งเป็นการเริ่มต้นการเปลี่ยนผ่านไปสู่การบริหารจัดการโดยบุคคลภายนอกครอบครัว^{[ 85 ]}

ในปี พ.ศ. 2497 ลิลลี่ได้ก่อตั้งบริษัทเอลันโกซึ่งตั้งชื่อตามบริษัทแม่ เพื่อผลิตยาสัตวแพทย์^{[ 86 ]}

นอกจากนี้ ในปี พ.ศ. 2497 มูลนิธิแห่งชาติเพื่อโรคโปลิโอในเด็ก ซึ่งปัจจุบันคือMarch of Dimesได้ทำสัญญากับบริษัทเภสัชกรรม 5 แห่ง ได้แก่ Lilly, Cutter Laboratories , Parke-Davis , Pitman-Moore Company และWyethเพื่อผลิตวัคซีนโปลิโอของ Salk สำหรับการทดลองทางคลินิก การที่ Lilly ได้รับเลือกให้ผลิตวัคซีนนั้น ส่วนหนึ่งเป็นเพราะประสบการณ์ก่อนหน้านี้ในการร่วมมือกับนักวิจัยของมหาวิทยาลัย ในปี พ.ศ. 2498 Lilly ผลิตวัคซีนโปลิโอของ Salk คิดเป็น 60% ^{[ 87 ]}

ในปี พ.ศ. 2505 บริษัทได้เข้าซื้อกิจการ The Distillers Companyและก่อตั้งโรงงานขนาดใหญ่ในเมืองลิเวอร์พูลประเทศอังกฤษ ในปี พ.ศ. 2511 Lilly ได้สร้างศูนย์วิจัยแห่งแรกนอกสหรัฐอเมริกา คือLilly Research Centreในเมืองเซอร์เรย์ประเทศอังกฤษ ในปี พ.ศ. 2512 บริษัทได้เปิดโรงงานแห่งใหม่ในเมืองคลินตัน รัฐอินเดียนา^{[ 81 ]}

ในช่วงทศวรรษ 1970 และ 1980 บริษัท Eli Lilly and Company ได้เร่งผลิตยาจำนวนมาก รวมถึงKeflexยาปฏิชีวนะในปี 1971, Dobutrexยา รักษา ภาวะหัวใจล้มเหลวในปี 1977, Cecloreซึ่งในที่สุดก็กลายเป็นยาปฏิชีวนะชนิดรับประทานที่ขายดีที่สุดในโลกในปี 1979, Eldisineยา รักษา โรคมะเร็งเม็ดเลือดขาว , Oraflexยา รักษา โรคข้ออักเสบและDarvonยาแก้ปวดกลุ่มโอปิออยด์

ในปี พ.ศ. 2514 เพื่อขยายสายผลิตภัณฑ์ให้หลากหลายยิ่งขึ้น ลิลลี่ได้เข้าซื้อกิจการElizabeth Arden, Inc.ในราคา 38 ล้านดอลลาร์สหรัฐ แม้ว่า Arden จะยังคงขาดทุนต่อไปอีก 5 ปีหลังจากที่ลิลลี่เข้าซื้อกิจการ แต่ในปี พ.ศ. 2525 ยอดขายของ Arden ก็เพิ่มขึ้น 90 เปอร์เซ็นต์จากปี พ.ศ. 2521 โดยมีกำไรเพิ่มขึ้นเป็นสองเท่าเกือบ 30 ล้านดอลลาร์สหรัฐ ในปี พ.ศ. 2530 ลิลลี่ขาย Arden ให้กับFabergéในราคา 657 ล้านดอลลาร์สหรัฐ^{[ 88 ]}

ในปี พ.ศ. 2515 Richard Donald Wood ได้ดำรงตำแหน่งประธานและซีอีโอของ Lilly หลังจากที่ Burton E. Beck เกษียณอายุ^{[ 89 ]}

ในปี พ.ศ. 2520 ลิลลี่ได้เข้าซื้อกิจการ IVAC Corporation ซึ่งเป็นผู้ผลิต ระบบตรวจสอบ สัญญาณชีพและระบบตรวจสอบการให้สารน้ำทางหลอดเลือดดำ^{[ 90 ]}ในปีเดียวกันนั้น ลิลลี่ได้เข้าซื้อกิจการ Cardiac Pacemakers, Inc.ซึ่งเป็นผู้ผลิตเครื่องกระตุ้นหัวใจในราคา 127 ล้านดอลลาร์ ในปี พ.ศ. 2523 ลิลลี่ได้เข้าซื้อกิจการ Physio-Controlซึ่งเป็นบริษัทผู้บุกเบิกด้านการกระตุ้นหัวใจด้วยไฟฟ้าและได้เข้าซื้อกิจการ Advance Cardiovascular Systems ในปี พ.ศ. 2527 ในราคา 85 ล้านดอลลาร์ในรูปของหุ้น^{[ 91 ]}

ลิลลี่เข้าซื้อกิจการไฮบริเทคในปี 1986 ด้วยมูลค่า 350 ล้านดอลลาร์ และขายให้กับเบ็คแมน คูลเตอร์ในปี 1995 ^{[ 92 ]}ในปี 1988 ลิลลี่เข้าซื้อกิจการดีไวซ์ฟอร์ วาสคูลาร์ อินเตอร์เวนชั่น ด้วยมูลค่า 50 ล้านดอลลาร์ โดยมีโอกาสที่จะได้รับเงินเพิ่มอีกถึง 150 ล้านดอลลาร์ตามเงื่อนไข^{[ 93 ]}ลิลลี่เข้าซื้อกิจการแปซิฟิก ไบโอเทคในปี 1990 และขายให้กับควิเดลออร์โธในปี 1995 ด้วยมูลค่า 3.95 ล้านดอลลาร์^{[ 94 ]}ในปี 1992 ลิลลี่เข้าซื้อกิจการออริจิน เมดซิสเต็มส์ ซึ่งกำลังพัฒนาอุปกรณ์หลายอย่างสำหรับใช้ในการผ่าตัดส่องกล้อง [ ^{95 ] และ}เข้าซื้อกิจการฮาร์ท ริธึม เทคโนโลยีส์ในปี 1992

ฟลูออกเซทีน (โปรแซค) ซึ่งเปิดตัวในปี 1988 กลายเป็นผลิตภัณฑ์ที่ขายดีที่สุดของบริษัทอย่างรวดเร็วสำหรับการรักษาโรคซึมเศร้า แต่ลิลลี่สูญเสียการคุ้มครองสิทธิบัตรในสหรัฐอเมริกาสำหรับผลิตภัณฑ์นี้ในปี 2001 โปรแซคเป็นหนึ่งในการบำบัดกลุ่มแรกๆ ที่ใช้รักษาโรคซึมเศร้าทางคลินิกโดยการปิดกั้นการดูดซึมเซโรโทนินภายในสมองของมนุษย์^{[ 96 ]}

ในปี พ.ศ. 2532 บริษัทร่วม ทุน ด้านเคมีเกษตรระหว่างElancoและDow Chemicalได้ก่อตั้ง DowElanco ขึ้น ในปี พ.ศ. 2540 Lilly ได้ขายหุ้น 40% ในบริษัทให้กับ Dow Chemical ในราคา 1.2 พันล้านดอลลาร์ และเปลี่ยนชื่อเป็นDow AgroSciences ^{[ 97 ]}

