กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 5 นาที

ไม่มีชื่อบทความ

WD40 repeat (หรือที่รู้จักกันในชื่อ WD หรือ beta-transducin repeat ) เป็น โมทีฟโครงสร้าง สั้นๆ ที่มี กรดอะมิโน ประมาณ 40 ตัวมักจะสิ้นสุดที่ ไดเป ป ไทด์ทริปโต แฟน - แอสปาร์ติกแอซิ..

WD40 ซ้ำ

WD40 repeat (หรือที่รู้จักกันในชื่อWDหรือbeta-transducin repeat ) เป็นโมทีฟโครงสร้าง สั้นๆ ที่มี กรดอะมิโนประมาณ 40 ตัวมักจะสิ้นสุดที่ ไดเป ป ไทด์ทริปโต แฟน - แอสปาร์ติกแอซิด (WD) [ 2 ]สำเนาที่เรียงต่อกันของ repeat เหล่านี้ มักจะพับรวมกันเพื่อสร้าง โดเมนโปรตีนโซลีนอยด์แบบวงกลมที่เรียกว่าโดเมน WD40

โครงสร้าง

โปรตีนที่มีโดเมน WD40 มีหน่วยซ้ำ 4 ถึง 16 หน่วย ซึ่งเชื่อกันว่าทั้งหมดก่อตัวเป็น โครงสร้าง เบต้าโพรเพลเลอร์ แบบวงกลม (ดูรูปทางด้านขวา) [ 3 ] [ 4 ]โดเมน WD40 ประกอบด้วยกรดอะมิโนประมาณ 40 ถึง 60 [ 4 ]ตัว โดยมีไดเปปไทด์ไกลซีนและฮิสติดีนอยู่ใกล้ปลาย N และไดเปปไทด์ทริปโตแฟนและกรดแอสปาร์ติกมักจะอยู่ที่ปลาย C มีบริเวณแปรผันสองบริเวณ หน่วยซ้ำมักจะก่อตัวเป็นแผ่นเบต้าหรือใบมีดแบบขนานกันสี่สาย ใบมีดเหล่านี้มารวมกันเพื่อสร้างใบพัด โดยที่พบได้บ่อยที่สุดคือใบพัดเบต้าเจ็ดใบ ใบมีดจะเกี่ยวกันเพื่อให้สายเบต้าสุดท้ายของหน่วยซ้ำหนึ่งก่อตัวกับสามสายแรกของหน่วยซ้ำถัดไปเพื่อสร้างโครงสร้างใบมีดสามมิติ[ 3 ] [ 4 ]

การทำงาน

โปรตีน WD40-repeat เป็นตระกูลใหญ่ที่พบในยูคาริโอต ทั้งหมด และมีส่วนเกี่ยวข้องกับหน้าที่ต่างๆ มากมาย ตั้งแต่การส่งสัญญาณและการควบคุมการถอดรหัสไปจนถึงการควบคุมวงจรเซลล์ออโตฟาจีและอะพอพโทซิส [ 5 ] หน้าที่พื้นฐานร่วมกันของโปรตีน WD40-repeat ทั้งหมดคือการประสานงานการประกอบคอมเพล็กซ์โปรตีนหลายชนิด โดยที่หน่วยที่ซ้ำกันทำหน้าที่เป็นโครงสร้าง ที่แข็งแรง สำหรับการโต้ตอบของโปรตีน ความจำเพาะของโปรตีนถูกกำหนดโดยลำดับภายนอกหน่วยที่ซ้ำกัน ตัวอย่างของคอมเพล็กซ์ดังกล่าว ได้แก่โปรตีน G (หน่วยย่อยเบต้าเป็นเบต้าโพรเพลเลอร์) ปัจจัยการถอดรหัส TAFIIและ ยูบิควิตินไล เกสE3 [ 3 ] [ 4 ]