ในปี พ.ศ. 2534 วอห์น ไบรสัน ได้ดำรงตำแหน่งประธานและซีอีโอ และวูดได้ดำรงตำแหน่งประธานกรรมการ^{[ 89 ]}ในช่วง 20 เดือนที่ไบรสันดำรงตำแหน่งประธานและซีอีโอของลิลลี่ บริษัทได้รายงานผลขาดทุนรายไตรมาสครั้งแรกในฐานะบริษัทมหาชน^{[ 71 ]}

ในปี พ.ศ. 2536 Randall L. Tobiasรองประธานบริษัท AT&T Corporationและสมาชิกคณะกรรมการบริหารของ Lilly ได้รับการแต่งตั้งเป็นประธาน ประธานเจ้าหน้าที่บริหาร และซีอีโอของ Lilly ซึ่งเป็นประธานเจ้าหน้าที่บริหารและซีอีโอคนแรกที่ได้รับการคัดเลือกจากภายนอกบริษัท^{[ 98 ] [ 89 ]}

ในปี พ.ศ. 2537 Lilly ได้แยกแผนกอุปกรณ์ทางการแพทย์ ออก ^{[ 99 ] [ 100 ]}

ในปี พ.ศ. 2537 Lilly ได้เข้าซื้อกิจการ PCS Systems ซึ่งเป็นองค์กรดูแลสุขภาพ ด้านยาที่ใหญ่ที่สุด ในขณะนั้น ด้วยมูลค่า 4 พันล้านดอลลาร์^{[ 101 ] [ 102 ]}

Zyprexa ( Olanzapine ) ซึ่งวางจำหน่ายในปี 1996 (สำหรับโรคจิตเภทและโรคอารมณ์สองขั้วรวมถึง การใช้ แบบนอกเหนือข้อบ่งใช้) (ดูการตลาดที่ผิดกฎหมายของ Zyprexa ) เป็นยาที่ขายดีที่สุดของบริษัทจนถึงปี 2010 ซึ่งเป็นปีที่สิทธิบัตรหมดอายุ^{[ 103 ]}

ในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2539 องค์การอาหารและยาได้อนุมัติเจมซิตาบีน (เจมซาร์) สำหรับการรักษาโรคมะเร็งตับอ่อนเจมซาร์มักใช้ในการรักษาโรคมะเร็งตับอ่อน โดยปกติจะใช้ร่วมกับเคมีบำบัด 5-FU และการฉายรังสี เจมซาร์ยังใช้เป็นประจำในการรักษา โรคมะเร็งปอดชนิดไม่ใช่เซลล์ขนาดเล็กอีกด้วย^{[ 104 ] [ 105 ]}

ในปี 1998 บริษัทได้จัดตั้งห้องปฏิบัติการใหม่สำหรับการวิจัยทางคลินิกที่ศูนย์การแพทย์มหาวิทยาลัยอินเดียนาในเมืองอินเดียนาโพลิส

ซิดนีย์ ทอเรลอดีตประธานเจ้าหน้าที่ฝ่ายปฏิบัติการของลิลลี่ ได้รับการแต่งตั้งเป็นซีอีโอในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2541 เพื่อแทนที่โทเบียสที่เกษียณอายุ ทอเรลดำรงตำแหน่งประธานกรรมการในเดือนมกราคม พ.ศ. 2542 ^{[ 106 ]}ทอเรลเกษียณอายุจากตำแหน่งซีอีโอในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2551 แต่ยังคงดำรงตำแหน่งประธานกรรมการจนถึงวันที่ 31 ธันวาคม พ.ศ. 2551 จอห์น ซี. เลชไลเตอร์ได้รับเลือกเป็นซีอีโอและประธานของลิลลี่ มีผลตั้งแต่วันที่ 1 เมษายน พ.ศ. 2551 เลชไลเตอร์ดำรงตำแหน่งประธานและประธานเจ้าหน้าที่ฝ่ายปฏิบัติการของลิลลี่มาตั้งแต่เดือนตุลาคม พ.ศ. 2548 ^{[ 107 ]}

ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2541 Lilly ได้จัดตั้งกิจการร่วมค้า 50-50 กับIcosซึ่งเป็น บริษัทเทคโนโลยีชีวภาพใน เมือง Bothell รัฐวอชิงตันเพื่อพัฒนาและจำหน่ายTadalafil (Cialis) สำหรับการรักษาภาวะหย่อนสมรรถภาพทางเพศ Lilly ตกลงที่จะจ่ายค่าธรรมเนียมล่วงหน้าให้ Icos เป็นจำนวน 75 ล้านดอลลาร์สหรัฐ^{[ 108 ] [ 109 ]}

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2545 Lilly ได้ร่วมมือกับAmylin Pharmaceuticalsเพื่อพัฒนาและจำหน่ายยาตัวใหม่ของ Amylin ที่มีพื้นฐานมาจาก exendin-4 ซึ่งเป็นสารใหม่ที่แยกได้จากพิษของกิ้งก่ากิลา [ ^{110 ] Exenatide}ซึ่งเป็นตัวกระตุ้นตัวรับ GLP-1 ตัวแรก ได้รับการอนุมัติจากสำนักงานคณะกรรมการอาหารและยา ของสหรัฐอเมริกา ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2548 ^{[ 10 ]}

ในปี 2546 Lilly ได้เปิดตัว Cialis ( tadalafil ) ซึ่งเป็นคู่แข่งของViagraสำหรับภาวะหย่อนสมรรถภาพทางเพศที่พัฒนาขึ้นโดยความร่วมมือกับIcos [ ^{111 ] Cialis}ออกฤทธิ์ได้นาน 36 ชั่วโมง ทำให้บางครั้งถูกเรียกว่า "ยาสำหรับวันหยุดสุดสัปดาห์" มีการโฆษณาในระหว่างการแสดงช่วงพักครึ่ง ของ Super Bowl XXXVIII ปี 2547 และSuper Bowl XXXIX ปี 2548 ^{[ 112 ]}

ในปี พ.ศ. 2547 Lilly ได้นำduloxetine (Cymbalta) ออกวางจำหน่าย ซึ่งเป็นสารยับยั้งการดูดซึมเซโรโทนิน-นอร์เอพิเนฟริน โดยใช้เป็นหลักในการรักษาโรคซึมเศร้าและโรควิตกกังวลทั่วไป ยา นี้ติดอันดับยาที่ประสบความสำเร็จทางการเงินมากที่สุดในประวัติศาสตร์อุตสาหกรรมยา ร่วมกับ Prozac นอกจากนี้ยังใช้ในการรักษาโรคไฟโบรมัยอัลเจีย โรคเส้นประสาทอาการปวดเรื้อรังและโรคข้อเข่าเสื่อม^{[ 113 ] [ 114 ]}

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2550 Lilly ได้เข้าซื้อกิจการIcosในราคา 2.1 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ หลังจากเพิ่มข้อเสนอและเผชิญกับการคัดค้านจากInstitutional Shareholder Services [ ^{115 ] [ 116 ] [ 117 ] [ 118 ] ต่อ}มา Lilly ได้ปิดโรงงานผลิตของ Icos และเลิกจ้างพนักงาน Icos เกือบ 500 คน เหลือพนักงานเพียง 127 คนที่ยังคงทำงานอยู่ในโรงงานผลิตยาชีวภาพ^{[ 119 ]}ในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2550 CMC Biopharmaceuticals A/S (CMC) ซึ่ง เป็นผู้ให้บริการรับจ้างผลิตยาชีวภาพใน โคเปนเฮเกนได้ซื้อ โรงงานผลิตยาชีวภาพในเมือง Bothell รัฐวอชิงตันจาก Lilly และยังคงจ้างพนักงานเดิม 127 คน^{[ 120 ]}

ในปี 2551 InnoMed PredTox ซึ่งเป็นการร่วมมือกับบริษัทเภสัชกรรม องค์กรวิจัย และคณะกรรมาธิการยุโรปเพื่อปรับปรุงความปลอดภัยของยา โดยมี Lilly SA ในสวิตเซอร์แลนด์ เข้าร่วมด้วย ได้รับ งบประมาณ 8 ล้านยูโรสำหรับโครงการระยะเวลา 40 เดือน ซึ่งประสานงานโดยสหพันธ์อุตสาหกรรมยาและสมาคมแห่งยุโรป ( EFPIA ) ซึ่งเป็นองค์กรที่เป็นตัวแทนของอุตสาหกรรมยาที่เน้นการวิจัยและบริษัทเทคโนโลยีชีวภาพที่ดำเนินงานในยุโรป^{[ 121 ]}ในปี 2551 กิจกรรมของ Lilly รวมถึงโครงการวิจัยภายใต้กรอบของInnovative Medicines Initiativeซึ่งเป็นโครงการวิจัยร่วมระหว่างภาครัฐและเอกชนในยุโรป ซึ่งเป็นความพยายามร่วมกันของEFPIAและคณะกรรมาธิการยุโรป^{[ 122 ]}

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2552 ค่าปรับ ทางอาญาที่สูงที่สุด ในประวัติศาสตร์สหรัฐอเมริกา รวมเป็นเงิน 1.415 พันล้านดอลลาร์ ถูกเรียกเก็บจากบริษัท Lilly สำหรับการทำการตลาดอย่างผิดกฎหมายของผลิตภัณฑ์ที่ขายดีที่สุดของบริษัท ซึ่งก็คือยาต้านโรคจิตชนิดผิดปกติZyprexa ^{[ 123 ] [ 124 ] [ 125 ]}

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2554 Boehringer Ingelheimและ Lilly ประกาศข้อตกลงระดับโลกเพื่อร่วมกันพัฒนาและทำการตลาดAPI ใหม่ สำหรับการรักษาโรคเบาหวาน Lilly อาจได้รับเงินมากกว่า 1 พันล้านดอลลาร์สำหรับการทำงานในโครงการนี้ ในขณะที่ Boehringer Ingelheim อาจได้รับเงินมากกว่า 800 ล้านดอลลาร์จากการพัฒนาตัวยาใหม่^{[ 126 ]} ยา ต้านเบาหวานชนิดรับประทานLinagliptin ของ Boehringer Ingelheim , BI 1077 และยาอะนาล็อกอินซูลิน สองชนิดของ Lilly , LY2605541 และ LY2963016 อยู่ในขั้นตอนที่ 2 และ 3 ของการพัฒนาทางคลินิกในขณะนั้น

ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2557 Lilly ได้เข้าซื้อกิจการด้านสุขภาพสัตว์ของNovartis AGซึ่งตั้งอยู่ในสวิตเซอร์แลนด์ ด้วยเงินสด 5.4 พันล้านดอลลาร์ เพื่อเสริมสร้างและกระจายธุรกิจของหน่วย Elanco ^{[ 127 ]}เพื่อให้ได้รับการอนุมัติจากหน่วยงานกำกับ ดูแล ยารักษาพยาธิหัวใจ milbemycin oxime/lufenuronจึงถูกขายให้กับVirbac ^{[ 128 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2558 บริษัทได้ประกาศว่าจะร่วมมือกับHanmi Pharmaceuticalในการพัฒนาและจำหน่ายHM71224ซึ่งเป็นสารยับยั้งBruton's tyrosine kinase ระยะที่ 1 ของ Hanmi ในข้อตกลงที่อาจสร้างรายได้ถึง 690 ล้านดอลลาร์สหรัฐ^{[ 129 ]}อย่างไรก็ตาม หนึ่งวันต่อมา บริษัทได้ประกาศข้อตกลงอีกฉบับกับInnovent Biologicsของจีนเพื่อร่วมกันพัฒนาและจำหน่ายการรักษาอย่างน้อยสามรายการของ Innovent ในอีกสิบปีข้างหน้า ในข้อตกลงที่อาจสร้างรายได้สูงถึง 456 ล้านดอลลาร์สหรัฐ ความร่วมมือดังกล่าวได้รับการขยายเพิ่มเติมในปี พ.ศ. 2565 ตามข้อมูลของ Innovent ในส่วนหนึ่งของข้อตกลง บริษัทได้มอบแอนติบอดีโมโนโคลนอล c-Met และ Innovent ได้มอบแอนติบอดีโมโนโคลนอลที่กำหนดเป้าหมายCD-20สารประกอบตัวที่สองจาก Innovent เป็นโมเลกุลภูมิคุ้มกันมะเร็ง ในระยะก่อนคลินิก ^{[ 130 ]}ในสัปดาห์ต่อมา บริษัทได้ประกาศว่าจะเริ่มความร่วมมือกับPfizer อีกครั้ง เกี่ยวกับการทดลองระยะที่ 3 ของTanezumabคาดว่าไฟเซอร์จะได้รับเงินล่วงหน้าจำนวน 200 ล้านดอลลาร์สหรัฐจากบริษัท^{[ 131 ]}

ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2558 Lilly ได้ว่าจ้างCBRE Groupให้ขาย โรงงาน ผลิตยาชีวภาพในเมือง Vacaville รัฐแคลิฟอร์เนียซึ่งเป็นพื้นที่ ขนาด 52 เอเคอร์ (0.21 ตารางกิโลเมตร⁾และเป็นหนึ่งในศูนย์การผลิตยาชีวภาพที่ใหญ่ที่สุดในสหรัฐอเมริกา^{[ 132 ]} 

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2559 Lechleiter เกษียณอายุและ David Ricks เข้ามาดำรงตำแหน่งแทน^{[ 133 ]}

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2560 Elancoซึ่งเป็นบริษัทในเครือของบริษัทดังกล่าว ได้เข้าซื้อกิจการ Boehringer Ingelheim Vetmedica ซึ่งเป็นบริษัทในเครือของ Boehringer Ingelheim ในกลุ่มผลิตภัณฑ์วัคซีนแมว สุนัข และโรคพิษสุนัขบ้าในสหรัฐอเมริกา ด้วยมูลค่า 885 ล้านดอลลาร์สหรัฐ^{[ 134 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2560 Lilly ได้เข้าซื้อกิจการ CoLucid Pharmaceuticals ในราคา 960 ล้านดอลลาร์สหรัฐ โดยได้รับยาlasmiditan ซึ่งเป็นยาที่อยู่ในขั้นตอนการทดลองทางคลินิกขั้นปลายสำหรับการรักษาไมเกรน^{[ 135 ]}

ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2560 Lilly และShionogi ได้ร่วมกันอนุญาต ให้ Ophirex ใช้ผลิตภัณฑ์varespladib สำหรับ โปรแกรมการรักษาพิษงู แบบใหม่ของ Ophirex ^{[ 136 ]}

ในเดือนพฤษภาคม 2018 Lilly ได้เข้าซื้อกิจการ Armo Biosciences ในราคา 1.6 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ โดยได้รับยาpegilodecakin ซึ่งเป็นยาที่ช่วยเพิ่มจำนวนเม็ดเลือดขาว ในการรักษาโรคมะเร็ง ^{[ 137 ]}ไม่กี่วันต่อมา บริษัทได้ประกาศว่าจะเข้าซื้อ กิจการ AurKa Pharma ผู้พัฒนาสารยับยั้ง Aurora kinase Aและควบคุมสารประกอบหลัก AK-01 ในราคาสูงถึง 575 ล้านดอลลาร์สหรัฐ^{[ 138 ] [ 139 ]}

ในเดือนมกราคม 2019 Lilly ประกาศว่าจะเข้าซื้อกิจการ Loxo Oncology ในราคา 235 ดอลลาร์ต่อหุ้น ซึ่งประเมินมูลค่าธุรกิจไว้ที่ประมาณ 8 พันล้านดอลลาร์ และขยาย กลุ่มผลิตภัณฑ์ ด้านมะเร็งวิทยา ของธุรกิจอย่างมีนัยสำคัญ ข้อตกลงนี้ทำให้ Lilly ได้รับยาต้านTRK ชนิดรับประทานของ Loxo ได้แก่ Vitrakvi (Larotrectinib), LOXO-292 ซึ่งเป็น ยาต้าน ตัวรับไทโรซีนไคเนส ของโปรโต ออนโคยีน ชนิดรับประทาน ที่จัดเรียงใหม่ระหว่างการถ่ายทอด (RET), LOXO-305 ซึ่งเป็น ยาต้าน ไทโรซีนไคเนสของ Bruton (BTK) ชนิดรับประทาน และ LOXO-195 ซึ่งเป็นยาต้าน TRK รุ่นต่อมา^{[ 140 ] [ 141 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2562 บริษัทได้ดำเนินการแยกบริษัทElancoออกไป จนเสร็จสิ้น ^{[ 142 ]}

ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2562 Elancoได้เข้าซื้อ กิจการด้านสุขภาพสัตว์ ของ Bayerในราคา 7.6 พันล้านดอลลาร์^{[ 143 ] [ 144 ]}

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2563 บริษัทได้ประกาศเข้าซื้อกิจการ Dermira ในราคา 1.1 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ ทำให้ได้ควบคุมlebrikizumab ผ้า glycopyrroniumที่ใช้ในการรักษาภาวะเหงื่อออกมากเกินไปและสินทรัพย์อื่นๆ^{[ 145 ] [ 146 ] [ 147 ]}

ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2563 Lilly ได้ประกาศว่าได้ร่วมมือกับAbCelleraซึ่งตั้งอยู่ในแวนคูเวอร์เริ่มการศึกษาครั้งแรกของโลกเกี่ยวกับการรักษาด้วยแอนติบอดีโมโนโคลนอล ที่มีศักยภาพ ในการรักษาCOVID-19โดยเริ่มจากการทดลองระยะที่ 1 ของ LY-CoV555 ^{[ 148 ] [ 149 ]}ภายในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2563 ความท้าทายในการดำเนินการทดลองทางคลินิกในสถานดูแลระยะยาวในช่วงการระบาดใหญ่กระตุ้นให้ Lilly สร้างรถบ้านที่ได้รับการดัดแปลงเป็นหน่วยวิจัยเคลื่อนที่ (MRU) เป็นครั้งแรก เพื่อเข้าถึงผู้คนในสถานที่ที่พวกเขาอยู่ และสนับสนุนห้องปฏิบัติการเคลื่อนที่และการเตรียมวัสดุสำหรับการทดลองทางคลินิก รถบรรทุกพ่วงสามารถนำทาง MRU พร้อมอุปกรณ์เพื่อสร้างคลินิกให้ยาทางหลอดเลือดดำในสถานที่ Lilly ได้ใช้งานกองยานหน่วยวิจัยเคลื่อนที่เพื่อตอบสนองต่อการระบาดของไวรัสในสถานดูแลระยะยาวทั่วสหรัฐอเมริกา

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2563 Amgenได้ร่วมมือกับ Lilly เพื่อผลิตยาต้านไวรัสโควิด-19 ^{[ 150 ]}

ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2563 ลิลลี่ประกาศว่าค็อกเทลของตนมีประสิทธิภาพและได้ยื่นขออนุมัติการใช้งานฉุกเฉิน (EUA) ต่อองค์การอาหารและยา (FDA) ^{[ 151 ]}ในวันเดียวกันนั้นรีเจเนอรอน ฟาร์มา ซูติคอลส์ ก็ได้ยื่นขอ EUA สำหรับการรักษาด้วยแอนติบอดีโมโนโคลนอลของตนเองเช่นกัน^{[ 152 ]}ในเดือนเดียวกันนั้น ลิลลี่ประกาศว่าจะเข้าซื้อกิจการดิสอาร์ม เธราพีติกส์ และการรักษาแบบทดลองสำหรับภาวะเสื่อมของแอกซอน โดยใช้ สารยับยั้ง SARM1ในราคา 135 ล้านดอลลาร์สหรัฐ บวกเพิ่มอีกสูงสุด 1.225 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ ขึ้นอยู่กับความสำเร็จด้านกฎระเบียบและเชิงพาณิชย์^{[ 153 ]}

นอกจากนี้ ในเดือนตุลาคม 2020 Lilly ได้ประกาศว่าการทดลองทางคลินิก ACTIV-3 ของสถาบันสุขภาพแห่งชาติ (NIH) ซึ่งประเมินแอนติบอดีโมโนโคลนอลbamlanivimab (LYCoV555) พบว่า bamlanivimab ไม่มีประสิทธิภาพในการรักษาผู้ป่วยที่เข้ารับการรักษาในโรงพยาบาลด้วย COVID-19 ^{[ 154 ]}แต่ข้อมูลแสดงให้เห็นว่า bamlanivimab อาจมีประสิทธิภาพในการรักษา COVID-19 โดยการลดปริมาณไวรัส อาการ และความเสี่ยงของการเข้ารักษาในโรงพยาบาลในผู้ป่วยนอก การศึกษาอื่นๆ รวมถึงการทดลอง NIH ACTIV-2 และการทดลอง BLAZE-1 ของตนเอง ยังคงประเมิน bamlanivimab ต่อไป^{[ 154 ]}ในเดือนพฤศจิกายน 2020 องค์การอาหารและยา (FDA) ได้ออกใบอนุญาตการใช้ฉุกเฉิน (EUA) สำหรับการบำบัดด้วยแอนติบอดีโมโนโคลนอล bamlanivimab ที่อยู่ระหว่างการวิจัยสำหรับการรักษา COVID-19 ระดับเล็กน้อยถึงปานกลางในผู้ป่วยผู้ใหญ่และเด็ก^{[ 155 ] [ 156 ]}ในเดือนธันวาคม 2020 Lilly ประกาศว่าจะเข้าซื้อกิจการ Prevail Therapeutics Inc. ในราคา 1 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ เพื่อเสริมความแข็งแกร่งให้กับกลุ่มผลิตภัณฑ์ด้านการบำบัดด้วยยีนสำหรับโรคทางระบบประสาทเสื่อม^{[ 157 ]}

ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2564 องค์การอาหารและยา (FDA) ได้เพิกถอนการอนุญาตให้ใช้ในกรณีฉุกเฉิน (EUA) ซึ่งอนุญาตและส่งสัญญาณว่า FDA เห็นชอบกับการบำบัดด้วยแอนติบอดีโมโนโคลนอลที่อยู่ระหว่างการวิจัย bamlanivimab เมื่อให้ยาเพียงอย่างเดียว เพื่อใช้ในการรักษา COVID-19 ระดับเล็กน้อยถึงปานกลางในผู้ใหญ่และผู้ป่วยเด็กบางราย^{[ 158 ]}เมื่อวันที่ 18 พฤษภาคม พ.ศ. 2564 FDA ได้ยอมรับคำขอของ Lilly สำหรับ Tyvyt ( sintilimab ) ร่วมกับ Alimta ( pemetrexed ) ของ Lilly เอง และเคมีบำบัดด้วยแพลทินัมสำหรับมะเร็งปอดชนิดไม่ใช่เซลล์ขนาดเล็กที่ไม่ใช่ squamous ที่ได้รับการวินิจฉัย ใหม่^{[ 159 ]}ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2564 บริษัทได้ประกาศว่าจะเข้าซื้อกิจการ Protomer Technologies ในราคามากกว่า 1 พันล้านดอลลาร์^{[ 160 ]}

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2565 การจำหน่ายยาแอนติบอดีต้านโควิด-19 ของ Lilly ถูกระงับเนื่องจากไม่มีประสิทธิภาพในการต่อต้านเชื้อ omicron สายพันธุ์ใหม่^{[ 161 ]}ยาต้านโควิด-19 ชนิดโมโนโคลนอลแอนติบอดีตัวที่สอง คือbebtelovimabซึ่งพัฒนาร่วมกับAbCelleraได้รับการอนุมัติให้ใช้ในกรณีฉุกเฉินในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2565 โดยรัฐบาลสหรัฐฯได้ให้คำมั่นที่จะซื้อยาจำนวน 600,000 โดส มูลค่า 720 ล้านดอลลาร์สหรัฐ^{[ 162 ]}

ในเดือนพฤษภาคม 2022 องค์การอาหารและยา (FDA) ได้อนุมัติยา Mounjaro ( tirzepatide ) สำหรับ รักษาโรคเบาหวาน ประเภทที่ 2 ของบริษัท Lilly ในเดือนสิงหาคม 2022 หลังจากที่คำตัดสินในคดี Dobbs พลิกคำตัดสิน ใน คดี Roe v. Wadeรัฐอินเดียนาได้ออกกฎหมายห้ามการทำแท้งเกือบทั้งหมด และบริษัท Lilly กล่าวว่าการกระทำดังกล่าวจะทำให้การดึงดูดบุคลากรที่มีความสามารถมายังรัฐเป็นเรื่องยาก และบริษัทจะต้องมองหา "การเติบโตของการจ้างงาน" มากขึ้นในที่อื่น^{[ 163 ]}

ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2565 Lilly ได้เข้าซื้อกิจการ Akouos ผู้พัฒนาการบำบัดด้วยยีนด้วยเงิน 487 ล้านดอลลาร์สหรัฐในรูปแบบการชำระเงินล่วงหน้า และ 123 ล้านดอลลาร์สหรัฐในรูปแบบการชำระเงินภายหลัง^{[ 164 ] [ 165 ]}

ในช่วงต้นปี 2020 ลิลลี่ได้เปิดตัวโครงการ Lilly Insulin Value Program ซึ่งผู้ที่มีประกันเชิงพาณิชย์หรือไม่มีประกันสามารถรับบัตรส่วนลดเพื่อซื้ออินซูลินของลิลลี่ได้ครบตามใบสั่งยารายเดือนในราคา 35 ดอลลาร์^{[ 166 ]}ในปี 2023 พระราชบัญญัติลดเงินเฟ้อได้ขยายแนวคิดที่คล้ายกันนี้ไปยังผู้จำหน่ายอินซูลินทั้งหมด โดยกำหนดเพดานค่าใช้จ่ายส่วนตัวสำหรับอินซูลินไว้ที่ 35 ดอลลาร์ต่อใบสั่งยารายเดือนสำหรับผู้ที่ลงทะเบียนในโครงการ Medicare Parts B และ D

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2566 Lilly และ TRexBio ประกาศความร่วมมือและข้อตกลงใบอนุญาตสำหรับสินทรัพย์สามรายการเพื่อรักษา โรคที่เกิดจาก ระบบภูมิคุ้มกัน^{[ 167 ]} TRexBio ได้รับเงินล่วงหน้า 55 ล้านดอลลาร์สหรัฐเป็นส่วนหนึ่งของข้อตกลงนี้^{[ 168 ]}ในเดือนมิถุนายน บริษัทประกาศว่าจะเข้าซื้อกิจการสตาร์ทอัพ Emergence Therapeutics ^{[ 169 ]}ด้วยมูลค่าที่ไม่เปิดเผย และ Sigilon Therapeutics ในราคา 300 ล้านดอลลาร์สหรัฐ^{[ 170 ]}มีรายงานว่าการวิจัยและพัฒนาของบริษัทในปี พ.ศ. 2566 มุ่งเน้นไปที่ยาในด้านโรคอ้วน เบาหวาน อัลไซเมอร์ และโรคภูมิต้านตนเอง^{[ 171 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2566 Eli Lilly ประกาศกำหนดเพดานราคาอินซูลินรายเดือนไว้ที่ 35 ดอลลาร์สหรัฐฯ โดยจะมีผลบังคับใช้ทันทีเพื่อให้สอดคล้องกับ^{พระราชบัญญัติ}ลดเงินเฟ้อ [ ^{172 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2566 Lilly ประกาศว่าจะเข้าซื้อกิจการ Versanis ในราคา 1.93 พันล้านดอลลาร์^{[ 173 ]}ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2566 Eli Lilly เข้าซื้อกิจการ Point Biopharma ในราคา 1.4 พันล้านดอลลาร์^{[ 174 ]}

ในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2566 องค์การอาหารและยา (FDA) ได้อนุมัติยา tirzepatide สำหรับการรักษาโรคอ้วนภายใต้ชื่อทางการค้า Zepbound ^{[ 175 ]}

ในปี 2024 องค์การอาหารและยาของสหรัฐฯ และสหราชอาณาจักรได้อนุมัติDonanemabซึ่งจำหน่ายภายใต้ชื่อทางการค้า Kisunla ซึ่งเป็นแอนติบอดีโมโนโคลนอลที่ใช้ในการรักษาโรคอัลไซเมอร์^{[ 176 ] [ 177 ]}

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2569 Eli Lilly ตกลงที่จะซื้อ Ventyx Biosciences ในราคา 1.2 พันล้านดอลลาร์ คาดว่าธุรกรรมจะเสร็จสิ้นในครึ่งแรกของปี พ.ศ. 2569 ^{[ 178 ] [ 179 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2569 Eli Lilly ประกาศข้อตกลงการค้นพบยาใหม่กับ InSilico ซึ่งมีมูลค่าประมาณ 2.75 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ^{[ 180 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2569 Eli Lilly ได้ทำข้อตกลงเพื่อเข้าซื้อกิจการ AtaiBeckleyในปี พ.ศ. 2569 ^{[ 181 ]}

ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2551 Eli Lilly ได้ซื้อสิทธิ์ในการผลิตbovine somatotropin (ฮอร์โมนการเจริญเติบโตของวัว) ซึ่งใช้เพื่อเพิ่มปริมาณน้ำนมในวัวนม จากMonsanto [ ^{214 ] การ}ใช้ผลิตภัณฑ์เสริมอาหารนี้กลายเป็นประเด็นถกเถียงเนื่องจากจริยธรรมเกี่ยวกับสัตว์และความกังวลด้านสุขภาพของมนุษย์^{[ 215 ]}

ในปี 2021 Eli Lilly ได้ยื่นคำร้องต่อศาลเพื่อตอบสนองต่อความเห็นที่ปรึกษาของกระทรวงสาธารณสุขและบริการมนุษย์ของสหรัฐอเมริกาที่ระบุว่า Eli Lilly และผู้ผลิตยาอื่นๆ ต้องเสนอราคาที่ลดลงสำหรับยาผู้ป่วยนอกที่ได้รับความคุ้มครองผ่านทางร้านขายยาที่ทำสัญญากับโรงพยาบาลแทนที่จะเสนอราคาเฉพาะกับโรงพยาบาลเองเท่านั้น^{[ 216 ] [ 217 ] [ 218 ]}

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2532 ในเหตุการณ์กราดยิงที่สแตนดาร์ด กราเวียร์โจเซฟ ที. เวสเบคเกอร์ ได้สังหารผู้คน 8 รายและบาดเจ็บอีก 12 รายก่อนที่จะฆ่าตัวตาย^{[ 219 ]}ญาติและเหยื่อของเขากล่าวโทษการกระทำของเขาว่าเป็นผลมาจากยาโปรแซค ซึ่งเขาเริ่มรับประทานเมื่อหนึ่งเดือนก่อนหน้านั้น เหตุการณ์ดังกล่าวได้ก่อให้เกิดการฟ้องร้องและการประท้วงจากสาธารณชนอย่างต่อเนื่อง^{[ 220 ]}ทนายความเริ่มใช้ยาโปรแซคเพื่อแก้ตัวพฤติกรรมที่ผิดปกติของลูกความของพวกเขา^{[ 221 ]}บริษัทอีไล ลิลลี่ ถูกกล่าวหาว่าไม่ได้ดำเนินการอย่างเพียงพอเพื่อเตือนผู้ป่วยและแพทย์เกี่ยวกับผลข้างเคียงของยา ซึ่งบริษัทได้อธิบายว่าเป็น"การกระตุ้น"หลายปีก่อนเกิดเหตุการณ์^{[ 222 ]}

ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2547 องค์การอาหารและยา (FDA) ได้เพิ่มคำเตือนในกรอบให้กับยาแก้ซึมเศร้าทุกชนิดเกี่ยวกับการใช้ในเด็ก^{[ 223 ]}ในปี พ.ศ. 2549 องค์การอาหารและยา (FDA) ได้รวมผู้ใหญ่ที่มีอายุ 25 ปีหรือน้อยกว่าไว้ด้วย^{[ 224 ]}ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2561 องค์การอาหารและยา (FDA) ได้สั่งให้ปรับปรุงคำเตือนโดยอิงจากหลักฐานทางสถิติจากการทดลอง 24 ครั้ง ซึ่งความเสี่ยงของเหตุการณ์ดังกล่าวเพิ่มขึ้นจากร้อยละ 2 เป็นร้อยละ 4 เมื่อเทียบกับการทดลองที่ใช้ยาหลอก^{[ 225 ]}

ในปี 2552 ลิลลี่รับสารภาพว่าทำการตลาดไซเพร็กซาอย่างผิดกฎหมายและตกลงจ่ายค่าปรับ 1.415 พันล้านดอลลาร์ ซึ่งรวมถึงค่าปรับทางอาญา 515 ล้านดอลลาร์ ซึ่งเป็นค่าปรับทางอาญาที่สูงที่สุดเท่าที่เคยมีมาในคดีด้านการดูแลสุขภาพ และเป็นค่าปรับทางอาญาที่สูงที่สุดสำหรับบริษัทใดบริษัทหนึ่งที่เคยถูกเรียกเก็บในการดำเนินคดีอาญาในสหรัฐอเมริกาในขณะนั้น^{[ 124 ] [ 125 ]}

บริษัท Eli Lilly เผชิญกับคดีฟ้องร้องมากมายจากผู้ที่อ้างว่าพวกเขาเป็นโรคเบาหวานหรือโรคอื่นๆ หลังจากรับประทานโอแลนซาพีน (ชื่อทางการค้า Zyprexa) ซึ่งเป็น ยา ต้านโรคจิตเภทรวมถึงจากหน่วยงานรัฐบาลต่างๆ บริษัทประกันภัย และอื่นๆ เอกสารภายในที่มอบให้แก่The New York Timesเปิดเผยว่า Lilly ได้ลดความสำคัญของความเสี่ยงของ Zyprexa ลง ตามเอกสารดังกล่าว ร้อยละ 16 ของผู้ที่รับประทาน Zyprexa มีน้ำหนักเพิ่มขึ้นมากกว่า 66 ปอนด์ในปีแรก ซึ่งเป็นตัวเลขที่มากกว่าที่ Eli Lilly แจ้งให้แพทย์ทราบมาก^{[ 226 ]}

ในปี พ.ศ. 2549 ลิลลี่จ่ายเงิน 700 ล้านดอลลาร์เพื่อยุติคดีความประมาณ 8,000 คดี^{[ 227 ]}และในช่วงต้นปี พ.ศ. 2550 ลิลลี่ได้ยุติคดีความประมาณ 18,000 คดีด้วยเงิน 500 ล้านดอลลาร์ ซึ่งทำให้ยอดรวมที่ลิลลี่จ่ายเพื่อยุติคดีความที่เกี่ยวข้องกับยานี้อยู่ที่ 1.2 พันล้านดอลลาร์^{[ 226 ] [ 228 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2551 ลิลลี่ได้ตกลงยุติคดีความกับรัฐอะแลสกา^{[ 229 ]}และในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2551 ลิลลี่ตกลงที่จะจ่ายเงิน 62 ล้านดอลลาร์สหรัฐให้กับ 32 รัฐและเขตปกครองโคลัมเบียเพื่อยุติคดีความที่ฟ้องร้องภายใต้กฎหมายคุ้มครองผู้บริโภค ของรัฐ ^{[ 230 ]}ในปี พ.ศ. 2552 ตัวแทนฝ่ายขายสี่คนของอีไลลิลลี่ได้ยื่น ฟ้องคดีแบบ qui tam แยกกัน ต่อบริษัทในข้อหาทำการตลาด Zyprexa อย่างผิดกฎหมายสำหรับการใช้งานที่ไม่ได้รับการอนุมัติจาก สำนักงานคณะ กรรมการอาหารและยา