ตัวอย่าง

จากการวิเคราะห์เบื้องต้นของจีโนมมนุษย์ พบว่าลำดับซ้ำ WD40 เป็นกลุ่มโปรตีนที่ใหญ่เป็นอันดับแปด โดยพบโปรตีนทั้งหมด 277 ชนิดที่มีลำดับซ้ำนี้[ 6 ]ยีนของมนุษย์ที่เข้ารหัสโปรตีนที่มีโดเมนนี้ ได้แก่:

ยีน WDR ของมนุษย์และโรคที่เกี่ยวข้อง
ยีน WDRชื่อยีนอื่นๆNCBI Entrez Gene IDโรคของมนุษย์ที่เกี่ยวข้องกับการกลายพันธุ์
ดับเบิลยูดีอาร์1เอไอพี1; โนริ-1; เฮล-เอส-529948
ดับเบิลยูดีอาร์2CORO2A ; IR10; CLIPINB7464
ดับเบิลยูดีอาร์3ดีพี2; ยูทีพี1210885
ดับเบิลยูดีอาร์4TRM82; TRMT8210785
ดับเบิลยูดีอาร์5SWD3; BIG-3; CFAP8911091
ดับเบิลยูดีอาร์611180
ดับเบิลยูดีอาร์7แทรค; เกียเอ0541; Rabconnectin 3 เบต้า23335
ดับเบิลยูดีอาร์8แรป7349856
ดับเบิลยูดีอาร์9BRWD1 ; N143; C21orf10754014
ดับเบิลยูดีอาร์10IFT122 ; CED; SPG; CED1; WDR10p; WDR14055764กลุ่มอาการเซนเซนเบรนเนอร์
ดับเบิลยูดีอาร์11DR11; HH14; BRWD2; WDR1555717กลุ่มอาการคัลล์แมนน์
ดับเบิลยูดีอาร์12วายทีเอ็ม155759
ดับเบิลยูดีอาร์13เอ็มจี2164743
ดับเบิลยูดีอาร์14GNB1L ; GY2; เอฟเคเอสจี1; WDVCF; DGCRK354584
ดับเบิลยูดีอาร์15ดับเบิลยูดีอาร์11
ดับเบิลยูดีอาร์16CFAP52 ; WDRPUH146845
ดับเบิลยูดีอาร์17116966
ดับเบิลยูดีอาร์18ไอพีไอ357418
ดับเบิลยูดีอาร์19เอทีดี5; ซีอีดี4; ดีวายเอฟ-2; โออาร์เอฟ26; โอเซก6; พปชร.; SRTD5; IFT144; NPHP1357728กลุ่มอาการ Sensenbrenner , กลุ่มอาการ Jeune
ดับเบิลยูดีอาร์20ดีเอ็มอาร์91833
ดับเบิลยูดีอาร์21DCAF4 ; WDR21A26094
ดับเบิลยูดีอาร์22DCAF5 ; BCRG2; BCRP28816
ดับเบิลยูดีอาร์23DCAF11 ; GL014; PRO238980344
ดับเบิลยูดีอาร์24JFP7; C16orf2184219
ดับเบิลยูดีอาร์25ซี14ออร์ฟ6779446
ดับเบิลยูดีอาร์26ซีดีดับบลิว2; จีไอดี7; เอ็มไอพี280232
ดับเบิลยูดีอาร์27253769
ดับเบิลยูดีอาร์28GRWD1; CDW4; GRWD; RRB183743
ดับเบิลยูดีอาร์29SPAG16 ; PF2079582
ดับเบิลยูดีอาร์30ATG16L1 ; IBD10; APG16L; ATG16A; ATG16L55054โรคโครห์น
ดับเบิลยูดีอาร์31114987
ดับเบิลยูดีอาร์32ดีซีเอเอฟ1079269
ดับเบิลยูดีอาร์33NET14; WDC14655339
ดับเบิลยูดีอาร์34DIC5; FAP133; SRTD1189891กลุ่มอาการเจอร์น
ดับเบิลยูดีอาร์35ซีดีดี2; ไอเอฟทีเอ1; เอสอาร์ทีดี7; ไอเอฟที12157539กลุ่มอาการเซนเซนเบรนเนอร์
ดับเบิลยูดีอาร์36GLC1G; UTP21; TAWDRP; TA-WDRP134430โรคต้อหินมุมเปิดปฐมภูมิ
ดับเบิลยูดีอาร์3722884
ดับเบิลยูดีอาร์38401551
ดับเบิลยูดีอาร์39CIAO1 ; CIA19391
ดับเบิลยูดีอาร์40เอDCAF12 ; CT102; TCC52; KIAA189225853
ดับเบิลยูดีอาร์41เอ็มเอสทีพี04855255
ดับเบิลยูดีอาร์43ยูทีพี5; เน็ต1223160