บริษัท Eli Lilly ยอมรับผิดในข้อหา ความผิดทางอาญาของรัฐบาลกลางสหรัฐฯในข้อหาทำการตลาด Zyprexa อย่างผิดกฎหมาย โดยส่งเสริมการใช้ยาในลักษณะนอกเหนือจากที่ระบุไว้ในฉลากโดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับการรักษาภาวะสมองเสื่อมในผู้สูงอายุ^{[ 231 ]}ค่าปรับ 1.415 พันล้านดอลลาร์ ประกอบด้วยการชดเชยทางแพ่ง 800 ล้านดอลลาร์ ค่าปรับทางอาญา 515 ล้านดอลลาร์ และการริบสินทรัพย์ 100 ล้านดอลลาร์^{[ 124 ]}กระทรวงยุติธรรมสหรัฐฯกล่าวว่าค่าปรับทางอาญา 515 ล้านดอลลาร์ เป็นค่าปรับที่สูงที่สุดเท่าที่เคยมีมาในคดีด้านการดูแลสุขภาพ และเป็นค่าปรับทางอาญาที่สูงที่สุดสำหรับบริษัทใดบริษัทหนึ่งที่เคยถูกเรียกเก็บในการดำเนินคดีอาญาในสหรัฐฯ ทุกประเภท^{[ 124 ] [ 125 ]} "นั่นเป็นรอยด่างสำหรับเรา" จอห์น ซี. เลชไลเตอร์ซีอีโอของ Lilly กล่าว "เราไม่ต้องการให้สิ่งนั้นเกิดขึ้นอีก เราได้วางมาตรการต่างๆ เพื่อให้แน่ใจว่าเราไม่เพียงแต่มีเจตนาที่ถูกต้องในด้านความซื่อสัตย์และการปฏิบัติตามกฎระเบียบเท่านั้น แต่เรายังมีระบบต่างๆ เพื่อสนับสนุนสิ่งนั้นด้วย" ^{[ 232 ]}ในอีเมลภายใน Lechleiter ได้ระบุว่า "เราต้องคว้าโอกาสนี้เพื่อขยายงานของเรากับZyprexaในกลุ่มเด็กและวัยรุ่นกลุ่มเดียวกันนี้" สำหรับการใช้งานนอกเหนือข้อบ่งใช้^{[ 233 ]}

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2563 ทนายความJames Gottsteinได้ตีพิมพ์หนังสือชื่อThe Zyprexa Papersซึ่งสรุปกิจกรรมทางกฎหมายที่เกี่ยวข้องกับ Zyprexa และผลกระทบต่อภูมิทัศน์ทางการเมืองของจิตเวชศาสตร์และการต่อต้านจิตเวชศาสตร์ในสหรัฐอเมริกา^{[ 234 ]}หนังสือเล่มนี้ให้รายละเอียดเกี่ยวกับวิธีการที่เขาได้รับเอกสาร Zyprexa รวมถึงวิธีที่Will Hallและกลุ่มเล็กๆ ของ "ผู้รอดชีวิตจากจิตเวช" เผยแพร่เอกสาร Zyprexa บนอินเทอร์เน็ต และการต่อสู้ของ Gottstein ในนามของ Bill Bigley ผู้ป่วยทางจิตเวชที่ความทุกข์ทรมานของเขาทำให้สามารถเปิดเผยเอกสาร Zyprexa ได้^{[ 235 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2564 บริษัท Eli Lilly and Company ถูกกล่าวหาว่าเลือกปฏิบัติทางเพศโดยอดีตนักล็อบบี้ที่อ้างว่าเธอถูกบังคับให้ทำงานในสภาพแวดล้อมการทำงานที่ไม่เป็นมิตรทางเพศ^{[ 236 ]}ฝ่ายที่เกี่ยวข้องตกลงกันด้วยจำนวนเงินที่ไม่เปิดเผยในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2564 ^{[ 237 ]}

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2564 Eli Lilly and Company ถูกกล่าวหาใน คดีฟ้องร้องต่อ ศาลรัฐบาลกลางว่าเลือกปฏิบัติกับผู้สมัครที่มีอายุมากกว่าสำหรับตำแหน่งงานขายโดยอาศัยการนำโควตาการจ้างงานสำหรับคนรุ่นมิลเลนเนียลมาใช้^{[ 238 ]}

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2556 Eli Lilly ฟ้องร้องแคนาดาฐานละเมิดพันธกรณีต่อนักลงทุนต่างชาติภายใต้ข้อตกลงการค้าเสรีอเมริกาเหนือโดยอนุญาตให้ศาลของแคนาดาเพิกถอนสิทธิบัตรของAtomoxetine (Strattera) และOlanzapine (Zyprexa) ^{[ 239 ]} ศาลแคนาดาพบว่าการศึกษา Atomoxetine (Strattera) ที่มีระยะเวลาเจ็ดสัปดาห์กับผู้ป่วย 22 รายนั้นสั้นเกินไปและมีขอบเขตแคบเกินไปที่จะมีคุณสมบัติสำหรับสิทธิบัตร สิทธิบัตรของOlanzapine (Zyprexa) ถูกเพิกถอนเนื่องจากไม่บรรลุประโยชน์ ตามที่สัญญาไว้ บริษัทเรียกร้องค่าเสียหายเป็นจำนวนเงิน 500 ล้านดอลลาร์สหรัฐสำหรับกำไรที่สูญเสียไป ในที่สุดพวกเขาก็แพ้คดีในปี พ.ศ. 2560 ^{[ 240 ]}

ในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2548 Eli Lilly and Company ยอมรับผิดและจ่ายเงิน 36 ล้านดอลลาร์สหรัฐ ในข้อหาเกี่ยวกับการส่งเสริมยาRaloxifene (Evista) อย่างผิดกฎหมาย ซึ่งเป็นยาที่ใช้ป้องกันและรักษาโรคกระดูกพรุนในสตรีวัยหมดประจำเดือน^{[ 241 ]}พนักงานขายได้รับการฝึกอบรมให้ส่งเสริมEvistaสำหรับมะเร็งเต้านมและโรคหัวใจและหลอดเลือด เพื่อกระตุ้นหรือล่อลวงให้แพทย์ถามคำถาม และส่งจดหมายที่ไม่ได้รับการร้องขอเพื่อส่งเสริมEvistaสำหรับการใช้งานที่ไม่ได้รับการอนุมัติ บริษัทฯ ยังได้แจกจ่ายวิดีโอเทปที่พนักงานขายประกาศว่า "Evista เป็นยาที่ดีที่สุดสำหรับการป้องกันโรคเหล่านี้ทั้งหมดอย่างแท้จริง" พนักงานขายบางคนยังได้รับคำสั่งให้ปกปิดหน้าการเปิดเผยข้อมูลที่ระบุว่ายังไม่มีการพิสูจน์ประสิทธิภาพของยาในการลดความเสี่ยงมะเร็งเต้านม

ในเดือนมกราคม พ.ศ. 2562 สมาชิกสภาผู้แทนราษฎรของสหรัฐอเมริกาได้ส่งจดหมายถึง Eli Lilly และผู้ผลิตอินซูลินรายอื่น ๆ เพื่อขอคำอธิบายเกี่ยวกับการขึ้นราคาอินซูลินอย่างรวดเร็ว ค่าใช้จ่ายรายปีของอินซูลินสำหรับผู้ป่วยโรคเบาหวานประเภทที่ 1 ในสหรัฐอเมริกาเพิ่มขึ้นเกือบสองเท่าจาก 2,900 ดอลลาร์เป็น 5,700 ดอลลาร์ในช่วงปี พ.ศ. 2555 ถึง พ.ศ. 2559 ^{[ 242 ]}