ดับเบิลยูดีอาร์44RPH11; RAB11BP54521
ดับเบิลยูดีอาร์45เจเอ็ม5; เอ็นบีเอ4; NBIA5; WDRX1; WIPI4; วิปิ-411152โรคความเสื่อมของระบบประสาทที่เกี่ยวข้องกับโปรตีนเบต้าโพรเพลเลอร์ (BPAN)
ดับเบิลยูดีอาร์46UTP7; BING4; FP221; C6orf119277
ดับเบิลยูดีอาร์47NEMITIN; KIAA089322911
ดับเบิลยูดีอาร์48พี80; ยูเอเอฟ1; เอสพีจี6057599
ดับเบิลยูดีอาร์49151790
ดับเบิลยูดีอาร์50ยูทีพี18 ; ซีจีไอ-4851096
ดับเบิลยูดีอาร์52ซีเอฟเอพี4455779
ดับเบิลยูดีอาร์53348793
ดับเบิลยูดีอาร์5484058
ดับเบิลยูดีอาร์5554853
ดับเบิลยูดีอาร์56IFT80 ; ATD2; SRTD257560กลุ่มอาการเจอร์น
ดับเบิลยูดีอาร์57SNRNP40 ; SPF38; PRP8BP; HPRP8BP; PRPF8BP9410
ดับเบิลยูดีอาร์58THOC6 ; BBIS; fSAP3579228
ดับเบิลยูดีอาร์59เอฟพี97779726
ดับเบิลยูดีอาร์60SRPS6; SRTD8; FAP16355112กลุ่มอาการเจอร์น
ดับเบิลยูดีอาร์61SKI8; REC1480349
ดับเบิลยูดีอาร์62เอ็มซีพีเอช2; ซี19ออร์ฟ14284403ไมโครเซฟาลี
ดับเบิลยูดีอาร์63DIC3; NYD-SP29126820
ดับเบิลยูดีอาร์64128025
ดับเบิลยูดีอาร์65CFAP57 ; VWS2149465กลุ่มอาการแวน เดอร์ วูเด
ดับเบิลยูดีอาร์66CaM-IP4144406
ดับเบิลยูดีอาร์67TBC1D31 ; Gm8593594
ดับเบิลยูดีอาร์68DCAF7 ; AN11; HAN11; SWAN-110238
ดับเบิลยูดีอาร์69DAW1 ; ODA16164781
ดับเบิลยูดีอาร์7055100
ดับเบิลยูดีอาร์71PAAF1 ; PAAF; Rpn1480227
ดับเบิลยูดีอาร์72AI2A3256764โรคอะเมลโลเจเนซิส อิมเพอร์เฟคตา
ดับเบิลยูดีอาร์73HSPC26484942
ดับเบิลยูดีอาร์7454663
ดับเบิลยูดีอาร์75NET16; UTP1784128
ดับเบิลยูดีอาร์76ซีดีดับบลิว1479968
ดับเบิลยูดีอาร์77หน้า 44; MEP50; MEP-50; HKMT1069; Nbla10071; หน้า 44/Mep5079084
ดับเบิลยูดีอาร์78ดีไอซี479819
ดับเบิลยูดีอาร์79WRAP53 ; DKCB3; TCAB155135
ดับเบิลยูดีอาร์80เอทีจี16แอล ; เอทีจี16บี89849
ดับเบิลยูดีอาร์81CAMRQ2; PPP1R166124997กลุ่มอาการสมองน้อยผิดปกติ ปัญญาอ่อน และเสียสมดุล-2
ดับเบิลยูดีอาร์82SWD2; MST107; WDR82A; MSTP107; PRO2730; TMEM113; PRO3404780335
ดับเบิลยูดีอาร์83มอร์ก184292
ดับเบิลยูดีอาร์84PAK1IP1 ; PIP1; MAK1155003
ดับเบิลยูดีอาร์85DPH7 ; RRT2; C9orf11292715
ดับเบิลยูดีอาร์86349136
ดับเบิลยูดีอาร์87NYD-SP1183889
ดับเบิลยูดีอาร์88พีคิวดับบลิวดี126248
ดับเบิลยูดีอาร์89MSTP050; C14orf150112840
ดับเบิลยูดีอาร์90C16orf15; C16orf16; C16orf17; C16orf18; C16orf19197335
ดับเบิลยูดีอาร์91HSPC04929062
ดับเบิลยูดีอาร์92โมนาด116143
ดับเบิลยูดีอาร์9356964
ดับเบิลยูดีอาร์94แอมบรา1 ; ดีซีเอเอฟ355626
ดับเบิลยูดีอาร์96CFAP43 ; C10orf7980217