การกำหนดราคาอินซูลินของ Eli Lilly กลับมาได้รับความสนใจอีกครั้งในเดือนพฤศจิกายน 2022 หลังจากบัญชี Twitter ที่ได้รับการยืนยันซึ่งแอบอ้างเป็น Eli Lilly โพสต์บน Twitter ว่าอินซูลินจะฟรี^{[ 243 ] [ 244 ] [ 245 ]}ในปีต่อมา บริษัทได้ประกาศว่าจะลดราคาอินซูลินที่ผู้ป่วยต้องจ่ายเองเหลือ 35 ดอลลาร์ต่อเดือน บริษัทยังระบุด้วยว่าจะลดราคา Humalog จาก 275 ดอลลาร์ต่อเดือนเหลือ 66 ดอลลาร์ และจะเสนออินซูลินกลาร์จีนในราคาลด 78% เมื่อเทียบกับบริษัทคู่แข่งอย่างSanofiอย่างไรก็ตาม ต้นทุนที่ลดลงนี้จะไม่ใช้กับอินซูลินแบรนด์ใหม่ของ Eli Lilly และการกำหนดราคาของบริษัทยังคงสูงกว่าเมื่อหลายทศวรรษก่อนอย่างมาก^{[ 246 ]}

ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2566 มีการยื่นฟ้องคดีแรกๆ โดยกล่าวหาว่าOzempic (semaglutide) ของNovo Nordiskและ Mounjaro ของ Eli Lilly ทำให้เกิดผลข้างเคียงร้ายแรงต่อระบบทางเดินอาหาร รวมถึงภาวะกระเพาะอาหาร ทำงานผิด ปกติ^{[ 247 ]}คดีนี้ถูกยื่นฟ้องในนามของ Jaclyn Bjorklund หญิง ชาวลุยเซียนาที่ได้รับการว่าความโดยMorgan & Morganซึ่งกล่าวหาว่าเธอมีอาการอาเจียนอย่างต่อเนื่องและได้รับบาดเจ็บร้ายแรงอื่นๆ หลังจากใช้ยาทั้งสองชนิด และผู้ผลิตล้มเหลวในการเตือนผู้ป่วยและแพทย์เกี่ยวกับความเสี่ยงที่เกี่ยวข้องอย่างเพียงพอ^{[ 247 ]}

ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2567 คณะกรรมการตุลาการสหรัฐฯ ว่าด้วยการดำเนินคดีหลายเขต ได้สั่งให้รวมคดีความมากกว่า 50 คดีที่เกี่ยวข้องกับ Ozempic และ Mounjaro ไว้ที่เขตตะวันออกของรัฐเพนซิลเวเนีย เอกสารที่ยื่นต่อศาลแสดงให้เห็นว่า Morgan & Morgan ได้ยื่นฟ้องหลายคดีและขอให้รวมการดำเนินคดีเข้า ด้วยกัน ^{[ 248 ]}หลังจากการรวมคดี ศาลได้แต่งตั้งคณะกรรมการผู้นำโจทก์เพื่อประสานงานการดำเนินคดี ซึ่งรวมถึงทนายความจากสำนักงานกฎหมาย Susen Law Group, Motley Rice , Levin Papantonio , Pogust Goodheadและ Johnson Becker ด้วย^{[ 248 ]}

ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2568 Eli Lilly ซึ่งมีKirkland & Ellisและ Walsh Pizzi O'Reilly Falanga เป็นตัวแทน ได้ยื่นฟ้องคดีหลายคดีในศาลรัฐบาลกลางในรัฐนิวเจอร์ซีย์และแคลิฟอร์เนียต่อ บริษัทผู้ให้บริการ ด้านการแพทย์ทาง ไกล และร้านขายยาปรุงยา หลายแห่ง รวมถึง Willow Health Services, Henry Meds, Mochi Health, Fella Health และ Empower Clinic Services โดยกล่าวหาว่ามีการแข่งขันที่ไม่เป็นธรรม การโฆษณาเท็จ และการดำเนินธุรกิจที่หลอกลวงที่เกี่ยวข้องกับการขายผลิตภัณฑ์ tirzepatide ที่ปรุงขึ้นเองโดยไม่ได้รับการอนุมัติจาก FDA ซึ่งทำการตลาดเพื่อการลดน้ำหนัก^{[ 249 ]}บริษัทโต้แย้งว่าจำเลยขาย tirzepatide ที่ปรุงขึ้นเองโดยไม่ได้รับการอนุมัติจาก FDA หรือการทดสอบที่เพียงพอ และอ้างอย่างเป็นเท็จว่าผลิตภัณฑ์ของพวกเขามีความปลอดภัย มีประสิทธิภาพ และเหนือกว่ายา Mounjaro และ Zepbound ที่ได้รับการอนุมัติจาก FDA ของ Lilly ^{[ 249 ]}จำเลยโต้แย้งข้อกล่าวหา โดยกล่าวว่าการฟ้องร้องดังกล่าวเป็นการพยายามของ Eli Lilly เพื่อจำกัดการแข่งขันและจำกัดทางเลือกของผู้ป่วยและผู้ให้บริการในตลาดยาลดน้ำหนัก^{[ 249 ]}

ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2568 ผู้พิพากษาศาลแขวงสหรัฐฯ Karen Marston ได้ออกคำตัดสินสำคัญครั้งแรกในคดีความหลายเขตอำนาจศาล โดยยกฟ้องข้อกล่าวหาบางส่วนในขณะที่อนุญาตให้ดำเนินคดีหลักต่อไปได้^{[ 250 ]}ศาลปฏิเสธข้อกล่าวหาบางส่วนของโจทก์เกี่ยวกับการบิดเบือนข้อเท็จจริง การตรวจสอบทางการแพทย์ และข้อบกพร่องด้านการออกแบบ แต่ได้อนุญาตให้ดำเนินคดีต่อไปได้ในกรณีที่ Novo Nordisk และ Eli Lilly ไม่ได้แจ้งเตือนผู้ป่วยเกี่ยวกับความเสี่ยงต่อระบบทางเดินอาหารบนฉลากยาอย่างเพียงพอ คดีความในขั้นตอนนี้ครอบคลุมคดีฟ้องร้องรายบุคคลมากกว่า 2,600 คดีที่เกี่ยวข้องกับ Ozempic, Mounjaro และยาตัวกระตุ้นตัวรับ GLP-1 ที่เกี่ยวข้อง^{[ 250 ]}

ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2568 รัฐเท็กซัสได้ฟ้องร้องบริษัทลิลลี่ในข้อหา "ติดสินบน" ผู้ให้บริการทางการแพทย์เพื่อให้สั่งจ่ายยามูนจาโรและเซปบาวด์ บริษัทลิลลี่ถูกกล่าวหาว่าเสนอสิ่งจูงใจที่ผิดกฎหมายแก่ผู้ให้บริการทางการแพทย์ในรัฐเท็กซัส ซึ่งรวมถึง "พยาบาลฟรี" และบริการสนับสนุนการชำระเงินคืน ในขณะที่ค่าใช้จ่ายของยาได้รับการคุ้มครองโดยเมดิเคด^{[ 251 ]}