ดูเพิ่มเติม

บทความนี้ได้นำข้อความจากเอกสารสาธารณะPfamและInterPro มาใช้ : IPR001680

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ไม่มีชื่อบทความ

WD40 repeat (หรือที่รู้จักกันในชื่อ WD หรือ beta-transducin repeat ) เป็น โมทีฟโครงสร้าง สั้นๆ ที่มี กรดอะมิโน ประมาณ 40 ตัวมักจะสิ้นสุดที่ ไดเป ป ไทด์ทริปโต แฟน - แอสปาร์ติกแอซิ..

โครงสร้าง

โปรตีนที่มีโดเมน WD40 มีหน่วยซ้ำ 4 ถึง 16 หน่วย ซึ่งเชื่อกันว่าทั้งหมดก่อตัวเป็น โครงสร้าง เบต้าโพรเพลเลอร์ แบบวงกลม (ดูรูปทางด้านขวา) [ 3 ] [ 4 ] โดเมน WD40 ประกอบด้วยกรดอะมิโนประมาณ 40 ถึง 60 [ 4 ] ตัว โดยมีไดเปปไทด์ไกลซีนและฮิสติดีนอยู่ใกล้ปลาย N...

การทำงาน

โปรตีน WD40-repeat เป็นตระกูลใหญ่ที่พบใน ยูคาริโอต ทั้งหมด และมีส่วนเกี่ยวข้องกับหน้าที่ต่างๆ มากมาย ตั้งแต่ การส่งสัญญาณ และ การควบคุมการถอดรหัส ไปจนถึงการควบคุม วงจรเซลล์ ออโตฟาจี และ อะพอพโทซิส [ 5 ] หน้าที่ พื้นฐานร่วมกันของโปรตีน WD40-repeat...

ตัวอย่าง

จากการวิเคราะห์เบื้องต้นของจีโนมมนุษย์ พบว่าลำดับซ้ำ WD40 เป็นกลุ่มโปรตีนที่ใหญ่เป็นอันดับแปด โดยพบโปรตีนทั้งหมด 277 ชนิดที่มีลำดับซ้ำนี้ [ 6 ] ยีนของมนุษย์ที่เข้ารหัสโปรตีนที่มีโดเมนนี้ ได้แก่: